蛋白质三级结构预测-线索化法
线索化模型产生的背景及发展上面已经提到,两个自然进化的蛋白质如果具有30%的等同序列,则它们是同源的蛋白质,具有基本相同的三维结构。那么,其余的是否就不是同源的呢?实际并非如此。在最新的蛋白质数据库PDB中,有上千对蛋白质具有同源的空间结构,但它们的序列等同部分小于25%,即远程同源。许多结构相似的蛋白质都是远程同源的。对于这类蛋白质,很难通过序列比对找出它们之间的关系,必须设计新的分析方法。对于一个未知结构的蛋白质(U),如果找到一个已知结构的远程同源蛋白质(T),那么可以根据T的结构模板通过远程同源模型化方法建立U的三维结构模型。一个成功的远程同源模型化方法要解决三个问题:(1)检测远程同源蛋白质(T);(2)U和T的序列必须被正确地比对或对比排列;(3)修改一般的同源模型化过程,以应用于相似度非常低的情况,即处理更多的环区,建立合理的三维结构模型。检测远程同源蛋白质是一个基本问题,而正确比对U和T的氨基酸序列则是更为复杂的......阅读全文
免疫组化染色方法(SP法和SABC法)
SP法1)脱蜡、水化;2)PBS洗2~3次各5分钟;3)3%H2O2(80%甲醇)滴加在TMA上,室温静置10分钟;4)PBS洗2~3次各5分钟; 5)抗原修复;6)PBS洗2~3次各5分钟;7)滴加正常山羊血清封闭液,室温20分钟。甩去多余液体。8)滴加Ⅰ抗50μl,室温静置1小时或者4℃过夜或者
酶的包埋法固定化技术凝胶包埋法介绍
凝胶包埋法常用的载体有海藻酸钠凝胶、角叉菜胶、明胶、琼脂凝胶,卡拉胶等天然凝胶以及聚丙烯酰胺、聚乙烯醇和光交联树脂等合成凝胶或树脂。 天然凝胶采用溶胶状天然高分子物质在酶存在下凝胶化的方法,包埋时条件温和、操作简便,对酶括性的影响甚少,但强度较差。合成的高分子则采用合成高分子的单体或预聚物在酶
免疫组化SP法步骤
SP(streptavidin-perosidase)法,即链霉菌抗生物素蛋白-过氧化物酶连结法.按标记物质的种类,如荧光染料、放射性同位素、酶(主要有辣根过氧化物酶和碱性磷酸酶)、铁蛋白、胶体金等,可分为免疫荧光法、放射免疫法、酶标法和免疫金银法等。按染色步骤可分为直接法(又称一步法)和间接法(二
免疫组化ABC法步骤
1、4%多聚甲醛常规灌注固定,取材并置20%蔗糖溶液(4℃)中过夜。蜡块制作。切片,贴片。0.01MKPBS清洗5min×3后;2、加入配好的0.3%的过氧化氢甲醇溶液(甲醇80ml+0.01MKPBS 100ml+30%过氧化氢)30min,以消除内源性过氧化物酶的影响,0.01MPBS清洗5mi
什么叫包埋法固定化酶
固定化酶(immobilized enzyme)是用物理的或化学的方法使酶与水不溶性大分子载体结合或把酶包埋在水不溶性凝胶或半透膜的微囊体中制成的。酶固定化后一般稳定性增加,易从反应系统中分离,且易于控制,能反复多次使用。便于运输和贮存,有利于自动化生产。固定化酶是近十余年发展起来的酶应用技术,在工
免疫组化SP法步骤
SP(streptavidin-perosidase)法,即链霉菌抗生物素蛋白-过氧化物酶连结法。按标记物质的种类,如荧光染料、放射性同位素、酶(主要有辣根过氧化物酶和碱性磷酸酶)、铁蛋白、胶体金等,可分为免疫荧光法、放射免疫法、酶标法和免疫金银法等。按染色步骤可分为直接法(又称一步法)和间接法(二
基因测定方法单元化定位法
在构窠曲霉这一类真菌的准性生殖过程中,杂合二倍体细胞在有丝分裂时常随机地丢失它的染色体。染色体在多次有丝分裂过程中逐条丢失而使二倍体细胞终于转变为单倍体细胞的过程称为单元化。如果一对染色体中带有显性的野生型基因的染色体丢失了,那么同源染色体上隐性基因的性状便得以表现。此外,通过体细胞交换也可以从杂合
石墨炉原子化法的原理
非火焰原子化器应用最为广泛的一种,1959年苏联物理学家Б.B.利沃夫首先将原子发射光谱法中石墨炉蒸发的原理用于原子吸收光谱法中,开创了无焰原子化方式。由于原子化效率高,石墨炉法的相对灵敏度可达10-9-10-12g/ml,最适合痕量分析。它的基本原理是利用大电流(常高达数百安)通过高阻值的石墨器皿
低温原子化法的的用途
低温原子化法(low-temperature atomisation),汞蒸气压高,易于气化,可用低温原子化法测定。以化学还原法使汞转变为气相后,再导入气体吸收池内测定。气相氢化物原子化法用来测定锡、铅、砷、 锑、秘、硒和蹄。这些元素在强还原剂硼氢化物作用下生成沸点低、易热解的共价氢化物,由惰性气体
浅谈归一化法、内标法、外标法及标准加入法区别很重要!
