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!单细胞测序的”CPU2.0”时代

对单个人类细胞的基因组进行准确的变异检测和大范围单倍体型分析一直以来都是测序领域的巅峰挑战。单细胞测序使我们能在更高的分辨率下研究生命的机制。一方面,在像癌症这样的组织样本中存在大量具有不同基因组类型的单个细胞,因此需要分析单细胞水平基因组而不是大量细胞的平均值;另一方面,对于非常珍贵的细胞样品,如人类卵母细胞和循环肿瘤细胞(CTCs),单细胞测序具有无与伦比的优势;此外,利用单细胞测序,还可以揭示细胞个体在特定时间的演化情况。 正常人类单个细胞DNA含量为6.6pg,相对于测序所需的ug级相当微量,并且独一无二,“有些DNA一旦错过就不再”!因此单细胞测序的关键一环是全基因组扩增(WGA),常见的方法如,DOP-PCR、MDA、MALBAC等需要用DNA聚合酶对细胞基因组做大量的体外扩增,然后构建文库进行相对读长较短的高通量测序。这些方法有两个明显的缺点:1,聚合酶的错误扩增可以在基因组上产生成千上万的假阳性。2,短......阅读全文

解决基因组学重要挑战的新工具

  单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术,可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多,但是,仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列,从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前,去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列,还是一个手动和耗时的过程,为了去除污染

解决基因组学重要挑战的新工具

  单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术,可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多,但是,仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列,从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前,去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列,还是一个手动和耗时的过程,为了去除污染

郑洪坤:“云模式”引领基因科技服务 2.0 时代

  生物信息和科技服务行业正在经历从1.0时代向2.0时代的变迁。在这个变迁的浪潮下,生物科研工作者,科技服务从业人员都面临着哪些挑战和机遇?从业十五年的百迈客CEO郑洪坤认为:云模式,才是打开基因科技服务2.0时代的正确方式。  基因科技服务1.0时代:测序数据少,分析以标准分析为主且主要由服务公

王小理:新一轮生物科技革命的前景与忧思

  在2018年及并不遥远的未来,新一代精细化操控生物学现象的变革性工具,将开拓生物科技新领域、新空间、新疆域,其引领新一轮生物科技革命乃至更广泛范围科技革命的前景日渐明朗。  2017年,生命科学延续近年来的高速发展态势,科技政策和科研成果亮点纷呈,在引领未来经济社会发展中扮演着越来越重要的角色。

刘伯宁:后基因组时代10年间生命科学的发展与挑战

  8月2日,我国科学家利用“全基因组关联分析”的方法,在人类1号染色体上发现了肝癌的易感基因区域。这将为肝癌的风险预测、早期预防和个体化治疗提供理论依据。  事实上,自2000年人类基因组草图绘制完成迄今,科学家已经相继发现70余种疾病的易感基因,基于此的基因诊断产业已经初现端倪,但10

临床分子诊断自动化的应用现状与展望

  近年来,分子诊断领域的发展遇到前所未有的契机,加之国家相关政策的制定与倾斜,更使其蓬勃发展。分子诊断以其快速、灵敏、精准的特点在疾病发生、发展、预后等各个阶段均可发挥一定的作用而使其在医疗行业中得到了较广泛的认可。  一、分子诊断及分子诊断自动化概述  分子诊断是应用分子生物学的技术和方法获得人

刘肖:80岁珀金埃尔默80后管理者的新风貌

  漫坪旧草催春梦。谱春曲,题春颂。沸雪春茶歌郁蓊。采撩春露,独临春宠。却把春心冻。  春芳摇曳春潮涌。惹雾含烟探春动。朗朗鹃啼春汛送。春晖柔旎,春风与共。一缕春光奉。  《青玉案–春颂》  ——刘肖  这是科学仪器界“诗人”刘肖在戊戌狗年新春佳节之际,为大家带来的祝福。当然,刘肖还有另外

Biotechniques:新一代测序中的缺口填补

  在完成的基因组的复兴时代,科学家使用由第三代测序技术提供的长读取,来填补基因组装配中的缺口(gap)。新一代测序能赶得上吗?  新一代测序,可让科学家们以比Sanger测序更快的速度和更低的价格,进行基因组测序,为1000美元基因组测序铺平了道路。但是这种方法牺牲了长读取速度,将平均读长减少至大

