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新算法比较分析可搜索癌症基因突变

桑福德伯翰医学研究所(Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute,SBP)承担了前所未有的对一个新兴算法类别的比较分析,该算法通过聚焦内部基因结构,在癌症数据库中挖掘遗传信息(即亚基因像素算法),这与专注于基因视其为单个单元的经典方法形成对照。这些强大的数据筛选工具正在帮助人们解决癌症的复杂性,并且发现以前未知的基因突变,这些突变对癌细胞生成起到重要作用。 这项研究发表在《自然-方法》(Nature Methods)杂志上,该研究对各种独立研究小组开发的20多种算法的优缺点进行了评论、归类和描述。 “尽管高分辨率基因组序列的日益普及,一个通常的假设是把一个基因作为一个单元来考虑,”SBP生物信息学和结构生物学项目主任和该研究的资深作者Adam Godzik博士解释说,“然而,有一些事件,如单一位置DNA替换和剪接变异,可以在亚基因水平发生在一个基因上。亚基......阅读全文

新算法比较分析可搜索癌症基因突变

  桑福德伯翰医学研究所(Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute,SBP)承担了前所未有的对一个新兴算法类别的比较分析,该算法通过聚焦内部基因结构,在癌症数据库中挖掘遗传信息(即亚基因像素算法),这与专注于基因视其为单个单元的经典方法形

新算法可模拟人脑整体神经电路

   下一代超级计算机利用新算法,可模拟人脑整体神经电路。图片来自网络   科技日报东京3月28日电 (记者陈超)日本理化学研究所日前宣布,他们的一个国际联合研究小组成功开发出模拟人脑整体神经电路的算法,可在下一代超级计算机上应用。新算法不仅节省内存,也能大幅提高现有超级计算机上的脑模拟速

NCCN增加女性癌症新基因突变检测

据医脉通报道,第21届美国国家综合癌症网络(National Comprehensive Cancer Network,NCCN)年会近日在好莱坞召开,会议增加了几个针对乳腺癌和卵巢癌遗传风险管理的新基因突变检测。 最近的研究发现PALB2基因突变与乳腺癌侵袭性相关,而RAD51C、

新DNA分析技术可快速诊断癌症等疾病

  加拿大研究人员取得的一项技术突破,有望用以更快地开展癌症及各种产前诊断。新开发的工具将允许研究人员在类似人体条件下,将长链DNA(脱氧核糖核酸)装载入可调谐纳米成像室,同时维持其结构不变。此项重要发现发表在本周美国《国家科学院学报》上。    麦吉尔大学物理系教授萨波莉娜·莱斯利、

种群进化+邻域搜索的混合算法求解作业车间调度问题...-1

种群进化+邻域搜索的混合算法求解作业车间调度问题之算法原理 前言 过去小编简单了解过作业车间调度问题(JSP),这两个月简单接触了柔性车间调度问题(FJSP),但是因为一些原因打算暂时研究到这里。在研究的时候,小编发现网上这方面的中文资源不多,那么秉持着普度众生的原则,

种群进化+邻域搜索的混合算法求解作业车间调度问题...-2

表b的OS String和MS String代表染色体编码。 在这里插入图片描述 OS String中有N个数字(N代表总工序数),每一位数字代表一道工序对应的工件。简单的说,在decode的过程中,优先安排靠左的工件到对应机器上。同一数字出现的次数代表工件的第k道

种群进化+邻域搜索的混合算法求解作业车间调度问题...-3

JBX非常类似: 将工件随机分配成两组,Jobset1和Jobset12;将P1中属于JS1的部分插入O1相同位置处,P2中属于JS2的部分插入O2相同位置中;将P2中属于JS2的部分按顺序插入O1的空余位置中(如图所示),P1则插入O2中。MS MS更简单,随机选择两

常见机器学习算法优缺点比较(一)

  机器学习算法太多了,分类、回归、聚类、推荐、图像识别领域等等,要想找到一个合适算法真的不容易,所以在实际应用中,我们一般都是采用启发式学习方式来实验。通常最开始我们都会选择大家普遍认同的算法,诸如SVM,GBDT,Adaboost,现在深度学习很火热,神经网络也是一个不错的选择。假

常见机器学习算法优缺点比较(二)

  常见算法优缺点   1.朴素贝叶斯   朴素贝叶斯属于生成式模型(关于生成模型和判别式模型,主要还是在于是否是要求联合分布),非常简单,你只是做了一堆计数。如果注有条件独立性假设(一个比较严格的条件),朴素贝叶斯分类器的收敛速度将快于判别模型,如逻辑回归,所以你只需要较少的训练

常见机器学习算法优缺点比较(三)

  优点:实现简单,计算简单;   缺点:不能拟合非线性数据.   4.最近领算法——KNN   KNN即最近邻算法,其主要过程为:   计算训练样本和测试样本中每个样本点的距离(常见的距离度量有欧式距离,马氏距离等);   对上面所有的距离值进行排序;   选前k个最小距离的样