90后斯坦福博士登Science封面！AI算法准确预测RNA三维结构
半个世纪以来，确定RNA三维结构一直困惑着科学家，也成为生物学的重大挑战之一。而现在，90后斯坦福大学博士和团队通过新型AI算法——ARES准确预测出RNA三维结构，堪比AlphaFold，是生物界「海啸级」存在！我们对大部分RNA的结构几乎一无所知 半个世纪以来，确定生物分子的三维结构一直困惑着科学家，也是生物学的重大挑战之一。难就难在，RNA折叠成复杂三维结构的形状很难通过实验或计算来确定。 而现在，美国斯坦福大学通过新型AI算法准确预测出RNA三维结构，可谓意义重大！ 今天，Science 封面刊登了这项研究的最新成果，由斯坦福大学在读博士生 Stephan Eismann 和 Raphael Townshend，以及计算机副教授 Ron Dror共同完成。 他们利用目前先进的神经网络技术，成功开发出了一种全新 RNA 三维结构预测模型——ARES。 从原子入手，机器学习算法预测RNA结构！ RNA 分子和......阅读全文
90后斯坦福博士登Science封面！AI算法准确预测RNA三维结构
半个世纪以来，确定RNA三维结构一直困惑着科学家，也成为生物学的重大挑战之一。而现在，90后斯坦福大学博士和团队通过新型AI算法——ARES准确预测出RNA三维结构，堪比AlphaFold，是生物界「海啸级」存在！我们对大部分RNA的结构几乎一无所知 半个世纪以来，确定生物分子的三维结构一直困
Science发现RNA全新结构，可抵抗酶降解
美国科罗拉多大学医学院的研究人员在黄病毒(flavivirus)中发现了一种全新的RNA结构，该结构允许RNA抵抗宿主核酸外切酶的降解。这一发现可以帮助人们开发治疗药物或疫苗，对抗那些致病性的黄病毒，例如登革热病毒、西尼罗病毒、黄热病病毒和乙型脑炎病毒等等。 据介绍，世界上约有40%的人面
学者发布RNA三维结构预测评估研究成果
近日，广州医科大学-中国科学院广州生物医药与健康研究院联合生命科学学院特聘教授、广州实验室研究员苗智超团队与合作者，对来自全球18个团队的预测进行了大规模评估，涉及23个RNA结构，包括RNA元件、适配体、病毒元件、核酶和核开关等多种类型RNA结构。相关研究发表于《自然-方法》（Nature Met
Science：从结构上揭示布氏锥虫RNA编辑机制
作为美国波士顿大学的分子生物学家和夫妻，Ruslan Afasizhev和Inna Afasizheva已经合作了几十年。他们共同发表了数十篇关于单细胞致病寄生虫---布氏锥虫（Trypanosoma brucei）---线粒体DNA和RNA机制的论文。如今，在一项新的研究中，他们详细介绍了一种
Science突破：实时追踪RNA
第一次，研究人员在单分子水平上实时观测了转录过程中的RNA折叠。他们是如何做到的?他们又从中获悉了什么? 在一个隔音、温度恒定、振动控制的地下实验室，斯坦福大学的研究人员实时观察了RNA的转录，注视着RNA新生单链变长――一个核苷酸一个核苷酸 ――并折叠形成一个调控核糖体开关(regu
Science聚焦：球形RNA让RNA疗法重获新生
几十年来，RNA疗法在治疗遗传疾病的道路上走得并不顺遂。不过，随着新型RNA（球形核酸SNA）在人体试验中取得成功，这一领域似乎焕发出新的活力。Science网站特别撰文介绍了这项重要突破。 RNA疗法一般是用反义RNA破坏疾病相关蛋白的生产。在美国化学学会(ACS)上周的一次会议上，研究人员
研究解析新冠病毒RNA聚合酶三维精细结构
由饶子和院士/娄智勇教授/王权教授等组成的“上海科技大学-清华大学抗新冠病毒联合攻关团队”率先在国际上成功解析了新型冠状病毒转录复制机器核心单元“RdRp-nsp7-nsp8”复合体的三维空间结构，整体分辨率达到2.9 埃（Å）。 该研究揭示了该病毒遗传物质转录复制机器核心“引擎”的结构特征，
【Science特刊】RNA中的信号
6月17日的Science出了一期关于RNA的特刊。RNA与基因表达的分子生物学紧密相关：有形成特定结构的能力；作为信号载体；对自身的调节。例如非编码小分子RNA，已知是基因表达的调控因子，和哺乳动物干细胞基因表达变化相关，而这种变化反过来和胚胎发育过程中细胞命运的决定有联系。 DNA甲基化是
