潘学文博士Nature解析DNA修复

生物通报道:来自贝勒医学院的研究人员指出了一种核小体重构因子:Fun30在DNA双链端粒末端切除过程中扮演的重要角色,为进一步解析DNA双链断裂修复过程提供了新思路,相关成果公布在Nature杂志上。 文章的通讯作者之一是华裔科学家潘学文博士(Xuewen Pan,生物通音译),其早年毕业于华中农业大学,2001年获得杜克大学医学中心的博士学位,之后赴约翰霍普金斯医学院进行博士后研究,目前任贝勒医学院生化与分子生物学,分子与人类遗传学系的副教授。 DNA作为细胞生命活动最重要的遗传物质,保持其分子结构的完整性和稳定性对于细胞的存活和正常生理功能的发挥具有重要意义。包括电离辐射、化疗药物及细胞代谢产物在内的多种外源和内源性因素都能引起不同形式的DNA损伤,其中DNA双链断裂(DSBs)是一种最严重的DNA损伤形式。DNA双链断裂可以导致突变、基因组不稳定性和细胞死亡,因此DNA双链断裂的修复对保持基因组的完整性......阅读全文

哈佛医学院6名研究人员中毒

  据香港《星岛日报》10月26日报道,近期公布的一份美国哈佛大学内部文件显示,哈佛大学医学院曾发生一起中毒案,有6名医学研究人员中毒,目前尚不清楚是否有人蓄意下毒。   哈佛大学一份内部文件透露,今年8月26日该校发生6名研究人员中毒事件,这6名研究人员都是哈佛大学医学院病理学学科的师生。当时,

美医学院审查研究人员“问题”论文

  美国纽约州的一所医学院近日表示,将对一名涉嫌违纪的教职员工进行调查。日前,加州某联邦法院公布的内部文件称,该研究人员署名的一篇论文部分由孟山都公司职员代笔。  纽约医学院副主席Jennifer Riekert表示,“现在我们意识到出了问题,并获取了一些相关材料。”  据悉,问题论文于2000年出

北京大学Cell子刊探究明星抑癌基因新功能

  来自北京大学、康奈尔大学Weill医学院的研究人员在新研究中证实,PTEN通过与组蛋白H1相互作用控制了染色质凝聚,这一研究发现发表在9月4日的《Cell Reports》杂志上。  北京大学基础医学院的尹玉新(Yuxin Yin)教授以及康奈尔大学Weill医学院的Wen H. Shen是这篇

潘学文博士Nature解析DNA修复

  生物通报道:来自贝勒医学院的研究人员指出了一种核小体重构因子:Fun30在DNA双链端粒末端切除过程中扮演的重要角色,为进一步解析DNA双链断裂修复过程提供了新思路,相关成果公布在Nature杂志上。   文章的通讯作者之一是华裔科学家潘学文博士(Xuewen Pan,生物通音译),其早年

上海交大教授Cell-Stem-Cell新发现:干细胞表观代谢新机制

  生物通报道:我们的机体在不断地发生改变:新细胞不断替换特化细胞来维持皮肤、肠、血液和其他组织,或在损伤后修复它们。由于分化细胞通常无法分裂,更新几乎总是由组织特异性的干细胞来完成,它们能够不断地生成新细胞。但是这其中具体的机制至今科学家们并不是十分清楚。  近期来自中科院上海生科院,上海交通大学

研究人员绘出苹果基因组草图

  一个国际科研小组8月29日在英国《自然—遗传学》(Nature Genetics)杂志上报告说,他们绘出了苹果的基因组草图,这将有助于从基因水平上分析苹果性状,培育更多苹果新品种。  意大利、美国、新西兰等国研究人员报告说,他们绘出的是广受人们喜爱的“金冠苹果”的基因组草图。结果

张强峰博士Nature解析全基因组蛋白互作

  来自美国哥伦比亚大学,同济大学等处的研究人员发表了题为“Structure-based prediction of proteinCprotein interactions on a genome-wide scale”的文章,提出了一种基于三维结构信息的全基因组蛋白质相互作用计算预测方

复旦大学发表Nature表观遗传学新文章

  来自复旦大学、中国科学院等机构的研究人员在新研究中揭示出了,从头甲基化转移酶DNMT3A自抑制以及组蛋白H3诱导DNMT3A激活的机制。研究结果发表在11月10日的《自然》(Nature)杂志上。  领导这一研究的是复旦大学上海医学院,生科院的徐彦辉(Yanhui Xu)教授,其早年毕业于清华大

