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orf1ab基因为何成为新型冠状病毒核酸检测的靶序列?

为什么当前nCov的核酸检测试剂盒以ORF1ab、S和N作为目标基因?为什么单用ORF1b做进化就能推测nCov来源于蝙蝠?为什么用如此短的时间就能比较分析那么多种coronaviruses基因组从而否定重组阴谋论?我睡前思考着这些问题,索性搜搜文献看。精神食粮让我意识到自己是个无知的人类。 我检索了有关nCov基因组可视化的文献,截取了Paraskevis等人文章的组装注释图[1](按道理讲我更希望贴我国科学家发表在nature上的,无奈尺寸和配色不适用于手机屏幕),如下: 所以看看吧,这么小的基因组,就这么几个主要的基因,你还想用哪个做qPCR?!哈哈哈,我真的是如此愚钝。 此外,如此小的基因组,加上病毒基因组属于单正义链RNA(所以也不会出现高等植物多倍体、杂合等问题),对下游计算分析的硬件要求及耗时也将相应降低,分析个重组不重组的当然会更快。 Zumla等人对冠状病毒的生活史做了比较全面的综述[2]。病毒......阅读全文

再解析:新冠病毒基因组组学特性分析与检测试剂性能...

再解析:新冠病毒基因组组学特性分析与检测试剂性能的关联性2019新型冠状病毒于2020年1月12日被世界卫生组织(WHO)命名为2019-nCoV。2020年3月13日,世卫组织将2019冠状病毒疫情从流行病升级为全球大流行病,疫情已在全球广泛传播。随着分子生物学技术的发展,分子诊断方法成为病原体检

新冠核酸检测检查哪些项目

  自2019 年 12 月以来,湖北省武汉市陆续发现新型冠状病毒(2019 novel coronavirus, 2019-nCoV)感染患者,且呈快速上升之势。自新型冠状病毒疫情爆发以来,近期湖北、武汉疫情从过去的爆发式增长已经走向趋缓,武汉防控工作取得阶段性成效。  而事实上,在2020年1月

数字PCR或为新冠疑似病人、无症状感染病人检测及确立...

数字PCR或为新冠疑似病人、无症状感染病人检测及确立出院标准提供新方法近日,南通市第三人民医院与苏州锐讯生物科技有限公司运用锐讯DropX数字PCR平台及试剂盒在大量样本中开展了新冠肺炎检测,数字PCR相较于荧光定量PCR体现出了显而易见的高灵敏度,有效避免了痕量病毒携带病例出院风险,并有望为无症状

新型冠状病毒荧光PCR引物探针设计之我见(三)

 4、二聚体设计时通常将二聚体(自身二聚体或配对二聚体)控制在dG>-5.0kc/m, 最好dG>-3.6 kc/m。从图8显示的三套引物探针的自身二聚体可见,第二套的探针具有一个非常稳定的自身二聚体(dG=-13.1kc/m),第二套的上游引物N2F有一个稳定的自身二

警惕,新冠核酸检测失败可能是这个原因

 案例发生比较典型,为了避免发生类似的问题,梳理原因分析过程并整理实验验证资料,与大家进行分享。 案例经过与原因分析 9月21日下午16:00接班时,值班老师称当日新冠核酸RT-PCR扩增失败致使检验报告全部未发,正在准备对标本重新复查。实验室使用的新型冠状病毒(201

中国计量院研制出新冠病毒核酸检测弱阳性标准物质

  日前,中国计量科学研究院前沿中心生命科学计量团队为应对核酸检测实验室日常质量控制对质控品的迫切需求,紧急研制了一批新型冠状病毒核酸检测弱阳性标准物质。NIM-RM5205NIM-RM5206新型冠状病毒核酸检测弱阳性标准物质  2020年12月28日,国务院应对新型冠状病毒感染肺炎疫情联防联控机

湖北新冠病毒检测试剂可先用后申报 这81家企业已可提供

  新型冠状病毒疫情日益严峻,武汉地区医护人员口罩、防护服、检测试剂等物资稀缺的新闻牵动每个国人的心。由于试剂缺乏,很多患者不能被第一时间确诊和收治,导致很多后续治疗工作推进缓慢。  1月25日下午,湖北召开新型肺炎疫情防控工作发布会。湖北省医保局副局长刘松林介绍,新型冠状病毒感染导致的肺炎,早诊断

新增2种,核酸检测弱阳性标准物质

  NIM-RM5205,NIM-RM5206新型冠状病毒核酸检测弱阳性标准物质  日前,中国计量科学研究院前沿中心生命科学计量团队为应对核酸检测实验室日常质量控制对质控品的迫切需求,紧急研制了一批新型冠状病毒核酸检测弱阳性标准物质。  2020年12月28日,国务院应对新型冠状病毒感染肺炎疫情联防

单靶标or多靶标:新冠检测试剂该如何选择?

