基于质谱的空间蛋白质组学系统研究方法

蛋白质亚细胞定位及其动态变化过程对于蛋白质功能至关重要。随着鸟枪法蛋白质组学的发展,通过亚细胞分离及质谱技术同时测定数千个蛋白质稳态定位的“蛋白质组学显微镜(proteomic microscope)”出现了。然而,表征因扰动导致的亚细胞定位变化的工具却一直局限在光学显微镜,每次仅能成像一个或几个蛋白。 德国马克思·普朗克生物化学研究所Borner实验室提供了一套获取“动态细胞器分布图谱(Dynamic Organellar Maps)”的方法。这是一种灵敏的,类似于蛋白质组学显微镜的方法,可以分析蛋白质亚细胞定位的变化。这套简单、快速、可靠的方法结合了差速离心亚细胞分离法,定量质谱,以及一套标准化的生物信息处理流程。仪器方面仅需质谱和超速离心机。所有下游分析都由免费软件完成,无需蛋白质组学或生物信息学专业知识。 该法可用于各种均相或原代细胞培养,只用极少量(1毫克)蛋白质作原料,且适用于各种生物环境。该方法成功应用的案......阅读全文

蛋白质的空间结构包括哪些

蛋白质是一种生物大分子,基本上是由20种氨基酸以肽键连接成肽链。肽键连接成肽链称为蛋白质的一级结构。不同蛋白质其肽链的长度不同,肽链中不同氨基酸的组成和排列顺序也各不相同。肽链在空间卷曲折叠成为特定的三维空间结构,包括二级结构和三级结构二个主要层次。有的蛋白质由多条肽链组成,每条肽链称为亚基,亚基之

基于质谱的空间蛋白质组学系统研究方法

  蛋白质亚细胞定位及其动态变化过程对于蛋白质功能至关重要。随着鸟枪法蛋白质组学的发展,通过亚细胞分离及质谱技术同时测定数千个蛋白质稳态定位的“蛋白质组学显微镜(proteomic microscope)”出现了。然而,表征因扰动导致的亚细胞定位变化的工具却一直局限在光学显微镜,每次仅能成像一个或几

蛋白质的四级结构空间构象和功能的关系

一、四级结构的组成  大分子蛋白质常由多条多肽链所组成,每条多肽链各具独立的三级结构。蛋白质的四级结构是指几个各具独立三级结构之多肽链的相互结集、以特定的方式接触、排列形成更高层次的大分子蛋白质的空间构象。在蛋白质四级结构中,每个各具独立三级结构的多肽链称为亚基。组成蛋白质的亚基数多为偶数,可以是同

神舟十七号成功发射-空间蛋白质展开5项研究

  据中国载人航天工程办公室消息,北京时间2023年10月26日11时14分,搭载神舟十七号载人飞船的长征二号F遥十七运载火箭在酒泉卫星发射中心点火发射,约10分钟后,神舟十七号载人飞船与火箭成功分离,进入预定轨道,航天员乘组状态良好,发射取得圆满成功。  记者从中国科学院空间应用工程与技术中心(以

CEInfinite:-全柱成像新技术-拓展蛋白质分析无限想象空间

出色的重复性和超高分辨率   CE-WCID(全柱成像毛细管等电聚焦电泳仪)具有超高的蛋白质pI点的分辨率(△pI

蛋白质三级机构(空间结构)预测-从头预测法

H-P模型是基于三种简化的,即蛋白质中各个氨基酸残基的α碳原子都位于二维网格或三维网格的格点上,疏水作用是蛋白折叠中唯一的重要因素,同时通过计算疏水残基接触的数目代替构象的能量计算。虽然这样的处理非常简单,但是,通过H-P模型的计算分析,能够发现蛋白质折叠的一些机制。如果在蛋白质模型中取消氨基酸定位

蛋白质三级机构(空间结构)预测-从头预测法...1

从头预测模型的基本思想在既没有已知结构的同源蛋白质、也没有已知结构的远程同源蛋白质的情况下,上述两种蛋白质结构预测的方法都不能用,这时只能采用从头预测方法(Abinitio),即(直接)仅仅根据序列本身来预测其结构。在1994年之前,还没有一个从头算方法能够预测蛋白质的空间结构。从那以后,人们陆续提

Science-Advances:一种新的单细胞空间蛋白质组学成像技术

  人体细胞表达的蛋白质种类超过几万种,而不同的蛋白质在细胞的定位也不一样。蛋白质亚细胞定位还会涉及到细胞功能异常和疾病。而空间蛋白质组学正是研究蛋白质在亚细胞上的定位、表达及其在亚细胞水平上的动力学,属于蛋白质组学的研究范畴。目前研究空间蛋白质组学分析的方法主要有两种:基于细胞器分离的质谱法和基于

