中国农大:测序解析miRNA调控害虫发育机制

小菜蛾(Plutella xylostella)是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫,据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼虫中的一组miRNAs,但仍缺乏对小菜蛾完整miRNA的鉴定。为此,来自中国农业大学和美国肯塔基大学的研究人员携手系统完整地鉴定了小菜蛾全部发育阶段的保守和新的 miRNAs2,该研究成果发表在11月刊的PLoS One上。 研究人员首先采用高通量测序技术对小菜蛾的miRNA组进行了全面鉴定(小RNA测序由联川生物承担完成)。实验中构建了小菜蛾(从卵到成虫)的整个发育阶段的混合小RNA文库。通过比对家蚕基因组和miRBase上已报道的miRNAs ,共鉴定出234个miRNAs。当使用小菜蛾的基因组数据作为参考时,可鉴定出3......阅读全文

中国农大:测序解析miRNA调控害虫发育机制

  小菜蛾(Plutella xylostella)是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫,据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼

测序解析miRNA调控害虫发育机制

小菜蛾(Plutella xylostella)是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫,据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼虫中的一组miRNA

四川农大:揭示miRNA调控玉米穗发育机制

  microRNA(miRNAs)是一类内源性的非编码小RNA,在植物的多种生理过程中发挥重要调控作用,包括代谢,激素反应,转座子的表观遗传控制,胁迫应答。在模式植物如水稻和拟南芥中已进行了广泛的miRNA研究。在玉米中,胁迫应答相关miRNA和其靶基因的研究也已开展过很多。然而,关于miRNA参

测序与芯片揭示miRNA调控海参夏眠机制

海参(Apostichopus japonicus),是生活在海边至海底8000米的海洋棘皮动物,以海底藻类和浮游生物为食。当夏季来临,上层海水由于太阳光强烈照射,温度上升。此时,海底的小生物都浮到海面,进行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海参,迫于夏季食物中断,进入夏眠,此时,其基础代谢率明

中国农大PLOS解析脱发分子机制

  今年三月份,中国农业大学生物学院农业生物技术国家重点实验室的于政权博士,与美国宾夕法尼亚大学的研究人员合作,发现了结肠癌的一个新元凶——一种称为 MSI2的蛋白质。他们的研究结果,为结直肠癌的干预治疗提供了新靶点,并增强了我们对于癌症发生、发展复杂性的认识。这项结果发表在国际知名期刊《Natur

中海大:测序与芯片揭示miRNA调控海参夏眠机制

  海参(Apostichopus japonicus),是生活在海边至海底8000米的海洋棘皮动物,以海底藻类和浮游生物为食。当夏季来临,上层海水由于太阳光强烈照射,温度上升。此时,海底的小生物都浮到海面,进行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海参,迫于夏季食物中断,进入夏眠,此时,其基础代谢

喂食microRNA-mimics和inhibitors研究昆虫miRNA调控发育的机制

棉铃虫(Helicoverpa armigera),夜蛾科昆虫的一种,是棉花蕾铃期的重要钻蛀性害虫,主要蛀食蕾、花、铃,也取食嫩叶。MicroRNA是一类非编码小分子RNAs(18-25 nt),其在各种生物进程中发挥着重要的作用,包括发育和基因调控。澳大利亚昆士兰大学研究人员通过人工合成miR

喂食microRNA-mimics和inhibitors研究昆虫miRNA调控发育的机制

  棉铃虫(Helicoverpa armigera),夜蛾科昆虫的一种,是棉花蕾铃期的重要钻蛀性害虫,主要蛀食蕾、花、铃,也取食嫩叶。MicroRNA是一类非编码小分子RNAs(18-25 nt),其在各种生物进程中发挥着重要的作用,包括发育和基因调控。澳大利亚昆士兰大学研究人员通过人工合成miR

华南农大:miRNA调控植物对镉的应激反应

   土壤中的重金属污染是一个世界范围内严重的环境问题,主要是由于一些人为活动,如采矿,工业活动和有机磷的使用等造成。土壤中镉(Cd)可以很容易地被植物吸收,从而导致各种中毒症状,如降低生物量,叶片失绿,抑制根系生长,发生形态学改变,甚至植株死亡。大量研究表明,在植物中,microRNA(miRNA

中国农大:玉米miRNA参与应答氮缺乏

        虽然最近研究表明,miRNA能调节植物对于营养缺乏的适应性应答,但对于miRNA在氮缺乏适应性应答的功能仍需进一步探索。为了阐明玉米中氮传感与信号传导的分子生物学机制,中国农业大学李文学副教授领衔团队联合应用miRNA测序和降解组测序对玉米miRNA在氮缺乏条件下的调控作用展开了系统

