首个核内DNA感受器hnRNPA2B1
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息,包括名称ID号等,一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑,设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR,分析其效率及脱靶的情况 一般使用CCTOP,少数物种如没有可找其它专业网站。 二、CRISPR活性验证 2.1 分析并确认基因组序列 设计Genotyping引物,确认实际基因组序列与理论匹配情况,如CRISPR靶点验证与理论序列存在出入,需回到1.4重做。 该步骤还需要确认引物扩增条件,以备后用,如不能正常扩增需要重新设计,并且不能进行下一步操作。 2.2 合成sgRNA 使用Thermo转录试剂盒转录,完成后需测定浓度(不得低于400 ng/μl) 和OD......阅读全文
Cell重要发现:揭示基因表达调控新层面
在几乎每个人类细胞的内部都有着一个直径为6微米(大约是人类头发宽度的1/300)的细胞核,细胞核中填满了大约3米长的DNA。DNA被紧密压缩装在细胞核内,其必须要接近细胞的转录机器才能充当指令引导所有的细胞过程。长期以来科学家们都认为DNA的包装方式影响了基因表达。现在,Whitehead研究所
激素核受体
中文名称激素核受体英文名称hormone nuclear receptor定 义细胞核内激素作用的靶分子。多为反式作用因子,当与相应的激素结合后,能与DNA的顺式作用元件结合,调节基因转录。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),激素与维生素(二级学科)
核转录分析
实验材料 cDNA0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA试剂、试剂盒 PBS NP-40 裂解缓: 20XSSC LNaOH 甘油储存缓冲液 10X 转录缓冲液 核苷酸:ATPGTPCTP 200uCi「α32P]-UTP 10XSET 蛋占酶 K 无 RNase 的 DNase
原核表达
基因克隆技术 实验方法原理 一个完整的表达系统通常包括配套的表达载体和表达菌株。如果是特殊的诱导表达还包括诱导剂,如果是融合表达还包括纯化系统或者Tag检测
核转录分析
实验材料 cDNA 0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA 试剂、试剂盒 PBS
原核表达
将克隆化基因插入合适载体后导入大肠杆菌用于表达大量蛋白质的方法一般称为原核表达。这种方法在蛋白纯化、定位及功能分析等方面都有应用。大肠杆菌用于表达重组蛋白有以下特点:易于生长和控制;用于细菌培养的材料不及哺乳动物细胞系统的材料昂贵;有各种各样的大肠杆菌菌株及与之匹配的具各种特性的质粒可供选择
真核转染
一些真核蛋白在原核宿主细胞中的表达不但行之有效而且成本低廉,然而许多在细菌中合成的真核蛋白或因折叠方式不正确,或因折叠效率低下,结果使得蛋白活性低或无活性。不仅如此,真核生物蛋白的活性往往需要翻译后加工,例如二硫键的精确形成、糖基化、磷酸化、寡聚体的形成或者由特异性蛋白酶进行的裂解等等,而
核因子κB
外文名NF-κB包 括5个亚单位定 义一个转录因子蛋白家族核因子κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)蛋白最早由David Baltimore发现,该蛋白家族可以选择性的结合在B细胞κ-轻链增强子上调控许多基因的表达。在几乎所有的动物细胞中都能发现NF-κB,它
眼病的再生疗法-光感受器是视网膜中的特殊神经细胞
美国研究人员14日在《自然》杂志线上版发表论文称,他们首次将哺乳动物视网膜中的Müller胶质细胞转变为杆状光感受器,成功逆转了小鼠的先天性失明。他们称,这一研究成果将推动年龄相关黄斑变性等眼病的再生疗法研究。 光感受器是视网膜中的一类特殊神经细胞,受到光刺激时会向大脑发出信号。在包括小鼠
肠道菌群调节血压新机制竟是从肾脏中“异常”感受器诞生
维持血压的平衡是一个复杂的构成,它由多种不同的机制共同控制。在前面我们发现:高盐饮食、高血压和肠道菌群之间有着紧密的联系。 1篇Science、2篇Nature:肠道菌群一日3篇重磅研究,都说了啥? 而在最近,研究人员发现了肠道菌群和高血压之间还有这另外的联系:这种联系说出来你可能难以置信,