布鲁克和景杰生物:单细胞和空间蛋白质组技术推动精准医疗

2023年9月24-27日,为促进蛋白质组学的研究和学科发展,增进国际间合作交流,由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)主办的第十二届中国蛋白质组学大会在四川成都隆重召开。本次大会的主题是“人体蛋白质组的导航者(π-HuB项目):通往智慧医学之路”。大会聚焦蛋白质组学的最新

亚太空间合作组织访问空间中心

  4月12日,亚太空间合作组织(Asia-Pacific Space Cooperation Organization,简称APSCO)张伟秘书长一行15人访问中科院空间科学与应用研究中心,并与中心主任吴季、副主任王赤、主任助理刘和光及史建魁研究员等举行了富有建设性的友好会谈。  

蛋白质的一级结构及空间结构主要取决于结构基

 一、氨基酸是构成蛋白质的基本化学成分  有20种由遗传密码所决定的标准氨基酸,根据侧链的化学性质,可分为疏水氨基酸〔Ala(A),Val(V),Le u(),lie(互),Phe(F),Pro(P)和Met(M)」、带电氨基酸[Asp(D),Gin(E),Lys(K)和Arg(R)]、极性氨基酸[

空间蛋白质组学:一种强大的细胞生物学发现工具

真核细胞高度区室化,生物过程被分隔在不同的区室进行。蛋白质功能与亚细胞定位密切相关,不同的区室提供不同的化学环境(例如pH和氧化还原条件)、不同的潜在作用配体或底物。因此,对蛋白质亚细胞定位的严格控制是细胞生理学的重要调控内容。大多数细胞生物学过程涉及蛋白质亚细胞定位的变化,例如转录因子在细胞核-胞

阿尔法(α)磁谱仪空间探测

2016年12月8日,正值阿尔法磁谱仪(AMS)进入太空运行的五年之际,该项目的主持人、诺贝尔物理奖获得者、美籍华人科学家丁肇中教授在欧洲核子中心(CERN)发布了AMS五年太空实验的结果。丁肇中认为,AMS项目做了五年,得出了很多不一样的结论,颠覆了我们对宇宙线的认识。这次发布的太空实验结果,表明

中国载人航天将会从近地空间走向地月空间

中国载人航天工程办公室主任郝淳17日在国新办新闻发布会上表示,纵观世界载人航天事业发展历程,月球一直是载人航天走向深空的一块热土,中国载人航天也将会从近地空间走向地月空间,进而迈向深空。在进行空间站研制建设的同时,我们也开展了载人月球探测关键技术攻关和方案深化论证。他说:“我相信,在不远的将来,中华

国家空间科学中心:坚守空间科学的国家使命

  “空间科学卫星计划”是中科院牵头实施的战略性先导科技专项中第一批启动的项目之一。负责该计划的国家空间科学中心再次站到了我国科技发展的大路口,义不容辞地扛起了发展我国空间科学的大旗,成为在我国牵头实施空间科学卫星系列的核心科研机构。 空间中心怀柔新园区   从“地球空间双星探测计划”,到国家重

商业空间站火爆,近地空间渐入佳境

  8月初,欧洲空客公司决定参与美企的商业空间站项目。随着航天技术进步,近地空间开发不再局限于商业卫星、短暂太空游,而是希望降低经济门槛,向着更宽广的领域迈进。随着新技术和新商业模式密切结合,太空旅游、建设商业空间站等近地空间开发活动需要克服哪些技术难关?又将呈现怎样的发展前景呢?  跨国联合 着眼

SUNYBuffalo-曲峻教授:3D打印微支架助力的空间蛋白质组学

  “Westlake Proteomics Series” (WeOmics)系列研讨会 由西湖大学Guomics实验室,西湖实验室iMarker实验室,CN-HUPO,The Proteomic Navigator of the Human Body (π-HuB) Project共同举办,并由

空间中心组织首次春季临近空间环境综合观测实验

  2011年春季,中国科学院空间科学与应用研究中心组织了我国首次春季临近空间环境综合探测实验,在空间中心河北廊坊临近空间环境野外科学观测研究站(以下简称廊坊临近空间野外站)利用综合探测设备获取我国上空直至120km的临近空间环境多参量数据。目前该实验仍在进行中,且进展顺利。  此次实验自今年3月底

空间中心代表团参加美国空间天气研讨会

  4月26日至29日,中科院空间科学与应用研究中心空间环境研究预报室(以下简称预报室)一行三人赴美参加了空间天气研讨会(Space Weather Workshop)。此次会议由美国国家海洋和大气局空间天气预报中心(NOAA/Space Weather Prediction Center)主办。 

