SNP位点的选择原则
1,如果是检测基因的所有已知的SNP,那么首先要去了解并查询到这些SNP位点,SNP位点可以通过查询dbSNP数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)和TSC(The SNP Consortium)数据库(http://snp.cshl.org/),可以获知基因及上下游邻近序列的SNP位点。2,至于挑选的原则,可以介绍一下Hap Map的正规化标准:SNP Selection CriteriaCategory 1 "verified"This contains all SNPs for which we have allele frequency or genotyping data. This includes SNPs from the TSC allele frequency project, as well as SNPs characterized by J......阅读全文
细胞化学词汇加帽位点
中文名称:加帽位点英文名称:cap site定 义:mRNA中加帽结构的部位,该位点在前体mRNA的5'端。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
细胞化学词汇进入位点
中文名称:进入位点英文名称:entry site定 义:特指氨酰tRNA进入核糖体的部位。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
土壤现状监测点位如何选择
根据土壤导则要求污染影响型建设项目,二级要求监测柱状样和表层样,三级要求监测表层样。如果建设项目场地已经硬底化,该如何如何选取监测点?是需要把已经硬底化的场地破坏还是另外选取监测点? 根据建设项目实际情况,如果项目场地已经做了防腐防渗(包括硬化)处理无法取样,可不取样监测,但需要详细说明
位点专一诱变的概念
中文名称位点专一诱变英文名称site-specific mutagenesis;site-directed mutagenesis定 义使DNA分子中某一特定的核苷酸序列发生改变。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
无嘌呤嘧啶位点的概念
所有细胞中都带有不同细胞类型,能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。
位点专一诱变的定义
中文名称位点专一诱变英文名称site-specific mutagenesis;site-directed mutagenesis定 义使DNA分子中某一特定的核苷酸序列发生改变。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
什么是位点专一诱变?
中文名称位点专一诱变英文名称site-specific mutagenesis;site-directed mutagenesis定 义使DNA分子中某一特定的核苷酸序列发生改变。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
大脑RNA编辑位点“辞典”发布
美国西奈山伊坎医学院研究人员对大脑中的数千个位点进行了编目,在这些位点中,RNA在整个人类生命周期中被修饰,这个过程被称为腺苷到肌苷(A-to-I)编辑,其为理解大脑发育的细胞和分子机制以及它们如何影响健康和疾病提供了重要的新途径。在《细胞报告》上发表的论文中,研究团队描述了大脑中RNA编辑的速率如
位点专一诱变的定义
中文名称位点专一诱变英文名称site-specific mutagenesis;site-directed mutagenesis定 义使DNA分子中某一特定的核苷酸序列发生改变。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
土壤现状监测点位如何选择
根据土壤导则要求污染影响型建设项目,二级要求监测柱状样和表层样,三级要求监测表层样。如果建设项目场地已经硬底化,该如何如何选取监测点?是需要把已经硬底化的场地破坏还是另外选取监测点? 根据建设项目实际情况,如果项目场地已经做了防腐防渗(包括硬化)处理无法取样,可不取样监测,但需要详细说明
无嘌呤嘧啶位点的定义
所有细胞中都带有不同细胞类型,能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。
序列标签位点图的定义
中文名称序列标签位点图英文名称sequence tagged site map定 义标明序列标签位点在基因组上位置的物理图。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
细胞化学词汇无碱基位点
中文名称:无碱基位点英文名称:abasic site定 义:核酸中失去碱基的部位。该部位碱基失去后,产生一个醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
转录因子定义和结合位点
定义人类金属巯基因调节区转录因子(transcription factor)是一群能与基因5`端上游特定序列专一性结合,从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子。结合位点转录因子的结合位点(transcription factor binding site,TFBS)是转录因子
酶的活性位点的定义
酶的活性位点通常是蛋白质表面一个能够让底物结合和嵌入的凹陷或裂隙,底物通常通过不同的相互反应结合位点上与现存的氨基酸结合,如:氢键、离子键、范德华力相互作用或偶极-偶极相互作用。例如,底物可能通过氢键结合在丝氨酸残基上,也可通过离子键结合在天冬氨酸残基上,或通过范德华力结合在苯丙氨酸残基上。这些结合
如何寻找转录起始位点
一、引物延伸分析(primer extension analysis) 引物延伸分析用于定量mRNA的量,测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端, 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域,随后用RNA作为模板,用反转录酶延伸引物得到cDNA,
如何寻找转录起始位点?