医疗投资大航海时代

  导语:中美两地的医疗投资领域可能从未像今天这样息息相连。如今,中国可能正在开始复制美国生物医药风投市场近20年的辉煌。面对2018年,大家跃跃欲试去投身医疗投资的大航海时代。然而数据再热也需冷静思考。大航海需要勇气,更需要专业的洞察和敬畏的态度。   华兴资本从2008年就开始关注、深耕「医疗

人工智能论坛在京召开,医药大咖聚焦健康技术大数据

  分析测试百科网讯 2017年11月24日,由中国科学技术协会主办,中国仪器仪表学会承办,人工智能产业技术创新战略联盟、博奥生物集团有限公司、中国仪器仪表学会医疗仪器分会、中关村医疗器械产业技术创新联盟、生物谷协办的“第66期中国科技论坛-人工智能与医疗健康技术前沿论坛”在中国科技会堂隆重召开。本

基因组学、医疗器械纳入“十三五”百大项目名单

  中国第十三个五年规划纲要是国家战略意图的反映。新华社记者从5日提交全国人大审查的纲要草案全文中摘取了未来五年中国计划实施的100个重大工程及项目。  它们涉及科技、装备制造、农业、环保、交通、能源、人才、文化和教育等领域,将对中国经济、社会和民生等各方面产生深远影响,也会给国际社会带来重大机遇。

第二届P4 China2017大会

  【精准医疗2.0时代】第二届P4 China 2017大会再现全新精彩!  聚中美精英,话世界“医”流  从2016年中国精准医疗计划实施至今,已近两年。我们越来越清地认识到未来通往精准医疗的核心,在于 “精准”二字。要想达到精准的目标1. 检测技术,极度依赖于以DNA测序为代表的体外诊断技术的

我国学者采用混合组装策略和软件技术大幅降低测序深度

  近日,中国科学院昆明动物研究所张亚平院士和马占山研究员领导的团队发布了以“10x Genomics测序”辅助“三代测序”的混合组装策略和软件技术。研究人员采用美国加州大学Jain等人2018年发表在 Nature Biotechnology(doi: 10.1038/nbt.4060.)的人类基

迪安诊断携手美国Agena 核酸质谱技术助力精准医疗

  日前,迪安诊断技术集团股份有限公司与美国AgenaBioscience公司在杭州达成商业合作协议,成为可持续发展的战略合作伙伴。作为国内第三方医学诊断服务外包机构的领先者,迪安诊断此次与全球唯一获得FDA认可的核酸质谱技术开发生产厂商——美国Agena强强联合,共同在中国市场推广先进的基因组学解

大数据精准匹配在生物医药制造业的应用前景

  一、大数据定义及特点  1、大数据的定义:大数据(big data),指无法在一定时间范围内用常规软件工具进行捕捉、管理和处理的数据集合,是需要新处理模式才能具有更强的决策力、洞察发现力和流程优化能力的海量、高增长率和多样化的信息资产。  2、大数据的特点:Volume(大量)、Velocity

从VR到MR:让世界虚实难辨

  经历了2016年VR热潮,VR、增强现实技术发展似乎仍然不温不火,而现在推出的MR在购物领域的应用,又有哪些技术优势?  ■本报记者 贡晓丽  近日有消息称,阿里巴巴旗下淘宝将与微软HoloLens合作,进军混合现实(MR)购物领域,即将在今年造物节上推出产品“淘宝买啊”。  阿里方面披露,在9

从VR到MR:让世界虚实难辨

近日有消息称,阿里巴巴旗下淘宝将与微软HoloLens合作,进军混合现实(MR)购物领域,即将在今年造物节上推出产品“淘宝买啊”。 阿里方面披露,在9月淘宝造物节上,淘宝将在西湖边搭建一座300平方米“未来购物街区”,消费者可以身临其境,亲身感受由“机器算法”叠加的“真实世界”,过一把“科

第三方医学检测拥抱“检测+”

  国务院总理李克强在2015年6月4日主持召开国务院常务会议,督促部署了社会办医的健康发展,其中提到“要探索以公建民营、民办公助等方式建立区域性检验检查中心”。这对我国的第三方医检行业来说是重大利好。近十年来,我国第三方医检行业发展迅猛,也已然成为医疗健康事业的中坚力量。  2015年8月4日,我

常用生物软件(windows)全面介绍

常用生物软件(windows)全面介绍一、基因芯片1、基因芯片综合分析软件。 ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件,不仅可以进行图像分析,还可以进行数据处理,方便protocol的管理功能强大,商业版正式版:6900美元。 Arraypro 4.0