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定1
㈣ DNA聚合酶 如前所述,选用合适的DNA聚合酶进行测序反应也是保证测序质量的重要因素之一。常用于双脱氧末端终止法测序的有几种不同的酶: 1.大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow片段) 此酶是最早用于建立Sanger测序的酶。但通常会有两个问题:①Klenow片段的持续合成能力较
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定2
目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法(双脱氧链终止法)和Maxam(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都同样生成相互独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组核苷酸都有共同的起点,却随机终止于一种(或多种)特定的残基,形成一系列以某一特定核苷酸
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定3
2.利用末端转移酶和α-32P-ddNTP标记DNA的3ˊ-末端 在二价阳离子存在下,末端转移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羟基末端,如果作为底物的核苷酸经过修饰(如ddNTP),则可以在DNA的3ˊ-OH上仅加入一个核苷酸。对于双链DNA片段,亦存在DNA的两侧均被标记问题,可通过上述同
牟昀博士Nature发表里程碑成果:世界首个蛋白质DNA生物材料
能够定制设计出诸如蛋白质和DNA一类的生物材料,为研究人员开辟了几十年前难以想象的技术可能性。例如,由DNA构成的合成结构有朝一日能够用于将癌症药物直接传递到肿瘤细胞中,及可以设计出定制蛋白来特异地攻击某类病毒。 尽管研究人员已经成功制造出了由DNA或蛋白质单独构成的这样的结构,近期加州理工学
显微镜下的生物艺术-你本来就很美二
4. Rising Sun(旭日)(左) 红色染料标记神经干细胞的球状簇,蓝色染料用于标记细胞核最常见蛋白。(右)艺术家使用机载贴花纱、欧根纱、网和珠子制作的织物图像。5. Visibly Complex(复杂视觉)(左)Nomarski optics检测小鼠视网膜的截面,揭示了组织的结构。黑色为色
原核和真核生物mRNA不同的特点
①原核生物mRNA常以多顺反子(见)的形式存在,即一条mRNA链编码几种功能相关联的蛋白质。真核生物mRNA一般以单顺反子的形式存在,即一种mRNA只编码一种蛋白质。 ②原核生物mRNA的转录与翻译一般是偶联的,即转录尚未完毕,蛋白质的转译合成就已开始真核生物转录的mRNA前体则需经后加工,加
抗核抗体(ANA)与抗核抗体谱
弥漫性结缔组织病(多属于自身免疫病)的一个重要特点是血清中出现自身抗体,其中最常见且与疾病关系最密切的是抗核抗体(ANA)。ANA包含一组自身抗体,无种属和器官特异性,见于多种疾病,缺乏特异性。在自身免疫性疾病中,细胞核常成为自身免疫反应的靶子。ANA主要是指对核内成分所产生的抗体,此外也包括对
抗核抗体(ANA)或抗核因子(ANF)简介
抗核抗体(ANA)是最常出现于自身免疫性风湿病(结缔组织病)患者血清中的一组自身抗体的总称,其靶抗原为真核细胞的核成分,但也包括某些细胞质和细胞骨架成分。核染色质中的抗原有DNA、组蛋白、高活动组(highmobilitygroup,HMG)蛋白、DNA拓朴异构酶-1、增殖细胞核抗原(PCNA/
核相仪的核相使用条件及方法
电力系统核对相位是经常性的工作。传统的定相方法多数采用电压互感器或高压验电器。这些方法前者设备笨重,后者依靠微弱的辉光指示容易出现误判断。核相仪使高压定相这项危险性较大的而又必不可少的工作安全可靠,指针显示一目了然,重量只有互感器的1/10-1/20、携带方便。当两个或两个以上的电源,有下列情况之一
新视网膜细胞图助力精确治疗致盲疾病
