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挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而，肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题，而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感，容易产生假阴性结果。针对此，中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法（Cross-Value Association Analysis，CVAA）。基于对同一批转录组数据（1037个乳腺肿瘤和110个正常组织）的分析结果揭示：与T-Test、edgeR及DESeq等常用算法相比，CVAA在处理异质性数据时能明显地减少异常样本的影响和假阴性结果。 进一步将CVAA应用于TCGA数据库的5540个肿瘤（13种实体瘤）及正常组织的RNA-Seq转录组数据，研究人员成功鉴定到大量肿瘤显著差异表达基因，且不同肿瘤之间存在很多相似的基因转录紊乱模式。进而，针对甄别得到的新的肿瘤相关基因和生物学途径，如酒精代......阅读全文
挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而，肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题，而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感，容易产生假阴性结果。针对此，中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法
挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而，肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题，而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感，容易产生假阴性结果。针对此，中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法
肿瘤目前是世界人口死亡的第一原因。中国每年因肿瘤死亡的人数超过200万。除了传统的放化疗等方法外，靶向治疗是肿瘤临床的研究热点及发展趋势。该治疗方法是通过药物选择性抑制肿瘤细胞特异的分子靶标的功能，来抑制肿瘤生长，而不杀伤或较少损伤正常细胞。相比传统放化疗方法，靶向治疗具有耐受性好、毒副作用轻微
美国《国家科学院院刊》（Proc Natl Acad Sci USA）9月2日在线发表了中美研究者有关黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）种系突变（germline mutation）分布模式的研究论文。该项工作由云南大学、中科院昆明动物研究所、美国德克萨斯大
蛋白酶激活受体1 (protease-activated receptor 1, PAR1) 属于G蛋白偶联受体家族，是凝血酶、金属蛋白酶等的受体，在血液循环系统、免疫系统中发挥重要的生理作用，并参与多种人类疾病的病理发生。目前研究表明PAR1信号通路激活的失调与慢性炎症以及肿瘤的发生和肿瘤转移
记者3月25日从中科院昆明动物研究所获悉，在国家自然科学基金委和科技部项目的支持下，该所李功华博士在黄京飞研究员的指导下，建立了新的系统生物学模型，并发现可能是新型的针对肺癌的肿瘤靶标。该研究成果已发表在《生物信息学》上。 据悉，肿瘤已是世界人口死亡的首要原因，我国每年因肿瘤死亡的人数超过
脊椎动物早期胚胎发育受到一些基因以及它们的“语法”控制。解译这一语法或许有助于了解畸形或癌症的形成，并开发出一些新的治疗药物。第一次，一项研究发现在斑马鱼的不同发育阶段基因表达过程中存在各种将DNA转录为RNA的机制。研究人员将这项研究发表在《自然》（Nature）杂志上。 在对几个基因组进
青藏高原低氧低压、寒冷、强紫外线等极端环境塑造了其独特的生物多样性资源。家养动物高原适应性状遗传机制的解析，不仅能够研究环境与遗传发育的相互作用机制，也有助于青藏高原动物遗传资源的保护和长远开发利用，为高原家畜育种、提高家畜的生产性能和品种改良提供重要信息和理论指导，进一步促进青藏高原地区生态文
在一项新的研究中，来自来自美国怀特黑德研究所、麻省理工学院和哈佛医学院的研究人员发现了雄性和雌性哺乳动物在基因表达上的全基因组差异。相关研究结果发表在2019年7月19日的Science期刊上，论文标题为“Conservation, acquisition, and functional imp
近日，中国科学院昆明动物研究所张亚平课题组与吴东东课题组合作，通过比较野生褐家鼠和实验大鼠的基因组和转录组数据，解析了实验大鼠的起源和驯化遗传机制。相关研究成果发表在Molecular Biology and Evolution上。 实验大鼠作为一种广泛使用的模式动物，由野生褐家鼠驯化而来