目前,国家药品监督管理局(NMPA)批准的新型冠状病毒检测试剂中,大部分采用的方法为实时荧光RT-PCR。它具有简便快速、特异性强、灵敏度高等特点。那么,其高灵敏度和高特异性的基础究竟是什么呢?让我们来一探究竟。01试剂的检测性能如何体现?检测性能评价中最主要的就是灵敏度与特异性。PCR扩增产物以指

新型冠状病毒肺炎病毒核酸检测专家共识

今日,国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV)宣布,新型冠状病毒(2019-nCoV)的正式分类名为严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coro

一文汇总新型冠状病毒肺炎病毒核酸检测专家共识

  突发新型冠状病毒(2019 novel coronavirus,2019-nCoV)肺炎疫情以来,感染病例快速上升。随着疫情的发展和防控力度加大,全国各地乃至境外均有病例报道[1,2,3,4],及时对急重症及疑似患者进行诊断需要快速有效的方法,病毒核酸检测可为诊断提供直接证据[5,6]。核酸检测

中国计量院首发新冠病毒核酸标准物质 免费支持一线

  日前,中国计量科学研究院前沿中心生命科学计量团队成功研发了高低两种浓度水平的新型冠状病毒核酸标准物质,并通过专家鉴定。  两种标准物质均为体外转录RNA,目标基因范围涵盖已公布的新冠病毒3个主要基因:核壳蛋白N基因全长、包膜蛋白E基因全长、开放阅读框1ab (ORF1ab)基因片段(基因组坐标:

大批量核酸检测已成常态,日均上千的标本该如何提高...

大批量核酸检测已成常态,日均上千的标本该如何提高效率?目前,SARS-CoV-2 感染人数超2200 万,死亡人数超80 万。COVID-19 给世界人民的生命健康带来了了巨大威胁。 2019年12月,武汉市出现多例不明原因的肺炎,2020 年1 月,通过基因组测序,我国科学家确定该不

以码抗病:计算机也能辅助抗病毒药物研发

  我原以为,这依然会是一个寻常的寒假。  直到疫情的形势愈发严峻。  对病毒各类蛋白的调研任务分配到远在五湖四海的每个实验室成员头上。没有瓶瓶罐罐,没有五花八门的试剂,没有昂贵精致的仪器。一台能远程连上服务器的电脑,这便是我所拥有的全部。图1。 药物研发有时只需要一台能连上服务器的笔记本(图片来源

湖北新冠病毒检测试剂可先用后申报 这81家企业已可提供

  69、德诺杰亿(北京)生物科技有限公司(13520466904)  德诺杰亿(北京)生物科技有限公司是一家自动化检测设备与诊断试剂研发、生产、销售的国家级高新技术企业,拥有相关技术产品多条生产线,设备与试剂一体化是公司的核心竞争力,以哑铃型创新模式完成在美国的前期研发,在中国完成中试及产业化。 

新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸实验室检测要点

2020庚子之春,突如其来的新冠病毒疫情,又一次将PCR推在疫情防控的前沿,使核酸检测成为热搜。那么,什么是核酸检测?它在新冠肺炎的诊断中起什么作用?如何发挥作用?如何在检测中保护检测人员安全、避免交叉传染和二次污染?为了帮助更多人了解这个熟悉而陌生的名字,带着诸多问题,让我们从实验室角度走近201

分子检测定性项目的性能验证

为加强新冠病毒核酸检测能力建设,以更好满足新冠肺炎疫情常态化防控要求,去年至今各地新建和改扩建的PCR实验室数量快速增长。虽在每次举办的PCR培训班上我们都会重点讲解性能验证相关内容,但在实验室现场验收或督查过程中,仍发现不少实验室对性能验证相关知识并不是很清楚。今天就以新冠病毒核酸检测项目为例,和

多国团队警告:新冠和MERS可能在人体内重组为嵌合病毒

  2012年4月,以沙特阿拉伯为中心的中东地区首次爆发了中东呼吸综合征冠状病毒(MERS -CoV),该病毒感染后致死率高达37%。2015年,MERS在韩国爆发,致死率高达20%,实际上,MERS至今仍在沙特并未消失,2019年12月至2020年3月,沙特至少出现了34名MERS确诊病例,至少1

中关村推动检测试剂盒取得第三类医疗器械注册证

  记者4月11日从中关村管委会获悉,中关村企业北京金豪制药公司研发的“新型冠状病毒核酸检测试剂盒(荧光PCR法)”日前通过国家药品监督管理局审批,取得第三类医疗器械注册证。  自疫情暴发以来,中关村管委会积极支持科技“战疫”、促进企业持续健康发展,并出台了众多具体措施,取得了显著成效。截至目前,中

张锋团队的新冠病毒CRISPR检测技术,三步检测是哪三步?

