二代测序在肿瘤临床中的应用

二代测序,又名下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS),也叫高通量测序(High-Throughput Sequencing),是相对于传统的桑格儿测序(Sanger Sequencing)而言的。有些文章中可能还会称为大规模平行测序平台(massively parallel DNA sequencing platform)和深度测序(Deep sequencing)。目前,二代测序平台的两个主要厂家是life及illumina,因life平台的通量相对较小,所以在临床检测的应用相对较多一些。它的核心技术是使用半导体技术在化学和数字信息之间建立直接的联系。在半导体芯片的微孔中固定DNA链,随后依次掺入ACGT。随着每个碱基的掺入,释放出氢离子,在它们穿过每个孔底部时能被检测到,通过对H+ 的检测,实时判读碱基,从而得到大量高质量的测序数据。顾名思义,二代测序最大的优势就在于:......阅读全文

肿瘤坏死因子在肿瘤治疗中的应用

  TNF在人、鼠肿瘤细胞株或原代培养的人癌细胞中,以及荷瘤裸鼠中都表现出杀瘤或抑瘤作用和免疫调节活性。应用TNF在治疗肿瘤等方面大多尚处于临床试验阶段,其也可与IL-2联合治疗肿瘤,目前认为全身用药的疗效不及局部用药,后者如病灶内注射,局部浓度高且副作用也较轻。近年来已采用TNF基因治疗开始对黑色

肿瘤坏死因子在肿瘤治疗中的应用

  TNF在人、鼠肿瘤细胞株或原代培养的人癌细胞中,以及荷瘤裸鼠中都表现出杀瘤或抑瘤作用和免疫调节活性。应用TNF在治疗肿瘤等方面大多尚处于临床试验阶段,其也可与IL-2联合治疗肿瘤,目前认为全身用药的疗效不及局部用药,后者如病灶内注射,局部浓度高且副作用也较轻。近年来已采用TNF基因治疗开始对黑色

第二代DNA测序技术的应用展望

第二代测序技术--以Illumina/Solexa Genome Analyzer 为例1.概述DNA测序(DNA sequencing)作为一种重要的实验技术,在生物学研究中有着广泛的应用。早在DNA双螺旋结构(Watson and Crick,1953)被发现后不久就有人报道过DNA测序技术,但

二代测序技术

人们常说“事后诸葛亮”,可见“料事如神”是一个让人艳羡的能力。现代科技的发展让人们无限接近这种能力,天气预报就是现代人诸多“料事如神”本领中的一种,不断进步中切实提高了生活品质与舒适度。个人体会进步主要体现在两个方面:1.越来越说人话。印象里小时候听天气预报感觉听的是中文,但是这些中国话想表达什么听

二代测序原理

第二代测序(Next-generation sequencing,NGS)又称为高通量测序(High-throughput sequencing),是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序,而二代测序开创性的引入了可逆终止末端,从而实现边合成边测序(Seque

空间转录组测序技术在肿瘤研究进展的应用

  空间转录组测序技术是一种基于组织空间结构进行高通量转录组测序的技术。通过该技术,可以得到组织空间位置的基因表达图谱。因此,空间转录组技术是现阶段可实现空间二维基因表达检测的高通量技术。该技术为基于空间的发育研究和疾病异质性问题提供了一个解决方案。   空间转录组测序运用方向(Trends Bi

空间转录组测序技术在肿瘤研究进展的应用

空间转录组测序技术是一种基于组织空间结构进行高通量转录组测序的技术。通过该技术,可以得到组织空间位置的基因表达图谱。因此,空间转录组技术是现阶段可实现空间二维基因表达检测的高通量技术。该技术为基于空间的发育研究和疾病异质性问题提供了一个解决方案。空间转录组测序运用方向(Trends Biotechn

单细胞测序技术在肿瘤研究中的发展趋势

单细胞测序技术在肿瘤研究中的发展趋势包括以下几个方面:多组学整合分析不仅局限于对肿瘤细胞的基因组和转录组测序,还将结合表观基因组、蛋白质组、代谢组等多组学数据,更全面地揭示肿瘤细胞的特征和调控机制。更高的分辨率和精度不断改进技术,以检测更微量的核酸物质,更准确地识别低频突变和罕见的细胞亚群,提高对肿

重磅!-首批肿瘤基因测序临床应用试点单位公布

  2014年3月,国家卫生计生委医政医管局发布《关于开展高通量基因测序技术临床应用试点单位申报工作的通知》(以下简称通知)。《通知》指出已经开展高通量基因测序技术,且符合申报规定条件的医疗机构可以申请试点,并按照属地管理原则向所在省级卫生计生行政部门提交申报材料,同时明确申请试点的基因测序项目(如

肿瘤细胞药敏检测在肿瘤治疗中的应用前景如何?

