环状RNA通过与蛋白PDK1和Akt互作促进心肌修复

作者所在课题组主要从事microRNA和circRNA在心脏疾病发生发展过程中的分子机制研究。近期,其实验室用Arraystar circRNA芯片对不同年龄段的心肌病组织样本进行筛查,发现在新生儿心肌病组织中高表达的circ-Amotl1通过与蛋白PDK1和Akt的互作在心肌修复过程中发挥积极作用。该文章发表在国际期刊Theranostics上(影响因子8.712)。(芯片实验由康成生物提供技术服务)研究背景: 据WHO统计,缺血性心脏病是导致死亡的主要原因之一。虽然心肌在梗死后具有一定的再生能力,但这有限的重塑性通常是不够的。心肌损伤可诱导心肌细胞和心肌成纤维细胞衰老和死亡。死细胞逐渐取代纤维瘢痕,扰乱正常的心室结构和功能。至关重要的是,心肌的年龄增长或衰老降低了其重塑再生的能力,这又进一步加剧了心血管疾病和损伤的风险。理解心脏重塑和心衰老的分子基础,对于这个严重的疾病的治疗和发展十分关键。 Akt在细胞......阅读全文

环状RNA通过与蛋白PDK1和Akt互作促进心肌修复

作者所在课题组主要从事microRNA和circRNA在心脏疾病发生发展过程中的分子机制研究。近期,其实验室用Arraystar circRNA芯片对不同年龄段的心肌病组织样本进行筛查,发现在新生儿心肌病组织中高表达的circ-Amotl1通过与蛋白PDK1和Akt的互作在心肌修复过程中发挥积极作用

Cell-Research:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,比

怎么理解蛋白与核酸的互作

如果是相互作用的话。我的理解是,核酸是细胞内携带遗传信息的物质。在生物蛋白质的合成中占有重要的作用。这就是为什么我们吃了猪肉没有长成猪,而是合成了自己的蛋白质。

Cell子刊:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

   RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,

2017年不能错过的长非编码RNA研究推荐

  2017年即将过去,这一年的非编码RNA研究取得了很多重磅级成果。与早先的主要是在不同类型的疾病(癌症)中大规模鉴定非编码RNA,今年的研究是对非编码RNA机制的更深入探索,给我们展现了作用方式更丰富多彩的非编码RNA世界。图片来源于网络  一 长非编码RNA(lncRNA)  长非编码RNA是

我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康,甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质,在致病过程中发挥着关键作用,但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期,我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络,研究成果发表在《Cell Research

我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康,甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质,在致病过程中发挥着关键作用,但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期,我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络,研究成果发表在《Cell Research

我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康,甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质,在致病过程中发挥着关键作用,但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期,我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络,研究成果发表在《Cell Research

环状RNA结合功能蛋白

环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转录前

通过TFEB激活吞噬溶酶体线粒体互作

巨噬细胞是我们先天免疫反应的关键细胞,这些细胞几乎遍布我们身体的所有组织,在维持我们器官的健康状态方面起着至关重要的作用。巨噬细胞特别擅长吸收、消化和破坏外来物质,它们会不断清除死亡细胞或入侵组织的微生物或病原体。然而,某些微生物和细菌,如沙门氏菌或分枝杆菌,已经发展出保护自己免受巨噬细胞消化的策略

浙大揭示新冠病毒RNA非编码区域与宿主蛋白质互作网络

  近日,浙江大学生命科学研究院冯新华、蒋超、任艾明、杨兵实验室在美国微生物协会(American Society for Microbiology)旗下的期刊mSystems杂志上合作发表了题为“High-sensitivity profiling of SARS-CoV-2 noncoding

亚热带所湿地植物间竞争和促进互作研究获得进展

  中国科学院亚热带农业生态研究所研究员谢永宏带领的课题组,经过几年的研究,在湿地植物间竞争和促进互作研究方面取得进展。   湿地植物间关系主要包括竞争(负效应)和促进(正效应),对植物分布、群落和生态系统组成具有重要的调节作用,是湿地生态研究的核心内容之一。该课题组系统研究了竞争理论及影响湿地植