Cell揭示miRNA调控新机制

  来自波士顿大学儿童医院及哈佛医学院的研究人员发现,微处理器上游的一个生物合成步骤控制了miR-17∼92表达。这一重要的研究发现发布在8月6日的《细胞》(Cell)杂志上。  MicroRNAs (miRNAs)是一个调控RNA大家族,其主要通过与靶mRNA 3′端非翻译区(3′ UTR)互补配

miRNA调控乳脂合成新机制

乳汁是年幼哺乳动物包括人类的主要营养来源。乳汁的营养价值主要来自脂肪和蛋白质组分。相比于牛奶,山羊奶含有更多的总脂肪,包括更高丰度的有益不饱和脂肪酸。MicroRNAs(miRNAs)是一类含有约22个核苷酸的小RNA,参与各种代谢过程。然而,目前有关miRNA在调控山羊奶成分中的作用知之甚少。西北

上海生科院揭示轴突富集的miRNA调控轴突发育的分子机制

  国际学术期刊Cell Reports 于12月17日在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所鲍岚研究组的最新研究进展:FMRP-Mediated Axonal Delivery of miR-181d Regulates Axon Elongation by Locall

遗传发育所在水稻分蘖角度调控机制解析中取得进展

  分蘖角度是水稻株型的重要决定因素之一,与水稻产量密切相关。培育分蘖角度适中的水稻品种能够有效地提高群体产量;解析水稻分蘖角度的调控机制有助于为水稻株型的遗传改良提供理论指导和基因资源。目前,已经克隆了多个调控水稻分蘖角度形成的关键基因,但对这些基因的调控机制及它们之间的遗传关系仍然缺乏系统深入的

首都医大:miRNA调控大型哺乳动物牙齿发育

  MicroRNA(miRNA)在啮齿类动物牙齿发育过程中扮演着重要的调控角色,但我们对其在大型哺乳类动物的牙齿发育中的作用知之甚少。现在,首都医科大学副校长王松灵教授领衔的团队利用Seq-Array™(芯片与二代测序相结合策略)技术方法鉴定出小型猪在下乳牙发育过程中

张永清PLoS-Genetics解析神经突触发育调控新机制

  神经突触是高度特化的细胞间连接,负责神经元与其靶细胞之间的信息传递。对突触形成和生长发育进行深入研究,不仅有利于阐明大脑发育和功能的分子机制,而且可以加深对相关神经精神疾病发病机制的认识。已知BMP(bone morphogenetic protein:骨形成蛋白)信号通路对多种组织器官包括大脑

遗传发育所解析生长素调控叶片展开的分子机制

  叶片是植物进行光合作用的主要器官。为最大限度提高光合能力,高等植物的叶片进化出了具有极性(即不对称性)的扁平形状。虽然叶片的展开对于高效光合至关重要,人们尚不了解叶片原基如何在发育过程中展开以形成扁平结构。  中国科学院遗传与发育生物学研究所焦雨铃研究组的最新研究发现,植物激素生长素对于叶片原基

Cell揭示重要发育调控机制

  鲁汶大学VIB研究所的Bassem Hassan研究小组发现了从前未知的一种机制,这一机制在物种间高度保守,通过精确地时间控制对大脑发育至关重要的一个蛋白质家族:proneural蛋白的活性调控了神经发生。这一机制——一种简单的可逆的化学修饰对于生成充足数量的神经元、它们的分化及中枢神经系统的发

中国科学家揭示光调控植物发育新机制

  林鸿宣小组的研究成果发表于《自然—细胞生物学》   中科院上海生科院植物生理生态所植物分子遗传国家重点实验室研究员林鸿宣领导的研究组,在水稻重要性状遗传与功能基因研究上又取得重要进展。该研究组通过对水稻耐盐相关基因OsHAL3的功能分析,揭示了光调控植物发育的一个新机制。相关研究论文于6月21

遗传发育所揭示水稻穗茎发育调控机制

  杂交水稻的发明和大规模应用不仅解决了中国人的吃饭问题,对世界减少饥饿也作出了卓越的贡献。杂交水稻的制种过程需要两个亲本材料——雄性不育系和恢复系,然而水稻不育系常常具有“包穗”(即抽穗期穗子被包裹在叶鞘内难以抽出)的特性,为杂交稻制种带来很大困难。研究表明最上部茎节内活性赤霉素水平的降低是导致不

