云序高分文章利器:​ctDNA(羟)甲基化测序案例分享

新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA(羟)甲基化测序 cfDNA(Cell free DNA)是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段,是一种新型的分子标记物。ctDNA(Circulating tumor DNA)特指来源于肿瘤细胞的cfDNA,是液体活检主流方向。 最新的报道表明:ctDNA(羟)甲基化不仅可以作为肿瘤分子标志物,还可用于追溯肿瘤细胞的组织来源。在精准医疗大趋势下,ctDNA(羟)甲基化检测既具有极高的科研价值,又具备推进精准医疗临床实践的巨大潜能,为实现肿瘤临床治疗的全病程管理提供强有力的支持。利用ctDNA(羟)甲基化测序,仅凭一管液体就可以进行肿瘤诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等,是里程碑式的新型液体活检技术。 云序生物率先推出ctDNA(羟)甲基化测序服务,最低仅需1ng ctDNA即可进行测序。客户仅需提供血浆、血清或体液样本,云序......阅读全文

云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

  RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN

SMAD2/3与TGFβ影响转录因子发生m6ARNA甲基化调控干细胞发育

  文章导读:   胚胎干细胞作为一种全能性细胞,通过增殖和分化,产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明,胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化,大多与细胞增殖[1-2],免疫应答[4]关系密切。然而,对于m6A修饰在胚胎干细胞向神经内胚层细胞分化过程中的分子机制目前并没有相关报道。今天,分享一

睾丸间质细胞(LCs)m6A修饰提供新治疗靶点在不育症...3

总结: 细胞的生长与分化依赖于基因的调控表达方式,越来越多的研究表明m6A 甲基化在更多领域发挥着关键作用,而本文作者正是利用多组学MeRIP, RIP, CoIP, CHIP(云序生物提供此服务)等多种技术联合分析,揭示了m6A修饰通过影响Camkk2转录的稳定性和Ppm1a的翻译效率调节LC

昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星

  m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你!   2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nature,Cell

RNA甲基化研究深度剖析

  一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?   1、高分文章频现   说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。

RNA甲基化研究深度剖析(一)

一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?1、高分文章频现 说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。 图:RNA甲基化近期高

揭秘m6A修饰新功能----调控染色质状态和转录活性

  文章导读   m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。   2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院

RNA修饰技术在华南农大余义勋组植物m1A-调控机制的运用

  RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。   近日,Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The N1-met

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用

  文章导读   表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M

如何快速查找LncRNA序列

  查找LncRNA序列的网站有很多,包括Genebank,Ensembl,RefSeq,UCSC数据库等。今天,小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。    一.根据LncRNA来源数据库,进入相应链接。   1. Genebank:https://www.ncb

睾丸间质细胞(LCs)m6A修饰提供新治疗靶点在不育症治疗

  m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,目前已有的研究表明m6A在加速mRNA代谢和翻译,以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。这一次,研究重大发现m6A修饰在“人类繁衍”中也发挥着重大意义,该方向的发现将会吸引着更多的科研工作者探究在m6A与“不孕不育”的密切联系。云序生物一

又传喜讯云序客户一次测序两项成果影响因子合计10分!

  感恩有你,一路同行,新年快乐!   感恩有你,一路同行!2019年伊始,云序生物携全体员工对一直以来关心和支持公司发展的广大新老客户致以最诚挚的问候!一元复始,万象更新!转眼间我们迎来了2019年,站在新时代新的历史起点,回望刚刚过去的2018年,不断创新收获硕果丰盈;展望2019,任重道远却

m5C-RNA修饰表达谱文章教您如何另辟蹊径快速发文

文章导读随着RNA修饰在生物领域的持续火热,关于m6A修饰的研究已经广 泛开展并发表,至今已觉不新鲜;5-甲基胞嘧啶RNA甲基化(m5C)是一类新的修饰方式,参与调控细胞应激、发育和基因表达等方面,目前m5C研究正处 方兴未艾之际,大量的科学研究工作也亟待开展,非常适合有探索性和新颖性需求的老师。这

解析检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(上)

  云序生物解析如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(上)   RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测

2018国自然研究热点二:-RNA甲基化研究深度剖析

  一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?   1、高分文章频现   说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。   图:

m6A-RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用

  最近小编检索了关于m6A修饰的文章发表情况,发现目前2020年发表的关于m6A修饰的文章已经达到309篇,已经追平2019年整年度发表篇数,可以预见m6A RNA修饰下半年年发表文章会呈现出爆炸式增长。   图1. 近6年m6A RNA修饰相关文章发表情况( data from PubMe

lncRNA启动子DNA甲基化/羟甲基化测序分析

技术优势:●   专注非编码RNA领域,完善的lncRNA启动子分析流程●   可与lncRNA表达谱芯片联合应用,实现平台间无缝对接●   可视化数据展示,提供paper级结果图表●   优化的IP实验方法,可信赖的检测平台及数据结果 介绍:      人类基因组中仅有约2%的DNA序列最

