云序高分文章利器：ctDNA（羟）甲基化测序案例分享
新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA（羟）甲基化测序 cfDNA（Cell free DNA）是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段，是一种新型的分子标记物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指来源于肿瘤细胞的cfDNA，是液体活检主流方向。 最新的报道表明：ctDNA（羟）甲基化不仅可以作为肿瘤分子标志物，还可用于追溯肿瘤细胞的组织来源。在精准医疗大趋势下，ctDNA（羟）甲基化检测既具有极高的科研价值，又具备推进精准医疗临床实践的巨大潜能，为实现肿瘤临床治疗的全病程管理提供强有力的支持。利用ctDNA（羟）甲基化测序，仅凭一管液体就可以进行肿瘤诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等，是里程碑式的新型液体活检技术。 云序生物率先推出ctDNA（羟）甲基化测序服务，最低仅需1ng ctDNA即可进行测序。客户仅需提供血浆、血清或体液样本，云序......阅读全文
ctdna测序数据测序深度多少可用
ctdna测序数据测序深度多少可用2-氨基嘌呤等其他碱基结构类似物同样具有诱变作用。②药物或射线引起的化学变化 亚硝酸能够作用于腺嘌呤(A）的氨基而使它变为次黄嘌呤(HX）；可以作用于胞嘧啶（c）而使它变为尿嘧啶（U）。这两种氨基到酮基的变化带来碱基配对关系的改变，从而通过 DNA复制而造成A∶T→
METTL3调控m6A甲基化修饰对小鼠脂肪细胞发育的重要作用
今 天我们为大家解读一篇今年4月3日发表在Nature communication（IF=11.878）的文章，作者研究了m6A修饰对小鼠脂肪组织发育的影响。 棕色脂肪组织(BAT)通过线粒体产生并耗散热量，对机体起到保暖和控制肥胖的重要作用，而BAT的出生后发育，正是它们获得这些功能的关
m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响
m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，例如癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等。2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子的辉煌。2020年1月何川教授团队再次带领m6A登上顶级期刊Science，预示着m6A等RNA修饰
影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析
云序客户发表首篇直肠癌转移肝癌环状RNA文章，影响因子高达7.8分! 文章导读： 在非编码RNA的大家族中，环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环，所以在生物体中具有稳定性高，不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控m
如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关...(四)
3. 多组学联合运用找靶点：转录组测序甲基化测序，双剑合璧 多个表达谱数据取交集找到靶基因（DOI: 10.1002/hep.29683） 甲基化数据同表达谱数据取交集（http://dx.doi.org/10.1016/j.ccell.2017.02.01）1）云序生物推荐MeRIP-seq测序技
外泌体LncRNA帮助免疫细胞“叛变”乳腺癌恶化新机制！
文章导读： 外泌体是细胞间传递信号的媒介，直径在30-200nm，表面具有磷脂双分子层，内部具有丰富内含物的小囊泡，其内含物包括miRNA，环状RNA，LncRNA和mRNA等。以不久前发表于Nature Cell Biology（影响因子：19）的文章为例，看一看外泌体中LncRNA的功
揭秘m6A修饰新功能－－－－调控染色质状态和转录活性
m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日，美国芝加哥大学何川，中科院北京基因组研究所
云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰...4
2）RNA修饰PCR芯片 new！ 云序生物提供多种RNA修饰PCR芯片检测，高效一次性检测6种RNA修饰相关的Writer，Eraser，Reader的表达情况，最全面的RNA修饰相关基因覆盖，RNA 修饰芯片基因列表（68 个基因）-human如图： 3）m6A相关酶预合成的慢(腺)病毒
RNA研究热点技术介绍总汇
头条消息：2019年8月16日，2019年国家自然科学基金评审结果发布，今年国自然重点资助项目743项，总金额达22.184亿，北京大学、浙江大学位居前两位，分别获得37项和34项，总计超过1亿元，而上海交通大学（30项）、复旦大学、清华大学、南京大学、中山大学、天津大学、华中科技大学、同济大学
同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平
RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品，已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者，云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商，首发推出了非编码RNA甲基化测序研究，首发推出了超微量RNA甲基化测序技术，首发推出RNA甲基化研究一站式系统性解决方案，云
不得了，大牛告诉你lncRNA甲基化如何研究
lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能，这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能轻松的变废为宝，竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章，你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。 RNA甲基化，作为最新的国
SUMO化修饰调控m6A－RNA甲基化酶METTL3及其催化功能分子机制
RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域，近3个月以来，该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析，感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号（2018国自然热点二：RNA甲基化研究深度剖析）。 近三个月高分文章部分列表： 2月28日
RNA研究热点技术介绍总汇
头条消息：2019年8月16日，2019年国家自然科学基金评审结果发布，今年国自然重点资助项目743项，总金额达22.184亿，北京大学、浙江大学位居前两位，分别获得37项和34项，总计超过1亿元，而上海交通大学（30项）、复旦大学、清华大学、南京大学、中山大学、天津大学、华中科技大学、同济大学
小白必看！RNA甲基化整体水平鉴定的方法汇总
RNA甲基化（RNA methylation）是一类表观遗传修饰，在已经发现的超过100种不同的RNA化学修饰中，主要有6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine, m6A）、5-甲基胞嘧啶（C5-methylcytidine, m5C）和1-甲基腺嘌呤（N1-methyladenos