吉林大学Cell子刊发表表观遗传学研究成果

  高等生物的基因组DNA围绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。染色质的结构和动态受到组蛋白表观遗传学修饰的调控,比如最近发现的组蛋白赖氨酸巴豆酰化。这种组蛋白修饰在基因表达、DNA损伤应答等重要的细胞过程中起到了关键性

上海交大LncRNA研究刊登国际期刊

  长非编码RNA(lncRNA)不编码蛋白质,最初被认为是基因组“暗物质”的一部分。最近,有研究表明,lncRNAs在染色质修饰复合物的招募过程中发挥作用,并能影响基因的表达。然而,是否lncRNAs以类似的方式在癌症中发挥作用,尚不明确。延伸阅读:中美学者JBC解析lncRNA在EMT中的作用。

《科学》杂志精选:人类基因组蛋白产物仍是谜

  几近完成的普通小麦基因组测序  研究人员已经展示了普通小麦基因组的序列草图,从而在通往创制世界上种植最广泛谷物作物之一的完整参考序列的道路上到达了一个主要的里程碑。他们的工作给了科学家们一个可在小麦个体染色体上快速定位特定基因的工具,这一资源可帮助他们改良小麦育种以满足从未有过的对食物的更高需求

Cell子刊:“垃圾”DNA的阴暗面

在基因之间的DNA片段,散布着重复序列,曾经被认为是“基因组垃圾”,但现在科学家们了解到,一些这样的垃圾DNA并不是无害的。在《Cell Reports》发表的一项研究中,来自北卡罗来那大学(UNC)Lineberger综合癌症中心的研究人员报道称,某些短的DNA重复序列,或“垃圾DNA”,在尤文肉

Nature:解析核小体的重塑机制

  在细胞核中,基因组DNA紧紧包裹在核小体上形成染色质,但基因在如此紧密的包装中是无法表达的。现在德国慕尼黑大学LMU的研究团队,揭示了局部释放核小体DNA的分子机制,正是这一机制使染色体DNA得以转录。文章发表在本期的Nature杂志上。   高等生物的细胞核负责储存基因组DNA,这些DNA环

上海同济大学Cell子刊揭示细胞信号切换开关

  来自上海同济大学医学院、美国Mayo临床中心的研究人员在新研究中证实,SIRT1-TopBP1信号轴发挥转换开关作用,调控了代谢检查点反应和DNA损伤检查点反应。这一研究发现在线发表在《分子细胞》(Molecular cell)杂志上。  上海同济大学医学院的袁健(Jian Yuan)教授以及美

Polycomb组蛋白与染色质相互作用的关键机制

  2021年6月,Genome Research杂志在线发表了法国巴黎萨克雷大学植物科学研究所Moussa Benhamed教授为通讯作者题为“Polycomb-dependent differential chromatin compartmentalization determines gen

癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据

   研究人员希望,数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。  这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望:“让我们测序你的肿瘤,或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过,现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些

曹雪涛院士、王青青教授Nature子刊发布免疫新成果

  来自浙江大学、中国医学科学院、第二军医大学等机构的研究人员证实,甲基转移酶Dnmt3a上调HDAC9使得TBK1激酶脱乙酰化激活了天然免疫。这一重要的免疫发现发布在5月30日的《自然免疫学》(Nature Immunology)杂志上。  我国著名的免疫学家曹雪涛(Xuetao Cao)院士和浙

首次绘制紫外辐射诱导的细胞应答遗传互作图谱

  美国加利福尼亚大学圣地亚哥医学院的研究人员,与荷兰和英国的合作者一起,首次绘制了紫外辐射诱导的细胞应答反应背后的详细的遗传互作图谱。这项研究成果将在12月26日的Cell Reports杂志上刊出。   加利福尼亚大学圣地亚哥医学院的研究人员,与荷兰、英国的合作者一起,首次绘制了紫外(UV

放大四千倍细胞解开基因组秘密

  基因调控是发生在分子水平上的过程,传统显微镜很难观察到。在最新一期《科学》杂志在线发表的一篇论文中,美国耶鲁大学研究人员开发了一种名为染色质扩张显微镜(ChromExM)的新技术,成功地将斑马鱼胚胎细胞核的物理体积扩大了4000倍,从而大幅提高了图像分辨率。这项技术让研究人员第一次看到了单个分子

