JIPtest荧光数据及其它生理生态数据主成分综合分析...2

2. 聚类分析不同处理之间的差异(Zhiponova M, 2020)光是控制植物生长发育的主要因素。光不仅推动植物光合作用,光质和光照时间还驱动着植物主要的发育变化,如光形态发生、开花的光周期诱导、向光性、避荫以及防御等。为了评估光照条件对植物生理状态的影响,该研究在豌豆植株的早期发育过程中使用正常白光(W)、白色阴影(WS)、高光强蓝/红/远红组合光(BR)和低光强蓝/红/远红组合光(BRS)四种光照射,采用JIP-test来评估与光吸收和电子传输有关的PSII参数,并通过PCA技术聚类分析不同光照之间的差异。图2. JIP-test参数和不同处理的主成分分析(Plant variants: W – white light; WS – white light with shadow; BR – blue and red light; BRS – blue and red light with shadow)对获得的JIP-t......阅读全文

JIPtest荧光数据及其它生理生态数据主成分综合分析...2

2. 聚类分析不同处理之间的差异(Zhiponova M, 2020)光是控制植物生长发育的主要因素。光不仅推动植物光合作用,光质和光照时间还驱动着植物主要的发育变化,如光形态发生、开花的光周期诱导、向光性、避荫以及防御等。为了评估光照条件对植物生理状态的影响,该研究在豌豆植株的早期发育过程中使用正

JIPtest荧光数据及其它生理生态数据主成分综合分析...1

JIP-test荧光数据及其它生理生态数据主成分综合分析(PCA)的应用解析近年来,快速叶绿素荧光诱导动力学曲线(OJIP曲线)及其数据分析方法JIP-test在植物科学研究中的应用越来越广泛(BussottiF, et al., 2020; KalajiH M, et al., 2017; Pon

JIPtest荧光数据及其它生理生态数据主成分综合分析...3

通过PCA技术分析发现,所选的JIP-test参数形成了三个很好分离的簇。其中两个位于PC1(Cluster 1&2)上,一个(Cluster 3)位于PC2上。每一组参数描述了不同的生理过程:光能捕获和光化学阶段(Cluster 1)、耗散(Cluster 2)和热阶段(Cluster

基因表达数据分析主成分分析-PCA

DNA微阵列基因表达数据分析 主成分分析 ( Princ ipal Component Analysis , PCA ) 是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法,它可以从多元事物中解析出主要影响因素,揭示事物的本质,简化复杂的问题。计算主成分的目的是将高维数据投影到较低维空间。给定 n 个变量的 m

JIPtest和主成分分析(PCA)在植物光合作用研究中的应用3

图4c. 数据点降维的信息损失与矫正:X/Y轴矫正最好的结果应该是我们依然选择了某个直线,并把点投影到这条直线上,但是点之间没有重合,点与点的间隔也比较远。看到这里,我们就知道PCA到底要做什么了,没错,就是找到这条直线,并求出投影到这条直线的点的坐标(当然二维降一维是直线,三维降二维就是平面了,更

JIPtest和主成分分析(PCA)在植物光合作用研究中的应用2

图2. 叶绿素荧光相关联合作者网络(注意R.Strasser和R.J.Strasser是同一个人)。从黄色到红色,协作性更强,中心性更高(K. HU et al, 2020)学术界对JIP-test方法的研究和应用热度在不断增加,而对脉冲调制式(PAM)方法的兴趣在逐渐减弱。这是什么意思?乍一看,一

数据分析介绍(I)-主成份分析法

数据分析介绍(I) 主成份分析法

数据分析介绍(I)-主成份分析法

华联于 2012 年 7 月~ 9 月的科技专题中,介绍芯片实验设计时,概略介绍了一些常用的数据分析方法,有许多客户及好学的读者纷纷来信,希望我们另辟单元,仔细教学这些对他们很有帮助的分析软件;数据分析素来是华联的强项之一,我们很乐意也很兴奋地开辟这个新单元 - 数据分析教学,本期以主成份分析法

月桂酸的性状及生态数据

生态数据其它有害作用:该物质对环境可能有危害,对水体应给予特别注意。性质稳定1.常温常压下稳定。禁配物:碱、氧化剂、还原剂。无色针状晶体。 溶于甲醇,微溶于丙酮和石油醚。不溶于水。与浓硫酸起硫酸化作用,遇强碱无化学作用。2.本品无毒。对皮肤刺激性小。3. 存在于烤烟烟叶、白肋烟烟叶、香料烟烟叶、烟气

荧光定量PCR数据分析举例

  首先看基线与阈值设置的是否合理;在基线和阈值设置合理的基础上,得到的CT值才是准确可靠的;在CT值是准确的基础上再进行相对定量或绝对定量实验。        1 绝对定量实验数据分析注意要点:    1.1 绝对定量实验对检测体系的扩增效率不做硬性要求;    1.2 检测的样本浓度必须落在标曲

JIPtest和主成分分析(PCA)在植物光合作用研究中的应用4

总的来说通过PCA我们可以分类植物对各种环境因素的不同反应:(i)找到特定处理下植物样品OJIP曲线发生的特异性变化(ii)筛选出发生显著变化的JIP-test荧光参数及其变化特征,可更好对植物样品光合机构发生的变化(伤害)进行定位分析,如PSⅡ供体侧/受体测或PSⅡ活性中心等。(iii)我们还可以

JIPtest和主成分分析(PCA)在植物光合作用研究中的应用1

1.快速叶绿素荧光诱导动力学分析(JIP-test)近二十年来,基于“生物膜能量通量理论”的活体快速叶绿素 a 荧光诱导动力学OJIP曲线和JIP-test分析,由于其无损、精确、快速等特性,已被广泛而成功地用做研究植物生理状态的有力工具(Strasser et al.,1995, 2004)。植物