蛋白互作研究技术:「FRET」VS「Duolink-PLA」

荧光能量共振转移 (FRET)检测活体中生物大分子纳米级距离和纳米级距离变化的有力工具,广泛应用于生物大分子相互作用分析、细胞生理研究、免疫分析等。原理当供体荧光分子的发射光谱与受体荧光分子的吸收光谱重叠,并且两个分子的距离在 10nm 范围以内时,就会发生一种非放射性的能量转移,即 FRET 现象

NatureMethods公布最大人类蛋白互作网络

一个国际研究小组公布了迄今为止最大的蛋白互作数据库资源,这将有助于解析众多疾病相关的基因如何促发疾病发生和进程的。这项研究由麻省总医院MGH和Broad研究院领衔完成,相关数据库: InWeb_InBioMap (InWeb_IM) 在线公布在11月28日Nature Methods杂志上。“现代遗

学者首次发现植物环状RNA编码蛋白

华南农业大学植物保护学院周国辉教授/杨新副研究员团队在国家自然科学基金等项目的资助下,首次发现植物环状RNA编码多肽的功能,并揭示该多肽赋予水稻对多种病原物的广谱抗性。2月25日,相关成果发表于《新植物学家》(New Phytologist)。水稻条纹花叶病毒的感染促进水稻植株中circ-WRKY9

科学家利用微RNA修复受损心肌

  心肌修复,请找微RNA(核糖核酸)。中美科学家的一项新研究发现,给心脏病发作的小鼠注射一种微RNA分子,可以刺激小鼠心脏长出新的细胞。这种受损心脏修复法有望应用到人身上。   与其他器官不同,哺乳动物的成年心肌细胞不具备增殖能力,因而其心脏受损后不能再生。但美国天普大学、宾夕法尼亚大学和中国第四

棉花与黄萎病菌互作研究取得进展

  棉花黄萎病是由大丽轮枝菌引起的土传维管束病害,是制约我国棉花生产的首要病害。从棉花黄萎病抗性品种中发掘关键抗病基因,进而通过分子育种与传统育种相结合的方法提高主栽品种的黄萎病抗性,是当前棉花领域基础和应用研究的重点。  质外体是植物细胞膜外由细胞壁和细胞间隙组成的系统,是植物抵御病原菌侵染的第一

植物与病原互作研究获重要进展

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519114.shtm

与PI3K/AKT/mTOR细胞增殖相关因子介绍PDK1

丙酮酸脱氢酶(pdh)是一种催化丙酮酸氧化脱羧的线粒体多酶复合物,是哺乳动物体内调节碳水化合物燃料稳态的主要酶之一。酶活性由磷酸化/去磷酸化循环调节。丙酮酸脱氢酶激酶(pdk)磷酸化pdh导致失活。已发现该基因的多个选择性剪接转录变体。[由RefSeq提供,2013年6月]Pyruvate dehy

各种蛋白互作检测方法优缺点分析

聚焦蛋白质互作研究进展与实验方法研究蛋白-蛋白相互作用是理解生命活动的基础。蛋白质—蛋白质互作网络是生物信息调控的主要实现方式,是决定细胞命运的关键因素。检测蛋白质间相互作用的实验方法有哪些?这些检测方法各有什么优缺点?总结如下。1. 生化方法●共纯化、共沉淀,在不同基质上进行色谱层析(需要补充)●

PNAS:蛋白RBM38和p53互作调控肿瘤发展

  科学家早就知道p53蛋白会抑制肿瘤。然而,加州大学戴维斯分校研究人员最近的一项动物研究发现p53与另一种蛋白质RBM38之间有复杂关系,揭示身体如何校准p53蛋白水平。RBM38太多会降低p53水平,增加患癌症的风险。RBM38太少允许p53表达增加,从而导致早衰。这项研究结果发表在PNAS杂志