1.归一化法 把所有出峰的组分含量之和按100%计的定量方法,称为归一化法。 各成分校正因子一致时可用该法,该法简便、准确,特别是进样量不容易准确控制时,进样浓度及进样量的变化的影响很小。 其他操作条件,如流速、柱温等变化对定量结果的影响也很小。GC应用广于HPLC。
科学家揭示大脑进化关键线索
日本冲绳科学技术研究所(OIST)与德国马克斯·普朗克进化人类学研究所团队在最新一期《美国国家科学院院刊》发表的研究揭示,50万年前现代人类大脑中基因发生的两个重要变化,重塑了人类的行为模式与认知能力,成为人类进化成功的关键。新发现不仅为人类学研究开辟了新方向,也为探索行为与认知的生物学基础提供了重
水牛难患疯牛病谜题获新线索
近日,中国科学院昆明动物研究所张亚平院士、云南大学副教授赵卉和硕士刘林林通过比较黄牛和水牛群体的基因,为解决为何水牛不感染疯牛病这一问题提供了线索。相关研究成果日前发表于《科学公共图书馆・综合》。 疯牛病因具有高度传染性和致死性,且可通过食物链传染给人类而受到高度关注。但张亚平等研究人员发
通过饮食“饿死”癌细胞又有新线索
据英国《自然》杂志近日发表的一项癌症学研究,美国科学家团队描述了通过限制热量“饿死”癌细胞的最新线索——饮食模式抑制胰腺癌小鼠模型肿瘤生长的独特机制。研究人员表示,这一发现的目的并不是推荐饮食,而是真正了解潜在的生物学机制,其描述了热量限制饮食如何抑制癌细胞生长,并为未来新药的研发提供了方向。
Nature:新研究为癌症提供线索
来自加州大学戴维斯分校的研究人员第一次成功观测到了正准备修复的DNA单链。相关研究成果发表在10月24日的《自然》(Nature)杂志上,对于我们了解乳腺癌的起源具有重要意义。 论文的资深作者、加州大学戴维斯分校著名微生物学和分子与细胞生物学教授Stephen Kowalczykows
化学线索揭示恐龙新陈代谢率
在《自然》杂志的一篇新论文中,美国科学家揭示了一种研究恐龙新陈代谢率的新方法,该方法利用恐龙骨骼中的线索表明个体动物在其生命的最后一个小时内呼吸量。研究以此证实,大多数恐龙都是温血动物。 几十年来,古生物学家一直在争论恐龙是像现代哺乳动物和鸟类一样是温血动物,还是像现代爬行动物一样是冷血动物,但
微表情为谎言监测提供线索
尽管你撒谎不脸红微表情透露你的心 对善于掩饰自己内心的人来说,撒谎不脸红并不困难。可“演技”再高超,微表情还是会泄露你的真实想法。10月11日下午,在中国科学院研究生院和高等教育出版社联合主办的“中国科学与人文论坛”第104场报告会上,中科院心理所所长傅小兰研究员给听众们介绍了这种微妙的“
糖尿病药物研发发现新线索
胰岛素分泌功能缺陷是引发糖尿病的主要原因,因此,促进胰岛素分泌便成为治疗糖尿病的主攻方向之一。我国科学家领衔联合国际团队,首次解析了胰高血糖素样肽-1受体(即GLP-1R)七次跨膜区的晶体结构并揭示了相关的别构调节机理,将掀起新一轮抗糖尿病药物设计和新药开发的热潮。这项研究成果日前在国际顶级学术
粉色钻石藏古大陆裂解线索
西澳大利亚的阿盖尔地区是全球最大的天然钻石来源地之一,也是彩钻的最大来源地。澳大利亚科学家发现,该地区的形成可能与最早的超大陆在约13亿年前的裂解有关。相关研究9月19日发表于《自然—通讯》。研究表明,各大陆的接合点可能对于发现粉钻很重要,或有助对其他钻石矿的勘探。 在2020年关闭前,阿盖尔
寻觅奋斗者的时光线索
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/499677.shtm《吾家吾国》主持人王宁独家对话81岁的生物化学与分子生物学家、中国科学院院士王志珍,88岁的地质学家、中国科学院院士任纪舜,95岁的气体动力学家、中国科学院院士俞鸿儒,从他们各自的时光
AI模型搜寻癌症线索速度远超以往
质谱仪可以检测人体细胞中糖分子的不同结构。图片来源:马格努斯·戈坦德/伦德伯格研究基金会科技日报北京7月10日电 (记者张梦然)瑞典哥德堡大学团队开发了一种人工智能(AI)模型,通过糖分析增加检测癌症的可能性。与当前的半手动方法相比,AI模型能在几秒钟内准确发现异常。研究结果发表在新一期《自然·方法
