circRNA再发IF=18.88高分文章circRNA机制研究汇总

超强子调控circRNA-Nfix缺失诱导成年小鼠心肌梗死后再生 circRNAs正在成为心脏发育和疾病强有力的调节因子,但其在心脏再生中的作用仍然未知。鉴于此,作者与他的团队探究了与超增强子(SEs)相关的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生过程中的功能,并探究了其调节心脏重塑的分子机制,并于2019年4月5日,将该成果发表在了circulation杂志(IF=18.88)中。在本研究中,作者首先利用生物信息学分析RNA测序数据并结合SE目录,识别与SE相关的circRNAs,并利用qPCR和原位杂交技术检测发现发现circNfix在人类、大鼠和小鼠的成年心脏中过表达。然后通过在心肌梗死(MI)后心肌细胞(CM)中干扰或过表达circNfix,探究其对细胞增殖和心肌修复过程中的作用,并发现下调circNfix能够促进心肌梗死后CM增殖和血管生成,并抑制CM凋亡,减轻心功能障碍,改善预后效果。最后作者利用染色质免疫沉淀......阅读全文

circRNA促进口腔鳞状细胞癌的发生发展

中南大学湘雅二医院陈林老师长期从事口腔癌的发生发展机制及治疗。近期,其实验室通过Arraystar circRNA芯片发现一种调控口腔鳞状细胞癌发生发展的circRNA分子—circRNA_100290。CircRNA_100290通过内源竞争结合miR-29,从而解除miR-29对CDK6的抑

环状RNA(circRNA)主要有哪些类型

目前发现的circRNA主要来源于基因外显子,但多项研究也表明circRNA的类型比想象的要复杂,可以来自基因组上多种基因结构。 同一基因位置可以产生不同类型的环状RNA

中国科学院动物所团队综述环形RNA药物设计

环形 RNA(circular RNA,circRNA)是一类广泛存在于真核细胞中的内源性非编码 RNA 分子,在生物体发育过程中发挥着重要作用。其独特的环状结构使其免受外切酶降解,因此比线性 RNA 更加稳定。自 2010 年代初以来,circRNA 在 RNA 适配体、 guide RNA 等领

全转录组测序的“一箭三雕”:circRNA,lncRNA,mRNA

1. 文章主题:环状RNA通过靶向miRNA调控的信号传导促进结直肠癌的转移发表期刊:Journal of pathology影响因子:5.942发表时间:201906实验方法:全转录组测序实验样本:结直肠癌组织肝转移是结直肠癌(CRC)患者的主要死亡原因。作者使用全转录组测序在CRC肝转移的小鼠模

研究人员揭示环状RNA或可成为阿尔兹海默症的临床新指标

  2019年10月7日,来自美国华盛顿大学医学院的Carlos Cruchaga教授研究团队在Nature Neuroscience上在线发表题为“An atlas of cortical circular RNA expression in Alzheimer disease brains de

云序超微量MeRIP测序技术在m6A甲基化文章发表的应用2

3) m6A修饰与基因表达联合分析通过m6A-MeRIP-seq和RNA-seq联合分析,文章展示了m6A修饰水平与基因表达水平间的关系,统计发现表达高的基因分组中,受m6A修饰的基因比例也更高。4)甲基化相关酶的表达通过qPCR检测了两组样品中6个甲基化相关酶的表达,发现在高度近视白内障患者中甲基

一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...1

一次RNA甲基化测序的多项成果-云序RNA甲基化测序技术大公开文章导读RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼,而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac

云序环状RNA研究策略在环状RNA研究的应用(一)

环状RNA作为新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中,“环状RNA作为癌症新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,其中大

云序环状RNA研究策略在环状RNA研究的应用(二)

4.对年龄相关性白内障circRNA的分析显示,circZNF292可以通过海绵机制调节miR-23b-3p功能发表期刊:Aging-us影响因子:4.831发表时间:2020.9.10研究方法:全转录组测序、qRT-PCR、RIP、RNA pull down、双荧光素酶实验等云序提供文章链接:Pr

环状RNA结合功能蛋白

环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转录前

外泌体circRNA-PDE8A促进胰腺导管癌细胞侵袭研究

第三军医大学西南医院李晓武教授团队长期从事肝胆外科研究,近期,其实验室对利用Arraystar circRNA芯片研究发现了在胰腺导管癌细胞中高表达的circ-PDE8A可以通过miR-338调控MACC/MET/ERK通路,促进癌细胞侵袭。进一步研究发现,病人血浆外泌体中circ-PDE8A显著高

2020年环状RNA高分文章怎么发?

  环状RNA作为最新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中,“环状RNA作为癌症新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,

影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析

  云序客户发表首篇直肠癌转移肝癌环状RNA文章,影响因子高达7.8分!​   文章导读:   在非编码RNA的大家族中,环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环,所以在生物体中具有稳定性高,不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控m

环状RNA研究深度剖析(二)

目标circRNA的机制研究 a RIP-qPCR:挑选功能最为明显的1个circRNA做RIP-qPCR实验,检测circRNA是否与AGO2蛋白结合。(AGO2是circRNA发挥海绵作用的指示蛋白) b RNA pull down:对上述circRNA进行RNA pull down实验,拉

伯豪客户《EMBO-reports》上阐述circRNA在膀胱癌中的作用机制

  研究背景   膀胱癌(Bladder cancer)是一种常见的泌尿系统肿瘤,由于易转移,死亡率高,5年生存率只有8.1%。因此,研究膀胱癌的发病机制,有助于对膀胱癌的诊断和治疗。circRNA是一类具有闭合环形结构的非编码RNA,是现阶段转录组学研究的新星。本研究从circRNA的角度出发,