Science：解析出嗜热栖热菌V/AATP酶的三维结构
细胞依赖于称为ATP合酶（ATP synthase）或ATP酶（ATPase）的蛋白复合物来满足它们的能量需求。三磷酸腺苷（ATP）分子为维持生命的大部分过程提供能量。在一项新的研究中，奥地利科学技术研究所的结构生物学者Leonid Sazanov和博士后研究员Long Zhou如今解析出V/A
Science发表超深度线粒体RNA测序
蒙特利尔大学的一项新研究显示，线粒体遗传物质在个体内和个体间具有显著的多样性，而线粒体RNA上的修饰影响着我们每个人的身体健康。 线粒体基因组中的突变与多种疾病和生物学过程有关，然而此前人们还不了解线粒体转录组中的序列多样性。这项研究通过超深度线粒体RNA测序，首次为人们展示了线粒体RNA
Science新突破：RNA折纸技术诞生
Aarhus大学和加州理工的科学家们发明了RNA折纸技术（RNA origami），将一条RNA链编织成为多种复杂的结构。这一突破性成果发表在本周的Science杂志上。 与现有DNA折纸技术不同的是，RNA折纸需要RNA聚合酶的参与，大量RNA可以同时折叠成指定形状。另外，RNA折
Science：小RNA分子的大作用
如果我们的神经系统发育被扰乱，我们便会有罹患上严重神经系统疾病，造成感觉系统、运动控制和认知功能受损的风险。从人类到线虫，对于所有具有发达神经系统的生物都是这种情况。 现在来自哥本哈根大学的一项新研究，揭示了线虫中一个叫做mir-79的小分子调控神经发育的机制。这一分子是发育过程中特异神经
RNA重组的结构
中文名称RNA重组英文名称RNA recombination定 义RNA分子内或分子间发生的共价重新组合。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
转运RNA的结构
转运RNA分子由一条长70~90个核苷酸并折叠成三叶草形的短链组成的。上图中有两种不同的分子，苯丙氨酸tRNA(4tna)和天冬氨酸tRNA(2tra)。tRNA链的两个末端在图上方指出的L形结构的末端互相接近。氨基酸在箭头示意的位置被连接。在这条链的中央形成了L形臂，如图下方所示，露出了形成反
Science突破性成果：鸟瞰细胞RNA
如同在房地产中一样，在生物学中位置也很重要。活化基因的mRNAs战略性定位在整个活体组织中，它们的位置往往帮助调控了细胞和组织的生长及发育方式。然而为了同时分析许多的mRNAs，科学学家们不得不将细胞碾磨成浆，这使得他们没有好的办法精确确定这些mRNAs在细胞内的定位。 现在，哈佛大学Wy
Science：更多证据证实RNA是生命起源
在一项新的研究中，来自德国慕尼黑大学的研究人员证实嘌呤类碱基腺嘌呤和鸟嘌呤如何能够容易地和高产率地合成，从而提供更多证据证实RNA可能是地球上生命的起源。相关研究结果发表在2016年5月13日那期Science期刊上，论文标题为“A high-yielding, strictly regiose
Science关注：向着RNA开炮的反义新药
来自Science网站的新闻报道，根据一项临床试验发布的结果，采用具有漫长、曲折历史的一种方法策略，一种新药似乎可以减轻克罗恩病（Crohn’s disease）的症状。这一以核苷酸作为基本构件的药物是生物技术公司Celgene做出的一场豪赌，去年Celgene付出7.1亿美元的巨款将这一药物收
Science关注：向着RNA开炮的反义新药
来自Science网站的新闻报道，根据一项临床试验发布的结果，采用具有漫长、曲折历史的一种方法策略，一种新药似乎可以减轻克罗恩病（Crohn’s disease）的症状。这一以核苷酸作为基本构件的药物是生物技术公司Celgene做出的一场豪赌，去年Celgene付出7.1亿美元的巨款将这一药物收
新成像法能对大脑进行三维RNA分析
