大肠杆菌杂交及基因定位

一、原理 大肠杆菌染色体呈环状。高频重组菌株(Hfr)的染色体上整合有F因子,当Hfr细菌与F-细菌细胞发生接合(即杂交)时Hfr细胞(供体菌)的染色体从Hfr细胞向F-细胞内转移。由于染色体的转移具有一定的方向性,并且可以随时中断,因此根据结合后F-细菌(以重组子形式选出)中Hfr细菌染色体基因出现次数的多少,即可得知基因转移的先后顺序,也就是说基因在染色体上排列的顺序。转移时,靠近转移起始点的染色体基因进入F-细胞的机率大,重组频率高,远离转移起始点的基因进入F-细胞的机会少,重组率低,F因子大部分位于转移起始点相对的一端(末端)。因此转移的频率很低。只有当接合时间很长,足以使整个染色体转入F-细胞(受体)时,才会使F-细胞转变为Hfr或F+状态。 基因定位时首先要从Hfr与F-细菌的混合培养物中筛选出某一Hfr与F-细菌基因(选择性标记基因)已经发生了重组的细菌(重组子),然后在......阅读全文

Southern印迹及基因组DNA杂交技术实验

实验材料 基因组 DNA试剂、试剂盒 限制性缓冲液仪器、耗材 琼脂糖凝胶实验步骤 1. 7~20 μg 基因组 DNA 稀释到 500 μl 合适的限制性缓冲液中。4℃ 过夜。2. 每管加 10~20 单位限制性酶。孵育 4~6 小时。10 μl 消化液在小琼脂糖凝胶上电泳检测消化的程度。如果需要,

大肠杆菌基因型及遗传符号说明系列一

实验室的一般大肠杆菌拥有4288条基因,每条基因的长度约为950bp,基因间的平均间隔为118bp(基因Ⅷ)。E.coli基因组中还包含有许多插入序列,如λ-噬菌体片段和一些其他特殊组份的片段,这些插入的片段都是由基因的水平转移和基因重组而形成的,由此表明了基因组具有它的可塑造性。利用大肠杆菌基因组

分子杂交——Southern基因检测

实验概要将待检测的DNA样品固定在固相载体上,与标记的核酸探针进行杂交,在与探针有同源序列的固相DNA的位置上显示出杂交信号。通过Southern杂交可以判断被检测的DNA样品中是否有与探针同源的片段以及该片段的长度。该项技术广泛被应用在遗传病检测、DNA指纹分析和PCR产物判断等研究中。但由于该技

分子杂交——Northern基因检测

实验概要Northern杂交采用琼脂糖凝胶电泳,将分子量大小不同的RNA分离开来,随后将其原位转移至固相支持物(如尼龙膜、硝酸纤维膜等)上,再用放射性(或非放射性)标记的DNA或RNA探针,依据其同源性进行杂交,最后进行放射自显影(或化学显影),以目标RNA所在位置表示其分子量的大小,而其显影强度则

Cell:基因定位听命于谁?

   生物通报道 来自美国国立卫生研究院下属国家癌症研究所(NCI)的科学家们,利用新型的大规模成像技术绘制出了个别基因在人类细胞核中的空间位置,并确定了50个细胞因子是基因正确三维(3D)定位的必要条件。这些空间定位对基因表达、DNA修复、基因组稳定性和其他的细胞活动起重要的作用。这项研究发布在8

基因测定方法单元化定位法

在构窠曲霉这一类真菌的准性生殖过程中,杂合二倍体细胞在有丝分裂时常随机地丢失它的染色体。染色体在多次有丝分裂过程中逐条丢失而使二倍体细胞终于转变为单倍体细胞的过程称为单元化。如果一对染色体中带有显性的野生型基因的染色体丢失了,那么同源染色体上隐性基因的性状便得以表现。此外,通过体细胞交换也可以从杂合

基因定位方法介绍连锁群法

利用近着丝粒距离基因的定位法  如果某一染色体上有一个离着丝粒距离较近的已知基因,另外有一个基因同样离着丝粒很近,可是不知道它是否属于同一染色体。把这样两个突变型品系进行杂交,如果这两个基因属于同一染色体,它们之间的重组频率不应超过两者的着丝粒距离之和;如果它们不属于同一染色体,那么它们的重组频率应

基因转变的梯度定位法介绍

一个基因内部的各个点突变的基因转变常呈梯度现象,即在这基因的一端发生基因转变的频率最高,在另一端则最低,在两端之间存在着一个转变频率的梯度。对于任何一个未知位置的点突变,可以通过基因转变频率的测定进行精细结构定位。这一方法的应用限于一次减数分裂产物包被在一个囊里面的子囊菌,而且限于影响子囊孢子颜色和

