双剑合璧|sumo化与磷酸化修饰联合分析赢高分文章
随着质谱技术的不断进步，大规模修饰组学的方法也越来越成熟，PTM作为生物体内非常重要的生理现象也逐步被揭示出参与各项生命活动。今天我们就一起来学习一篇运用质谱技术对磷酸化修饰和类泛素化修饰鉴定，找出两种修饰联合作用对在DNA复制损伤压力时的响应。该篇文献来自哥本哈根大学的研究人员于2017年10月发表在“cell report”杂志上的 Proteomics Reveals Global Regulation of Protein SUMOylation by ATMand ATR Kinases during Replication Stress文献， 目的是通过质谱技术分析sumo化修饰和磷酸化修饰在细胞面对DNA复制压力时的信号传递、相互影响和关联的机制。 IF 8.282 课题背景 真核生物DNA复制是耗时且非常具有挑战性的过程，DNA复制的正常进行是维持正常细胞活动的基础，所以需要精......阅读全文
蛋白质SUMO化修饰精细调控植物次生细胞壁增厚新机制
1月18日，PLOS Genetics 杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所李来庚研究组题目为SUMO modification of LBD30 by SIZ1 regulates secondary cell wall formation in Arabido
磷酸化多肽及其修饰方法
蛋白质磷酸化是生物界最普遍，也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰，20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中，大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关，如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质
磷酸化多肽及其修饰方法
蛋白质磷酸化是生物界最普遍，也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰，20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中，大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关，如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质
磷酸化多肽及其修饰方法
蛋白质磷酸化是生物界最普遍，也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰，20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中，大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关，如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质及多
浙大张龙教授连发两篇Cell子刊－发现关键信号通路新机制
浙江大学生命科学研究院教授张龙主要从事细胞信号转导及肿瘤细胞转移方向的跨学科研究，近期其研究组接连在Molecular Cell和Cell Host & Microbe上发表文章，发现了YAP/TAZ激活新机制，以及调节固有免疫自激活的重要分子机制。 在第一文章中，研究人员揭示了去泛素化酶OT
2019年云序RNA甲基化修饰领域文章汇总
感恩有你，一路同行！2019年末，云序生物携全体员工对一直以来关心和支持公司发展的广大新老客户致以最诚挚的问候！光阴如梭，一年转瞬又将成为历史，新的一年意味着新的起点、新的机遇、新的挑战，决心再接再厉，更上一层楼。回首即将过去的2019，云序生物不断创新，硕果累累；展望2020，任重道远却信心倍
如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关...(四)
3. 多组学联合运用找靶点：转录组测序甲基化测序，双剑合璧 多个表达谱数据取交集找到靶基因（DOI: 10.1002/hep.29683） 甲基化数据同表达谱数据取交集（http://dx.doi.org/10.1016/j.ccell.2017.02.01）1）云序生物推荐MeRIP-seq测序技
我所基于纳米离子通道器件开发出检测SUMO1蛋白的新方法
原文地址：http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202307/t20230721_6814330.html 近日，我所生物技术研究部生物分离与界面分子机制研究组（1824组）卿光焱研究员团队和生物分子高效分离与表征研究组（1810组）张丽华研究员团队合作，在蛋白质SUM