中国“黑科技”公司群落崛起,成为纳米技术、生物技术、

  全息投影”技术,知名歌手李宇春的歌曲《蜀绣》中,4个“李宇春”分身与主唱者互动舞蹈,变换绮丽,被观众戏称为李宇春、夏、秋、冬。   这是“全息投影”,或称“虚拟成像”技术在春晚等公众舞台上的首次应用。全息投影利用光的干涉和衍射原理,再现其三维图像。   包括全息投影等这些炫酷、超出人类现有知

我研发出全球首款高性能和高集成度芯片

  我国在高端通用芯片和计算机单芯片技术领域取得重大进展。今天,新岸线公司和英国ARM公司在京联合发布全球首款40纳米A9双核2.0G高性能计算机系统芯片。这款名为NuSmart 2816的芯片是基于ARM公司技术架构,中国自主设计的计算机系统芯片。   这款芯片兼具高性能、低功耗、

第66期中国科技论坛会议议程公布啦!

—人工智能与医疗健康技术前沿论坛会议议程  人工智能技术应用于医疗健康一直被认为是人工智能发展的重要方向和应用领域。由中国科学技术协会主办,中国仪器仪表学会、人工智能产业技术创新战略联盟、博奥生物集团有限公司承办,中国仪器仪表学会医疗仪器分会、中关村医疗器械产业技术创新联盟、生物谷协办的“第66期中

华大基因汪建:未来两三年可以“管理”癌症

  日前,在深圳证券交易所举行的创业家思享汇上,华大基因董事长汪建,在介绍了目前全球基因技术的前沿进展,以及技术进入对人们健康管理带来的改变。据了解,第一次邀请一家拟上市公司的创业家做客。去年,有着“生物版Google”之称的华大基因曾被曝拟在刚上市,纯姐打听到的情况是,华大基因目前已经决定将华大科

重新定义“看上去很美”的移动医疗

  目前,全球与医疗相关的App产品已经达到近万种,与健康相关的App更是难以计数。然而,当前的移动医疗(mHealth)只是改善体验,并没有触及到医疗核心。移动医疗已经到了“七年之痒”的非常时期。  移动医疗创业者似乎也意识到这一点,从去年下半年开始,多家公司纷纷转变思路,从“崇尚技术”转向“医生

2017年中国环保行业发展现状分析【图】

  我国环保行业从起步到现在主要经历了两个发展阶段:   “十五”、“十一五”时期是以政府投资为主驱动的“1.0时代”。我们分析中国“十五”和“十一五”时期环保产业发展历史发现,政策扶植和财政资金投入一直是这一阶段环保行业发展最核心的驱动力量。由于环保行业发展和投资落实处于政府主导之下,必然存在着行

微藻“吃”下电厂废弃物 产出上等生物油脂

  说不定哪一天,我们吃的保健品就是电厂废弃物生产的。  这是记者采访王强研究员时闪过的一个念头。  最近,一则“我国科学家发现小球藻‘吃’烟气中的氮氧化物和二氧化碳”的消息引起了很多人的好奇。  小球藻是什么?它“吃”下氮氧化物和二氧化碳又变成什么?11月27日,科技日报记者带着这些疑问,采访了中

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  新知  说不定哪一天,我们吃的保健品就是电厂废弃物生产的。  这是记者采访王强研究员时闪过的一个念头。  最近,一则“我国科学家发现小球藻‘吃’烟气中的氮氧化物和二氧化碳”的消息引起了很多人的好奇。  小球藻是什么?它“吃”下氮氧化物和二氧化碳又变成什么?11月27日,科技日报记者带着这些疑问,

独立医学实验室2.0时代 积极拥抱新模式

  新医改推动下,我国独立医学实验室有望实现弯道超车。1)1500亿总市场,二级医院市场扩容加速,15%+增长:2009年开始的新医改,核心在公立医院改革,旨在通过取消基层医疗机构药品加成、信息化技术(远程医疗、网络医院、云医院)推动分级诊疗,改善居民“看病难、看病贵”的问题,建立基层首诊制度,20

一次治愈!CRISPR基因编辑技术或将永久消除某些遗传病

  本杰明·多普瑞在9岁时上楼梯不扶着栏杆就很费劲,随后到医院被诊断为杜氏肌营养不良(也称假肥大型肌营养不良)。但很幸运,24岁的他已经活得比其他许多同类患者更久。医生当时只告诉他这是一种无法治愈的绝症,但并没有教他该怎么办。那些经过他轮椅的女孩丝毫不会注意到他,也没有朋友给他打电话聊天,只有妈妈和