关于新建自动化生物样本库的流程思考(三)
三、 核心产品选型与方案打造 当理想目标被纳入现实框架,实际需求就产生了,根据实际需求我们可以进行核心产品的选型和项目方案的打造。 a. 确定准入门槛确定准入门槛本质上是明确项目核心利益所在,每个项目皆可不同:例如涉及生产级细胞样本的保藏可能会要求样本存取时温度波动应小于某个固定值;又如涉及生物安全风险的样本保藏可能会要求所有样本都可进行自动权限管理和信息追溯;液氮价格低廉地区的项目可能会要求全部尽量避免采用压缩机制冷。设置好明确的准入门槛,能够筛选掉大多数无效选项以节省精力。b. 市场信息收集参加行业会议会是较好的全面信息收集途径,咨询先行者以获取经验或联系行业领先的供应商也是获得市场全景的重要选项。 c. 建立客观评价体系复杂产品(如自动化系统)要求建立更加客观全面的评价体系。决策者不宜完全基于供应商参数来架构评价体系,相反应优先考虑目标产品在自身应用场景中能够提供的核心价值,再将候选供应商的参......阅读全文
关于新建自动化生物样本库的流程思考(三)
三、 核心产品选型与方案打造 当理想目标被纳入现实框架,实际需求就产生了,根据实际需求我们可以进行核心产品的选型和项目方案的打造。 a. 确定准入门槛确定准入门槛本质上是明确项目核心利益所在,每个项目皆可不同:例如涉及生产级细胞样本的保藏可能会要求样本存取时温度波动应小于某个固定值;又如涉及生物安全
关于新建自动化生物样本库的流程思考(二)
c. 规模及温区目标规模和温区选择同样是需要定义的核心目标。规模的决策逻辑主要考虑以下几点:年度样本提供者的数量预期、涉及样本的种类、单个样本可用于下游检测的最小体积、每种样本的复份数量、规划使用年限等;温区的选择则具有相对更加复杂的决策逻辑:需要综合考量下游应用目标、微环境纯净度、分子在微环境中的
关于新建自动化生物样本库的流程思考(四)
四、 明确配套要求 正如开篇我们提到的,样本库系统化建设会牵一发而动全身,所以我们在确定了核心产品方案之后需要审视配套要素,以使得之后发生的装机、使用流程较为顺畅。核心产品必须能够运入目标场地并顺利装机,这就产生了基建对接要求;核心产品的正常使用会同时涉及到冻存耗材和样本信息管理软件的使用,这就产生
关于新建自动化生物样本库的流程思考(一)
生物样本库的规划与筹建工作一般多由医学、生物学背景的专家承担,然而由于在建库过程中往往会涉及到多专业的知识和复杂的决策流程,一旦某个环节出现疏漏就会造成更广泛的影响。自动化样本库的建设所涉及的信息和界面则更是纷繁复杂。在此背景下,我们将基于以往经验,梳理整个建设流程的逻辑思路,抛砖引玉,供有建库需求
组织库冷冻样本管理流程(三)
一. 组织库冷冻保存管的常见形态与保存温度。组织:冻存管保存(以内旋冻存管为多),常保存于-80 度/-150 度冰箱或液氮,也有很多单位将部分组织以RNAlater 浸润后保存于-30 度或-80 度条件,此外也有OCT 包埋,蜡块等组织保存形态。在条件允许的情况下,尽量保留T/P/N 三
生物样本库类型
生物样本库(Biobank)有多种类型,常见的组织、器官库(Tissue bank),如血液库、眼角膜库、骨髓库,到拥有正常细胞、遗传突变细胞、肿瘤细胞和杂交瘤细胞株(系)的细胞株(系)库,近年来出现了脐血干细胞库、胚胎干细胞库等各种干细胞库以及各种人种和疾病的基因组库(Genome bank)
生物样本库的价值
在和大量客户接触和交流的过程中,发现越来越多的临床科研工作者意识到样本资源对于科研工作的重要性,开始重视临床生物样本的大量收集和规范化管理工作,一个优秀的生物样本库信息化管理体系的建立,将带来以下价值: 整体科研 即从短期、中期和长期三个阶段来规划本单位的科研目标,明确各个阶段可以采用的科研
生物样本库的现状
早在1994年中国科学院就建立了中华民族永生细胞库,而后,山东省脐带血造血干细胞库、北京脐带血造血干细胞库、泰州(复旦)健康科学研究院、SBC芯超生物银行等专项生物标本资源库也相继建立,所以我国生物样本资源库与欧美相比,起步时间并不算晚。 2003年我国启动了国家自然科技资源共享平台建设项目,