最新高分文章套路－|－强强联合（脂质组+DIA），IF>10
脂质组学技术 相比其他组学技术，脂质组学技术发展较晚，新颖性高，仅仅只是纯数据分析也可以发表在不错的期刊上。如果希望研究得更高深入，可以往下游脂质功能或者往上游的蛋白或基因出发研究脂代谢调控机制。 【纯组学数据分析发文】 PNAS | 脂质组学揭示病毒感染引起的脂代谢异常及
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脂质组学技术 相比其他组学技术，脂质组学技术发展较晚，新颖性高，仅仅只是纯数据分析也可以发表在不错的期刊上。如果希望研究得更高深入，可以往下游脂质功能或者往上游的蛋白或基因出发研究脂代谢调控机制。 【纯组学数据分析发文】 PNAS | 脂质组学揭示病毒感染引起的脂代谢异常及
多肽磷酸化修饰及检测方法
磷酸化影响着细胞生命的方方面面。在细胞中，大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关，如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质及多肽的研究可以帮助人们阐述上述过程的机理，进一步认识生命活动的本质。肽谷生物依据自身原料优势和技
云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰...2
2. m6A甲基转移酶METTL3的泛素化调节其功能 发表期刊：Nucleic Acids Research影响因子：11.147发表日期：2018.06.01实验方法： m6A-seq，RNA-seq，MeRIP-PCR，RIP等（云序提供） 上海交通大学医学院余健秀组在著名期刊《核酸研究》发
Sumo化蛋白定量试剂盒—小泛素化研究
众所周知，泛素（ubiquitin, Ub）是一类高度保守的小蛋白, 可与靶蛋白的赖氨酸残基共价连接, 形成多聚泛素链行使指导蛋白质降解的功能。类似于泛素化修饰过程, 小泛素相关修饰物(small ubiquitin related modifier, SUMO）也可以共价修饰靶蛋白的赖
蛋白质PEG化修饰与纯化
聚乙二醇具有较广的分子量分布，随着平均分子量的不同，性质也产生差异，当分子量小于1000Da时，聚乙二醇是无色无臭粘稠的液体，高分子量的聚乙二醇则是蜡状白色固体，固体聚乙二醇的熔点正比于分子量，逐渐接近67℃的极限。毒性随分子量的增加而减少，小于400Da的 PEG在体内会经乙醇脱氢酶降解成有毒的代
上海巴斯德所揭示调控流感病毒存活的新机制
7月24日，中国科学院上海巴斯德研究所分子病毒课题组的研究论文Sumoylation of Influenza A Virus Nucleoprotein Is Essential for Intracellular Trafficking and Virus Growth（《A型流感病毒NP
研究揭示NLP1－SUMO化修饰调控硝酸盐信号转导和共生结瘤新机制
硝酸盐是植物吸收利用的主要氮源，也是调控植物的生长发育的重要信号分子。豆科植物不仅能吸收土壤中的氮素，还可通过与根瘤菌共生固氮获取氮营养。但是，共生固氮需要耗费大量植物能量，当土壤氮素较高时，氮会作为信号分子影响共生固氮基因的功能，从而抑制根瘤的形成及固氮能力。此前研究发现，蒺藜苜蓿中RWP-RK类
研究揭示NLP1－SUMO化修饰调控硝酸盐信号转导和共生结瘤新机制
硝酸盐是植物吸收利用的主要氮源，也是调控植物的生长发育的重要信号分子。豆科植物不仅能吸收土壤中的氮素，还可通过与根瘤菌共生固氮获取氮营养。但是，共生固氮需要耗费大量植物能量，当土壤氮素较高时，氮会作为信号分子影响共生固氮基因的功能，从而抑制根瘤的形成及固氮能力。此前研究发现，蒺藜苜蓿中RWP-RK类
NLRP3磷酸化修饰与炎症小体通路激活的调控机制
9月21日，Molecular Cell在线发表了国家生物医学分析中心李涛研究员和周涛研究员合作的题为“NLRP3 phosphorylation is an essential priming event for inflammasome activation”的最新研究成果。该文报道了磷
研究揭示SPF1/2介导WRI1去SUMO化负调控种子油脂合成
油脂不仅是种子储存能量的重要形式，更是人类营养供给与工业生产中不可或缺的关键原料。SUMO修饰作为影响蛋白质功能的关键修饰方式，广泛参与植物生长发育的调控过程。然而，其在种子油脂合成过程中的具体生物学功能尚未明确阐明。中国科学院遗传与发育生物学研究所首次揭示，SUMO蛋白酶SPF1和SPF2通过对油
解析糖基化修饰及位点分析