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用

  表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在Molecular

最新云序生物m6A“RNA甲基化”研究汇总—癌症篇

  一个月发表30多篇10分以上的文章,到底是何方神圣?答案:RNA甲基化。今天小编先来介绍一下m6A RNA甲基化。   m6A是真核细胞中mRNAs丰度最高的甲基化修饰,在包括组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克以及DNA损伤应答,母本合子(maternal-to-zygotic)转化等多个

云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—病毒篇

  RNA甲基化领域是当前最耀眼的国际科研明星,也是国自然申请的大热点;究其原因,是因为最近一两年,RNA甲基化的功能与分子机制方面取得了巨大的进展。RNA甲基化已被证实在癌症发生发展,病毒感染,神经发育,干细胞分化等过程中发挥着关键作用。今天,我们承接上一期的癌症篇,为您带来病毒领域的RNA甲基化

睾丸间质细胞(LCs)m6A修饰提供新治疗靶点在不育症治疗

  m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,目前已有的研究表明m6A在加速mRNA代谢和翻译,以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。这一次,研究重大发现m6A修饰在“人类繁衍”中也发挥着重大意义,该方向的发现将会吸引着更多的科研工作者探究在m6A与“不孕不育”的密切联系。云序生物一

揭示Y染色体上LncRNA-TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖和迁移

  前列腺癌(Prostate cancer,PCa)作为男性发病率第二的癌症,严重影响了患者生殖健康和生活质量。由于前列腺癌受多种基因调控,且目前缺乏相关机制方面的深入研究,治疗效果往往不甚理想。随着高通量技术的发展,使研究PCa相关分子标志物基因和作用机制成为可能。目前,已有报道指出许多明星Ln

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用(三)

总结本文作者通过RNA-seq, m6A-seq, MeRIP-qPCR, ChIP, CoIP,双荧光素酶实验等方法,研究发现去甲基化酶ALKBH5缺失会加重胰腺ai的发生和不良临床病理表现特征。ALKBH5的过度表达可降低了体外肿 瘤的增殖、迁移和侵袭活性,改善了体内肿 瘤生长,而ALK

我是“神药”——二甲双胍抑癌机制研究

  上海交通大学附属第一人民医院张箴波团队以题为“Metformin sensitizes endometrial cancer cells to chemotherapy through IDH1-induced Nrf2 expression via an epigenetic mechanis

lncRNA启动子DNA甲基化/羟甲基化测序分析综述

  技术优势:   ● 专注非编码RNA领域,完善的lncRNA启动子分析流程   ● 可与lncRNA表达谱芯片联合应用,实现平台间无缝对接   ● 可视化数据展示,提供paper级结果图表   ● 优化的IP实验方法,可信赖的检测平台及数据结果   介绍:    人类基因组中仅有

2020年环状RNA高分文章怎么发?

  环状RNA作为最新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中,“环状RNA作为癌症新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,

如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关...(三)

如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(三)上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL

最具潜力的液体活检技术,ctDNA-甲基化测序助力肿瘤筛查

癌症对每个人和家庭来说都是一场灾难,对国家来说是一笔极大的公共卫生项目支出,根据2019年国家癌症中心发布的中国恶性肿瘤流行情况分析报告显示,随着恶性肿瘤发病数持续上升,我国每年所需的相关医疗花费超过2200亿元。面对这一现状,唯有进行肿瘤早筛,在肿瘤发生发展的源头,将其扼杀,才能逆转这个局面。肿瘤

云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰...3

5. m6A修饰调控新生小鼠β细胞的成熟 发表期刊:Diabetes影响因子:7.2发表日期:2020.05.13实验方法:m6A-seq、mRNA-seq、MeRIP-PCR、整体m6A修饰水平等(云序提供) 近期Diabetes杂志(IF=7.2)发表了m6A修饰调控新生小鼠β细胞的成熟机制相关

METTL3调控m6A甲基化修饰对小鼠脂肪细胞发育的重要作用

  今 天我们为大家解读一篇今年4月3日发表在Nature communication(IF=11.878)的文章,作者研究了m6A修饰对小鼠脂肪组织发育的影响。   棕色脂肪组织(BAT)通过线粒体产生并耗散热量,对机体起到保暖和控制肥胖的重要作用,而BAT的出生后发育,正是它们获得这些功能的关