气相色谱法分析归一化法怎么计算
气相色谱分析(chromatography)是使混合物中各组分在两相间进行分配,其中一相是不动的(固定相),另一相(流动相)携带混合物流过此固定相,与固定相发生作用,在同一推动力下,不同组分在固定相中滞留的时间不同,依次从固定相中流出,又称色层法或者层析法。按流动相可分为气相色谱(GC)和液相色谱(
气相色谱法分析-归一化法怎么计算
气相色谱分析(chromatography)是使混合物中各组分在两相间进行分配,其中一相是不动的(固定相),另一相(流动相)携带混合物流过此固定相,与固定相发生作用,在同一推动力下,不同组分在固定相中滞留的时间不同,依次从固定相中流出,又称色层法或者层析法。按流动相可分为气相色谱(GC)和液相色谱(
免疫组化SABC法操作流程
1、洗载玻片将载玻片置于重铬酸钾和浓H2SO4混合液中,目的是为了是载玻片上的硅胶等除去,同时使一些肉眼看不见的凹凸不平的表面变平整,便于组织吸附,然后置于清水中清洗,除去残余的重铬酸钾和浓H2SO4(大约冲一个小时左右),再将载玻片浸泡于酒精之中, 然后放到架子上,置于37 ℃温箱中,将多聚赖
石墨炉原子化法的工作原理
1、特点:升温速度快,绝对灵敏度高,可分析70多种金属和类金属元素;分析速度慢,分析成本高,背景吸收、光辐射、和基体干扰比较大。2、原因:(1)石墨炉的原子化效率接近100%,而火焰法的原子化效率只有1%左右.(2)用石墨炉进行原子化时,基态原子在吸收区内的停留时间较长。石墨炉原子化器是将一个石墨管
离子化损失谱法的简介
中文名称离子化损失谱法英文名称ionization lose spectroscopy定 义基于原子电离时,其电子必须克服束缚能的原理,利用具有能量E的电子束激发试样原子并使之电离时,对应入射电子的剩余能量(Ea-Eb)将有相应的能谱峰,对试样的原子和结构进行定性定量分析的电子能谱法。应用学科机械
关于酶固定化法的分类介绍
酶固定化法是为了提高酶作为催化剂的使用性能而将酶与一定的固相载体结合,加以固定化的技术方法。依据固定化的物理化学方式可将其分成四类: ①将酶吸附在活性炭、多孔玻璃、离子交换分子筛、离子交换纤维素等固体的表面上; ②将酶与淀粉、琼脂糖、聚丙烯酰胺、葡聚糖凝胶等固态物质形成共价键,实现载体偶联;
免疫组化ABC法操作流程
1、4%多聚甲醛常规灌注固定,取材并置20%蔗糖溶液(4℃)过夜,蜡块制作,切片,贴片。0.01M PBS清洗5min×3次;2、脱蜡、水化:用二甲苯两次10min,用梯度乙醇由低浓度到高浓度进行水化;3、加入0.3%的过氧化氢甲醇溶液(甲醇80ml+0.01M PBS 100ml+30%过氧化氢)
基因定位方法介绍单元化定位法
在构窠曲霉这一类真菌的准性生殖过程中,杂合二倍体细胞在有丝分裂时常随机地丢失它的染色体。染色体在多次有丝分裂过程中逐条丢失而使二倍体细胞终于转变为单倍体细胞的过程称为单元化。如果一对染色体中带有显性的野生型基因的染色体丢失了,那么同源染色体上隐性基因的性状便得以表现。此外,通过体细胞交换也可以从杂合
免疫组化SABC法操作流程
1、洗载玻片将载玻片置于重铬酸钾和浓H2SO4混合液中,目的是为了是载玻片上的硅胶等除去,同时使一些肉眼看不见的凹凸不平的表面变平整,便于组织吸附,然后置于清水中清洗,除去残余的重铬酸钾和浓H2SO4(大约冲一个小时左右),再将载玻片浸泡于酒精之中, 然后放到架子上,置于37 oC温箱中,将多
石墨炉原子化法的工作原理
1、特点:升温速度快,绝对灵敏度高,可分析70多种金属和类金属元素;分析速度慢,分析成本高,背景吸收、光辐射、和基体干扰比较大。2、原因:(1)石墨炉的原子化效率接近100%,而火焰法的原子化效率只有1%左右.(2)用石墨炉进行原子化时,基态原子在吸收区内的停留时间较长。石墨炉原子化器是将一个石墨管