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新算法比较分析可搜索癌症基因突变

桑福德伯翰医学研究所(Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute,SBP)承担了前所未有的对一个新兴算法类别的比较分析,该算法通过聚焦内部基因结构,在癌症数据库中挖掘遗传信息(即亚基因像素算法),这与专注于基因视其为单个单元的经典方法形成对照。这些强大的数据筛选工具正在帮助人们解决癌症的复杂性,并且发现以前未知的基因突变,这些突变对癌细胞生成起到重要作用。 这项研究发表在《自然-方法》(Nature Methods)杂志上,该研究对各种独立研究小组开发的20多种算法的优缺点进行了评论、归类和描述。 “尽管高分辨率基因组序列的日益普及,一个通常的假设是把一个基因作为一个单元来考虑,”SBP生物信息学和结构生物学项目主任和该研究的资深作者Adam Godzik博士解释说,“然而,有一些事件,如单一位置DNA替换和剪接变异,可以在亚基因水平发生在一个基因上。亚基......阅读全文

大数据研究推翻常规认识

  近年来,科学创新日渐进入"大数据"时代,各种高通量的分析手段以及各类"组学"的发展,使得我们对生命科学的基本原理以及与人类健康有关的疾病发生机制方面有了更加深入的认识。针对最近一段时间以来科学家们利用"大数据"的手段产生的科学进展,我们

基因测序市场深度剖析

   Technologies(现为Thermo Fisher收购)公司全国临床与科研事业部销售总监、ThermoFisher公司全国临床市场战略总监柴映爽写了一系列文章,对基因测序领域进行了深入剖析。让我们看看这个领域深入工作的人士,怎么看待2015年基因测序市场大热这一现实的。   ▌第一篇:基

2019年10月Science期刊不得不看的亮点研究

  10月份Science期刊又有哪些亮点研究值得学习呢?小编对此进行了整理,与各位分享。  1.Science:新研究揭示人类微生物组是潜力巨大的新型抗菌药物聚宝盆  doi:10.1126/science.aax9176  就像淘金热中的淘金者曾经在北加州的山上开采这种闪亮的贵金属一样,“生物勘

再次飞跃 | 短短2天,中国学者连续发表11篇CNS

3.杨辉/李亦学/Lars M. Steinmetz等团队建立新型脱靶检测技术,基因编辑工具安全性评估或迎来新突破  CRISPR/Cas9是广泛关注的新一代基因编辑工具,自从2012年被发明以来,它一直以其高效性和特异性备受世人的期待,然而值得注意的是,CRISPR/Cas9从问世以来,其脱靶风险

2019年中国学者86篇Cell,Nature及Science文章汇总

  2019年上半年很快就结束了,iNature盘点了中国学者在Cell,Nature及Science发表的成果,我们发现总共有86篇(截至2019年6月24日),具体介绍如下:  4-6月发表的文章  【1】2019年6月21日,西北工业大学王文,中科院昆明动物研究所/BGI 张国捷及丹麦哥本哈根

专家经验谈:如何追踪癌症的生物学指标

  癌症的生物学指标可以帮助研究者们诊断疾病、预测治疗效果、选择合适的治疗方案、和跟踪疾病的进程。目前,癌症指标的检测大多在集中在染色体异常上,例如染色体倍增、染色体缺失和染色体重排。染色体异常能影响蛋白的表达和功能,进而引发肿瘤或者为细胞癌变创造条件。  随着基因组技术的发展,出现了许多检测癌症指