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realtimePCR技术的原理及应用

一、实时荧光定量PCR原理(一)定义:在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号累积实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法 。(二)实时原理1、常规PCR技术:对PCR扩增反应的终点产物进行定量和定性分析无法对起始模板准确定量,无法对扩增反应实时检测。2、实时定量PCR技术:利用荧光信号的变化实时检测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化,通过Ct值和标准曲线的分析对起始模板进行定量分析3、如何对起始模板定量?通过Ct值和标准曲线对起始模板进行定量分析.4、几个概念:(1)扩增曲线 :(2) 荧光阈值:(3)Ct值:CT值的重现性:5、定量原理:理想的PCR反应: X=X0*2n非理想的PCR反应: X=X0 (1+Ex)nn:扩增反应的循环次数X:第n次循环后的产物量X0:初始模板量Ex:扩增效率5、标准曲线6、绝对定量1)确定未知样品的 C(t)值2)通过标准曲线由未知样品的C(t)值推算......阅读全文

实时荧光定量PCR

Real Time PCR实时荧光定量PCR   其定量的基本原理是在 PCR 反应体系中加入非特异性的荧光染料(如: SYBR GREEN I )或特异性的荧光探针(如: Taqman 探针),实时检测荧光量的变化,获得不同样品达到一定的荧光信号(阈值)时所

实时荧光定量PCR的研究进展及其应用(二)

1.3 定量方法 在real-time Q-PCR中,模板定量有两种策略;相对定量和绝对定量。相对定量指的是在一定样本中靶序列相对于另一参照样本的量的变化。绝对定量指的是用已知的标准曲线来推算未知的样本的量。 1.3.1 标准曲线的法的相对定量 由于在此方法中量的表达是相对于某个参照物的量而言的

Real-time PCR 基础知识

理论基础 聚合酶链式反应作为一种革命性的方法在生物学研究的历史中占据了重要的地位。以此为基础发展出包括real-time PCR在内的多项应用技术。自诞生后real-time PCR技术持续发展,从简单的增扩到整个PCR过程,real-time PCR表现出比PCR更敏感、更明确的

实时荧光定量PCR(Real-time PCR,QPCR,荧光定量)分类以...

实时荧光定量PCR(Real-time PCR,QPCR,荧光定量)分类以及实验步骤介绍实时荧光定量PCR(Real-time PCR,QPCR,荧光定量)技术(Real-time quantitative PCR),是指在(QPCR,荧光定量)反应体系中加入荧光基因,

qPCR Protocol for SNP Genotyping

实验概要Platinum® qPCR  SuperMix for SNP Genotyping is a ready-to-use reaction mix for the  amplification and identification of single-nucl

荧光定量PCR应用——肿瘤篇

   肿瘤是是机体在各种致癌因素作用下,局部组织细胞在基因水平上失去对其生长的正常调控,从而导致其克隆性异常增生而形成的异常病变。学界将其分为良性和恶性两大类。肿瘤作为全球疾病致死的重要元凶之一,如果发现和治疗不及时,有可能导致人体消瘦、无力、贫血、食欲不振、发热及脏器功能受损等

荧光定量PCR应用——肿瘤篇

肿瘤是是机体在各种致癌因素作用下,局部组织细胞在基因水平上失去对其生长的正常调控,从而导致其克隆性异常增生而形成的异常病变。学界将其分为良性和恶性两大类。肿瘤作为全球疾病致死的重要元凶之一,如果发现和治疗不及时,有可能导致人体消瘦、无力、贫血、食欲不振、发热及脏器功能受损等,其后果极为严重。实时荧光

基于PCR技术的染色质沉淀分析

INTRODUCTION After chromatin immunoprecipitation (ChIP), different PCR-based approaches can be used to determine how much DNA is p

Real-time qPCR手册---手把手教你从菜鸟到高手

3.3 SYBR@Green 法SYBR@Green I是一种结合于小沟中的双链DNA结合染料,与双链DNA结合后,其荧光大大增强。这一性质使其用于扩增产物的检测非常理想。SYBR@Green I 的最大吸收波长约为497nm,发射波长最大约为520nm。在PCR反应体系中,加入过量SYBR@Gre

PCR Array 简单实用的检测基因表达的高通量方法

 简介:什么是PCR芯片?实时定量PCR是检测基因表达zui灵敏,zui可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备

实时荧光定量PCR的研究进展及其应用(一)

多聚集链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术发明至今已近20年了,在这期间技术得到了不断的发展,近年来出现的实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR)技术实现了PCR从定性到定量的飞跃,它以其特异性强、灵敏度高、重复性好、

Dynamic Monitoring ofCellular Remodeling Induced bythe Transforming Growth1

The plasticity of differentiated adult cells could have a great therapeutic potential, but at the same time, it is characteristic of progression of se

RT-PCR、QPCR、Real-time PCR、real-time RT-PCR你真的区分的开吗?

