RACE(rapidamplificationofcDNAends)技术2
具体的实验步骤cDNA第一条链的合成:我们建议进行cDNA合成的对照反应,这样可以对样品的 cDNA的合成进行鉴定。加入各种试剂之后,在气浴中42度保温一个小时。注意: 在水浴或酒精浴中保温回减少反应体积,从而降低第一链的合成效率。将管放于冰上,以终止第一链的合成反应。直接进行第二链的合成。cDNA第二链的合成:第二链合成的酶混合物中,含有聚合酶、RNaseH和连接酶。T4 DNA聚合酶的功能是补平dscDNA的末端。我们建议做阳性对照,试剂盒中提供人类骨骼肌的mRNA。建议进行阳性对照,cDNA的质量取决于制备的polyA+RNA的质量。非哺乳动物样品的mRNA大约在0.5-3kb之间。通过电泳检测cDNA的产量,与对照进行对比,这样可以有利于在以后的步骤中对cDNA进行稀释。接头的连接及连接产物的稀释按照程序进行连接反应。如果没有对比样品和对照的产量,利用 Tricine-EDTA buffer制备接头连接的ds cDNA的......阅读全文
cDNA-法推断蛋白质的一级结构实验3
实验方法原理PCR(polymerase chain reaction)作为一种常用的分子生物学实验手段,已非常成熟。各个公司推出了各种高保真和高效率的聚合酶及成套的 PCR 试剂盒,使得 PCR 技术简便而且有效。实验步骤1. 方法的选择:对于两端序列已知的情况,可根据两端序列设计引物,选用普通的
用新-RACE-法扩増-cDNA-的-5末端(二)
第 3 阶段:RNA 寡核苷酸的制备选择离 T7 或 T3RNA 聚合酶作用位点下游约 lOObp 处可以线性化的质粒 [见图 25-3(b)]。因为来自多克隆位点回文序列的引物用于 PCR 效果不好,因此比较理想的是用在多克隆位点克隆进某个插入片段的质粒。一个已经验证过的质粒是 pBS-S
用新-RACE-法扩増-cDNA-的-5末端(一)
试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂酶和酶缓冲液核酸和寡核苷酸仪器、耗材 特殊设备实验步骤 第 1 阶段:降解 RNA 的去磷酸化一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂乙酸钠,3mol/L,pH5.2乙醇二硫苏糖醇(DTT)(0.1mol/L)苯酚/氯仿(1:1,体积比)2. 酶和酶缓冲液磷酸酶缓冲液,10X
cDNA的筛选2
(三)免疫筛选制备Sepharose偶联细菌裂解液1.各用一个E.coli温度敏感溶源菌株(BTA 282(λgt11amp3)或BNN 97)单菌落接种于2×7.5ml培养基并于32℃生长过夜。2.过夜培养物用LB培养基稀释100倍,于32℃生长至OD600值为0.5。3.于45℃温育15min诱
Cloning-of-small-RNAs-with-5’-phosphate-and-3’-OH-ends2
3’ Adaptor Ligation and PurificationHeat shock the RNA by putting at 90°C for 30 seconds. Snap cool on ice.Set up the 3’Adaptor ligation reaction in a
cDNA-文库的构建2
阶段 3:cDNA 的甲基化 材料 缓冲液和溶液 将贮存液稀释到合适浓度。 氯仿 10XEcoRⅠ 缓冲液 1XEcoRⅠ 甲基化酶缓冲液(选用) 如希望,可替代步骤 1 中的 Tris-HCl,NaCl 和 EDTA。 EDTA(0.5mol/L,pH8.0) 乙醇 MgCl2(
cDNA文库的构建2
10. Sephadex G-50用含有10 mmol/L NaCl的TE(pH7.6)溶液进行平衡,然后通过离子柱层析将未掺入的dNTP和 cDNA分开。11. 加入0.1倍体积的3mol/L乙酸钠(pH5.2)和2倍体积的乙醇,沉淀柱层析洗脱下来的cDNA,将样品置于冰上至少15分钟,然后在微量
cDNA合成技术
