RealtimePCRmRNA定量实验路线选择F&Q
本期专文要来跟大家讨论的话题是核糖核酸(RNA)的萃取，看到这里各位心中可能已经起了疑问: RNA 萃取不是很简单吗?只要照着标准步骤操作，加一加试剂就完成了，有必要大费周章特地开篇幅来谈这件事吗?其实越简单的东西遇到困难时就越难解，各位看倌就请耐着性子，听我们娓娓道来。 Lab 的经验和客户的难题 以华联基因体实验室的长期以来承接客户RNA检体的经验来说，我们经常遇到的问题是(1)RNA的总量不够，(2)RNA有严重的盐类污染，(3)RNA有严重的有机溶剂污染，(4)DNA污染及(5)样品降解严重(图一图二)。前四项问题都还好解决，只需要再次萃取或进行纯化即可解决，但是样品降解就较为棘手，常常因重新准备检体一来一往，耗掉不少心力和时间，最后也拿不到好的结果。 客户经常会问为什么执行芯片实验会如此要求RNA质量呢?而其他的检测方法如实时定量聚合连锁反应(Real-time Quantitative Poly......阅读全文
从RNA的提取到PCR——Realtime－PCR经验
一 引物的设计引物的设计对于这个实验至关重要，因为real time pcr的检测灵敏度比较高，所以相应的对引物设计的要求就很高。普通的要求规则大家都知道，还有几点必须注意：1，引物的错配率（引物错配形成引物二聚体，但是SYBR照样能嵌入进去，结果导致实验结果的误差很大，重复性也不好）。2，引物的特
Real－time－PCR－跟RTPCR有什么区别
实时荧光定量PCR原理所谓实时荧光定量PCR技术，是指在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。1．内标在传统定量中的作用由于传统定量方法都是终点检测，即PCR到达平台期后进行检测，而PCR经过对数期扩增到达平台期时，检测重
realtime－PCR技术的原理及应用
一、实时荧光定量PCR原理（一）定义：在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号累积实时监测整个PCR进程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法 。（二）实时原理1、常规PCR技术：对PCR扩增反应的终点产物进行定量和定性分析无法对起始模板准确定量，无法对扩增反应实时检测。2、实时定量PC
Realtime－PCR－数据导出－——－ABI仪器篇
1. Real-time PCR数据：Real-time PCR完成后，所有数据并非可以直接导出，由于每一次实验的情况都不相同，仪器的很多默认设定都会对最终数据结果造成重大偏差，所以在完成PCR过程后，需要人为对实验结果进行条件设置，才能提取到科学有效的实验结果，进而完成对实验结果的分析和判断。
食物过敏原的检测和定量方法即时（realtime）PCR法
即时PCR方法与其他DNA定量方法相比，即时PCR方法需要昂贵的实验室设备，但准确度高，劳动强度低。即时PCR方法不用凝胶制品而使用特定目标的低聚核苷酸探子，因而实现即时分析。
实时荧光定量PCR（RealTimePCR）实验流程
一、RNA的提取(详见RNA提取及反转录) 不同组织样本的RNA提取适用不同的提取方法，因为Real-TimePCR对RNA样品的质量要求较高，所以，正式实验前要选择一款适合自己样品的提取方法，在实验过程中要防止RNA的降解，保持RNA的完整性。 在总rna的提取过程中，注意避免m
realtime－PCR中内参基因的CT值
这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的，而内参做出来差别大（比如3-4个CT值）那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多，内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的，那说明你的样本要么降解了，要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响，必须换一个基因做内参
realtime－PCR中内参基因的CT值
这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的，而内参做出来差别大（比如3-4个CT值）那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多，内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的，那说明你的样本要么降解了，要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响，必须换一个基因做内参
realtime－PCR中内参基因的CT值
这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的，而内参做出来差别大（比如3-4个CT值）那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多，内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的，那说明你的样本要么降解了，要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响，必须换一个基因做内参
realtime－PCR中内参基因的CT值
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realtime－PCR中内参基因的CT值
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引物设计原则（Principle－of－realtime－quantiation－PCR－primer－）
1、引物的长度一般为15-30bp，常用的是18-27bp，但不应大于38，因为过长会导致其延伸温度大于74°C，不适于Taq DNA聚合酶进行反应。2、引物序列在模板内应当没有相似性较高，尤其是3’端相似性较高的序列，否则容易导致错配。引物3’端出现3个以上的连续碱基，如GGG或CCC，也会使错误
realtime－PCR中内参基因的CT值