肿瘤细胞药敏检测在肿瘤治疗中具有广阔的应用前景:精准医疗的重要支撑:随着精准医疗理念的深入发展,肿瘤细胞药敏检测能够为患者提供更个体化的治疗方案,提高治疗效果,减少不必要的药物使用和副作用。新治疗策略的开发:有助于筛选和评估新的抗癌药物、药物组合以及新兴的治疗方法,如免疫治疗与化疗的联合应用等。克服

单细胞测序技术在癌症治疗中的应用

单细胞测序技术在癌症治疗中的应用具有重要意义,以下是详细的介绍:肿瘤异质性分析癌症通常由具有不同基因表达模式和突变特征的细胞群体组成。单细胞测序能够揭示肿瘤内细胞的异质性,包括不同的亚型、分化状态和恶性程度。这有助于更全面地理解肿瘤的发展和演进,为制定个性化治疗方案提供依据。发现新的治疗靶点通过对大

深度测序和普通的二代测序有什么区别?有什么应用

 有两种体细胞突变容易被忽视bai,一种是局限在特定组织的突变。举例来说,如果突变只存在于大脑,而我们检测的是血液,那就找不到这些致病突变。另一种致病性体细胞突变虽然发生在所有组织中,但是只影响一部分细胞,因此不容易被检测到。   普通的二代测序,全基因组或外显子组测序是将DNA分成小片段,然后对各

不卑不亢看待二代测序

  人们常说“事后诸葛亮”,可见“料事如神”是一个让人艳羡的能力。现代科技的发展让人们无限接近这种能力,天气预报就是现代人诸多“料事如神”本领中的一种,不断进步中切实提高了生活品质与舒适度。个人体会进步主要体现在两个方面:  1.越来越说人话。印象里小时候听天气预报感觉听的是中文,但是这些中国话想表

数字PCR在肿瘤的液体活检中的应用

 肿瘤学研究是数字PCR的重要应用领域,该技术作为极为重要的工具,能够识别DNA突变(例如EGFR)、肿瘤患者用药监控、基因扩增检测、循环肿瘤细胞(CTC)特性研究、长链非编码RNA检测、液体活检中循环的核酸(cfDNA)和肿瘤细胞(CTC)的绝对定量等研究中。

全基因组与外显子组测序在临床诊断中的应用

  全基因组或外显子组测序的临床应用,称为临床基因组和外显子测序( Clinical genome and exome sequencing,CGES)。由于该技术检测范围广,可以同时检测2000多个基因的变异,对于临床罕见病、疑难疾病、复杂疾病,特别是孟德尔遗传病的诊断是一种强大而有效的方法。  

时空分辨单细胞测序技术在临床上的应用

时空分辨单细胞测序技术在临床上具有以下潜在应用:肿瘤诊断与治疗早期诊断:有助于发现肿瘤发生早期的细胞变化,提高诊断的敏感性和特异性。肿瘤分型和分子特征分析:明确肿瘤的亚型和特定的分子标志物,为个性化治疗提供依据。监测治疗效果:实时追踪肿瘤细胞在治疗过程中的变化,评估治疗的有效性,及时调整治疗方案。预

台式扫描电镜在肿瘤研究中的应用

放射性栓塞是一种治疗肝肿瘤的内部放射治疗方法。肝肿瘤几乎完全依靠肝动脉供血。在放射性栓塞疗法中,放射性粒子被选择性地放置到肝动脉,从而使得肿瘤周围聚集了很多放射性粒子。因此,肿瘤组织被辐射,同时保留健康的肝组织。自上世纪90年代中期以来,乌特勒支大学(UMCU)的核医学中心就对Ho-166聚(L-乳

数字PCR和HRM在肿瘤样本中的应用

摘要:Vogelstein和Kinzler(美国国家科学院院刊,1999年)第一次描述了Digital PCR(dPCR)的概念,一种在微量细胞群中(如原发性肿瘤组织)鉴定突变的方法。通过稀释样品DNA到一个单个分子水平,它可以把PCR自然模拟指数转化为数字信号。当PCR成功的扩增出这些单个

单细胞分析技术在肿瘤学中的应用

肿瘤异质性研究:通过分析肿瘤组织中的单个癌细胞,揭示不同癌细胞之间的基因表达、突变和蛋白水平的差异,为理解肿瘤的发生、发展和耐药机制提供关键信息。例如,在乳腺癌中,发现某些肿瘤细胞具有特定的基因突变,导致对特定治疗药物产生抗性。肿瘤微环境分析:了解肿瘤细胞与免疫细胞、基质细胞等微环境成分之间的相互作