  今日,麻省理工学院(MIT)的麦戈文脑科学研究所(McGovern Institute for Brain Research)宣布,张锋教授团队利用基于CRISPR的技术,开发了一种检测新冠病毒RNA的方法。它仅需纯化的核酸分子样本,通过简单的三步,就能在1个小时的时间里完成检测。由于这项技术还

又一核酸检测试剂盒通过国家药监局应急审批

  分析测试百科网讯 3月12日,国家药品监督管理局应急审批通过武汉明德生物科技股份有限公司新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒(荧光PCR法)。该产品采用多重PCR-荧光探针检测方法,结合一步法RT-PCR技术,对新型冠状病毒2019-nCoV感染的肺炎疑似病例、疑似聚集性病例患者、其他需

国家药监局应急审批多个新型冠状病毒检测产品

  近日,国家药监局先后应急审批通过南京诺唯赞医疗科技有限公司和珠海丽珠试剂有限公司2个新型冠状病毒IgM/IgG抗体检测试剂盒(胶体金法),该抗体检测试剂采用免疫层析技术,通过间接法定性检测人新型冠状病毒IgM和IgG抗体。  3月12日,国家药监局应急审批通过武汉明德生物科技股份有限公司新型冠状

广纳信捷推出新型冠状病毒检测试剂盒30分钟检出

与时间赛跑,黄埔科技助力阻击新型冠状病毒!继达安基因、万孚倍特、华银医药、和信健康、微远基因等企业研发出新型冠状病毒检测试剂盒后,黄埔区、广州开发区生物医药研发机构再传佳讯。广东粤港澳大湾区国家纳米科技创新研究院的广纳信捷医疗(以下简称“广纳信捷”)与中科院国家纳米科学中心联合攻关的新型冠状病毒常温

新型冠状病毒感染的常规检测方法是它

  根据新型冠状病毒感染的肺炎实验室检测技术指南(第二版),新型冠状病毒感染的肺炎实验室检测主要是实时荧光RT-PCR方法。  新型冠状病毒核酸测定(实时荧光RT-PCR方法)  1.推荐选用针对新型冠状病毒的ORF1ab、N基因区域的引物和探针。  靶标一(ORF1ab):  正向引物(F):CC

实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸作业指导书

实时荧光 RT-PCR 方法检测新型冠状病毒核酸   (一)目的。 规范实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸的工作程序,保证实验结果的正确可靠。 (二)范围。 copyright sysqy.com 适用于实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸。 (

微滴芯片数字PCR技术在检测新冠病毒的应用

国家卫健委发布了《新型冠状病毒肺炎防控方案(第五版)》,其中在实验室检测技术指南中明确提出,核酸检测结果阴性不能排除新型冠状病毒感染。3月4日,国家卫健委发布的《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第七版)》 中提到了以下两点:对疑似病例要尽可能采取包括快速抗原检测和多重PCR核酸检测等方法对呼吸道病

新型冠状病毒核酸提取检测全套解决方案的应用

针对新型冠状病毒2019-nCoV,博日公司第一时间推出了基于不同样本来源、样本量的核酸提取及荧光定量PCR检测的方案,详细介绍如下: 一、样本前处理 二、核酸提取        核酸提取是分子检测的基础,高质量核酸也是保证下游检

以丙肝病毒血清样本为例介绍如何提高RNA病毒核酸检测...

以丙肝病毒血清样本为例介绍如何提高RNA病毒核酸检测灵敏度这段时间普通民众都是谈新冠病毒色变,无非印证了一句话「人们对不了解的事物才会感到恐惧」。为了减少我们的恐惧感,让我们来深入了解新闻发布会上不断提及的「新冠病毒核酸检测」吧。首先分享中国疾控中心发布的检测新冠病毒的引物、探针序列:推荐选用针对新

复工体检最需要关注的检验项目解读

假期在经历一次又一次的延长后,全国多地正式迎来节后复工潮,4月8日,武汉也正式“解封”,开启“离汉通道”。虽然新型冠状病毒肺炎疫情在全国人民的努力下得到了初步控制,但目前境外输入性病例仍在增加,无症状感染者再次重新进入到公众视野,很多企业为了防止疫情再扩散,害怕复工后再一次因为疫情“停工整顿”,好多

新型冠状病毒的检测方法及产品开发进展

  作者:中国科技大学 罗昭锋  【摘要】:新冠状病毒(2019-nCoV)检测目前只有荧光定量PCR方法和测序方法两种被认可的方法。测序不具备快速筛查潜力,这里不做讨论。目前国家药监局审批通过的都是荧光定量PCR的试剂盒。等温扩增的检测试剂盒,至少已有两个单位开发成功,有望近几天上市。等温扩增的试