一、引物延伸分析(primer extension analysis)引物延伸分析用于定量mRNA的量,测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端, 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域,随后用RNA作为模板,用反转录酶延伸引物得到cDNA,用变
为什么蛋白质保守丝氨酸位点是其磷酸化位点
磷酸化位点一般有丝氨酸,苏氨酸,酪氨酸。其中,丝氨酸和苏氨酸是最常见的磷酸化位点,因为其结构末端含有羟基,羟基很活泼,可以与磷酸基团结合。磷酸化的过程就是传递磷酸基团。所以说,蛋白质中如果某个丝氨酸很保守的话,很大程度上就是磷酸化位点。
为什么蛋白质保守丝氨酸位点是其磷酸化位点
磷酸化位点一般有丝氨酸,苏氨酸,酪氨酸。其中,丝氨酸和苏氨酸是最常见的磷酸化位点,因为其结构末端含有羟基,羟基很活泼,可以与磷酸基团结合。磷酸化的过程就是传递磷酸基团。所以说,蛋白质中如果某个丝氨酸很保守的话,很大程度上就是磷酸化位点。
SNP-的检测方法
SNP 的分型技术可分为两个时代,一为凝胶时代,二为高通量时代。凝胶时代的主要技术和方法包括限制性酶切片段长度多态性分析(RFLP)、寡核苷酸连接分析(OLA)、等位基因特异聚合酶链反应分析(AS2PCR)、单链构象多态性分析(SSCP)、变性梯度凝胶电泳分析(DGGE),虽然这些技术与高通量时代的
qPCR-Protocol-for-SNP-Genotyping
实验概要Platinum® qPCR SuperMix for SNP Genotyping is a ready-to-use reaction mix for the amplification and identification of single-nucleotide polymorp
SNP检测技术对比
1. SNP检测方法分类1.1. 根据检测原理分类根据检测原理进行分类,目前来说,基于杂交原理的检测方法应用更为广泛。1.2. 根据检测通量分类根据检测通量进行分类,可以分为高通量、中通量和低通量方法。目前中通量方法和高通量总的基因芯片法(包括beadschip)应用更为广泛。除此之外,基于Ta
治癌症不可忽视-非肿瘤位点
瑞典卡罗琳医学院和中国研究人员日前发布最新研究成果,揭示了肿瘤如何对身体多个器官功能造成系统性影响,表明治疗癌症不能只关注抑制肿瘤本身的生长,还需针对其他器官的症状进行综合治疗。 这一成果发表在美国期刊《细胞报告》上。研究小组成员、瑞典卡罗琳医学院华人教授曹义海10日接受新华社记者采访时说,这
核酶切割-RNA-专一位点
核酶切割 RNA 专一位点 实验材料 合成的核酶分子 切割底物RNA 试剂、试剂盒
多克隆位点的常见载体
常见的基因工程载体都具有多克隆位点,有些载体,如λEMBL4、Charon40等甚至有两个。
宁夏设341个土壤风险点位
《宁夏重点区域土壤环境质量监测风险点位布设申请方案》近日通过中国环境监测总站技术审核,标志着宁夏初步完成土壤环境质量监测风险点位的布设工作。 据了解,2016年环保部印发《关于开展重点区域土壤环境质量监测风险点位布设工作的通知》。根据相关要求,宁夏以重点防控重金属污染为主线,共选择污染行业企业
DNA-酶-I-超敏感位点作图
实验材料 真核细胞 试剂、试剂盒 缓冲液 A EDTA 乙醇 裂解缓冲液
DNA-酶-I-超敏感位点作图
DNA 酶 I 超敏感位点作图法经常用于定位真核基因的调控区。由于还未被理解的原因,基因带有对 DNA 酶 I 切割敏感的分开的序列,而且这些所谓超敏感位点图谱是随基因的激活状态而变化的(Weintrauband Gmudine1976)。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J.
染色体整合位点的概念
中文名称染色体整合位点英文名称chromosomal integration site定 义染色体上能接纳外源遗传物质的位点。应用学科遗传学(一级学科),细胞遗传学(二级学科)
核糖体结合位点生物合成
抗体是由核糖体合成细胞内定位核糖体的功能就是将mRNA上的遗传密码(核苷酸顺序)翻译成多肽链上的氨基酸顺序。因此,它是肽链的装配机,即细胞内蛋白质合成的场所,细胞合成的蛋白质可分为两类:外输性蛋白和内源性蛋白。1.外输性蛋白:主要在固着核糖体上合成,分泌到细胞外发挥作用,如抗体蛋白、蛋白类激素、酶原