二代测序在肿瘤临床中的应用
二代测序，又名下一代测序（Next Generation Sequencing，NGS），也叫高通量测序（High-Throughput Sequencing），是相对于传统的桑格儿测序（Sanger Sequencing）而言的。有些文章中可能还会称为大规模平行测序平台（massively parallel DNA sequencing platform）和深度测序(Deep sequencing)。目前，二代测序平台的两个主要厂家是life及illumina，因life平台的通量相对较小，所以在临床检测的应用相对较多一些。它的核心技术是使用半导体技术在化学和数字信息之间建立直接的联系。在半导体芯片的微孔中固定DNA链，随后依次掺入ACGT。随着每个碱基的掺入，释放出氢离子，在它们穿过每个孔底部时能被检测到，通过对H+ 的检测，实时判读碱基，从而得到大量高质量的测序数据。顾名思义，二代测序最大的优势就在于：......阅读全文
二代测序在肿瘤临床中的应用
二代测序，又名下一代测序（Next Generation Sequencing，NGS），也叫高通量测序（High-Throughput Sequencing），是相对于传统的桑格儿测序（Sanger Sequencing）而言的。有些文章中可能还会称为大规模平行测序平台（massive
二代测序技术在临床诊疗中的应用（一）
Sanger测序在过去的二十年间是基因组研究的主流方法，取得了包括人类基因组计划(human genome project, HGP)等一系列重大成就，这使得单基因遗传病的鉴定和靶向治疗成为可能1,2。随着基因组大数据时代的到来，尽管Sanger测序是基因检测的金标准，但是NGS）技术应运而
二代测序技术在临床诊疗中的应用（二）
二二代测序在心血管疾病诊断中的应用1. 二代测序在心血管疾病研究中的应用潜力巨大：NGS已被证明可成功鉴定出单基因疾病和心血管系统常见疾病的新型致病突变34。NGS在常见心血管疾病（cardiovascular diseases, CVD）中正变得越来越重要，因为与仅提供已知单核苷酸多态性（si
二代测序在肿瘤治疗研究项目中的应用及数据
GenomeWeb芝加哥讯 – 本周美国临床肿瘤学会年度会议中展示的研究项目包括了来自于部分研究项目的大量数据，这些研究项目均使用了二代测序技术来指导对肿瘤患者的治疗方法。 研究结果表明，正如之前科学界已报道的那样，NGS panel及更广泛的测序方法可以在很多情况下的少部分（有时是多数）患者中鉴别
CSCO：肿瘤二代测序技术应用重在规范
“二代测序技术应用于临床肿瘤精准诊治最关键的问题，是规范测序公司的标准和操作方法，只有规范的技术才能保证后续的精准发现和精准治疗。”前不久，中国临床肿瘤学会（CSCO）理事长吴一龙教授在《二代测序技术应用于临床肿瘤精准诊治的共识》（以下简称《共识》）发布会上表示，《共识》旨在为二代
CSCO：肿瘤二代测序技术应用重在规范
“二代测序技术应用于临床肿瘤精准诊治最关键的问题，是规范测序公司的标准和操作方法，只有规范的技术才能保证后续的精准发现和精准治疗。”前不久，中国临床肿瘤学会（CSCO）理事长吴一龙教授在《二代测序技术应用于临床肿瘤精准诊治的共识》（以下简称《共识》）发布会上表示，《共识》旨在为二代测序（NGS）
单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用
单细胞测序技术在肿瘤研究中有以下多方面的应用：肿瘤细胞异质性研究鉴定肿瘤内不同的细胞亚群，包括具有不同基因突变、转录组特征和表型的细胞。揭示肿瘤细胞之间的差异对肿瘤进展、转移和治疗反应的影响。肿瘤微环境分析解析肿瘤微环境中免疫细胞、基质细胞等的组成和功能状态。研究肿瘤细胞与微环境中其他细胞的相互作用
单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例
以下是一些单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例： **案例一：乳腺癌** 研究人员利用单细胞测序技术对乳腺癌肿瘤组织进行分析，发现了不同亚型乳腺癌细胞之间的基因表达差异和肿瘤细胞的异质性。他们鉴定出了具有干细胞特性的肿瘤细胞亚群，这些细胞可能与肿瘤的复发和耐药性有关。这为开发更有针对性的治疗
二代测序及其应用
二代测序为高通量测序，采用微珠或高密度芯片边合成边测序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次获得数G数据，相对与第三代，都仍然需要扩增的方法放大信号，扩增后再检测。二代测序应用如下：1、Illumina 原理：桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像。2、Roche 454：油包
二代测序及其应用
