斑马鱼基因敲除是怎么做的

一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息,包括名称ID号等,一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑,设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR,分析其效率及脱靶的情况 一般使用CCTOP,少数物种如没有可找其它专业网站。 二、CRISPR活性验证 2.1 分析并确认基因组序列 设计Genotyping引物,确认实际基因组序列与理论匹配情况,如CRISPR靶点验证与理论序列存在出入,需回到1.4重做。 该步骤还需要确认引物扩增条件,以备后用,如不能正常扩增需要重新设计,并且不能进行下一步操作。 2.2 合成sgRNA 使用Thermo转录试剂盒转录,完成后需测定浓度(不得低于400 ng/μl) 和OD......阅读全文

科研人员利用斑马鱼探究增塑剂DBP的水生态毒理

西北农林科技大学动物科技学院水域生态团队基于前期黄河流域(陕西段)中增塑剂污染情况的调研工作基础,使用斑马鱼探究了典型增塑剂—邻苯二甲酸二丁酯(Dibutyl Phthalate,DBP)的水生态毒理,从mtDNA-cGAS-STING信号通路角度为增塑剂的水生态毒理研究提供了新的视角,近日该研究成

科研人员利用斑马鱼探究增塑剂DBP的水生态毒理

西北农林科技大学动物科技学院水域生态团队基于前期黄河流域(陕西段)中增塑剂污染情况的调研工作基础,使用斑马鱼探究了典型增塑剂—邻苯二甲酸二丁酯(Dibutyl Phthalate,DBP)的水生态毒理,从mtDNA-cGAS-STING信号通路角度为增塑剂的水生态毒理研究提供了新的视角,近日该研究成

2020年我国将绘成斑马鱼全脑介观图谱

“到2020年完成有20万个神经元的斑马鱼全脑介观图谱的绘制。”5月2日,香山科学会议召开“全脑介观神经联接图谱”国际合作计划特别会议,中国科学院外籍院士、中国科学院神经科学研究所所长蒲慕明介绍,中国科学家将从模式动物斑马鱼入手从全脑尺度上解读脑工作原理,利用期间形成的脑科学研究技术,进一步于

斑马鱼雌二醇elisa试剂盒几点操作步骤

斑马鱼雌二醇(E2)elisa试剂盒操作步骤1.标准品的稀释:本试剂盒提供原倍标准品一支,用户可按照下列图表在小试管中进行稀释。80 pmol/L5号标准品150μl的原倍标准品加入150μl标准品稀释液40 pmol/L4号标准品150μl的5号标准品加入150μl标准品稀释液20 pmol/L3

组织靶向性胚胎嵌合体—斑马鱼囊胚细胞移植

真核生物的基因调控比原核生物复杂得多。这是因为这两类生物在三个不同水平上存在着重大的差别:①在遗传物质的分子水平上,真核细胞基因组的DNA含量和基因的总数都远高于原核生物,而且 DNA不是染色体中的唯一成分,DNA和蛋白质以及少量的RNA构成以核小体为基本单位的染色质;②在细胞水平上,真核细胞的染色

斑马鱼行为变化及免疫调节研究新进展

  近日,中国水产科学研究院淡水渔业研究中心生物技术研究室基因中心以斑马鱼为研究对象,在锌离子污染环境下,对斑马鱼行为变化、免疫调节等方面开展研究,并取得新进展。  研究团队评估了雄性斑马鱼(Danio Rerio)在1.0或1.5ppm(mg/L)氯化锌暴露6周后的行为和生理变化。锌暴露导致雄性斑

通过研究斑马鱼来揭示视网膜生物钟活性

昼夜节律和视网膜生物钟人类以及许多其他动物体,睡眠-清醒循环以及其他的生物节律过程是由内源性振荡器-生物钟所调节的。生物钟受一系列基因控制,这些基因的表达因是否有光照所微调,从而使得每日的生物节律适应于日夜循环交替。在哺乳动物的大脑中,生物钟母钟(主要的控制因子)位于下丘脑视交叉上核。然而它并非每日

斑马鱼帮助发现致命性心肌病治疗药物

  最近,研究人员利用斑马鱼模型,确定了一种药物化合物,似乎能逆转致心律失常性心肌病(ACM),这种遗传性疾病,是年轻人猝死的主要原因。由贝斯以色列女执事医疗中心(BIDMC)和布莱根妇女医院的研究人员带领的这项研究,为这种危险疾病的新疗法开发,提供了关键的第一步,而目前这种疾病还没有预防性的治疗方

国内外大型药企追捧斑马鱼新药筛选平台

  可别小看这几厘米长的小不点,斑马鱼基因与人类基因同源性高达85%,信号传导通路基本相似。这意味着在其身上做药物实验所得到的结果在多数情况下也适用于人体。“比如癫痫、关节炎、脂肪肝、癌症等常见人类疾病模型,都可以通过斑马鱼进行新药筛选。”据环特生物科技有限公司负责人介绍,目前斑马鱼可以承