绝对荧光定量PCR的数据分析

现在最常用的两种分析实时定量PCR实验数据的方法是绝对定量和相对定量。绝对定量通过标准曲线计算起始模板的拷贝数;相对定量方法则是比较经过处理的样品和未经处理的样品目标转录本之间的表达差异。2-△△CT方法是实时定量PCR实验中分析基因表达相对变化的一种简便方法,即相对定量的一种简便方法。本文介绍了该

绝对荧光定量PCR的数据分析

现在最常用的两种分析实时定量PCR实验数据的方法是绝对定量和相对定量。绝对定量通过标准曲线计算起始模板的拷贝数;相对定量方法则是比较经过处理的样品和未经处理的样品目标转录本之间的表达差异。2-△△CT方法是实时定量PCR实验中分析基因表达相对变化的一种简便方法,即相对定量的一种简便方法。本文介绍了该

鸟嘌呤的生理生化数据

鸟嘌呤核苷酸的盐酸盐单水合物100℃失水,200℃失氯化氢成鸟嘌呤。为核酸中嘌呤型碱基之一。存在于DNA和RNA中,可从鸟粪或鱼鳞水解制得,也可以用2,6,8-三氯嘌呤与NaOH水溶液、NH3、HI反应而合成制得。在生物体内,一般是先合成次黄嘌呤核苷酸,经氧化生成黄嘌呤苷酸,再经氨基化生成鸟嘌呤核苷

溴化乙锭的生态学数据

对是水稍微有危害的不要让未稀释或大量的产品接触地下水、水道或者污水系统,若无政府许可,勿将材料排入周围环境。

乙烯的生态学数据

1、生物降解性好氧生物降解性:24~672h厌氧生物降解性:96~2688h2、非生物降解性空气中光氧化半衰期(h):6.2~56h3、其他有害作用该物质对环境有危害,对鱼类应给予特别注意。还应特别注意对地表水、土壤、大气和饮用水的污染。

草酸的生态学数据

该物质对环境可能有危害,对水体应给予特别注意。该品具有强烈刺激性和强烈腐蚀性。其粉尘或浓溶液可导致皮肤、眼或黏膜的严重损害。具有较强毒性和腐蚀性。草酸对人的最低致死量为71mg/kg,对成年人的致死量为15~30g。人若口服5g草酸即发生胃肠道炎、虚脱、抽搐和休克等症状甚至死亡。吸入草酸蒸气发生慢性

丙酮的生态学数据

1、生态毒性LC50:4740~6330mg/L(96h)(虹鳟鱼);10mg/L(48h)(水蚤);2100mg/L(48h)(卤虫)LD50:5000mg/L(24h)(金鱼)EC50:8600mg/L(5min)(发光菌,Microtox毒性测试);10mg/L(48h)(水蚤)2、生物降解性

尿酸的生态学数据

水危害级别1(德国规例)(通过名单进行自我评估)该物质对水有稍微危害的。不要让未稀释或大量的产品接触地下水、水道或污水系统。若无政府许可,勿将材料排入周围环境。

乙醛的生态学数据

  1、生态毒性  LC50:37.2mg/L(96h)(黑头呆鱼);53mg/L(96h)(蓝鳃太阳鱼)  EC50:42mg/L(48h)(水蚤);30.8mg/L(96h)(黑头呆鱼)  2、生物降解性  MITI-I测试,初始浓度100ppm,污泥浓度30ppm,2周后降解80%。  3、非

层析法常用数据表及性质(2)

(三) 琼脂糖凝胶的技术数据 ( 琼脂糖是琼脂内非离子型的组分,它在0 ~ 4℃,pH 4~9范围内是稳定的。) 名称、型号

qpcr数据分析及作图方法

荧光定量PCR(qPCR)就是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。由于常规的PCR的缺点,荧光定量PCR( qPCR)由于其操作简便,灵敏度高,重复性好等优点发展非常迅速。设在已经涉

关于2氯苯甲酸的生态学数据介绍

  该物质对环境有危害,对水体和大气可造成污染,有机酸易在大气化学和大气物理变化中形成酸雨。因而当PH值降到 5以下时,会给动、植物造成严重危害,鱼的繁殖和发育会受到严重影响,流域土壤和水体底泥中的金属可被溶解进入水中毒害鱼类。水体酸化还会导致水生生物的组成结构发生变化,耐酸的藻类、真菌增多,而有根

关于2氯苯甲酸的生态学数据介绍

  2-氯苯甲酸对环境有危害,对水体和大气可造成污染,有机酸易在大气化学和大气物理变化中形成酸雨。因而当PH值降到 5以下时,会给动、植物造成严重危害,鱼的繁殖和发育会受到严重影响,流域土壤和水体底泥中的金属可被溶解进入水中毒害鱼类。水体酸化还会导致水生生物的组成结构发生变化,耐酸的藻类、真菌增多,

分析数据的处理——可疑数据的取舍

1. Q-检验法 (3~10次测定适用,且只有一个可疑数据)  (1) 将各数据从小到大排列:x1, x2, x3……xn ;   (2)计算  (x大-x小),  即  (xn -x1);   (3)计算    ( x可-x邻),   (4)计算舍弃商  Q 计 =ô x可-x邻ô/ xn -x1

月桂酸的生态学数据

其它有害作用:该物质对环境可能有危害,对水体应给予特别注意。

马尿酸的生态学数据

该物质对环境可能有危害,对水体应给予特别注意。

马尿酸的生态学数据

该物质对环境可能有危害,对水体应给予特别注意。

反油酸的生态学数据

对水体没有危害。