去泛素化酶(DUB)的5大分类详解
泛素一蛋白酶体途径(ubiquitin-proteasome pathway)是细胞内一个重要的蛋白质降解调节系统。通过对底物蛋白的多聚泛素化并经蛋白酶体降解,可以影响或调节多种细胞活动,包括:基因转录、细胞周期调节、免疫反应、细胞受体功能及肿瘤生长、炎症过程等。该途径也是一种动态的蛋白质双向修饰调控系统,在体内由泛素连接酶系统(E1-E2-E3)对底物进行泛素化修饰,去泛素化酶(DUB)家族负责通过水解泛素羧基末端的酯键、肽键或异肽键,将泛素分子特异性的从链接有泛素的蛋白质或者前体蛋白水解下来,起到去泛素化的作用,对蛋白降解进行反向调节,从而影响蛋白质的功能。 去泛素化酶 去泛素化酶是一类数量很大的蛋白酶家族,人类基因组编码大约......阅读全文
泛素蛋白酶体途径的简介
泛素蛋白酶体途径(ubiquitin proteasome pathway)是生物化学术语,介导的蛋白降解是机体调节细胞内蛋白水平与功能的一个重要机制。负责执行这个调控过程的组成成分包括泛素及其启动酶系统和蛋白酶体系统。泛素启动酶系统负责活化泛素,并将其结合到待降解的蛋白上,形成靶蛋白多聚泛素链
泛素结合酶E2的作用机理
泛素结合酶E2的UBC结构域中有一个保守的半胱氨酸残基,这个Cys残基作为活性位点与泛素分子(Ub)形成硫酯键。泛素活化酶E1将泛素转移到E2的半胱氨酸活性位点上,形成Ub-E2复合体,之后或是直接结合底物将泛素连接在靶蛋白上,或是与泛素连接酶E3相互作用,将泛素转移到靶蛋白上 。在泛素化过程中
泛素蛋白质连接酶的定义
中文名称泛素-蛋白质连接酶英文名称ubiquitin-protein ligase定 义泛素化级联反应中的第三个酶(E3),催化将结合在泛素缀合酶上的泛素传递给目标蛋白质,泛素G76与目标蛋白质的赖氨酸上的ε氨基形成异肽键。泛素化由泛素激活酶、泛素缀合酶和泛素-蛋白质连接酶共同完成,总反应为:AT
Sumo化蛋白定量试剂盒—小泛素化研究
众所周知,泛素(ubiquitin, Ub)是一类高度保守的小蛋白, 可与靶蛋白的赖氨酸残基共价连接, 形成多聚泛素链行使指导蛋白质降解的功能。类似于泛素化修饰过程, 小泛素相关修饰物(small ubiquitin related modifier, SUMO)也可以共价修饰靶蛋白的赖
生物物理所等揭示Wnt信号通路泛素化连接酶降解机制
6月1日,《基因与发育》(genes & development)杂志以封面论文的形式发表了中国科学院生物物理研究所梁栋材课题组与美国诺华生物医学研究所Feng Cong研究团队、华盛顿大学教授许文清关于Wnt信号通路泛素化连接酶降解机制的最新研究成果,文章题为The SIAH E3 ubiqu
泛素化介导叶绿体蛋白降解新途径
为了应对全球气候变化带来的频繁逆境胁迫,全面而清晰地了解植物面对胁迫反应的不同调控机制具有重要的意义。在植物抗逆研究中,研究发现非生物胁迫会抑制植物的光合作用,影响叶绿体的稳定性并诱导叶绿体的降解,叶绿体降解进而会引发植物早衰,最终影响作物产量。叶绿体是为植物提供能量来源的重要细胞器。植物叶绿体内部
USP21通过调控去泛素化来稳定FOXP3及维持Treg特有基因表达
FOXP3+调节性T细胞(Treg)具有免疫抑制作用,在维持自身免疫过程中具有重要作用。因此,对Treg细胞在体内的分子机制研究也具有重要意义。关于FOXP3+ Treg细胞稳定性的争论从最近的一些工作报道中也是愈演愈烈。在这些研究中,稳定Treg细胞在炎症反应以及成淋巴反应中具有T-effec
USP18是肌肉细胞分化和成熟的重要调节因子
肌肉退化是行动能力下降的标志。肌肉变性的特征是萎缩、脂肪浸润、纤维化和再生受损,这些都受到多种细胞机制的共同调节,其中泛素-蛋白酶体系统发挥着重要作用。肌肉被发现以泛素积累为特征,这伴随着几种DUB的表达和活性的改变。最近,USP19和USP1被发现与肌肉萎缩有关,也可能影响肌肉生成。肌发生是指在肌
离心机分类详解