这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的，而内参做出来差别大（比如3-4个CT值）那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多，内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的，那说明你的样本要么降解了，要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响，必须换一个基因做内参
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这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的，而内参做出来差别大（比如3-4个CT值）那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多，内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的，那说明你的样本要么降解了，要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响，必须换一个基因做内参
realtime－PCR中内参基因的CT值
这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的，而内参做出来差别大（比如3-4个CT值）那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多，内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的，那说明你的样本要么降解了，要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响，必须换一个基因做内参
realtime－PCR中内参基因的CT值
这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的，而内参做出来差别大（比如3-4个CT值）那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多，内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的，那说明你的样本要么降解了，要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响，必须换一个基因做内参
realtime－PCR负对照有信号问题分析
引物设计不够优化：应避免引物二聚体和发夹结构的出现。 引物浓度不佳：适当降低引物的浓度，并注意上下游引物的浓度配比。 镁离子浓度过高：适当降低镁离子浓度，或选择更合适的 mix 试剂盒。 模板有基因组的污染：RNA 提取过程中避免基因组 DNA 的引入，或通过引物设计避免非特异扩增。
Realtime－PCR－数据导出－——－ABI仪器篇（二）
• 6. StepOne阈值（Threshold）：选中孔板中所有的数值，如下界面选择log、Target对话框• 将每个基因的Tredshold Auto勾选掉，阈值数值调整范围原则在指数增长期。阈值数值调整范围原则在指数增长期，该范围中，曲线斜率相同，ΔCT值不变 • 注意同
realtime－PCR中内参基因的CT值
这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的，而内参做出来差别大（比如3-4个CT值）那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多，内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的，那说明你的样本要么降解了，要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响，必须换一个基因做内参
realtime－PCR中内参基因的CT值
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Realtime－PCR－数据导出－——－ABI仪器篇（一）
1. Real-time PCR数据：Real-time PCR完成后，所有数据并非可以直接导出，由于每一次实验的情况都不相同，仪器的很多默认设定都会对最终数据结果造成重大偏差，所以在完成PCR过程后，需要人为对实验结果进行条件设置，才能提取到科学有效的实验结果，进而完成对实验结果的分析和判断。
实时荧光定量PCR（RealTimePCR）实验流程（一）
一、RNA的提取(详见RNA提取及反转录) 不同组织样本的RNA提取适用不同的提取方法，因为Real-TimePCR对RNA样品的质量要求较高，所以，正式实验前要选择一款适合自己样品的提取方法，在实验过程中要防止RNA的降解，保持RNA的完整性。 在总rna的提取过程中，注意避免mRNA
实时荧光定量PCR（RealTimePCR）实验流程（二）
五、cDNA与引物质量检测 取0.2ml薄壁PCR管，编号。向各管中加入含染料2×PCRTaqMix10ul;加入正反向引物各0.5ul(引物浓度10uM)，向管中加入混合的cDNA各1ul。各管补加水至20ul。 组份加量 2×PCRTaqMix10ul 10uMPrime
Realtime同电泳检测产物的PCR有何优势？
Real-time qPCR通过荧光信号在每个反应循环终点检测，反应指数增长期，可以真实监测模板起始量，线性范围可达5——7个数量级；而终点法重复性不佳、线性范围较窄，且产物电泳检测受限于片段大小和凝胶分辨率、胶染料灵敏度等因素，线性范围在100-fold左右。
做－realtime－PCR之前，你应该如何着手设计引物
正在着手做 real-time PCR 的朋友们，我想最开始肯定要考虑引物设计的问题。看完下面的文字，我保证你得到想要的引物设计方法和引物序列。第一步：拿到你所要研究的基因的序列。不要告诉我你不会找序列。如果真的不会，请参考丁香园内其他版块，如NCBI使用，序列查找等。第二步：确定你想用哪种方法。T
RealTime－PCR－(qPCR)常见问题及解决方案
Real Time PCR(qPCR)，即实时荧光定量核酸扩增检测系统，是一种利用荧光染剂检测每次PCR循环后产物总量的方法技术，是常规PCR的衍生反应。主要是通过荧光信号的变化实时监测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化，通过ct值和标准曲线的关系对起始模板进行定量分析。因其具有灵敏、特异、