多少同学能将 RT-PCR、Realtime-PCR、QPCR区分开?有多少同学还在犯晕?今儿这贴,师兄就带你区分区分,拨开那扇 PCR 迷雾。什么是 RT-PCR?RT-PCR就是逆转录 PCR(reverse transcription PCR)或者称反转录PCR(reverse tr

实时荧光定量PCR

聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)可对特定核苷酸片断进行指数级的扩增。在扩增反应结束之后,我们可以通过凝胶电泳的方法对扩增产物进行定性的分析,也可以通过放射性核素掺入标记后的光密度扫描来进行定量的分析。无论定性还是定量分析,分析的都是PCR终产物。但是在许多

做 real-time PCR之前,你应该如何着手设计引物

正在着手做 real-time PCR 的朋友们,我想最开始肯定要考虑引物设计的问题。看完下面的文字,我保证你得到想要的引物设计方法和引物序列。第一步:拿到你所要研究的基因的序列。不要告诉我你不会找序列。如果真的不会,请参考丁香园内其他版块,如NCBI使用,序列查找等。第二步:确

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析

  随着人类基因组计划(human genome project )在2003年顺利完成,基因组测序技术取得了长足的进步,这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊,这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以

基于PCR技术的染色质沉淀分析-1

INTRODUCTIONAfter chromatin immunoprecipitation (ChIP), different PCR-based approaches can be used to determine how much DNA is precipitated at a locu

ABI实时定量PCR仪获批准与美新流感检验试剂配套联用

美国应用生物系统公司(纽约证券交易所代码:ABI)即日宣布,其新一代7500 Fast Dx Real-Time PCR仪已经获得美国食品与药品监督管理局(FDA)的正式批准函件(510(k)),可与美国疾病预防与控制中心的新CDC人类流感病毒实时定量RT- PCR检测和鉴定组(rRT-PCR Fl

实时荧光定量PCR(Real-Time PCR)实验流程

一、RNA的提取(详见RNA提取及反转录)不同组织样本的RNA提取适用不同的提取方法,因为Real-Time PCR对RNA样品的质量要求较高,所以,正式实验前要选择一款适合自己样品的提取方法,在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在总rna的提取过程中,注意避免mRNA的断裂;取2u

荧光定量PCR常用术语

荧光定量PCR原理和过程已经非常清楚,为方便初学者更加清晰的学习,QIAGEN为大家汇总了荧光定量PCR常用术语,供您查阅参考使用。基线:基线是早期循环的噪点水平,通常在第3和第15循环之间测量,这是因为在此期间还检测不到扩增产物引起的荧光值增加。用于计算基线的循环数量是可以改变的,如果使用高模板量

狂犬病实验诊断新方法:可能取代当前的金标准(DFA)

即将向全球推广的狂犬病实验诊断新方法----实时定量RT-PCR检测法(简称LN34检测法),可能作为狂犬病基本检测诊断方法,补充或取代当前的金标准:DFA检测。动物和人狂犬病的确诊,必须要有实验室检测结果,否则都只能算疑似病例。目前WHO(世界卫生组织)肯定的人和动物狂犬病的死后诊断的金标准,是直

荧光定量PCR常用术语

基线:基线是早期循环的噪点水平,通常在第3和第15循环之间测量,这是因为在此期间还检测不到扩增产物引起的荧光值增加。用于计算基线的循环数量是可以改变的,如果使用高模板量或者靶标基因的表达水平高则循环数量需要减少。设置基线需要查看线性度扩增曲线的荧光数据。设置基线,使得扩增曲线的增长所开始的循环圈数大

real-time PCR 数据分析

无论所使用的real-time PCR是何种型号,正确的数据分析对于获得有效的实验结果都是至关重要的。这里介绍有关real-time PCR数据分析的知识。 在讨论基本分析过程之前,先介绍如何设计一个好的实验。如果你是自己设计的引物和探针,那有助于下一步的工作。但是在有些情况下,人们使用出

解析荧光定量PCR常用术语

 基线:基线是早期循环的噪点水平,通常在第3和第15循环之间测量,这是因为在此期间还检测不到扩增产物引起的荧光值增加。用于计算基线的循环数量是可以改变的,如果使用高模板量或者靶标基因的表达水平高则循环数量需要减少。设置基线需要查看线性度扩增曲线的荧光数据。设置基线,使得扩增曲线的增长所开始

QPCR常见问题及其分析

一般来讲,进行real-time qPCR MasterMix都是2×的浓缩液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR灵敏度高,所以每个样品至少要做3个平行孔,以防在后面的数据分析中,由于Ct相差较多或者SD太大,无法进行统计分析。通常来讲,反应体系的引物终浓度为10

QPCR常见问题及其分析

一般来讲,进行real-time qPCR MasterMix都是2×的浓缩液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR灵敏度高,所以每个样品至少要做3个平行孔,以防在后面的数据分析中,由于Ct相差较多或者SD太大,无法进行统计分析。通常来讲,反应体系的引物终浓度为10

一文读懂分子诊断技术、PCR技术、基因测序技术

  四、定量PCR(quantitative PCR,qPCR)  相比于其他分子诊断检测技术,qPCR具有2项优势,即核酸扩增和检测在同一个封闭体系中通过荧光信号进行,杜绝了PCR后开盖处理所带来扩增产物的污染;同时通过动态监测荧光信号,可对低拷贝模板进行定量。正是由于上述技术优势,qPCR已经成

QPCR常见问题及其分析

一般来讲,进行real-time qPCR MasterMix都是2×的浓缩液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR灵敏度高,所以每个样品至少要做3个平行孔,以防在后面的数据分析中,由于Ct相差较多或者SD太大,无法进行统计分析。通常来讲,反应体系的引物终浓度为100-400

PCR Array 简单实用的检测基因表达的高通量方法(三)

PCR 芯片实验体系    完整的PCR芯片实验体系包括RT2ProfilerTM PCR芯片,RT2 Real-TimeTM  SYBR Green PCR反应体系和cDNA合成试剂盒。所有这些组分均为基于SYBR  Green的实时定量PCR反应优化。精心

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析 6

应用WGS正在成为NGS中最广泛的应用。通过该技术并且结合生物学应用,研究人员可以获得基因组信息中最值得注意的信息73。举例来说,2012年,Ellis等报道了基因与乳腺癌患者芳香酶抑制剂(aromatase inhibitor)治疗法之间的关联。他们指出突变,后果与诊断之间的关联,同样还有