为了适应市场的需求,博翎仪器在不断的更新现有产品,不断的研发新的产品。就目前的离心机来说主要是按下面几个方面分类。1、按脱帽方式来分:自动脱帽和人工脱帽。2、按结构可分:台式离心机和立式离心机。台式离心机相对来说是比较小型的,容量也比较小,还可以理解为需要放在台面上的。而立式离心机通常也叫
泛素连接酶E3的基本介绍
泛素蛋白酶体途径是己知的所有真核生物体内具有高度选择性的最为重要的蛋白质降解途径。真核细胞中泛素化修饰后的靶蛋白可能被降解、可能被转移到细胞或细胞外的特定部位,也有可能导致靶蛋白的功能发生变化,这主要取决于靶蛋白所加的泛素链的结构,以及泛素链的长短。泛素连接酶E3决定靶蛋白的特异性识别,在泛素途
泛素连接酶E3的识别机制
靶蛋白通过被泛素途径的酶E2或E3识别而被泛素化修饰,通常是通过识别靶蛋白的特定Lys残基而将泛素连接到靶蛋白上。有时对靶蛋白的识别还需要特定位点的磷酸化并且要达到一定的磷酸化阈值。除此之外还有另外两种识别机制,即N.end规则和一种新的区别于N.end规则的N端氨基酸残基识别机制。N.end规
军事医学科学院Nature子刊p53研究新发现
来自军事医学科学院放射与辐射医学研究所、天津大学的研究人员证实,ABRO1通过稳定p53抑制了肿瘤生成并调控了DNA损伤反应。相关论文发表在10月6日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 军事医学科学院放射与辐射医学研究所所长杨晓明(Xiaoming Yang)
泛素化蛋白快速富集纯化黑科技TUBEs
泛素化是一种常见的调节蛋白的稳定性和功能的翻译后修饰。蛋白的泛素化需要3种酶的参与,分别是泛素活化酶(ubiquitin-activating enzyme,E1)、泛素偶联酶(ubiquitin conjugation enzyme,E2)和泛素连接酶(ubiquitin
DNA的去甲基化过程
DNA的去甲基化由基因内部的片段及与其结合的因子所调控。有两种假说可以解释DNA去甲基化的分子机制。一种假说与DNA半保留复制联系在一起,为被动去甲基化。如果甲基化的DNA经半保留复制后不被甲基化,其DNA则处于半甲基化状态,半甲基化的DNA如再次发生DNA半保留复制,而DNA甲基化活性仍被抑制,则
中国农大JBC解析RNA去甲基化酶晶体结构
2014年3月10日,在百年老牌杂志《生物化学杂志》(Journal of Biological Chemistry)发表的一项最新研究中,中国农业大学、清华大学和多伦多大学的研究人员,报道了RNA去甲基化酶Alkbh5催化核心的5个高分辨率晶体结构。该研究的通讯作者为中国农业大学的陈忠周教
数据记录仪的分类详解
数据记录仪是人类科学的伟大发明创造,早期我们想要获取某方面实验数据,所采用的方式是用简单的仪器加专人观测并人工记录下来,需要花费庞大的人力、物力和时间。于是有新的科学技术诞生出来的新型产品--数据记录仪就出现了。 数据记录仪主要分为有纸记录仪和无纸记录仪 有纸记录仪以独特的热打印记录方式和先
蒲慕明小组发现泛素连接酶修饰途径
来自加州大学伯克利分校Helen Wills神经科学研究所等处的研究人员发现了蛋白泛素化途径中的一种关键酶调控的新机制,有助于解释细胞功能蛋白选择性降解。这一研究成果公布在《神经元》(Neuron)杂志上。 领导这一研究的是著名的神经生物学家蒲慕明教授,其现任中科院神经科学研究所所长,
Cell综述:三种泛素连接酶
泛素化(ubiquitination)作为一类作用方式更加复杂且作用结果更加多样的蛋白质修饰, 在细胞生命周期各个方面扮演着同样重要的角色。 泛素化过程通常需要3种泛素酶的协同作用,其中E1泛素激活酶(ubiquitin-activating enzyme)与E2 泛素偶联酶(ubiquiti
中科院动物所唐铁山王强等PLOS-Biol:致癌基因p53最新成果
11月16日,在国际学术期刊《PLOS Biology》发表的一项研究中,来自中科院动物研究所、中科院北京基因组研究所的研究人员,确定了ATX-3和p53介导的细胞死亡之间的一种新型分子联系,并对于p53直接参与SCA3疾病的发病机制,提供了一个解释。这项研究的通讯作者分别是中科院动物研究所的唐