实验材料RNA试剂、试剂盒α32PdNTPmRNA甲基氢氧化汞β-巯基乙醇RNase抑制剂引物01igo dTTris-HClMgCl2KCl逆转录酶EDTA酚-氯仿乙醇琼脂糖HepesDTTDNA聚合酶核酸酶S1仪器、耗材SephadexG-100离心柱层析离心管恒温水浴锅电泳仪低温离心机实验步骤
cDNA合成技术
实验材料 RNA试剂、试剂盒 α32PdNTPmRNA甲基氢氧化汞β-巯基乙醇RNase抑制剂引物01igo dTTris-HClMgCl2KCl逆转录酶EDTA酚-氯仿乙醇琼脂糖HepesDTTDNA聚合酶核酸酶S1仪器、耗材 SephadexG-100离心柱层析离心管恒温水浴锅电泳仪低温离心机实
cDNA合成技术
实验材料 RNA 试剂、试剂盒 α32PdNTP mRNA 甲基氢氧化汞 β-巯
RACE的原理、应用和优缺点(二)
三、RACE 的应用 RACE技术主要是应用于对全长cDNA序列的获得,但对该技术进行一定的修改后,也可在其它方面显示出极高的应用价值。 首先,RACE技术可用于cDNA文库的构建及筛选。Belyavaasky等(1989)用10个骨髓瘤细胞分离的总RNA,通过TdT加同聚尾、(dT)
差减cDNA文库法2
[cDNA末端磷酸化]1.70℃灭活反应后,稍微离心一下,置室温5分钟。2.在反应混合物(10μl)中加入:1μl10×连接缓冲液2μl10mMATP1μl(10μ)DNA激酶 [限制性内切酶消化]以得到粘性末端 1.限制性内切酶消化DNA和载体。 2.在37℃保温1~5小时,然后冷却到
cDNA文库组标准流程2
(二)动物组织totalRNA的提取 1.根据表1选择适当的组织量和相应的变性裂解液量,将变性裂解液分装到RNase-free的50ml无菌离心管中,冰浴5分钟。 2.将组织样品放入变性裂解液中,在高速下匀浆15-30秒/次,直到看不见组织和细胞碎片。 3.根据表1加入适量2M的乙酸钠(pH4.0)
cDNA合成技术3
2. 电泳分析(1) 用50mM NaCl, 1mM EDTA制备1.4%的碱性琼脂糖电泳, 并置碱性电泳缓冲液中30分钟。(2) 取样品液, 用TE调整体积, 使第一链和第二链产率测定液的体积相同,加入等体积的2×样品缓冲液(20mmol/L NaOH, 20%甘油,0.025%溴粉兰)。(3)
cDNA合成技术1
Promega公司的RibocloneR M-MLV(H- ) cDNA合成系统采用M-MLV反转录酶的RNase H缺失突变株取代AMV反转录酶,使合成的cDNA更长。该系统的第一链合成使用M-MLV反转录酶,cDNA第二链合成采用置换合成法,采用 RNaseH和DNA聚合酶Ⅰ进行置换合成
mRNA差异显示技术(mRNA-differetial-display)(2)
6.技术路线 mRNA 差异显示技术 The fluoroDD System •Builds on the HIEROGLYPH™ system –TMR-labeled anchored primers –Increased primer concentrations –I
SMARTTM-5RACE-PCR的原理
SMARTTM 5‘-RACE的原理是先是利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以Oligo(dT)30MN作为锁定引物在反转录酶MMLV作用下,反转录合成标准第一链cDNA。利用该反转录酶具有的末端转移酶活性,在反转录达到第一链的5‘末端时自动加上3一5个(dC)残基,退
SMARTTM-5RACE-PCR的原理
SMARTTM 5‘-RACE的原理是先是利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以Oligo(dT)30 MN作为锁定引物在反转录酶MMLV作用下,反转录合成标准第一链cDNA。利用该反转录酶具有的末端转移酶活性,在反转录达到第一链的5‘末端时自动加上3一5个(dC)残基,
SMARTTM-5RACE-PCR的原理
SMARTTM 5‘-RACE的原理是先是利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以Oligo(dT)30MN作为锁定引物在反转录酶MMLV作用下,反转录合成标准第一链cDNA。利用该反转录酶具有的末端转移酶活性,在反转录达到第一链的5‘末端时自动加上3一5 个(