经常听到糖基化修饰，今天带大家一探究竟。什么是糖基化修饰呢？糖基化是在糖基转移酶的控制下，蛋白质或脂质附加上糖类的过程，发生于内质网和高尔基体。糖基化修饰是一类非常重要的翻译后修饰，大部分膜蛋白和分泌蛋白均为糖蛋白，糖基化修饰不仅影响蛋白质的空间构象、活性、运输和定位，同时在信号转导、分子识别，
中药配方颗粒——附子黄芩配伍分析
用Q Exactive 高分辨质谱对附子单煎组、黄芪单煎组、附子黄芪合煎组、附子黄芪混合的化学成分进行系统分析，以期为黄芪对附子的解毒机理提供物质基础。 利用Compound Discoverer 软件，结合标准中药数据库，共鉴定179 种可能的中药成分，主要为氨基酸、生物碱、黄芪皂苷、黄酮类
百人博士最新Nature子刊文章：泛素化修饰的特殊因子
细胞内蛋白泛素化经由泛素-蛋白酶体途径实现。在这个过程中，一系列酶（E1、E2和E3）调控泛素链组合体，而且当正确的泛素化发生之后，一个冗余的或受损的蛋白就会被蛋白酶体破坏掉，关于泛素链形成的机制尚不是十分清楚。 来自中国科学院动物研究所，美国国立卫生研究院的研究人员近期发现在蛋白质泛素化修饰
使用Azurespot分析软件定量非磷酸化与磷酸化蛋白
在上期我们回顾了使用多重来成像磷酸化蛋白的技巧，在这部分中，我们将介绍使用Azurespot分析软件进行定量。 背景去除 背景扣除对于有效定量是必不可少的。 例如，AzureSpot有五个自动后台选项和三个手动选项。 > 如果背景不均匀，请使用 Rolling Bal
使用Azurespot分析软件定量非磷酸化与磷酸化蛋白
背景去除背景扣除对于有效定量是必不可少的。 例如，AzureSpot有五个自动后台选项和三个手动选项。> 如果背景不均匀，请使用 Rolling Ball。 类似指定半径的圆盘在泳道轮廓下“滚动”，对信号求平均，从而产生平滑小的变化。 半径越大，滚动越平滑。> 如果轮廓的末端与轮廓的其余部分没有
RNA修饰技术在华南农大余义勋组植物m1A－调控机制的运用
RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用，m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表，然而RNA m1A（N1-甲基腺嘌呤）修饰在植物中的研究还非常少。 近日，Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The N1-met
罗元明副研究员：生物质谱与蛋白翻译后修饰研究方法学
2013年12月8日，由首都医科大学附属北京朝阳医院、AB SCIEX公司主办的第四十期质谱沙龙活动在北京朝阳医院顺利举办，来自北京师范大学、北京朝阳医院、中科院微生物所、空军总医院的百余名专家学者齐聚一堂共同参加了此次沙龙活动，分析测试百科
云序高分文章利器：ctDNA（羟）甲基化测序案例分享
新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA（羟）甲基化测序 cfDNA（Cell free DNA）是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段，是一种新型的分子标记物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指来源于肿瘤细胞的cfDNA，是液体活检主
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新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA（羟）甲基化测序 cfDNA（Cell free DNA）是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段，是一种新型的分子标记物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指来源于肿瘤细胞的cfDNA，是液体活检主
云序RNA修饰技术余义勋课题组植物m1A修饰调控机制的运用
导读 RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用，m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表，然而RNA m1A（N1-甲基腺嘌呤）修饰在植物中的研究还非常少。 近日，Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The
NSMB：科学家发现调节基因组复制的代码信号
三年前，来自西班牙国家癌症研究中心的研究者首次对干预细胞重要过程的特殊蛋白进行了描述，该细胞过程即细胞分裂期间遗传物质的复制过程，当时研究者发现，DNA复制的关键基因组区域充满着特殊蛋白的修饰，即为小分子泛素样修饰蛋白（Small ubiquitin-like modifier， SU