科学家揭示去甲基化酶在肿瘤中的致病机理
11月21日,肿瘤学研究领域的国际权威杂志《癌症研究》在线发表了武汉大学李枫教授团队和中国科学院北京基因组所吕雪梅研究员最新合作研究成果。该研究以“KDM4B通过激活LINE-1促进DNA损伤”为题,解析了组蛋白去甲基化酶(KDM4B)在肿瘤中所扮演的新角色,从全新角度揭示了KDM4B在肿瘤细
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用
文章导读 表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M
Oncogene:组蛋白去甲基化酶如何影响癌症相关的糖酵解
糖酵解途径(glycolysis)是肿瘤细胞中重要的能量来源途径,然而,目前对于这条代谢相关途径的调控方式的了解,还十分有限。来自厦门大学生命科学学院,南京大学等处的研究人员发现JMJD1A作为一个组蛋白去甲基化酶,它能够影响膀胱肿瘤细胞糖代谢途径关键酶的启动子上组蛋白甲基化修饰水平,从而影响酶
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用
表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在Molecular
泛素蛋白质连接酶的基本信息
中文名称泛素-蛋白质连接酶英文名称ubiquitin-protein ligase定 义泛素化级联反应中的第三个酶(E3),催化将结合在泛素缀合酶上的泛素传递给目标蛋白质,泛素G76与目标蛋白质的赖氨酸上的ε氨基形成异肽键。泛素化由泛素激活酶、泛素缀合酶和泛素-蛋白质连接酶共同完成,总反应为:AT
去糖基化的基本概念
中文名称去糖基化英文名称deglycosylation定 义在糖缀合物中除去糖基的过程。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞化学(二级学科)
人泛素连接酶(UBPL)ELISA试剂盒
人泛素连接酶(UBPL)ELISA试剂盒 (用于血清、血浆、细胞培养上清液和其它生物体液内) 原理本实验采用双抗体夹心 ABC-ELISA法。用抗人 E3/UBPL 单抗包被于酶标板上,标准品和样品中的 UBPL与单抗结合,加入生物素化的抗人UBPL,形成免疫复合物连接在板上,辣根过氧化物酶标记的S
iScience:利用蛋白质组学构建预测模型识别未知底物
近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子功能研究组研究员朴海龙团队基于生物信息学方法,揭示了癌症中关键的去泛素化与泛素化分子相互作用网络。 去泛素化与泛素化作用是生命体内至关重要的转录后修饰作用,参与到细胞周期、免疫调控、信号传递等几乎所有的生物学通路过程中。同时,该作用体系对
汽油辛烷值的分类及详解
不同化学结构的烃类,具有不同的抗爆震能力。异辛烷(2,2,4-三甲基戊烷)的抗爆性较好,辛烷值给定为100。正庚烷的抗爆性差,给定为0。汽油辛烷值的测定是以异辛烷和正庚烷为标准燃料,按标准条件,在实验室标准单缸汽油机上用对比法进行的。调节标准燃料组成的比例,使标准燃料产生的爆震强度与试样相同,此
固定化酶固定化酶与游离酶相比的优点
固定化酶与游离酶相比的优点:①极易将固定化酶与底物、产物分开;②可以在较长时间内进行反复分批反应和装柱连续反应;③在大多数情况下,能够提高酶的稳定性;④酶反应过程能够加以严格控制;⑤产物溶液中没有酶的残留,简化了提纯工艺;⑥较游离酶更适合于多酶反应;⑦可以增加产物的收率,提高产物的质量;⑧酶的使用效
病毒通过泛素化调控寄主de-novo甲基化研究取得进展
双生病毒(Geminivirus)是一组具有双生颗粒形态的单链环状植物DNA病毒。由于双生病毒主要依赖于植物宿主系统来完成生活史,能够通过自身编码的少数几个蛋白来调控植物的若干重要生命过程,因此,对双生病毒展开深入研究,有助于揭示植物自身若干重要生命过程的分子机制。另外,双生病毒侵染广泛的农作物