瑞典卡罗琳斯卡医学院等机构研究人员开发出一种突破性的显微镜方法，能够以细胞级分辨率对完整的小鼠大脑进行详细的三维RNA分析。发表在最新一期《科学》杂志上的这种名为TRISCO的新方法，有可能改变人们对正常和疾病状态下大脑功能的理解。小鼠大脑图像。图片来源：美国《科学》杂志尽管RNA分析取得了巨大进步
Science公布单个循环肿瘤细胞RNA测序结果
由麻省总医院，哈佛大学主持的一项最新研究发现了前列腺癌细胞对一种常见的癌症治疗方法产生抗性的原因，研究人员完成了前列腺癌单个循环肿瘤细胞的RNA测序，其中找到了非经典Wnt信号所起的关键作用。 这一研究成果公布在9月18日的Science杂志上。 Androgendeprivationthe
RNA折叠的结构特点
中文名称RNA折叠英文名称RNA folding定 义新合成的或变性的RNA转变为特定的、成熟的三维结构构象的过程。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
转运RNA的结构介绍
转运RNA分子由一条长70~90个核苷酸并折叠成三叶草形的短链组成的。上图中有两种不同的分子，苯丙氨酸tRNA(4tna)和天冬氨酸tRNA(2tra)。tRNA链的两个末端在图上方指出的L形结构的末端互相接近。氨基酸在箭头示意的位置被连接。在这条链的中央形成了L形臂，如图《tRNA的三叶草结构》下
RNA构象的结构特点
中文名称RNA构象英文名称RNA conformation定 义RNA分子的空间结构，构象改变并不导致共价键的断裂和生成。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
转移RNA的结构特点
转移RNA（tRNA）在蛋白质合成过程中负责转运氨基酸、解读mRNA遗传密码。tRNA占细胞总RNA的10%~15%，绝大多数位于细胞质中。tRNA由Crick于1955年提出其存在，Zamecnik和 Hoagland于1957年鉴定。1.tRNA一级结构具有以下特点：①是一类单链小分子RNA，长
核仁RNA的结构组成
中文名称核仁RNA英文名称nucleolar RNA定 义核仁中的RNA。包括核糖体核糖核酸(rRNA)前体、核仁小RNA等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
转运RNA的结构介绍
转运RNA分子由一条长70~90个核苷酸并折叠成三叶草形的短链组成的。上图中有两种不同的分子，苯丙氨酸tRNA(4tna)和天冬氨酸tRNA(2tra)。tRNA链的两个末端在图上方指出的L形结构的末端互相接近。氨基酸在箭头示意的位置被连接。在这条链的中央形成了L形臂，如图《tRNA的三叶草结构》下
概述转运RNA的结构
转运RNA分子由一条长70~90个核苷酸并折叠成三叶草形的短链组成的。上图中有两种不同的分子，苯丙氨酸tRNA(4tna)和天冬氨酸tRNA(2tra)。tRNA链的两个末端在图上方指出的L形结构的末端互相接近。氨基酸在箭头示意的位置被连接。在这条链的中央形成了L形臂，如图《tRNA的三叶草结构
转移RNA的结构特点
1.tRNA一级结构具有以下特点： ①是一类单链小分子RNA，长73~95nt（共有序列76nt），沉降系数4S。 ②是含稀有碱基最多的RNA，含7-15个稀有碱基（占全部碱基的15%~20%），位于非配对区。 ③5′末端碱基往往是鸟嘌呤。 ④3'端是CCA序列，其中的腺苷酸常称为A76，其
基因组的三维结构
摘要： 阐明染色质复杂结构的技术有染色质构象捕获(chromatin conformation capture, 3C)及更高通量的衍生技术4C、5C，这些提供了长距离的染色质相互作用，但不能扩展到整个染色质相互反应组。在2009年末，两种新方法的迸发，有望绘出全基因组范围的相互作用图谱。
破解整合酶的三维结构
英国和研究人员在1月31日的《》杂志上报告说，他们合作进行的一项最新研究模拟出的。整合酶在包括艾滋病等逆转录酶病毒中可以找到，并且充当了艾滋病病毒在人体内复制时的“帮凶”。这项重大突破有助于家解决困扰了艾滋病研究领域长达20年的一个难题，从而找到更好的治疗艾滋病的方法。 当艾滋病病毒感染人体时，