蛋白质三级结构预测-线索化法
线索化模型产生的背景及发展上面已经提到,两个自然进化的蛋白质如果具有30%的等同序列,则它们是同源的蛋白质,具有基本相同的三维结构。那么,其余的是否就不是同源的呢?实际并非如此。在最新的蛋白质数据库PDB中,有上千对蛋白质具有同源的空间结构,但它们的序列等同部分小于25%,即远程同源。许多结构相似的蛋白质都是远程同源的。对于这类蛋白质,很难通过序列比对找出它们之间的关系,必须设计新的分析方法。对于一个未知结构的蛋白质(U),如果找到一个已知结构的远程同源蛋白质(T),那么可以根据T的结构模板通过远程同源模型化方法建立U的三维结构模型。一个成功的远程同源模型化方法要解决三个问题:(1)检测远程同源蛋白质(T);(2)U和T的序列必须被正确地比对或对比排列;(3)修改一般的同源模型化过程,以应用于相似度非常低的情况,即处理更多的环区,建立合理的三维结构模型。检测远程同源蛋白质是一个基本问题,而正确比对U和T的氨基酸序列则是更为复杂的......阅读全文
蛋白质三级结构预测-线索化法
线索化模型产生的背景及发展上面已经提到,两个自然进化的蛋白质如果具有30%的等同序列,则它们是同源的蛋白质,具有基本相同的三维结构。那么,其余的是否就不是同源的呢?实际并非如此。在最新的蛋白质数据库PDB中,有上千对蛋白质具有同源的空间结构,但它们的序列等同部分小于25%,即远程同源。许多结构相似的
线索细胞的简介
线索细胞是加特纳菌或小杆菌感染正常的鳞状上皮细胞,使正常的上皮细胞形态发生改变,如边缘不整齐、粗糙、透明度不高等。其为阴道脱落上皮细胞上黏附大量加特纳杆菌等厌氧菌的一种形态表现。当阴道分泌物中出现大量线索细胞时,一般预示患了细菌性阴道病。当然还要结合其他几项重要指标来确诊,一般是pH值、胺试验及
世纪肿瘤提供罕见线索
在英国伦敦大奥蒙德街儿童医院档案馆的地下室中存放着很多病例,癌症研究专家Sam Behjati希望能够让医院的历史为未来作贡献。5月2日,他和同事发表了研究结果:对近一个世纪之前该医院收集的3名儿童的肿瘤样本基因组进行了DNA测序。 这些历史上的细胞帮助解决了一个现代问题:罕见癌症肿瘤样本数量
绿茶与防癌:新线索
绿茶与前列腺癌 洛杉矶加利福利亚大学David Geffen医学院副教授M.Henning博士说,饮用绿茶的前列腺癌患者,与不饮用绿茶的患者比,前列腺组织的炎症较轻,这与癌生长和其他变化有关。 “我们可以表明绿茶多酚(抗氧化剂)到达前列腺组织,并减轻其炎症,”她说。多酚是保护细胞
致命菌起源获线索
深圳华大基因研究院5日公布最新研究结果表示,引起欧洲疫情爆发的病原菌或起源于2001年在德国分离到的肠出血型大肠杆菌。 研究小组表示,通过对2001年与今年爆发菌株的基因组比较分析,将极大地助于进一步阐明为什么导致这次疫情的菌株致病能力如此之强;并将为疾病的起源、传播和来源提供线索。这将为
酶固定化技术固定化方法交联法
交联法是用多功能试剂进行酶蛋白之间的交联,使酶分子和多功能试剂之间形成共价键,得到三向的交联网架结构,除了酶分子之间发生交联外,还存在着一定的分子内交联。多功能试剂制备固定化酶方法可分为:( 1) 单独与酶作用;( 2) 酶吸附在载体表面上再经受交联;( 3) 多功能团试剂与载体反应得到有功能团的载
酶固定化技术固定化方法吸附法