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点，也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature，cell级别高分文章领域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码，之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究（详细见云序课堂之前往期回顾）。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
单细胞测序技术在癌症研究中的应用案例分享
以下是一些单细胞测序技术在癌症研究中的应用案例： 1. 胶质母细胞瘤：通过单细胞 RNA 测序，发现了肿瘤细胞中的不同亚型，以及肿瘤微环境中免疫细胞的特征。这有助于理解肿瘤的异质性和免疫细胞的功能状态，为开发更有效的治疗策略提供了依据。 2. 乳腺癌：研究人员利用单细胞测序揭示了肿瘤细胞在转移过
Mettl3介导m6A－RNA甲基化调控骨髓间充质干细胞骨质疏松症
文章导读： 近日，四川大学华西医院的周学东和袁泉研究组，联合中山大学第一附属医院的林水宾团队合作研究共同揭示了Mettl3介导m6A RNA甲基化调控骨髓间充质干细胞和骨质疏松症命运的新机制。该研究成果以Mettl3-mediated m6A RNA methylation regulat
解锁5分m6A甲基化谱文章新思路
1.构建OSC细胞模型--MG63/DXR作者选择人的OS细胞系--MG63，通过阿霉素DXR诱导，建立了多药耐药性细胞株--MG63 / DXR。并通过分析其特定的细胞表面标志物CD133和CD117 / STRO-1；干细胞相关基因的表达量；皮下注射对裸鼠的致瘤潜力等多个方面数据证明MG
人类组织中m6A修饰的动态变化和进化
文章导读 m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰，通过多种机制，比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异，m6A位点在转录本上的位置分布，以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响，近期Nucle
m6A－RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用（四）
1）m6A修饰PCR芯片 new！云序生物提供m6A修饰PCR芯片检测，高效一次性检测m6A相关的Writer，Eraser，Reader的表达情况，m6A PCR 芯片基因列表（34 个基因）-human如图： 2）RNA修饰PCR芯片 new！云序生物提供多种RNA修饰PCR芯片检测，高效一次
看表观新修饰6mA甲基化如何助力IF飙升!
DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一，我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化（5-methylcytosine, 5mC），却不知道随着测序技术的快速发展，科研者们已经在真核生物中（果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等）发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化，且DNA-6m
云序生物客户发表的首篇吉西他滨耐药胰腺导管癌环状RNA
本篇文章主要研究的药物是吉西他滨，其主要应用于晚期胰腺癌病人的治疗，可是若病人对此类药物产生了耐药反应，那势必会影响患者的生活质量，甚至生命。目前，对于吉西他滨对胰腺癌耐药机制研究尚不明朗。作者首先构建了对吉西他滨耐药细胞系，并通过全转录组测序比较了耐药与正常细胞系之间环状RNA的表达谱。通过生
环状RNA研究方法（一）
至2015起云序生物已经完成10000+例环状RNA全转录组测序服务，涵盖了50+疾病，20+物种，帮助众多客户在环状RNA分子的研究中取得突破性进展。客户发表的环状RNA文章高达20篇以上。此外云序生物还提供环状RNA机制研究手段，rip&RNA pull down技术，帮助客户冲刺高分机制文章。
人类组织中m6A修饰的动态变化和进化
文章导读 m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰，通过多种机制，比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异，m6A位点在转录本上的位置分布，以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响，近期Nucle
circRNA_104075在促进肝癌发生和进展的机制研究
在全球范围内原发性肝癌是造成癌症相关死亡的三大原因之一。肝细胞癌(HCC)是最常见的原发性肝脏癌症。由于缺乏高特异性和敏感性的早期诊断生物标志物，HCC患者往往得不到及时有效的治疗。相比于长链非编码RNA和miRNA，circRNA作为一种新型环状RNA，具有共价闭合环状结构，在组织和血液中具有
表观新修饰6mA甲基化助力IF飙升（一）
DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一，我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化（5-methylcytosine, 5mC），却不知道随着测序技术的快速发展，科研者们已经在真核生物中（果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等）发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化，且DNA-
Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰－m1A
说起近来的科研热点，RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一，亮点文章频出，着实让人有些目不暇接。日益增多的发表文章、特别是高分文章说明，这个领域现在正在迅速成为大家关注的焦点。RNA甲基化修饰类型很多，目前最热门的有三种，分别是：m6A RNA甲基化﹑m5C RN
m5C－RNA甲基化测序介绍
m5C RNA甲基化简介通过分析近几年的国自然立项，可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势：特别是从2015年的5项到2017年的25项，项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇，可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段，多篇文章荣登CNS级别期刊。RNA甲基
SUMO化修饰调控m6A－RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种...
SUMO化修饰调控m6A RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种全新分子机制RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域，近3个月以来，该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析，感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号（2018国自然热点二：R
昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星
m6A RNA甲基化是当前在LncRNA，环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星，到底有多火？摆出数据告诉你！ 2019年才过去一半还不到，已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域，不仅文章数量多，高分文章也有许多。据统计，仅2019年上半年就发表了多篇Nature，Cell