斑马鱼雌二醇elisa试剂盒几点操作步骤

斑马鱼雌二醇(E2)elisa试剂盒操作步骤1.标准品的稀释:本试剂盒提供原倍标准品一支,用户可按照下列图表在小试管中进行稀释。80 pmol/L5号标准品150μl的原倍标准品加入150μl标准品稀释液40 pmol/L4号标准品150μl的5号标准品加入150μl标准品稀释液20 pmol/L3

科学家揭示斑马鱼大脑空间信息表达机制

中国科学院上海微系统与信息技术研究所研究员李孟与德国马克斯普朗克学会生物控制论研究所合作,证实了在斑马鱼幼鱼端脑中存在编码空间的神经元,表明斑马鱼可作为研究空间信息在全脑尺度表达及处理的全新模式动物,为开发类脑空间计算及类脑导航提供了理论基础和生物机理支持。相关研究发表于《自然》。当来到一座陌生的城

专访张博:两篇Nature子刊技术论文开创同源重组新方法

  2011年在我们还不是十分熟悉它的名字的时候,它被评为了当年Nature Methods杂志的年度技术,2012年在这种技术已成功应用于人类体外培养细胞、酵母、线虫、斑马鱼、植物、大小鼠等多个领域之后,它又入选了Science十大科学突破。这就是TALEN (Transcription

无刺鱼有望成现实!华中农大团队找到控制鱼刺基因

   无刺鱼将有望走上餐桌,华中农业大学水产学院高泽霞教授团队找到了控制鱼刺的基因。  2012年开始,高泽霞教授便致力于无刺鱼的研究。2019年年底,团队从斑马鱼身上发现了对调控鱼刺生长起主要作用的主效基因。目前,高泽霞团队和中科院水生所桂建芳院士团队已经分别在鳊鱼、草鱼和银鲫身上试验了敲除调控鱼

海马“脾脏丢失”与“雄性怀孕”演化机制新进展

近日,中科院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室林强研究员团队取得了“基因单个位点敲除导致整个动物器官丢失”的创新性研究进展,揭示了海马基因tlx1的特异性位点突变(tlx1A208T)调控其脾脏丢失的遗传机制,并首次提出海马“脾脏丢失”与“雄性怀孕”协同演化的新观点。德国康斯坦茨大学、基

基因敲除与RNA干扰的关系

20世纪80年代初,胚胎干细胞分离和体外培养的成功为基因敲除奠定了技术基础。1985年,首次证实的哺乳动物细胞中同源重组(homology recombination, HR)的存在为基因敲除奠定了理论基础[2]。为了编辑基因,传统的靶向特定等位基因的同源重组技术被使用,但是,这个方法在当年来说,存

基因敲除技术的原理和方法

1.利用基因同源重组进行基因敲除基因敲除是80年代后半期应用DNA同源重组原理发展起来的。80年代初,胚胎干细胞(ES细胞)分离和体外培养的成功奠定了基因敲除的技术基础。1985年,首次证实的哺乳动物细胞中同源重组的存在奠定了基因敲除的理论基础。到1987年,Thompsson首次建立了完整的ES细

基因敲除小鼠的原理和方法

1.利用基因同源重组进行基因敲除。基因敲除是80年代后半期应用DNA同源重组原理发展起来的。80年代初,胚胎干细胞(ES细胞)分离和体外培养的顺利奠定了基因敲除的技术基础。1985年,首次证实的哺乳动物细胞中同源重组的存在奠定了基因敲除的理论基础。到1987年,Thompsson首次建立了完整的ES

基因敲除的基本功能

基因敲除(knockout)是用含有一定已知序列的DNA片段与受体细胞基因组中序列相同或相近的基因发生同源重组,整合至受体细胞基因组中并得到表达的一种外源DNA导入技术。它是针对某个序列已知但功能未知的序列,改变生物的遗传基因,令特定的基因功能丧失作用,从而使部分功能被屏蔽,并可进一步对生物体造成影

基因敲除的技术和功能简介

基因敲除(knockout)是用含有一定已知序列的DNA片段与受体细胞基因组中序列相同或相近的基因发生同源重组,整合至受体细胞基因组中并得到表达的一种外源DNA导入技术。它是针对某个序列已知但功能未知的序列,改变生物的遗传基因,令特定的基因功能丧失作用,从而使部分功能被屏蔽,并可进一步对生物体造成影

miR1423p调控脊椎动物造血干细胞的形成和分化

过去关于造血发生的研究主要集中在信号和转录因子,然而近期的研究热点主要是包括microRNAs的表观遗传调控。本文研究者发现在斑马鱼和小鼠中,miR-142-3p在造血干细胞(HSCs)中特异性表达。敲除斑马鱼的miR-142a-3p基因导致主动脉-性腺-中肾(AGM)区的HSCs数量降低,同时胸腺