吸附法是利用物理吸附法,将酶固定在纤维素、琼脂糖等多糖类或多孔玻璃、离子交换树脂等载体上的固定方式。显著特点是:工艺简便及条件温和,包括无机、有机高分子材料,吸附过程可同时达到纯化和固定化;酶失活后可重新活化,载体也可再生。但要求载体的比表面积要求较大,有活泼的表面。
酶固定化技术固定化方法包埋法
包埋固定化法是把酶固定聚合物材料的格子结构或微囊结构等多空载体中,而底物仍能渗入格子或微囊内与酶相接触。这个方法比较简便,酶分子仅仅是被包埋起来,生物活性被破坏的程度低,但此法对大分子底物不适用。1) 网格型将酶或包埋在凝胶细微网格中,制成一定形状的固定化酶,称为网格型包埋法。也称为凝胶包埋法。2)
酶固定化技术固定化方法吸附法
吸附法是利用物理吸附法,将酶固定在纤维素、琼脂糖等多糖类或多孔玻璃、离子交换树脂等载体上的固定方式。显著特点是:工艺简便及条件温和,包括无机、有机高分子材料,吸附过程可同时达到纯化和固定化;酶失活后可重新活化,载体也可再生。但要求载体的比表面积要求较大,有活泼的表面。
线索细胞的注意事项
检查线索细胞前三天禁止性交,并在前一天的晚八时以后应禁食。且检查应在月经干净后的3~7天。在检查时可能会对身体及心理造成负担,应放松心情。
DNA提供鸟类迁徙新线索
每年秋天,数不清的鸣鸟会离开它们在美国和加拿大的繁殖区,向南飞至墨西哥和中美洲过冬。鸣鸟通常在晚上飞行以躲避老鹰。但它们到底去了哪里以及如何飞至目的地一直是一个谜。日前,一个团队通过分析其羽毛上的DNA 给出了关于鸟类迁徙的新线索。华盛顿州西雅图市北方鸣禽保护协会的Jeff Wells说:“尽管
线索细胞的临床意义
检查线索细胞需要做涂片染色,但不包含在常规检查之中。主要是结合其他的检查项目来确定是否有阴道炎及指导用药。细菌性阴道病诊断的金标准是革兰染色发现线索细胞。在镜检时发现大量短小杆菌及上皮细胞,酸碱度,胺试验为常用的检测方法。一般的描述是:线索细胞来自于大型扁平上皮细胞,其表面附着有大量的短杆菌,表
线索细胞的注意事项
检查线索细胞前三天禁止性交,并在前一天的晚八时以后应禁食。且检查应在月经干净后的3~7天。在检查时可能会对身体及心理造成负担,应放松心情。
线索细胞的临床意义
检查线索细胞需要做涂片染色,但不包含在常规检查之中。主要是结合其他的检查项目来确定是否有阴道炎及指导用药。细菌性阴道病诊断的金标准是革兰染色发现线索细胞。在镜检时发现大量短小杆菌及上皮细胞,酸碱度,胺试验为常用的检测方法。一般的描述是:线索细胞来自于大型扁平上皮细胞,其表面附着有大量的短杆菌,表
免疫组化SABC法与SV法
实验概要本文介绍了免疫组化SABC法与SV法。实验原理SABC(Strept Avidin-Biotin Complex)法是一种显示组织和细胞中抗原分布的简便而敏感的免疫组化染色方法。亲和素(Avidin)存在于鸡蛋中,分子量67000。是一种碱性蛋白质,具有对生物素近乎于共价键的结合力。链霉亲和
免疫组化SABC法与SV法
实验概要本文介绍了免疫组化SABC法与SV法。实验原理SABC(Strept Avidin-Biotin Complex)法是一种显示组织和细胞中抗原分布的简便而敏感的免疫组化染色方法。亲和素(Avidin)存在于鸡蛋中,分子量67000。是一种碱性蛋白质,具有对生物素近乎于共价键的结合力。链霉亲和
什么是低温原子化法?