二代测序为高通量测序，采用微珠或高密度芯片边合成边测序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次获得数G数据，相对与第三代，都仍然需要扩增的方法放大信号，扩增后再检测。二代测序应用如下：1、Illumina 原理：桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像。2、Roche 454：油包
时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用
时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中有以下应用：肿瘤发生的早期检测能够追踪肿瘤起始细胞在早期阶段的变化，发现潜在的肿瘤发生标志，从而实现更早期的诊断。肿瘤异质性解析明确肿瘤内部不同细胞在空间位置上的基因表达差异，深入了解肿瘤异质性的形成机制和演化过程。肿瘤微环境研究分析肿瘤微环境中各种细胞（如免疫细胞
单分子测序在肿瘤基因检测中的6大应用
肿瘤是当今导致人类主要死亡的主要疾病之。由于其发病隐匿、治疗方法局限、多数预后不良,且分子生物学特征复杂多变,因而肿瘤的预防、早期筛查与诊断、临床治疗、预后评估一直是临床医生致力于解决的关键问题。随着现代医学技术的发展,肿瘤已经进人了个体化治疗阶段。肿瘤的基因组转录组和表观遗传特征在探究肿瘤的发
数字PCR在－二代测序辅助建库的应用
目前靶向测序建库方法包括扩增子方法，在均相溶液中，当扩增引物增加时，由于扩增引物之间的相互作用，从而影响扩增的效率；如果将其分散到大量微液滴中扩增，将可大大降低引物间相互作用，提高扩增效率。同时还可以实现对于少量模板的有效扩增，得到更多的有效测序数据。
时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例
时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例：乳腺癌研究通过时空分辨单细胞测序，研究人员发现了肿瘤细胞在不同部位的异质性，以及与肿瘤微环境中免疫细胞和基质细胞的动态相互作用。这有助于理解肿瘤的进展和转移机制，并为治疗策略的制定提供依据。黑色素瘤研究该技术揭示了黑色素瘤细胞在原发灶和转移灶中的基因表达
二代测序原理及应用
二代测序原理及应用如下：一、原理二代测序原理也就是文库构建，PCR产生的片段或基因组打断的片段两端需要添加接头修饰才能进行测序。1、末端修饰。打断的片段是随机断裂，其末端可能是不平的。因此，建库第一步是补齐不平的末端。2、添加接头。经过末端修饰后的DNA片段3’末端具有突出的A尾，而接头具有突出的T
新一代测序在癌症中的临床应用
一提起癌症，人们往往谈虎色变。的确，癌症是全球发病和死亡的主要原因。据WHO统计，2012年有820万例癌症相关的死亡。所幸，DNA测序技术的快速发展正在改变我们对癌症的认识，也在转变癌症的筛查、诊断和治疗。 如今，新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面？美国罕见病基因组研究所的研究人
新一代测序在癌症中的临床应用
一提起癌症，人们往往谈虎色变。的确，癌症是全球发病和死亡的主要原因。据WHO统计，2012年有820万例癌症相关的死亡。所幸，DNA测序技术的快速发展正在改变我们对癌症的认识，也在转变癌症的筛查、诊断和治疗。 如今，新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面？美国罕见病基因组研究所的研究人
新一代测序在癌症中的临床应用
一提起癌症，人们往往谈虎色变。的确，癌症是全球发病和死亡的主要原因。据WHO统计，2012年有820万例癌症相关的死亡。所幸，DNA测序技术的快速发展正在改变我们对癌症的认识，也在转变癌症的筛查、诊断和治疗。如今，新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面？美国罕见病基因组研究所的研究人员不久前
基因测序仪在肿瘤诊断上的应用
肿瘤的发生是遗传基因和环境因素共同作用的结果，其中遗传基因是内因，与人体是否具有肿瘤易感基因有关。肿瘤易感基因的检测可以检测出人体内是否存在肿瘤易感基因或家族聚集性的致癌因素，根据个人情况给出人性化的指导方案。
中国首部二代基因测序技术临床应用共识出台
当今，肿瘤诊治已迈入个体化及精准医学的时代，从“一刀切”向“针对每一个病人的具体病情，正确选择并精确地应用适当的治疗方法”发展，这对进一步提高治疗的有效性，降低不必要的药物副作用和节约医疗支出都有着深远的意义。肿瘤的精准医疗是一项系统工程，包括精准诊断、精准治疗、精准管理多个环节，均以精准的肿瘤
肿瘤二代测序都能干什么？
基因检测包括：PCR，FISH，芯片技术，基因测序。基因测序技术是基因检测的一种。基因测序目前主要有一代测序（Sanger测序）、二代测序（illumina/Life Tech）、三代测序（单分子测序）等。PCR、FISH和芯片技术，主要是通过已知序列去调查特定确定的片段序列或位点的有或无，
不同二代测序平台用于临床肿瘤样本体细胞突变检测的...