动物所等揭示m6A修饰调控哺乳动物造血干细胞发育的机制

  血液,犹如生命的“河流”,静静地在生物体内流淌,哺育着每一个“细胞”。然而,成体血液的再生与再造,一直是临床恶性血液疾病治疗过程中难以攻克的瓶颈。作为脊椎动物血液的源泉,具有自我更新和多系分化潜能的造血干细胞的体外诱导和扩增,一直是组织器官再造的前沿课题,更是众多恶性血液疾病患者的希望。由于对血

动物所揭示Ncor2调控斑马鱼造血干细胞产生的机制

  造血干细胞是一群维持生命体正常生理功能所必需的多能造血祖细胞,可以发育成各种成熟的血细胞,包括:红细胞、髓系细胞和淋系细胞等。斑马鱼的造血过程分为两个阶段,即:初级造血和次级造血。以前的研究表明转录共抑制因子Ncor2在初级造血中发挥作用,但其对次级造血的影响,尤其是对造血干细胞产生的作用还不清

基因敲除真把整个基因敲掉吗?

一般我们把基因分成两类:编码蛋白的基因不编码蛋白的基因这两类基因的敲除方式有着很大的区别编码蛋白的基因这些基因的功能主要是通过编码区中的三联体密码所编码的蛋白来实现的。基因敲除的最终目的是让这个基因的蛋白产物不能发挥功能,或者蛋白不能表达。整个编码区统统删掉所有的密码都没了,当然就不能翻译出蛋白啦!

被带入太空的斑马鱼如何助力医学研究?一文揭秘

神舟十八号载人飞船从酒泉卫星发射中心发射升空。 一箱斑马鱼也一同进入太空。中国探索以斑马鱼和金鱼藻为研究对象,在轨建立稳定运行的空间自循环水生生态系统。  记者29日走访长期与各类新发与再现传染病打交道的上海市公共卫生临床中心(下称:上海公卫中心),该院饲养了大量斑马鱼用于科学研究。  “对于普通人

使用人类疾病模型生物斑马鱼的高通量成像实验

为什么使用斑马鱼进行筛选? 目前,基于斑马鱼的筛选由于花费,通量和伦理原因作为一种哺乳动物筛选的替代受到欢迎。斑马鱼由于其与人类的高度生物相似性,成为一种有用的药物开发模型。在个体学和器官形成研究中体现了其主要器官系统与人类极其相似,且斑马鱼和人类的相似度高达 70 - 80%。斑马鱼由于其繁殖力强

Cell-Rep:科学家利用斑马鱼成功捕获癌症发生的“窗口”

癌症相关的炎症往往会明显影响癌症的发生和进展,近日,一项刊登在国际杂志Cell Reports上的研究报告中,来自布里斯托大学的科学家们通过对斑马鱼进行研究首次发现,炎性细胞或会利用细胞外基质屏障层的薄弱点或微孔眼来接近皮肤癌细胞;文章中,研究者利用半透明的斑马鱼来模拟多种类型皮肤癌,同时进行活体成

中国科学家用斑马鱼找出人类拉肚子的原因

  在人类疾病研究中,模式动物功不可没,建立人类重大疾病(如肿瘤和心血管疾病等)的动物模型,对分析疾病的发病机制,解答特定人群对某种疾病的易感性,及开发新型药物开发有重要推动作用。尤其是与人类相似的哺乳类动物:小鼠、猪、猴……可是你知道吗,利用斑马鱼也能研究人类疾病!  北京时间7月6日17时,国际

“斑马鱼测试水质及其毒性的用途和方法”-获国家发明ZL

  10月15日获悉,由中国科学院华南植物园陈峰研究员完成的“斑马鱼测试水质及其毒性的用途和方法”获得国家发明ZL授权(ZL号:ZL 201210453903.6)。  对日益恶化的水源污染问题,自来水厂所采取的方式便是加入大量超过标准的氯(漂白粉)来消毒杀菌。加氯虽然能够杀死水中的各种病菌,但它一

脑功能障碍是脑发育缺少“修理工”

  南京医科大学顾爱华副教授通过研究发现,如果脑发育过程中缺少了一种名为OGG1(8-羟基鸟嘌呤DNA糖苷酶)的基因,就会形成脑损伤。这为大脑保护性药物研发及先天性神经系统疾病的诊断提供了新的依据。日前,该项研究获得国家发明ZL授权。   OGG1的作用相当于“修理工”,它能够识别DNA损伤并启动

关于基因敲除技术应用介绍

基因敲除技术主要应用于动物模型的建立,而最成熟的实验动物是小鼠,对于大型哺乳动物的基因敲除模型还处于探索阶段。近年来,牛、羊、猪、猴等大型哺乳动物实现了基因敲除。但由于狗的生殖生理较为特殊,基因敲除狗的培育难度大为增加,狗基因组的定点修饰一直未获成功。针对这一问题,研究团队设计了一个自体移植的策略,