生物样本库的定义
生物样本库 根据经济合作与发展组织(OECD)的定义,”生物样本库(Biobank)是一种集中保存各种人类生物材料(Human biological material),用于疾病的临床治疗和生命科学研究的生物应用系统”。 类型 生物样本库(Biobank)有多种类型,常见的组织、器官库(T
组织库冷冻样本管理流程(六)
附件C.生物样本库编号规则建议标本库编号命名规则:总原则:唯一性,共享性辅原则:在满足总原则基础上,尽量精简。编号长度尽量保持统一。一.组织生物样本采集和常规采集的编号规则组织编号规则。组织编号规则标签类型:BRADY THT-163-499-3-IP 长方形为25.4mm*9.525mm, 圆直径
组织库冷冻样本管理流程(二)
10. 样本库标识建议在冰箱外门上贴上磁性冻存架模拟标识,并在对应的空格位置上填写冻存盒的信息。例如冻存盒内样本名称,冻存盒编号,冻存盒内样本编号起止等。这样,在打开冰箱门之前,对内部的样本基本情况也能一目了然。注:【根据某些样本最终的实验要求,可能需要设计不同的存储流程,比如有些需要做蛋白实验的样
组织库冷冻样本管理流程(五)
2.卧式冰箱卧式冰箱的标本位置信息也采用类似于立式冰箱的方式,区别是卧式冰箱里的冻存架的高度是用方框内的格子表达的。请参考如下:3. 液氮灌一个标本的位置信息会用AA-BB-CC-DD 表达,AA 是液氮灌在整个冰箱/液氮灌的主界面排列中的编号。BB 是冻存架的编号,可以选择A…..Z 的编号,也可
组织库冷冻样本管理流程(四)
四. 超低温冰箱的考虑因素1. 冰箱类型。 超低温冰箱有立式和卧式之分,温度有-80 度和-150 度。目前市面上-150 度冰箱都是卧式。卧式冰箱优点是开门冷气散发较小,缺点是占地面积大,立式冰箱正好相反。所以大规模建库的情况下,推荐使用立式冰箱做大规模存储,而卧式冰箱做经常开关门的
组织库冷冻样本管理流程(一)
一. 取材和编号/标签部分在本环节进行组织和血液的取材,并制作条形码标签,将样本进行分装。1. 取材单:手术医生根据临床病例情况在术前一日通知样本库次日取样本,同时在医嘱中注明需要抽取血样数量、种类。样本库根据次日样本情况预先准备样本提取单,并预先定义好流水编号。样本提取单上的信息可包含并不仅限于以
什么是生物样本库?
生物样本库又称生物银行(Biobank),主要是指标准化收集、处理、储存和应用健康和疾病生物体的生物大分子、细胞、组织和器官等样本(包括人体器官组织、全血、血浆、血清、生物体液或经处理过的生物样本(DNA、RNA、蛋白等)以及与这些生物样本相关的临床、病理、治疗、随访、知情同意等资料及其质量控制
生物样本库主要形式
1、医院或研究机构下单个研究人员或者单个科室因其研究需要将其搜集的生物样本单独保存而建立的生物样本库(Biobank); 2、医院或研究机构建立的生物样本库(Biobank),进行医院或研究机构内部搜集的生物样本资源统一保存和分配使用; 3、多个医院或研究机构联合组成的生物样本库(Bioba
生物样本库主要形式
1、医院或研究机构下单个研究人员或者单个科室因其研究需要将其搜集的生物样本单独保存而建立的生物样本库(Biobank); 2、医院或研究机构建立的生物样本库(Biobank),进行医院或研究机构内部搜集的生物样本资源统一保存和分配使用; 3、多个医院或研究机构联合组成的生物样本库(Bioba
生物样本库的识别跟踪
a) 提取、分装后的样本应能通过信息系统追溯到原始样本并与其信息相关联; b) 每份样本在信息系统中应有且仅有唯一一个或者一组识别符号(数字或条形码); c)样本从采集到处理、储存、配送运输、使用后剩余返回重新储存等的全过程都应被有效记录; d) 生物样本的转移应被及时记录,信息系统能追溯
生物样本库发展现状
生物样本库是标准化搜集处理、储存和分发健康和疾病生物体的生物大分子、细胞、组织和器官等样本,以及相关的个体生理及病理信息的系统。目前主要是人体样本的搜集储存,包括核酸、蛋白、细胞、血液及其分离成分、尿液、唾液、毛发、精液、卵子、受精卵、卵巢组织、睾丸组织、胎盘、脐带、胸腺、脂肪、皮肤、骨髓、角膜、血