使用二代测序技术检测肿瘤组织FFPE样品中的DNA体细胞突变用于临床分子诊断存在的问题是，DNA质量和数量的变异较大，以及检测到的低频突变难以用二代测序以外的其他技术予以验证。以下实验测评了MiSeq和Ion Proton两个平台检测体细胞突变的表现，分别选用了 TruSeq Amplicon
二代测序技术指导肿瘤患者的治疗方法
本周美国临床肿瘤学会年度会议中展示的研究项目包括了来自于部分研究项目的大量数据，这些研究项目均使用了二代测序技术来指导对肿瘤患者的治疗方法。 研究结果表明，正如之前科学界已报道的那样，NGS panel及更广泛的测序方法可以在很多情况下的少部分（有时是多数）患者中鉴别出与肿瘤有关的基因变异，而
时空分辨单细胞测序技术在临床应用中的实际案例
时空分辨单细胞测序技术在临床应用中的实际案例：肿瘤研究在肺癌研究中，通过时空分辨单细胞测序技术，发现了肿瘤组织中不同区域的癌细胞具有独特的基因表达模式和免疫细胞浸润情况。这有助于深入了解肿瘤的异质性，为制定更精准的治疗策略提供依据，例如针对特定区域的癌细胞选择更有效的靶向药物。神经系统疾病对于脑胶质
高通量测序平台发展及在临床分子诊断中的应用
自2000年人类基因组计划完成，测序技术得到了快速的发展。在美国ABI公司基于末端终止法的第一代测序基础上，各大公司相继推出了不同的NGS测序平台。核酸（DNA和RNA）测序技术的发展推动了医学对遗传病分子特征的认识。以揭示疾病分子特征为目的的高通量测序，即下一代测序（next generati
二代基因测序临床应用“放闸”－达安基因将受益！
1月19日讯，卫计委公布首批可开展高通量基因测序产前筛查与诊断临床应用试点的109家医疗机构，为二代基因测序“放闸”，随着试点范围公布，行业有望迎来爆发性增长。值得一提的是，上述医疗机构开展相关临床应用必须使用国家食药监总局（CFDA）已批准上市的基因测序仪及配套试剂，目前仅华大基因和达安基因（
一代测序、二代测序及三代测序的应用对比
一、初现庐山真面目 一代测序：又称Sanger测序(多分子，单克隆) 历史：第一代DNA测序技术(又称Sanger测序)在1975年，由Sanger等人开创，并在1977年完成第一个基因组序列(噬菌体X174)，全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进(如使用
一代测序、二代测序及三代测序的应用对比
一、初现庐山真面目 一代测序：又称Sanger测序(多分子，单克隆) 历史：第一代DNA测序技术(又称Sanger测序)在1975年，由Sanger等人开创，并在1977年完成第一个基因组序列(噬菌体X174)，全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进(如使用
肿瘤坏死因子在肿瘤治疗中的应用
TNF在人、鼠肿瘤细胞株或原代培养的人癌细胞中，以及荷瘤裸鼠中都表现出杀瘤或抑瘤作用和免疫调节活性。应用TNF在治疗肿瘤等方面大多尚处于临床试验阶段，其也可与IL-2联合治疗肿瘤，目前认为全身用药的疗效不及局部用药，后者如病灶内注射，局部浓度高且副作用也较轻。近年来已采用TNF基因治疗开始对黑色素瘤
肿瘤坏死因子在肿瘤治疗中的应用
TNF在人、鼠肿瘤细胞株或原代培养的人癌细胞中，以及荷瘤裸鼠中都表现出杀瘤或抑瘤作用和免疫调节活性。应用TNF在治疗肿瘤等方面大多尚处于临床试验阶段，其也可与IL-2联合治疗肿瘤，目前认为全身用药的疗效不及局部用药，后者如病灶内注射，局部浓度高且副作用也较轻。近年来已采用TNF基因治疗开始对黑色