cDNA文库构建技术cDNA链的反转合成
构建cDNA文库是一种获得目标基因并进一步进行基因重组,基因克隆的重要方法,而在该文库构建中有mRNA 逆转录出cDNA是一步极为关键的操作。mRNA的逆转录主要由MMLV、AMV两种逆转录酶催化合成cDNA,在这个逆转录过程中,模板mRAN及逆转录酶是两个最重要的影响因素。对于mRNA来讲,一
cDNA文库构建技术cDNA链的反转合成
实验概要构建cDNA文库是一种获得目标基因并进一步进行基因重组,基因克隆的重要方法,而在该文库构建中有mRNA 逆转录出cDNA是一步极为关键的操作。mRNA的逆转录主要由MMLV、AMV两种逆转录酶催化合成cDNA,在这个逆转录过程中,模板mRAN及逆转录酶是两个最重要的影响因素。对于mR
cDNA-法推断蛋白质的一级结构实验2
二、引物的设计实验步骤在得到蛋白质部分氨基酸序列的基础上通常采用设计简并性或偏性引物,用锚定 PCR 的方法来获得该蛋白质的 cDNA 部分或全长序列。现在许多公司推出的 RACE(rapidly amplication cDNA ends)系统的技术核心便是如此。简并性引物的设计一般遵循以下几个原
Atlas™cDNA表达距阵(Expression-Array)2
区分关系相近肿瘤的诊断工具 分析在肿瘤发生中起关键作用的基因的表达 588种与癌症相关的cDNA点阵于一带正电的尼龙膜上,另外还包括9个管家基因的质粒、噬菌体等阴性对照。cDNA按分子途径和家族分类置于不同板块,包括癌基因、抑癌基因、细胞周期相关基因和凋亡等。 Atlas? Mouse cD
RACE服务
这时我们可以根据基因的一段已知序列(或一段同源序列),利用3'-Race方法获得该基因的3'端序列,或者利用5'-Race方法得到该基因的5'端序列。服务流程:1、先由您提供背景资料,其中包括已知的DNA序列部分,RNA的情况,所扩增基因的估计长度,是否具有同源序列等
杂交瘤测序仅需5个细胞
杂交瘤技术是通过将免疫动物的B淋巴细胞与骨髓瘤细胞融合,得到既能产生抗体又能无限增殖的杂交瘤细胞的单克隆抗体开发技术。自1975年Köhler和Milstein发明该技术以来,杂交瘤技术已经成为单抗发现最重要的技术之一,也为后续治疗性抗体药物的发展奠定了基础。杂交瘤细胞在保存过程中易存在污染、基因丢
3RACE-PCR
实验概要 This technique is used to obtain the 3'end of a cDNA, it requires some sequence information internal to the mRNA under study. The
PCR
PCRPolymerase Chain Reaction1) Add the following to a microfuge tube:10 ul reaction buffer1 ul 15 uM forward primer1 ul 15 uM reverse primer1 ul templ
cDNA克隆技术的特点
①有些生物,如RNA病毒没有DNA,只能用cDNA克隆;②cDNA克隆易筛选,因为cDNA库中不包含非结构基因的克隆,而且每一cDNA克隆只含一个mRNA的信息;③cDNA能在细菌中表达。cDNA仅代表某一发育阶段表达出来的遗传信息,只有基因文库才包含一个生物的完整遗传信息。
关于cDNA合成技术的介绍
以Riboclone M-MLV CDNA合成技术为例。 Riboclone M—MLV cDNA合成系统采用M—MLV反转录酶的RNase H缺失突变株取代AMV反转录酶,使合成的cDNA更长。该系统的第一链合成使用M-MLV反转录酶,cDNA第二链合成采用置换合成法,采用RNaseH和DN
cDNA合成技术的基本步骤
(1)取一灭菌的无RNA酶的eppendorf管,加入RNA模板和适当引物,每RNA使用0.5ug引物(如使用Not I引物接头,用0.3ug),用H2O调整体积至15ul,70℃处理5min冷却至室温,离心使溶液集中在管底,再依次加入:5X第一链缓冲液5ul。RNasinRNA酶抑制剂25UM—M