探讨胚胎发育的调控机制

发育生物学是生命科学的前沿领域,在最近几十年里,对发育生物学的某些基础领域有了较为深入的认识。但是发育生物学领域依然存在许多未解的问题,例如,一个单细胞——受精卵细胞是如何发育成复杂的组织、器官、系统乃至完整的有机个体。生命最大的奥秘就是探讨一个受精卵如何发育成复杂的生物体,但是,由于受精卵植入子宫

Nature揭示发育的重要调控机制

  巨噬细胞也被称为清道夫细胞,是机体免疫系统的一个重要部分。在遇到病原体组分或炎症性细胞因子的时候,巨噬细胞会激活并加入对抗病原体的战斗。此外,巨噬细胞还参与了器官和组织发育,具有摧毁肿瘤细胞的能力。  过去人们认为,驻留在组织里的巨噬细胞来自于骨髓前体细胞,通过血液迁移到不同器官。但近年来研究显

水稻胚乳发育调控机制项目启动

农作物种子胚乳中累积的淀粉是人类碳水化合物类营养物质的主要来源,也为食品工业和动物饲料的生产提供初始的原料。水稻胚乳发育和成熟过程的调控对种子中淀粉的含量与组成具有关键的决定作用,直接影响粮食产量以及稻米的食用和加工品质。日前,国家重大科学研究计划在上海启动“植物胚乳发育及储藏物质累积的分

吴立刚研究组研发微量小RNA深度测序技术

   中科院上海生科院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心(上海)吴立刚研究组与上海市计划生育研究所施惠娟研究组合作,优化建立了适用于微量样本的小RNA深度测序文库构建方法,并系统解析了小鼠早期胚胎发育过程中小RNA的动态变化及其生物学功能。相关研究成果日前在线发表于《科学进展》。  目前小

草业花卉所百合团队与中国农大百合团队合作解析百合鳞茎休眠调控机制

  北京市农林科学院草业花卉所张秀海/杜运鹏团队与中国农业大学吴健教授团队合作解析百合鳞茎休眠调控机制方面取得了突破性进展。相关研究论文“Epigenetic silencing of callose synthase forbid VIL1 promotes the bud growth tran

西北农林:发现miRNA调控乳脂合成新机制

   乳汁是年幼哺乳动物包括人类的主要营养来源。乳汁的营养价值主要来自脂肪和蛋白质组分。相比于牛奶,山羊奶含有更多的总脂肪,包括更高丰度的有益不饱和脂肪酸。MicroRNAs(miRNAs)是一类含有约22个核苷酸的小RNA,参与各种代谢过程。然而,目前有关miRNA在调控山羊奶成分中的作用知之甚少

西北农林:发现miRNA调控乳脂合成新机制

  乳汁是年幼哺乳动物包括人类的主要营养来源。乳汁的营养价值主要来自脂肪和蛋白质组分。相比于牛奶,山羊(Capra hircus)奶含有更多的总脂肪,包括更高丰度的有益不饱和脂肪酸。MicroRNAs(miRNAs)是一类含有约22个核苷酸的小RNA,参与各种代谢过程。然而,目前有关miRNA在

Cell:miRNA,调控子的调控

  MicroRNAs是多细胞生物体遗传程序的重要调控者。由于它们具有强大的作用,其自身的生成也受到严密地控制。来自德国马克思•普朗克发育生物学研究所的科学家们在新研究中获得了关键的研究发现。他们在拟南芥(阿拉伯芥,thale cress)中发现了一个调节micro RNAs生成的新元件,通过去

巧用单细胞测序解析生发过程的深层次调控机制(二)

图2 单细胞测序结果tSNE细胞分类结果为进行更加精细的分类,研究人员对由巨噬细胞marker表达的细胞进行了重新分类,共产生7个新的分类亚群。这些巨噬细胞簇显示出相对均一的CD68表达,但相对于经典炎症和抗炎标记物是异质的。其中,Cluster 3主要表达抗炎症marker Mrc2(CD20

巧用单细胞测序解析生发过程的深层次调控机制(一)

单细胞转录组测序是这两年来非常流行的高通量组学研究工具,然而,是不是所有的研究都适合用该方法?是不是所有的问题都可以通过该方法来解释?这是一个值得探讨的问题。从现有的研究报道来说,单细胞转录组学研究很好地解决了细胞图谱,发育过程等重要的生物学问题。但是在相对比较传统的研究方向,是否也能利用单细胞转录