RIP测序解析RNA结合蛋白SORBS2在卵巢癌细胞转移中作用机制

环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转录前、后及翻译水平严格调控细胞生殖生长等过程。云序曾对环状RNA经典研究思路进行过详细解析(2018国自然研究热点—环状RNA研究深度剖析),感兴趣的老师可以查询浏览。4月3日,知名免疫学杂志Immunity(IF:22.845)在线发表了中科院生物物理所范祖森教授与王硕研究员为共同通讯作者的文章,介绍发现环状RNA Cia-cGAS定位于细胞核,可结合DNA敏感的cGAMP合酶cGAS并抑制其活性,调控长效造血干细胞(LT-HSC)静息状态。本文极大拓展了核内环状RNA通过结合激酶发挥重要生理功能的研究思路。 研究背景: ......阅读全文

RIP测序解析RNA结合蛋白SORBS2在卵巢癌细胞转移中作用机制

  环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转

RIP测序解析RNA结合蛋白SORBS2在卵巢癌细胞转移作用机制

  作为环状RNA和RNA甲基化领域的领跑者,云序生物最近一个月捷报频传。RNA甲基化领域,云序m6ARNA甲基化测序服务协助上海交大余健秀组发表18年国内首篇10分以上RNA甲基化文章(“Nucleic Acid Research”,IF:10.162);环状RNA领域,云序环状RNA测序服务助力

RIP测序解析RNA结合蛋白SORBS2在卵巢癌细胞转移中的作用...

RIP测序解析RNA结合蛋白SORBS2在卵巢癌细胞转移中的作用机制作为环状RNA和RNA甲基化领域的领跑者,云序生物最近一个月捷报频传。RNA甲基化领域,云序m6ARNA甲基化测序服务协助上海交大余健秀组发表18年国内首篇10分以上RNA甲基化文章(“Nucleic Acid Research”,

RIP技术(RNA结合蛋白免疫沉淀)

RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA结合蛋白免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。RIP这种新兴的技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合

诱骗RNA结合蛋白不与癌细胞中的天然RNA分子结合

  科学家也开始变得“狡猾”,开始用欺骗来对抗癌症。希伯莱大学的研究人员发明了一种诱饵,可以阻止癌症用于转移的RNA结合蛋白。  近年来,RNA结合蛋白在肿瘤生长中起着重要作用已经成为不争的事实。这些蛋白在所有细胞中都很活跃,尤其是在癌细胞中,它们与RNA分子结合,加速癌细胞的生长。不幸的是,目前还

m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响

  m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,例如癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等。2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子的辉煌。2020年1月何川教授团队再次带领m6A登上顶级期刊Science,预示着m6A等RNA修饰

m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响

  m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,例如癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等。2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子的辉煌。2020年1月何川教授团队再次带领m6A登上顶级期刊Science,预示着m6A等RNA修饰

m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响(二)

为了全面探索YTHDF1及其靶基因之间的直接相互作用,作者对过表YTHDF1的A2780细胞,进行了eCLIP-seq,并鉴定了2,343个目标转录物,这些转录物大多数是mRNA。将eCLIP seq的结果2,343个基因和上面三组数据交集确定的647个基因取交集,产生175个基因,将其确定

m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响(一)

文章导读m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,例如癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等。2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子的辉煌。2020年1月何川教授团队再次带领m6A登上顶级期刊Science,预示着m6A等RNA

昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星

  m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你!   2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nature,Cell

云序客户8.0分成果揭秘:还愁lncRNA功能机制如何研究吗?

  文章导读   LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱

云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

  RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN

RNA甲基化研究深度剖析(一)

一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?1、高分文章频现 说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。 图:RNA甲基化近期高

昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星

  m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你!   2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nature,Cell

昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星

m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你!   2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nat

RNA甲基化研究深度剖析

  一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?   1、高分文章频现   说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。

2019年,大牛们都在研究什么?—m6A文章盘点

  19年悄悄的已经将近过半,但RNA甲基化研究马不停歇。单单过去一个半月的时间里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相关文章发表;造血干细胞分化,癌细胞上皮间质转化,树突细胞活化,心肌细胞肥厚,内源性免疫应答调控都有它的身影。这里小编给大家列举展示几篇最新的m6A RNA甲基化研究成

云序RNA修饰技术余义勋课题组植物m1A修饰调控机制的运用

  导读   RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。   近日,Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The

研究揭示RNA结合蛋白相分离在植物热胁迫应答中重要作用

  2022年2月28日,Developmental Cell在线发表了中科院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心刘聪课题组与中科院分子植物科学卓越创新中心植物逆境生物学研究中心张蘅课题组合作的题为“Liquid-liquid phase separation of RBGD2/4 is req

研究揭示RNA结合蛋白相分离在植物热胁迫应答中重要作用

  2022年2月28日,Developmental Cell在线发表了中科院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心刘聪课题组与中科院分子植物科学卓越创新中心植物逆境生物学研究中心张蘅课题组合作的题为“Liquid-liquid phase separation of RBGD2/4 is req

PNAS:癌细胞或能利用特殊铜结合蛋白来发生转移

  日前,一项刊登在国际杂志Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究报告中,来自瑞典查尔姆斯理工大学等机构的科学家们通过研究发现,乳腺癌细胞中发现的一种名为Atox1的蛋白或参与了癌细胞的转移过程,该蛋白或有望作为一种潜在的生物标志物来帮

揭示糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动...(二)

图5. 荧光定量证实miRNA不管在人源还是鼠源都在糖尿病组中低表达;与靶基因的表达成反比;miRNA低表达促进糖尿病患者血管内膜增生5.构建VSMC损伤修复模型作者首次提出VSMC损伤修复机制模型,机制的参与成员主要包括VSMC、内皮组织和血小板,如下图所示。在未受伤个体中,内皮组织完整,VSMC

2018国自然研究热点二:-RNA甲基化研究深度剖析

  一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?   1、高分文章频现   说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。   图:

研究揭示CHML蛋白在肝癌转移过程中的作用与机制

  复发与转移是肝癌预后差的主要原因,但是目前对这一过程的具体机制知之甚少,鉴定在肝癌转移和复发过程中的关键分子将为临床干预或者治疗提供帮助。6月7日,国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所谢东研究组题为CHML promot

糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复

  血管平滑肌细胞(VSMC)在健康状态下处于去分化表型,在其受损时,循环系统中的血小板快速激活,通过凝血反应为受伤部位止血,同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质,使VSMC切换为高分化表型,同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化状态切换机制失调引起的。

云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

  RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN

糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复

  血管平滑肌细胞(VSMC)在健康状态下处于去分化表型,在其受损时,循环系统中的血小板快速激活,通过凝血反应为受伤部位止血,同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质,使VSMC切换为高分化表型,同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化状态切换机制失调引起的。

m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在

RNA修饰技术在华南农大余义勋组植物m1A-调控机制的运用

  RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。   近日,Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The N1-met

微RNA与癌细胞转移有关

一种正常作用之一可能是帮助细胞从胚胎的一部分向另一部分运动的微RNA,被发现在侵略性人类乳腺癌中高度表达,调控乳腺癌细胞的迁移、入侵和转移。微RNA(自然出现的单链RNA分子,参与基因调控)以前曾被发现能引起癌症,但这是首次关于它与癌细胞转移有关的报告。微RNA的功能目标似乎是HoxD10基因,它是