开放合作,闯出多少空间

   开放合作,对我国科学家来说并不陌生,这是科研工作中的必然活动。但与20年前甚至10年前不同的是,我们正在从跟在别人身后的“学生”,成为并肩而行的合作者甚至主导者,合作空间也更宽广。开放合作与科技创新发展的关系,也正从“被动跟随、服务辅佐”转变到“主动布局、支撑引领”。   国际科技合作已成

电石市场仍有上涨空间

  截至上周末,国内电石主流采购价格3370元(吨价,下同),较周初上涨100元;各企业出厂价格也陆续站上3000元关口。“受内蒙古地区限电影响,电石市场供应缩减,预计短期市场继续上行。”隆众资讯电石分析师张仲英等业内人士分析认为。  限电缩减供应  “内蒙古地区沙圪堵薛家湾有30台小电石炉,年前因

技术打开基质市场空间

  基质栽培技术以其省工省力、节水节肥、减少环境污染、避免连作障碍、减少农药投入、保障农产品安全等诸多优点逐渐被蔬菜种植、林业育苗、草坪种植、中草药和水稻育苗产业所认可。图片来源网络  泥炭是一种经过几千年所形成的天然沼泽地产物(又称为草炭或是泥煤),是煤化程度最低的煤,同时也是煤最原始的状态,无菌

什么是自由空间?

真空体积法进行物理吸附实验是在一个密闭空间进行的。样品管阀门以上的歧管体积和样品管阀门以下的体积共同组成了静态容量法物理吸附测量中所需的系统体积,在后者的这个空间中(即样品管的空间中),除了样品所占据的体积,剩余的空间就是自由空间(free  space),其所占据的体积叫死体积(voidvol

VHP空间灭菌方法研究

1.目前空间灭菌方法简介灭菌方法有如下几种:有物理方法、化学方法及生物方法,生物方法利用生物因子去除病原体,作用缓慢,而且灭菌不彻底,一般不采用,故灭菌主要应用物理及化学方法。物理灭菌消毒方法有很多种,用在空间灭菌的方法主要有辐射法。引化学法灭菌能力强,故目前在医疗防疫制药工业中应用最广。以下几种灭

色差仪的颜色空间

  色差仪 均匀颜色空间(LAB ,LUV)是CIE为了减少对颜色距离的变形而定义的色空间。这两种色空间明度值L*的计算是完全一样的,都近似是亮度值Y的立方根函数(比较接近我们对于光亮度的对数响应)。这两种色空间都试图成为一个在颜色感觉上均匀的色空间,换句话说就是,空间中两个点之间的距离预示了两种颜

VHP空间灭菌方法研究

1.目前空间灭菌方法简介灭菌方法有如下几种:有物理方法、化学方法及生物方法,生物方法利用生物因子去除病原体,作用缓慢,而且灭菌不彻底,一般不采用,故灭菌主要应用物理及化学方法。物理灭菌消毒方法有很多种,用在空间灭菌的方法主要有辐射法。引化学法灭菌能力强,故目前在医疗防疫制药工业中应用最广。以下几种灭

酶的空间结构

空间结构它们通过多肽链的盘曲折叠,组成一个在酶分子表面、具有三维空间结构的孔穴或裂隙,以容纳进入的底物与之结合并催化底物转变为产物,这个区域即称为酶的活性中心。不过酶的活性中心(active center)只是酶分子中的很小部分。酶催化反应的特异性实际上决定于酶活性中心的结合基团、催化基团及其空间结

澳大利亚成立首个空间机构-关注空间科学商业价值

  UNSW-EC0 是一颗在澳大利亚新南威尔士大学制造的卫星,它于2017 年搭乘美国的火箭飞入太空。图片来源:新南威尔士大学本报讯 澳大利亚5月8日宣布成立该国第一个空间机构,尽管其重点显然关注于空间科学的商业利用方面,但研究人员也希望会涉及纯粹的科学研究。 据澳大利亚媒体日前报道

科技部:498家众创空间为国家备案众创空间

科技部关于印发2020年度国家备案众创空间的通知国科发火〔2020〕104号各省、自治区、直辖市及计划单列市科技厅(委、局),新疆生产建设兵团科技局,各有关单位和企业:  为引导众创空间健康发展,发挥创业带动就业示范效应,营造良好创新创业环境,根据《国务院办公厅关于发展众创空间推进大众创新创业的指导

VOC检测仪在开放空间和密闭空间中的使用

VOC检测仪在开放空间中的使用在开放的工作车间中,采用便携式的VOC检测仪,可以随时、随地、精确地显示现场的VOC浓度情况。有的便携式VOC检测仪还配有振动警报附件,以免在噪声中听不到报警声音。VOC检测仪在密闭空间中的使用在密闭空间中使用VOC检测仪应注意易燃有害气体,例如反应罐、下水道、船运货舱