冯银刚团队发现pH依赖的双结合位点切换现象

中国科学院青岛生物能源与过程研究所代谢物组学研究组研究员冯银刚带领的研究团队,在能源微生物的一对相互作用蛋白质模块中发现一种独特的pH依赖的双结合位点切换现象,并阐明其化学和结构机制。近日,相关研究成果发表在Science Advances上。该研究揭示生物体系复杂精巧的调控机制,并为pH依赖的蛋白质器件和生物材料开发提供新素材,在合成生物学和生物技术应用中具有重要价值。 pH是几乎所有在水溶液中进行的化学反应的重要因素,在生命过程中起重要作用。生物体中有许多pH依赖的蛋白质功能开关,可调控细胞的生理和生化过程,并可作为生物技术开发中的关键感应器件和功能开关。目前已知的pH依赖的蛋白质构象变化均是通过感应pH变化实现“打开-关闭”式的开关切换控制,发现新型的pH依赖的蛋白质互作方式具有科学应用价值。代谢物组学研究组以一种高效降解木质纤维素的多酶复合体“纤维小体”为对象开展研究,并在研究丙酮丁醇梭菌(一种产溶剂梭菌)的纤维小......阅读全文

异钙调素结合在质膜胞外位点上并导致胞内钙离子水平...

异钙调素结合在质膜胞外位点上并导致胞内钙离子水平上升钙调蛋白(CaM)是一种高保守性的细胞内钙离子感应器。在植物中,胞外CaM也作为一个多肽信号影响许多生理功能,但是其在细胞质外的结合位点至今仍存在争议。2009年5月,中科院植物所林金星研究组在《JBC》上发表文章,研究人员利用CaM交联QD系统对

无碱基位点的定义

中文名称无碱基位点英文名称abasic site定  义核酸中失去碱基的部位。该部位碱基失去后,产生一个醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

加帽位点的概念

中文名称加帽位点英文名称cap site定  义mRNA中加帽结构的部位,该位点在前体mRNA的5'端。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

什么是序列标签位点?

序列标签位点(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。

无嘧啶位点的概念

中文名称无嘧啶位点英文名称apyrimidinic site定  义核酸中脱去嘧啶碱的部位。产生的醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

无嘌呤位点的定义

中文名称无嘌呤位点英文名称apurinic site定  义核酸中脱去嘌呤碱的部位。产生的醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

序列标签位点的简介

任何DNA序列,只要知道它在基因组中的位置,都能被用作STS标签。作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。这种序列在染色体上只出现一次,其位置和碱基顺序都是已知的。在PCR反应中可以检测出STS来,STS适宜于作为人类基因组的一种

细胞化学词汇nut-位点

中文名称:nut 位点英文名称:nut site定  义:噬菌体基因组中抗终止因子N蛋白的识别位点。N蛋白对nut位点的识别和随之发生的相互作用,使RNA聚合酶能忽略终止信号而持续通过终止子。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

SNP位点的选择原则

1,如果是检测基因的所有已知的SNP,那么首先要去了解并查询到这些SNP位点,SNP位点可以通过查询dbSNP数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)和TSC(The SNP Consortium)数据库(http://snp.cshl.org/),可以获知基因及上

阴离子位点显示实验

实验方法原理 实验材料 组织样品试剂、试剂盒 磷酸缓冲液阳离子化铁蛋白液体戊二醛锇酸实验步骤 1. 0.1 mol/L磷酸缓冲液配制阳离子化铁蛋白,浓度为0.2~0.5 mg/ml。2. 组织样品悬浮于阳离子化铁蛋白液体中,室温下反应30 min。3. 0.1 mol/L磷酸缓冲液充分漂洗。4. 3

序列标签位点的定义

序列标签位点(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。

上海药物所合作发现双孔钾通道抗抑郁药物位点

  随着现代社会的高速发展,抑郁症发病率逐年提高,抑郁症已成为全球性社会问题。现有药物的副作用、起效慢、个体差异等问题依然困扰着抑郁疾病的临床治疗。双孔钾离子通道是近年发现的一类新型钾通道超家族,其中TREK1双孔钾离子通道成为抗抑郁治疗、镇痛和治疗脑缺血的重要潜在新靶点,筛选和发现TREK1钾通道

补体结合试验知识点

  将免疫溶血作为指示系统,用以检测另一反应系统中抗原或抗体。该方法并非用于补体的检测,而是利用补体的溶细胞作用进行各种物理状态的抗原抗体测定。  一、试验原理  包括:  ①反应系统:已知抗原(或抗体)与待测抗体(或抗原);  ②补体系统;  ③指示系统:SRBC与相应溶血素预先结合,成为致敏绵羊