5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分

2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台,也是客户发表文章最多的RNA甲基化测

Nat-Neurosci-∣-环状RNA或可成为阿尔兹海默症的临床新指标

  阿尔茨海默症(Alzheimer’s disease,AD)是世界卫生组织公认的全球公共卫生重点。AD是一种由多种原因引起的、不可逆转的神经退行性疾病,是痴呆中最常见的一种类型,主要表现为进行性记忆丧失、认知功能障碍、注意力散漫、情感障碍、人格变化等特点,在疾病的最后阶段,患者表现为卧床不起,需

环状RNA通过与蛋白PDK1和Akt互作促进心肌修复

作者所在课题组主要从事microRNA和circRNA在心脏疾病发生发展过程中的分子机制研究。近期,其实验室用Arraystar circRNA芯片对不同年龄段的心肌病组织样本进行筛查,发现在新生儿心肌病组织中高表达的circ-Amotl1通过与蛋白PDK1和Akt的互作在心肌修复过程中发挥积极作用

环状RNA结合功能蛋白!找对方向20分文章水到渠成

  环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转

影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析

文章导读:在非编码RNA的大家族中,环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环,所以在生物体中具有稳定性高,不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控miRNA和靶基因参与海绵机制,现已有多篇文章报道该机制在疾病的发生发展过程中起至关重要的作

非编码RNA(ncRNA)在前列腺癌发生发展中的作用机制

  人类基因组计划的研究结果显示, 仅有2.5万~3万个蛋白质编码基因, 占总基因组序列不到3%, 其余基因组序列转录产生的RNA都是非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA). ncRNA与恶性肿瘤发生发展关系密切. 近年来, 关于ncRNA中的长链非编码RN(lncRNA)以及环

circRNA研究揭示矽肺炎症和肺纤维化的干预靶点

东南大学医学院巢杰教授课题组主要研究方向为肺炎和肺纤维化的机理机制的研究。该课题组利用Arraystar CircRNA芯片研究发现circRNA circHECTD1通过HECTD1/ZC3H12A依赖的泛素化介导SiO2诱导的矽肺中巨噬细胞活化,释放相关炎性因子和纤维化因子,继而影响矽肺纤维化的

circRNA研究揭示矽肺炎症和肺纤维化的干预靶点

   东南大学医学院巢杰教授课题组主要研究方向为肺炎和肺纤维化的机理机制的研究。该课题组利用Arraystar CircRNA芯片研究发现circRNA circHECTD1通过HECTD1/ZC3H12A依赖的泛素化介导SiO2诱导的矽肺中巨噬细胞活化,释放相关炎性因子和纤维化因子,继而影响矽肺纤

circRNA研究揭示矽肺炎症和肺纤维化的干预靶点

   东南大学医学院巢杰教授课题组主要研究方向为肺炎和肺纤维化的机理机制的研究。该课题组利用Arraystar CircRNA芯片研究发现circRNA circHECTD1通过HECTD1/ZC3H12A依赖的泛素化介导SiO2诱导的矽肺中巨噬细胞活化,释放相关炎性因子和纤维化因子,继而影响矽肺纤

CircRNA422通过SP7/LRP5轴促进骨髓间充质干细胞早期成骨分化

  环状RNA(CircRNAs)在干细胞的增殖、自我更新和成骨分化等生物学活动中发挥重要作用。与其他线性RNA相比,CircRNA由于其共价封闭结构,在细胞和组织中具有高度的稳定性和独特的构象。  目前,研究最多的是线性RNA(miR-21、antimR-138或siMIR31HG),它们被组装在

雄激素受体通过上调ADAR1抑制circRNA表达,促进肝细胞癌

浙江大学医学院附属邵逸夫医院蔡秀军教授在腹部外科、肝胆胰外科、微创外科、移植外科等研究方面有丰富的经验,近期其团队利用Arraystar circRNA芯片研究了肝细胞癌(HCC)中雄激素受体(AR)对circRNA表达的影响。研究发现AR可以结合到RNA编辑酶ADAR1的启动子区上调ADAR1

环状RNA研究文章汇总(一)

环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达20

环状RNA研究文章汇总(二)

4.世界首篇人胶质瘤环状RNA研究(影响因子:3.0)胶质瘤作为最常见的颅内恶性肿瘤占颅脑肿瘤的40%~50%,电磁辐射等其他环境致癌因素会导致胶质瘤的发生,尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤治疗手段,但是多形性胶质母细胞瘤(GBM)的强侵袭、增殖能力仍给病人的治疗造成很大的

影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析

  在非编码RNA的大家族中,环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环,所以在生物体中具有稳定性高,不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控miRNA和靶基因参与海绵机制,现已有多篇文章报道该机制在疾病的发生发展过程中起至关重要的作用。另

雄激素受体通过上调ADAR1抑制circRNA表达,促进肝细胞癌

浙江大学医学院附属邵逸夫医院蔡秀军教授在腹部外科、肝胆胰外科、微创外科、移植外科等研究方面有丰富的经验,近期其团队利用Arraystar circRNA芯片研究了肝细胞癌(HCC)中雄激素受体(AR)对circRNA表达的影响。研究发现AR可以结合到RNA编辑酶ADAR1的启动子区上调ADAR1 p