研究揭示组蛋白变体调控早期胚胎发育新机制

  近日,华中农业大学动物科学技术学院、动物医学院苗义良团队研究成果在Advanced Science在线发表。研究针对鼠猪早期胚胎系统地揭示了H2A.Z在早期胚胎发育过程中的动态分布规律,并首次证实了H2A.Z的分级富集参与调节哺乳动物早期胚胎的基因表达和组蛋白修饰状态。  在哺乳动物早期胚胎发育

CRISPR新应用:寻找基因调控元件

  人体内所有的组织都是由蛋白质构成的,每一种蛋白质都是由人类基因组中一段DNA“编码”的。  但是这些编码区仅占基因组的大约百分之1,而分散在基因组中的其他百分之99的序列,参与了调节基因的表达,或决定哪些编码区将被翻译成蛋白质,以及何时被翻译。  1月25日在《Nature Biotechnol

Nature发表表观遗传学新成果揭示与生育有关的重要机制

高等生物的基因组DNA围绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。通过“读取”模块识别组蛋白修饰是表观遗传学调控的一个主要机制。十一月十四日Nature Communications杂志发表的一项新研究揭示了小鼠生殖细胞生成中

新研究揭示乙肝病毒DNA与人基因组互作景观图

  乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是全球性重大公共卫生健康问题之一,目前,全球乙肝病毒慢性感染者人数较多。HBV属嗜肝DNA病毒科,在人体肝脏细胞核内可形成cccDNA、整合入人体基因组等病毒DNA形式稳定存在,这是HBV维持长期慢性感染的关键。因此,研究乙肝病毒与宿

原子力显微镜研究λDNA组蛋白的相互作用

     对DNA与组蛋白的相互作用的认识是我们进一步了解其功能和探讨生命现象的重要基础。原子力显微镜(AFM)成像分辨率高、成像直观,且样品制备简单,不需要经过脱水、抽真空、染色、包埋等 这些会使生物分子结构发生一定改变的复杂处理过程,并可对生物分子在近生理条件下检测它们的动态结构信息。     

研究人员破译香蕉“美食蕉”品种香蕉基因组

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512730.shtm广东省农业科学院研究员易干军领衔的香蕉遗传改良团队与广西大学教授陈玲玲团队合作,破译了香蕉“美食蕉”品种香蕉基因组,首次在国际上组装染色体级别的异源三倍体香蕉栽培种(AAB)参考基因

弥补ChIPseq缺陷的新工具

  来自美国麻省大学医学院的研究人员开发出了一项新技术,可以提供真核生物基因组的详细三维(3-D)图像,这有可能帮助科学家们解答一些有关染色质结构的关键问题。在发表于《细胞》(Cell)杂志上的研究论文中,这一称作为Micro-C的新技术使得研究人员能够以核小体分辨率来分析染色体折叠,填补了以往一些

Cell发布突破性染色质检测技术

  来自美国麻省大学医学院的研究人员开发出了一项新技术,可以提供真核生物基因组的详细三维(3-D)图像,这有可能帮助科学家们解答一些有关染色质结构的关键问题。在发表于《细胞》(Cell)杂志上的研究论文中,这一称作为Micro-C的新技术使得研究人员能够以核小体分辨率来分析染色体折叠,填补了以往一些

Cell发布突破性基因组研究技术

  来自美国麻省大学医学院的研究人员开发出了一项新技术,可以提供真核生物基因组的详细三维(3-D)图像,这有可能帮助科学家们解答一些有关染色质结构的关键问题。在发表于《细胞》(Cell)杂志上的研究论文中,这一称作为Micro-C的新技术使得研究人员能够以核小体分辨率来分析染色体折叠,填补了以往一些

中科院新成果揭示癌症干细胞中的表观遗传学调控

  癌症干细胞能够通过自我更新和分化,启动并维持癌症的发生和发展。人们已经在越来越多的肿瘤中分离和鉴定到了癌症干细胞,比如结肠癌、肝癌、乳腺癌和胰腺癌。  Metadherin (MTDH)广泛参与了肿瘤生长、药物抗性、肿瘤复发和转移,但此前人们并不了解其分子机制。中科院的研究团队通过深入研究,揭示

Nature子刊发现表观调控因子在抑癌方面的新作用

  来自中科院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室,美国迈阿密大学米勒医学院的研究人员发表了题为“Loss of Asxl2 leads to myeloid malignancies in mice”的文章,揭示了急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)重现性突变