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基于拉曼组与机器学习的微藻种质挖掘新技术

微藻是地球上代谢功能较为多样化的生物类群,在全球碳循环中发挥关键作用,也是生物技术产业中重要的一类光合细胞工厂。但微藻的种质鉴定和代谢功能检测繁琐,且自然界大部分微藻难以培养。近日,中国科学院青岛能源研究所单细胞中心发表了首个微藻拉曼组数据库,并结合机器学习示范了单细胞精度、快速的微藻种类鉴定和代谢功能表征。该技术为微藻细胞工厂的高效挖掘和筛选提供了一个免培养、高通量的强有力手段,相关研究成果发表在《分析化学》上。 微藻是在自然界中广泛存在的单细胞光合自养生物,可将空气中的二氧化碳高效转化为油脂、碳水化合物、蛋白质和色素等高附加值产品,应用于第三代生物燃料、饲料、食品和保健品等。因此,“微藻细胞工厂”有望成为服务“碳中和”和“碳达峰”的低碳制造解决方案之一。这一前景的前提和基础是微藻种质资源的快速鉴定和代谢功能检测,然而,传统上“先养后筛”的种质筛选策略面临着诸多瓶颈。 为此,中科院青岛能源所单细胞中心Mohammadh......阅读全文

基于拉曼组与机器学习的微藻种质挖掘新技术

  微藻是地球上代谢功能较为多样化的生物类群,在全球碳循环中发挥关键作用,也是生物技术产业中重要的一类光合细胞工厂。但微藻的种质鉴定和代谢功能检测繁琐,且自然界大部分微藻难以培养。近日,中国科学院青岛能源研究所单细胞中心发表了首个微藻拉曼组数据库,并结合机器学习示范了单细胞精度、快速的微藻种类鉴定和

青岛能源所提出微藻属内精确种质鉴定新策略

  微藻通过光合作用,在地球生物圈的碳固定、初级生物量积累和能量转化等方面发挥着重要作用。一些具有含油量高、生长速度快、抗逆性强等生理特征的微藻,具备规模生产生物柴油等可再生燃料的潜力。而目前使用的ITS等系统发育分子标记经常无法准确区分与鉴定种内不同藻株或属内不同藻种。因此,开发高灵敏度和高可靠性

微区拉曼探针是什么

  激光拉曼微区探针r hamln microprc}6e一种新的非破坏性微区分析技术。这种激光拉曼分子探}i是用激光去激发样品,组成样品的不同组分产生不同频率的拉曼散射,以检测和鉴定各个组分,然后丙经显微照相成像,给出各组分的分布图它可以检}}!和研究在空气或控制气氛、液体或透明介质中的样品。样品

微区拉曼光谱仪

  微区拉曼光谱仪是一种用于材料科学领域的分析仪器,于2003年11月8日启用  技术指标  配有双激光器:514nm和785nm; 拉曼位移范围:50~4000cm-1; 显微尺寸范围:0.1微米*0.1微米; 光谱分辨率:1cm-1。  主要功能  拉曼光谱和红外光谱相配合可全面地研究分子运动状

从微区拉曼到现代的激光共聚焦显微拉曼

  拉曼微区探针(微区拉曼)是把显微镜和拉曼光谱联系起来,测得的拉曼光谱具有较高的精确性,可以用来进行表面光谱学研究,发现与组分化学性质有关的表面均一性。  拉曼微区探针的概念最早是由Tomas Hirshfled在1969年提出的。图1给出了第一台成功的拉曼显微镜示意图。它把常规显微镜和配有高灵敏

Fluidigm微流控技术助力乌龙茶种质鉴定

  近日,福建农林大学联合福建省出入境检验检疫局的研究小组在Tree Genetics & Genomes发表最新论文《Genetic diversity of oolong tea (Camellia sinensis) germplasms based on the nanofluidic ar

微区拉曼有什么区别

  微区拉曼和普通拉曼只是实验方法不同,拉曼谱图的形状原则上只取决于样品,当然实验方法不同对拉曼光谱图的记录效果有影响。  若不做偏振实验,单晶和粉晶的拉曼光谱图不会有太大差别,只是某些谱峰的相对强度有些不同。单晶与粉晶的拉曼光谱图中的谱峰较尖锐,而非晶的谱峰趋于宽化。  微区拉曼和普通拉曼应是测试

青岛能源所研制出活体单细胞淀粉含量检测方法

  近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心助理研究员籍月彤、硕士研究生何曰辉等利用该中心研制的活体单细胞拉曼分选仪原型机,通过单细胞拉曼光谱的快速采集和分析,发明了一种快速、非侵入性、不需标记、以单个活体细胞为单位的淀粉定量检测方法,为富含淀粉的种质资源选育提供了一种崭新手段。  据

蓝藻门、裸藻门、黄藻门、硅藻门鉴定——裸藻门鉴定

实验材料裸藻属藻类试剂、试剂盒I-KI 溶液0.1%而甲基蓝溶液浓KOH溶液仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤裸藻门 Euglenophyta裸藻绝大多数为无细旋壁、具鞭毛能游动的单细胞种类。细胞质外层特化为周质,有的周质较硬,使细胞保持一定的形态,有的周质较软,细胞能变

蓝藻门、裸藻门、黄藻门、硅藻门鉴定 ——黄藻门鉴定

实验材料黄丝藻属无隔藻属藻类试剂、试剂盒I-KI 溶液0.1%而甲基蓝溶液浓KOH溶液仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤黄藻门 Xanthophyta1. 黄丝藻属 Tribonema(图 2-18-4)隶属于异丝藻目,黄丝藻科。藻体为单列不分核的丝状体,细胞长圆柱形或两