补体结合试验知识点

将免疫溶血作为指示系统,用以检测另一反应系统中抗原或抗体。该方法并非用于补体的检测,而是利用补体的溶细胞作用进行各种物理状态的抗原抗体测定。一、试验原理包括:①反应系统:已知抗原(或抗体)与待测抗体(或抗原);②补体系统;③指示系统:SRBC与相应溶血素预先结合,成为致敏绵羊红细胞。反应分两步进行。

降水监测降水采样点监测点位环境要求

①采样点应位于开阔、平坦的地区,测点周围的下垫面无裸露上壤,以免风沙扬尘的影响。②采样点应避开局地污染排放源,包括排放酸碱物质的烟尘、粉尘和生活排放源、废物堆积场、停车场以及交通T线等。③采样点周应无遮挡雨、雪的障碍物,其中包括房屋、桥梁、高大树木等。障碍物与采样器之间的水平距离不得小于该障碍物高度

深度结合技术可预言蛋白结合点查出致病突变

  据国外媒体报道,美国加州食品与农业研究学会科学家近日提出一项名为“深度结合”的最新技术手段,通过运用机器学习技术分析蛋白质与DNA和RNA的结合方式,查出可阻断细胞进程的致病突变。   美国加州食品与农业研究学会高级研究员布伦丹-弗雷运用“深度学习”技术,最新研发出一项可查出致病突变的科技手段。

SPR设备在大分子复合物活化位点结合反应分析中的应用

ACS Chem. Biol. 2013, 8, 2794−2801  Michael P. Storz, ect.美国化学生物学,2013.8.2794-2801  Michael P. Storz等人Biochemical and Biophysical Analysis of a Chiral

染色质架构蛋白CTCF结合人类基因组位点的机制研究取得..

  近日,国际著名学术期刊《Cell Research》杂志在线发表了上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心吴强课题组和中科院北京生物物理所王艳丽课题组合作研究成果,“Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diver

双链RNA结合域的特点

中文名称双链RNA结合域英文名称dsRNA-binding domain定  义双链RNA或RNA中的双链区能被特异蛋白质所结合的区域。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

Nature-|-破解领域难题:BRCA1如何被募到DNA双链断裂位点?

  同源末端重组 (HR) 和非同源末端重组 (NHEJ) 是细胞遭受DNA双链断裂 (DSBs) 之后进行损伤修复的两个重要武器,并分别由各自通路中的关键蛋白BRCA1 (HR) 和53BP1 (NHEJ) 所介导。它们的相同之处在于,BRCA1和53BP1都需要同时结合在H2AK15ub (由泛

什么是位点专一诱变?

中文名称位点专一诱变英文名称site-specific mutagenesis;site-directed mutagenesis定  义使DNA分子中某一特定的核苷酸序列发生改变。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

位点专一诱变的定义

中文名称位点专一诱变英文名称site-specific mutagenesis;site-directed mutagenesis定  义使DNA分子中某一特定的核苷酸序列发生改变。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

位点专一诱变的定义

中文名称位点专一诱变英文名称site-specific mutagenesis;site-directed mutagenesis定  义使DNA分子中某一特定的核苷酸序列发生改变。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

土壤现状监测点位如何选择

  根据土壤导则要求污染影响型建设项目,二级要求监测柱状样和表层样,三级要求监测表层样。如果建设项目场地已经硬底化,该如何如何选取监测点?是需要把已经硬底化的场地破坏还是另外选取监测点?    根据建设项目实际情况,如果项目场地已经做了防腐防渗(包括硬化)处理无法取样,可不取样监测,但需要详细说明

大脑RNA编辑位点“辞典”发布

美国西奈山伊坎医学院研究人员对大脑中的数千个位点进行了编目,在这些位点中,RNA在整个人类生命周期中被修饰,这个过程被称为腺苷到肌苷(A-to-I)编辑,其为理解大脑发育的细胞和分子机制以及它们如何影响健康和疾病提供了重要的新途径。在《细胞报告》上发表的论文中,研究团队描述了大脑中RNA编辑的速率如

无嘌呤嘧啶位点的概念

所有细胞中都带有不同细胞类型,能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。

位点专一诱变的概念

中文名称位点专一诱变英文名称site-specific mutagenesis;site-directed mutagenesis定  义使DNA分子中某一特定的核苷酸序列发生改变。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

无嘌呤嘧啶位点的定义

所有细胞中都带有不同细胞类型,能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。

细胞化学词汇进入位点

中文名称:进入位点英文名称:entry site定  义:特指氨酰tRNA进入核糖体的部位。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇无嘧啶位点

中文名称:无嘧啶位点英文名称:apyrimidinic site定  义:核酸中脱去嘧啶碱的部位。产生的醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)