生物样本库认可依据
CNAS-R01《认可标识使用和认可状态声明规则》 CNAS-R02《公正性和保密规则》 CNAS-R03《申诉、投诉和争议处理规则》 CNAS-RL01:2019《实验室认可规则》 CNAS-RL02:2018《能力验证规则》 CNAS-RL10:2020《生物样本库认可规则》 C
生物样本库与转化医学
随着后基因组时代的来临,对基因的研究引发了新的方法和研究手段的诞生,密切了基础医学与药物研发、临床医学之间的联系。使人们可以更准确地理解环境和人类遗传分子之间的相互作用,以期精确地描绘疾病发生的本质,从而改进对于疾病的诊查和治疗。由此诞生了从实验室到病床,把基础研究所获得的知识、成果快速转化为临
生物样本库的信息系统
生物样本库(Biobank)资源管理信息系统是为了便利于有效的管理生物样本和相关信息所建立的具有搜集、保存、检索和分析功能的信息系统。其易用性、安全性、可靠性是其重要考核内容。为此: 生物样本库(Biobank)资源管理信息系统的功能包括但不限于:追踪捐赠者的问卷和知情同意,管理生物样本采集、
生物样本库的发展现状
生物样本库(Biobank)是众多重要科研成果快速产业化、应用到临床,实现“转化医学”的重要保证,美国、欧洲以及国际卫生组织都投入了几亿到几百亿美元建立大型生物样本库。 进入二十一世纪以来,随着现代生物技术的快速发展,分子遗传学取得了巨大的发展,国外对于人类遗传资源的保护与开发研究势头强劲,主
关于举办生物样本库认可宣贯培训的通知
原文地址:https://www.cnas.org.cn/zxtz/912820.shtml 关于举办生物样本库认可宣贯培训的通知
生物样本库的推广势在必行如何安全存储和管理生物样本
1. 标准化样本处理 生物样本种类繁多(主要分为5大类:组织样本、血液样本、核酸和蛋白质样本、冻存的细胞样本、组织切片和组织芯片),对样本进行标准化处理是构建样本库最重要也是最核心的一样工作。 1) 样本处理是对样本进行必要的分割、分装和处理,以使样本满足储存和将来使用的质量要求。样本的处理
活体肿瘤样本库与常规肿瘤生物样本库有什么区别?
一、常规生物样本库 肿瘤在临床上有实体瘤和非实体瘤之分。来源于临床活检或外科手术的固体肿瘤组织,由病理医生决定切割组织的关键部份用于常规病理诊断,且在不影响常规病理诊断的情况下,组织的剩余部份被生物样本库切割收集,将肿瘤蜡块存储到样本库中。但是这种方式保存的样本,不能够保证保存下来的肿瘤块是否
爱沙尼亚基因组中心生物样本库的自动化解决方案
概述爱沙尼亚生物样本库是收集能够代表整个爱沙尼亚人口的以民族委基础的生物样本库。因为整体工作量、反应时间、样本的完整性和过程的安全性等因素,为研究伙伴人工发放样本变得越来越困难,因此爱沙尼亚生物样本库采用了由一套自动化存储系统,一台自动化液体处理系统和多个小设备(如离心机和开盖机)组成的Hamilt
盛元广通实验室自动化生物样本库质量控制管理系统
随着我国生物医学研究的不断深入和精准医疗的快速发展,对高质量生物样本的需求日益增长。近年来,我国生物样本库建设取得了显著进展。各级政府、高校和医院纷纷投入资源建设生物样本库,推动了生物样本资源的有效整合和利用。生物样本库的质量控制管理体系正在逐步完善。相关机构和部门已经制定了一系列质量控制标准和操作
中国生物样本库:不能仅“存起来再说”
101篇1980年前后发表于《细胞》《自然》等杂志的重大发现,20年后仅1项有临床价值。”中国科学院院士、复旦大学附属中山医院院长樊嘉在近日召开的中国整合生物样本学大会上说,美国的这组统计数字显示从实验室到临床的传统转化模式效率低、时间长。 高质量论文仅有不足百分之一临床转化,这样的窘境有
WHO欲建埃博拉病毒生物样本库
随着西非埃博拉疫情的逐渐好转,为了更好地利用公共卫生部门收集的数十万患者样本,一项计划正在酝酿。日前,世界卫生组织(WHO)在塞拉利昂首都弗里敦召开会议,讨论建造生物样本库,储存取自确诊和疑似埃博拉患者的血液、精子、尿液和母乳样本以及取自死亡患者的标本等,共计约10万份样本。 WHO理事会顾