低温原子化法又称化学原子化法,是指原子吸收光谱法中使元素化合物在低温下(室温乃至数百摄氏度)热解。低温原子化法中原子化温度为室温至摄氏数百度。常用的有汞低温原子化法及氢化法。
色谱归一化定量法
定量测量时,可根据供试品的具体情况采用峰面积法或峰高法,测定杂质含量时须采用峰面积法。1、内标法加校正因子测定供试品中某个杂质或主成分含量(1)按各品种项下的规定,精密称(量)取对照品和内标物质,分别配成溶液,精密量取各溶液,配成校正因子测定用的对照溶液。取一定量注入仪器,记录色谱图。测量对照品和内
骨髓检查:检验疾病的重要线索
前 言疾病的发生和进展经历了分子阶段-蛋白水平-细胞改变-疾病宏观表现等过程。随着人们对疾病认识程度的增加、医学检验手段的革新,许多未知领域得以突破。众所周知,骨髓是血细胞起源和分化的场所,因此骨髓检查可以提供疾病的重要线索,疾病状态下骨髓微观环境的改变不容忽视。几种常见的骨髓检查手段:骨髓涂片骨
在显微镜下搜寻线索
在显微镜下搜寻线索如果只调换了照片, 而且调换时非常谨慎, 那么, 排版或数据读出方面不会露出任何破绽。 因此, 查找线索的唯一方法就是利用显微镜了。 有时, Fischer 将身份证弯曲, 放在桌子边缘, 然后弯下身观察插入的图像边缘。 如果他发现身份证侧面存在撕裂纤维, 而该撕裂纤维与图像后面不
-肠道菌群:法医破案新线索
通过肠道微生物侦查凶手,图片来自斯考特斯溪谷社区学院 在我们的肠道中,大约有10万亿个细菌——这是一件好事。这些菌群帮助我们的身体消化食物、支持免疫系统、保证胃肠道健康,同时它们也因此获得稳定的食物供应。 但是当人去世后,这些友好的肠道菌群迅速变成肠道敌人。没有了食物,这些微生物通过循环系统逃离
《PLOS》:修复受损脊髓的新线索
青蛙、狗、鲸鱼、蜗牛等许多动物的神经受损之后都可以再生,但是人类和灵长类动物却不能。最近,美国索尔克生物研究所的一项最新研究表明,一种小分子或许可以使受损的神经生长,并有效地重新连接神经电路。这种壮举最终可能为严重脊髓损伤和瘫痪患者带来新的治疗方法。 相关研究结果发表在2014年8月5日的《P
古老星系形成新线索找到了
早期宇宙星暴星系中核球结构的形成过程以及这一过程与当今宇宙巨型椭圆星系演化联系示意图。受访者供图■本报记者袁一雪宇宙浩瀚无垠,存在许多星系。有的星系具有明显的螺旋臂结构,看起来像一个旋转的圆盘,充满了年轻的恒星和气体,被称为旋涡星系,比如人类所在的银河系;有的星系中央则有一个庞大而明亮的核球,由大量
临床化学检查方法介绍线索细胞
线索细胞介绍: 线索细胞是指阴道脱落上皮细胞上粘附大量加特纳杆菌等厌氧菌的一种形态表现。于细胞边缘贴附大量颗粒状物即加德纳尔菌。细菌边缘不清。线索细胞正常值: 检查结果呈阴性。线索细胞临床意义: 异常结果: 检查结果呈阳性,即阴道分泌物中出现大量线索细胞,一般预示患了细菌性阴道病,还要结合其
海藻或为治疗疟疾提供线索
美国研究人员2月21日说,他们发现一类特殊海藻。这类海藻可释放某种天然物质,以化学方法抵御菌类感染。这一发现有助于研发抗疟药物。 疟疾,这种由疟原虫引起的虫媒传染病每年在全球致死逾百万人。由于疟原虫对传统抗疟药物逐渐产生抗药性,新型抗虐药物研发提上日程。 研究人员在华盛顿举行的一场
Cell揭示自闭症新线索
去年十二月,研究人员在一些自闭症患者中鉴别出了1000多个基因突变,但对于这些突变提高自闭症风险的机制却仍不清楚。现在来自北卡罗来纳大学医学院的研究人员首次揭示出了,其中的一种突变使得一个基因中的分子开关丧失功能,引起自闭症的机制。 在发表于今天《细胞》(Cell)杂志上的一篇论文中,研究人员
各显神通!浅谈归一化法、内标法、外标法及标准加入法
面积归一法、内标法、外标法、标准加入法。这么多定量法,用哪一种呢?每一种的适用范围是什么呢?其优缺点又是什么?其标准物又有什么要求呢?看完你就都知道了。 1、归一化法 把所有出峰的组分含量之和按100%计的定量方法,称为归一化法,各成分校正因子一致时可用该法。 归一化法的优点: 该法简便
微胶囊化尼龙珠法酶固定化实验
微胶囊化尼龙珠法 实验方法原理 实验材料 酶溶液
微胶囊化尼龙珠法酶固定化实验
实验方法原理 实验材料 酶溶液试剂、试剂盒 碳酸氢钠癸二酰二氯化合物溶液磷酸钾NaCl实验步骤 实验所需「试剂」具体见「其他」相同体积的酶和 1,6-己烷溶液混合,为了尼龙珠子在形成的时候彼此不相互接触,癸二酰二氯化合物溶液用微量注射器缓慢注入混合液中。5 min 后,有机相被轻轻倒出,在有
微胶囊化尼龙珠法酶固定化实验
实验方法原理实验材料酶溶液试剂、试剂盒碳酸氢钠癸二酰二氯化合物溶液磷酸钾NaCl实验步骤实验所需「试剂」具体见「其他」相同体积的酶和 1,6-己烷溶液混合,为了尼龙珠子在形成的时候彼此不相互接触,癸二酰二氯化合物溶液用微量注射器缓慢注入混合液中。5 min 后,有机相被轻轻倒出,在有机溶液完全挥发后