焦磷酸测序在甲基化分析中的应用

  DNA甲基化是近年来研究的热点,因为越来越多的证据表明,它参与了胚胎发育、基因印迹等过程。同时,它在疾病发展中也起着举足轻重的作用。甲基化状态的改变被认为是引起癌症的一个重要因素,这种变化包括基因组整体甲基化水平的降低和CpG岛局部甲基化水平的异常升高,从而导致基因组的不稳定(如染色体的不稳定、

手术导航系统在肿瘤治疗中应用

在众多的肿瘤治疗方案中,早期诊断和外科手术完全切除是最有效的方法之一,但肿瘤切缘的正确评估一直依赖于外科医生的经验和视觉判断,而传统方法极低的探测灵敏度和肿瘤病灶的不完全切除也一直困扰着外科医生,所以在实际的手术过程中,为了防止肿瘤细胞的残留和术后复发,只能人为的扩大肿瘤边缘并将其切除,即使如此每年

一代测序和二代测序的区别

一、含义不同:第一代测序:指双脱氧末端终止法,扩增后通过毛细管电泳读取序列,每次获取数据量少。第二代测序:为高通量测序,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大信号,扩增后再检测。二、作用不同:San

第二代测序技术(NGS)推动个性化肿瘤学发展

  目前,肿瘤学已经上升到基因组分析的前沿,它可以被用于识别驱动突变和其他标记, 临床医生也可以借此设计疗法,监测病人的反应,而突变和标记可以通过NGS技术(第二代测序技术,一个生成gigabases数据的大规模平行测序技术)显现出来。  何为NGS?它面临着哪些问题?  NGS已经成为一个研究平台

不同平台的二代测序技术

  二代测序技术基于大规模平行测序技术(massive parallel analysis,MPS),它能同时完成测序模板互补链的合成和序列数据的获取。主要可以分成Roche 454焦磷酸测序、Illumina Solexa合成测序和ABI SOLiD连接法测序。  (1)Roche 454焦磷酸测

质谱技术在临床中的应用

来自SDi的最新报告指出,未来五年临床质谱市场将以7.6%的速度增长。根据美国临床实验室协会的数据,美国临床实验室每年对血液、尿液和其他患者样品检测次数超过70亿次。免疫分析一直是临床诊断中应用最广泛的技术,但出于对检测结果精准性等需求,越来越多的实验室开始将质谱作为首选的检测工具。另外,相比于测序

临床输血在骨科治疗中的应用

输血及血制品在骨科临床中应用广泛,随着ABO血型和Rh血型的发现以及输血技术的不断成熟,输血已成为一种安全有效的治疗手段,但输血治疗并不是绝对的安全,它也可以带来一些不良反应及严重的并发症,同时血液及其制品的来源的不可随意性决定了其稀缺“能源”地位。因此输血工作必须由粗放型转化为安全节约型,这也是当

PCR在临床检验中的应用(二)

     呼吸系统感染性疾病主要的有肺结核、非典型性肺炎等。结核杆菌感染曾给人类健康带来很大威胁,一度是较严重的致死性疾病之一。解放以后由于对结核病的预防的重视,特别是特效抗痨药物的出现,使结核病流行基本被控制。近来结核病有抬头的趋势,基原因可能有两方面,其一是耐药株的不断出现,其二是对结核预防

PCR在临床检验中的应用(三)

     我国恶性肿瘤为人口死亡的第一位原因,其中以肺癌、胃癌及食管癌的发病率最高,占恶性肿瘤死亡总数的60%以上。引起肿瘤的原因非常复杂包括外界环境因素及遗传背景。外界因此可分为三大类即化学、物理及生物因素。肿瘤与遗传有关的证据越来越多,除已知的单基因遗传肿瘤如视网膜细胞瘤、肾母细胞瘤等以外,

PCR在临床检验中的应用(四)

遗传病是由于遗传基础异常而引起的疾病,人类遗传病约有3000多种,患者占总人口数的10%。遗传病大概可分为单基因、多基因及染色体遗传病。常用诊断方法有家系谱分析、染色体检查(特别是显带法)、生物化分析等。随分子生物学发展,基因诊断愈来愈表现出其优越性,PCR技术是基因诊断的主要技术之一,为快速、准确

PCR在临床检验中的应用(一)

医学检验大致可分为形态学、生物化学、血清免疫学和分子生物学几大类,其分别代表几代实验诊断技术。60年代DNA双螺旋结构及半保留复制模式的出现,70年代基因重组及体外基因克隆技术、分子杂交技术的应用使分子生物学在疾病诊断中得到了长足的发展。特别是1985年Mullis发明了聚合酶链式反应(PCR)技术