缺失定位———基因精细结构分析

实验方法原理 如果某一待测缺失突变株能和一种已知缺失突变株进行重组,表明这一待测突变的位置一定不在已知缺失区域内。如果不能重组,待测定菌株突变位置便在已知缺失范围内。菌株A、B、C的缺失区域是已知的,另外有一系列点突变菌株1、2、3和4。分别将它们两两滴加在固体培养基表面的同一位置上,根据是否出现野

用共缺失法进行基因定位

共缺失法缺失带来和基因突变相同的表型。由一次缺失所造成的突变只涉及相邻接的基因,因此可以从缺失所带来的基因突变的分析来测定一些基因的相对位置,这一方法被广泛应用于酵母菌的线粒体基因的定位(见染色体外遗传)。根据基因行为的定位  基因的某些行为可以反映它们的位置。在细菌接合过程中“雄性”细菌的染色体基

基因定位方法介绍假连锁法

相互易位杂合体只有在减数分裂过程中通过交互离开所形成的平衡配子才能够存活,并使非同源染色体上的基因显示假连锁现象(见染色体畸变)。所以把带有属于已知染色体的标记基因的相互易位品系作为测交品系和一个突变型品系杂交,如果发现这一突变基因经常和标记基因的野生型等位基因相连锁,就可以判定突变基因一定在相互易

用标记获救法进行基因定位

标记获救法这是一种结合物理图谱制作和遗传学分析的基因定位方法,它适用于病毒等基因组较小的生物。以大肠杆菌噬菌体ΦX174为例,把野生型噬菌体的双链复制型DNA分子用限制性内切酶HindⅡ切为13个片段,把每种片段和突变型 amg的DNA单链在使DNA分子变性并复性的条件下混合保温,然后用各个样品分别

缺失定位———基因精细结构分析

实验方法原理如果某一待测缺失突变株能和一种已知缺失突变株进行重组,表明这一待测突变的位置一定不在已知缺失区域内。如果不能重组,待测定菌株突变位置便在已知缺失范围内。菌株A、B、C的缺失区域是已知的,另外有一系列点突变菌株1、2、3和4。分别将它们两两滴加在固体培养基表面的同一位置上,根据是否出现野生

分子杂交——Southern基因检测2

C.转移按凝胶的大小剪裁NC膜或尼龙膜并剪去一角作为标记,水浸湿后,浸入转移液中5min。剪一张比膜稍宽的长条Whatman 3mm滤纸作为盐桥,再按凝胶的尺寸剪3-5张滤纸和大量的纸巾备用。按下图所示进行转移。( 转移过程一般需要8-24hr,每隔数hr换掉已经湿掉的纸巾。转移液用20×S

杂交与转基因的区别

   杂交是自然界广泛存在的一种农作物育种方法。杂交分为近源杂交和远源杂交,近源杂交一般是种内杂交,比如黑人和白人结婚,生下混血儿一样。远缘杂交是种间杂交,但是也必须是遗传密码近似的种类才行。比如驴和马杂交生出骡子。  转基因技术是利用现代生物技术,将人们期望的目标基因,经过人工分离、重组后,导入并

outhern印迹及基因组DNA杂交技术实验——Southern-印迹

实验方法原理硝酸纤维膜或尼龙滤膜对单链DNA的吸附能力很强,当电泳后凝胶经过DNA变性处理,覆以上述滤膜,再于其上方压上多层干燥的吸水纸,借助它对深盐溶液的上吸作用,凝胶上的单链DNA将转移到滤膜上。转移是原位的,即DNA片段的位置保持不变。转移结束后,经过80℃烘烤的DNA,将原位地固定于膜上。实

简述密码子的基因定位功能

  密码子的使用模式在细胞核和细胞质遗传物质之间也存在差异,如核基因中的起始密码子只有ATG,而线粒体基因中的起始密码子为ATN;核基因中的终止密码子TGA在线粒体基因中用来编码色氨酸等。因此,可以通过比较密码子的使用模式,来进行真核生物核糖体在细胞内以及未知基因在基因组的定位。

基因定位方法介绍直接观察法

易位(见染色体畸变)使染色体上的基因改变连锁关系,所以易位可以用来进行基因定位。如果易位所涉及的染色体是可以被识别的,那就更有利于定位工作。如果在遗传学分析中发现某两个连锁群的连锁关系都发生了改变,同时在显微镜下又可以辨认出有两个染色体发生了相互易位,那么就可以知道两个连锁群和两个染色体的对应关系。