美国国家眼科研究所(NEI)的科学家利用人工智能(AI)分析了单细胞分辨率的视网膜色素上皮(RPE)图像,创建了一个定位眼睛内每个亚群的参考地图,最终发现了RPE的5个亚群——一层滋养和支持视网膜感光器的组织。新发现将帮助科学家为特定的退行性眼病开发更精确的细胞和基因疗法。相关研究报告发表在近日
DNA重组技术(DNA-Recombination)
一、DNA 的酶切与连接(1)酶切反应:同质粒DNA 的鉴定,只不过是质粒DNA 换为载体DNA 。若大量酶切,则成比例增加。(2)加2倍体积的预冷无水乙醇和1/10体积的3mol/l NaAc混匀,-20℃2h以上。(3)15000rpm离心15min,弃上清。(4)加入75%乙醇洗涤2次,离心弃
Cell:新发现!哪类基因让你感知寒冷
走在寒冬的大街上已被冻得瑟瑟发抖的你,最想做的事可能莫过于“赶快钻进一个暖烘烘的屋里,再喝上一杯暖暖的热饮…” 显而易见,在脱离舒适温度的寒冷刺激环境下,选择“趋利避害” 是人与生俱来的一种自我保护机制。那么,人体到底是如何感知寒冷刺激的? 8月29日的《Cell》杂志刊登了美国密歇根大学的研
哺乳动物基因组三维结构首次确定
英国医学研究理事会网站日前报道称,英国科学家从单个细胞中确定出完整保存的哺乳动物基因组的首个3D结构,显示了细胞核内所有染色体中的DNA是如何复杂地折叠在一起的。该项研究成果发表在近日出版的《自然》杂志上。 很多人对于呈现“X”形状的染色体十分熟悉,但事实上,染色体仅在细胞分裂时呈现这种形态。
哺乳动物基因组三维结构首次确定
英国医学研究理事会网站日前报道称,英国科学家从单个细胞中确定出完整保存的哺乳动物基因组的首个3D结构,显示了细胞核内所有染色体中的DNA是如何复杂地折叠在一起的。该项研究成果发表在近日出版的《自然》杂志上。 很多人对于呈现“X”形状的染色体十分熟悉,但事实上,染色体仅在细胞分裂时呈现这种形态。
显微镜下的生物艺术-你本来就很美
1. Fire In Her Eyes(她眼中的火焰)(左)斑马鱼视网膜的部分显示。红色羽毛状细胞是光感受器,细胞核被标记为蓝色。(右)红色的面料加上用手工缝制的用来表示细胞核的亮片,是由手工艺术家描绘创作的光感受器。2. Guts and glory(胆量和荣耀)(左)单个绒毛的横截面,具有绿色标
关于琼脂糖凝胶块中DNA的限制性内切酶消化的简介
1.应使用消毒溶液及戴无菌手套以免DNA降解。 2.在Falcon试管中用1×TE溶液漂洗凝胶块20min 3次,以去除EDTA。 3.混合:酶反应缓冲液(高、中或低盐缓冲液),100mmol/L亚精胺(只用于高盐缓冲液状态),10~20单位的内切酶。20单位的内切酶就足以过夜完全消化10μ
谭蔚泓课题组:开发出能直接工作于细胞内的DNA分子机器
日前,由我校化学生物传感与计量学国家重点实验室、化学化工学院和生物学院共同建设的“分子科学与生物医学实验室(MBL实验室)”谭蔚泓教授研究团队,开发出一种能直接在细胞内工作的三维DNA分子信号放大器。 相关研究成果以“mRNA-Initiated, Three-Dimensional DNA
按DNA量身定做的护肤品问世-12周内可减少30%细纹及皱纹
最近,英国伦敦帝国学院教授克里斯·图马佐把他发明的微芯片基因快速测序仪用到了新领域——按每个人的DNA来定做护肤乳清,这或许将成为抗老化的最佳美容品。 据英国每日电讯网站11月30日报道,这种护肤乳清叫做Geneu,经18个月的临床实验证明,它能在12周内减少细纹和皱纹达30%。这也是科学家
cccDNA:慢性乙肝持续感染的元凶
慢性乙型病毒性肝炎影响着全球超过 2.5 亿人口,每年约有 65 万人死于 HBV 相关终末期肝病。共价闭合环状(ccc)DNA 是慢性乙肝持续感染的元凶,作为病毒复制的中介,其在宿主肝细胞核内以微染色体的形式存在,目前的治疗手段难以将其彻底清除,从而达到慢性乙肝的彻底治愈。 Gut 杂志上发
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组的载体2
二、噬菌体载体作为细菌寄生物的噬菌体,大多数具有编码多种蛋白质的基因,能利用宿主细胞的蛋白质合成体系,进行生长和增殖。构建的噬菌体载体,以λ噬菌体、M13和粘粒最为常用。㈠ λ噬菌体载体野生型λDNA是一种基因组为4.8 kb的线性双链DNA,全部序列已知,共编码50多个基因。其中约一半基因参与