RNA蛋白互作揭示视网膜母细胞瘤发生的染色体构象调控

   上海交通大学医学院附属第九人民医院范先群教授主攻眼部肿瘤和眼眶外科,在基础研究和临床治疗方面取得突出成就。其带领的眼肿瘤团队利用ChIRP-MS技术(一种研究RNA-蛋白相互作用的技术手段)结合RNA-seq、ChIP等一系列体内体外实验对视网膜母细胞瘤新的作用机制进行了深入研究。研究发现肿瘤

基因的分离独立分配和互作实验

实验方法原理孟德尔定律包括“分离定律”及“独立分配定律”。根据分离规律,位于一对同源染色体上的一对等位基因在减数分裂形成配子时,要彼此发生分离,互不干扰地分到不同的配子中去。因此对于一对基因的杂合体,在完全显性条件下,其自交子代和测交子代的表现型分离比例分别为3:1和1:1。独立分配规律(自由组合规

基因的分离独立分配和互作实验

实验方法原理:孟德尔定律包括“分离定律”及“独立分配定律”。根据分离规律,位于一对同源染色体上的一对等位基因在减数分裂形成配子时,要彼此发生分离,互不干扰地分到不同的配子中去。因此对于一对基因的杂合体,在完全显性条件下,其自交子代和测交子代的表现型分离比例分别为3:1和1:1。独立分配规律(自由组合

Molecular-Cancer:环状RNA通过经典信号通路抑制肿瘤进展

  环状RNA(circRNAs)以单链和共价闭环结构为特征,通常由preRNAs的外显子反向剪接而成。以前,circRNA被认为是低丰度剪接错误的副产品。然而,通过深入的RNA测序和生物信息学,circRNAs已被证明广泛存在于转录本中。大量证据表明,环状RNA(circRNAs)在肿瘤的发生发展

内质网蛋白VAPA/B与自噬蛋白互作调控自噬小体形成

  4月23日,《当代生物学》(Current Biology)发表了中国科学院生物物理研究所张宏课题组的研究论文:The ER contact proteins VAPA/B interact with multiple autophagy proteins to modulate autopha

Nature-Genetics揭示基因与环境的复杂互作

  目前的个性化医疗主要是通过分子分析(尤其是基因测序)来鉴定遗传突变,进而评估个体患上特定疾病的风险。但日内瓦大学(UNIGE)的科学家们指出,真正的个性化医疗远没有这么简单。  研究人员对四百对双胞胎进行了RNA测序,量化了遗传背景和环境背景对基因表达的影响。这项发表在Nature Geneti

Nature子刊:揭示蛋白互作的链式反应

  科学家们开发了一种新方法,不需要用酶就可以在固定样本中鉴定蛋白之间的互作。  细胞内的所有生物学过程基本上都是蛋白质控制的,蛋白一般通过互作来执行其正常功能。可想而知,研究蛋白互作是理解细胞生物学的关键。不过,灵敏可靠的检测蛋白质互作并不是一件容易的事。  举例来说,用荧光标记的两种抗体对蛋白互

看得见的蛋白互作新技术Duolink-PLA

  现今,科技发展的齿轮正在高速运转,每隔2-3年就会出现一个重大的技术变革引领生命科学走向更精细、更微观、更真实的水平,这其中也包括蛋白的研究。在疾病的致病机理、分子机制、信号通路、药物筛选以及新型诊断标志物的发现中,传统的蛋白研究“金标准”方法如Co-IP、Western blot、ELISA、

Nature发表蛋白质互作里程碑成果

  德克萨斯大学和多伦多大学的科学家们日前绘制了超大规模的蛋白质互作图谱。这项研究发表在九月七日的Nature杂志上,为研究阿尔茨海默症、帕金森症和癌症等疾病的提供了强大的新工具。  细胞中的蛋白通常以蛋白复合体的形式,执行特异性的生物学功能。研究人员发现,海葵、线虫、小鼠和人类共享近千种关键的蛋白