基因测定的方法单元化定位法

单元化定位法基因定位在构窠曲霉这一类真菌的准性生殖过程中,杂合二倍体细胞在有丝分裂时常随机地丢失它的染色体。染色体在多次有丝分裂过程中逐条丢失而使二倍体细胞终于转变为单倍体细胞的过程称为单元化。如果一对染色体中带有显性的野生型基因的染色体丢失了,那么同源染色体上隐性基因的性状便得以表现。此外,通过体

密码子的应用基因定位功能

密码子的使用模式在细胞核和细胞质遗传物质之间也存在差异,如核基因中的起始密码子只有ATG,而线粒体基因中的起始密码子为ATN;核基因中的终止密码子TGA在线粒体基因中用来编码色氨酸等。因此,可以通过比较密码子的使用模式,来进行真核生物核糖体在细胞内以及未知基因在基因组的定位。

物理图谱进行基因定位的方法介绍

原核生物 DNA分子上缺乏天然的容易识别的标记,可用限制图谱和部分变性图的测定来弥补这一不足。各种限制性核酸内切酶具有各自的识别顺序。这些识别顺序可以作为DNA部位的标记,用不同的限制酶处理同一DNA分子,通过对酶切产生的DNA片段的大小和位置的分析,可以绘制出某一 DNA分子的限制图谱。此外,每一

用共转导法进行基因定位

共转导法公式2每一种转导噬菌体有一定的大小,只能携带一定长度的供体细菌的 DNA。例如大肠杆菌噬菌体PI的头部中只能包装大约分子量为5.8×10的DNA,大肠杆菌的染色体DNA的分子量是2.5×10,所以PI所能包装的 DNA至多相当于大肠杆菌的遗传学图上相距两分钟这样一段DNA分子。如果两个基因能

标记获救法进行基因定位的方法介绍

每一种转导噬菌体有一定的大小,只能携带一定长度的供体细菌的 DNA。例如大肠杆菌噬菌体PI的头部中只能包装大约分子量为5.8×10的DNA,大肠杆菌的染色体DNA的分子量是2.5×10,所以PI所能包装的 DNA至多相当于大肠杆菌的遗传学图上相距两分钟这样一段DNA分子。如果两个基因能同时被转导,这

共转导法方法介绍

共转导法公式2每一种转导噬菌体有一定的大小,只能携带一定长度的供体细菌的 DNA。例如大肠杆菌噬菌体PI的头部中只能包装大约分子量为5.8×10的DNA,大肠杆菌的染色体DNA的分子量是2.5×10,所以PI所能包装的 DNA至多相当于大肠杆菌的遗传学图上相距两分钟这样一段DNA分子。如果两个基因能

分子杂交基因探针的类型介绍

分子杂交基因探针根据标记方法不同可粗分为放射性探针和非放射性探针两大类,根据探针的核酸性质不同又可分为DNA探针,RNA探针,cDNA探针,cRNA探针及寡核苷酸探针等几类,DNA探针还有单链和双链之分。

比较基因组杂交芯片介绍

  比较基因组杂交芯片(Comparative Genomic Hybridization Array)、基于芯片的比较基因组杂交(Microarray-based comparative genomic hybridization)或者阵列比较基因组杂交技术(array comparative g

比较基因组杂交方法介绍

比较基因组杂交是将消减杂交、荧光原位杂交相结合,用于检测DNA序列的拷贝数变异并将其定位在染色体上的方法。CGH 只能检测不平衡的染色体改变。结构染色体变异,例如:平衡的相互易位或倒位不能被检测出来,因为拷贝数没有变化。CGH最初设计是用来检测单一副本缺失的,所以它的的区带长度至少5~10Mbarr

比较基因组杂交芯片介绍

比较基因组杂交芯片(Comparative Genomic Hybridization Array)、基于芯片的比较基因组杂交(Microarray-based comparative genomic hybridization)或者阵列比较基因组杂交技术(array comparative gen

DNA微阵列检测基因表达水平及识别基因序列

  Schena等1996年用拟南芥光调基因微阵列,以不同器官中的mRNA为探针,检测其基因表达水平,结果表明叶mRNA的表达水平是根的500倍。Shelon等1996年将酿酒酵母基因组DNA克隆制成微阵列,用6条最大染色体和10条最小染色体DNA探针分别标记上红,绿荧光标记进行杂交检测,结果表明9

英研究表明:“说话基因”帮蝙蝠回声定位

一个与人类语言进化相关的基因可能同时帮助蝙蝠喊出了自己的声音。根据一项新的研究,为了寻找猎物及躲避障碍物,不同种类的蝙蝠都会发出高频尖叫声,无一例外,它们都携带有一种高度变异的FOXP2基因,这意味着,这种基因在蝙蝠体内的遗传变化促进了其在功能上的进化。 FOXP2所编码的蛋白质似乎能够影响嘴部运动