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大规模酵母双杂交技术研究蛋白质相互作用的应用

摘 要: 简介了酵母双杂交技术原理, 总结了酵母双杂交技术大规模筛选蛋白质相互作用的基础、应用及存在的问题。因为大规模酵母双杂交技术结果有大量假阳性及假阴性问题, 因此, 有条件情况下有必要同时开展其他方法的大规模蛋白相互作用研究, 以构建规模更大可信度更高的蛋白质相互作用网络图。点击这里进入下载页面:进入下载页面......阅读全文

蛋白质相互作用研究:从整体到局部

随着越来越多的物种基因组测序完成,对全蛋白质组与相互作用组的解释已经成为近期研究的热点。虽然蛋白质组研究阐述了表达蛋白质的所有组成成分,但是相互作用组包括了生物体内存在或者可能存在的成对蛋白质-蛋白质相互作用,因此,形成了庞大且稀疏的网状结构。伦敦帝国理工学院生物信息学中心的WP Ke

大规模蛋白质相互作用研究方法进展(一)

 来源:生命科学 关 薇, 王 建, 贺福初*(军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京 100850)  摘 要:随着2000 年酵母大规模蛋白质相互作用网络图谱的成功描绘,蛋白质相互作用特别是大规模蛋白质相互作用研究成为生命科学领域的又一个研究热点。酵母、果

酵母双杂交系统的发展和应用

随着对多种重要生物的大规模基因组测序工作的完成,基因工程领域又迎来了一个新的时代---功能基因组时代。它的任务就是对基因组中包含的全部基因的功能加以认识。生物体系的运作与蛋白质之间的互相作用密不可分,例如:DNA合成、基因转录激活、蛋白质翻译、修饰和定位以及信息传导等重要的生物过程均涉及到蛋白质复合

大规模蛋白质相互作用研究方法进展(四)

表1 蛋白质相互作用分析相关数据库及网站  网站 资源类型 网址  DIP  蛋白质相互作用http: //dip.doe-mbi.uda.edu  INTERACT  蛋白质相互作用http: //bioinf.man.ac.uk/interact

大规模蛋白质相互作用研究方法进展(二)

这一经典的蛋白相互作用研究方法接近于体内环境,那些瞬时、不稳定的两两相互作用也可以被检测到,并且与内源蛋白的表达无关[6]。鉴于这些优点并结合简便高效的Gateway表达载体构建方法[7],在大规模的蛋白质-蛋白质相互作用研究中酵母双杂交系统得到了最为广泛的应用。Rain 等[8]用该法绘

科学仪器学科与技术进展的研究报告

  2.蛋白质组学技术与仪器   (1)以高准确度质谱技术为核心的规模化蛋白质鉴定技术与仪器   为了适应蛋白质组研究的需要,从高分辨率、高灵敏度的蛋白质分离与鉴定的线性离子阱-质谱仪(LTQ)到2005年刚推出的LTQ-Orbitrap质谱仪,以及具有小于2ppm的准确度的傅里叶变换离子回

科学仪器学科与技术进展的研究报告(九)

  C)Nanopore sequencing (纳米孔测序方法)  采用完全不同的方法来鉴别DNA分子上的单个碱基,被称为纳米测序。以4种碱基间的物理性质差别为基础,将这种差别转变成为可以检测的信号,从而进行测序。此方法测序的是单个DNA分子,并不需要DNA的扩增。此方法目前还处于理论阶

类似Google的蛋白功能搜索引擎研究进展

细胞通过成千上万控制其生长和分化的蛋白相互协作而发挥功能,关键蛋白功能失常常会导致疾病。目前已经有许多关于探索所有人类蛋白功能的大规模研究项目。最近,de Recherches Cliniques de Montréal (IRCM)研究所Benoit Coulombe博士率领的研究小组新发展了一套

大规模蛋白质相互作用研究方法进展(三)

           图1 TAP亲和层析纯化原理[14]  注:A:标签中的ProteinA 与固化的IgG 结合缓冲液淋洗去除不能结合的杂蛋白,TEV 酶切分离ProteinA &nbs

蛋白质组与蛋白质芯片研究现状及应用

摘要: 蛋白质组研究目的在于从蛋白水平阐明基因的功能,这对于探索生命的奥秘具有重要的意义。蛋白质芯片是近年来兴起的一种强有力的高通量研究方法, 能够一次平行分析成千上万的蛋白样品, 具有很高的敏感度与准确性。它将成为蛋白质组学研究中的强有力的研究方法, 并最终架起基因组学与蛋白质组学的桥梁。1  研

蛋白质谱分析方法特点及其在蛋白组学研究领域中的应用

褚福亮,王福生, 中国人民解放军第302医院全军艾滋病与病毒性肝炎重点实验室 北京市 100039项目负责人 王福生, 100039 ,北京市丰台路26号, 中国人民解放军第302医院全军艾滋病与病毒性肝炎重点实验室. fswang@public.b

上海交大教授Cell Stem Cell新发现:干细胞表观-代谢新机制

  生物通报道:我们的机体在不断地发生改变:新细胞不断替换特化细胞来维持皮肤、肠、血液和其他组织,或在损伤后修复它们。由于分化细胞通常无法分裂,更新几乎总是由组织特异性的干细胞来完成,它们能够不断地生成新细胞。但是这其中具体的机制至今科学家们并不是十分清楚。  近期来自中科院上海生科院,上海交通大学

科学家将发起人类蛋白质组计划

如果能够实现该计划,这将是继人类基因组计划后又一宏伟壮举 日前,一组科学家正在积极筹备发起一个雄心勃勃的研究项目——人类蛋白质组计划(Human Proteome Project),旨在归类和描绘出人体内的所有蛋白质。如果能够实现,这将是继“人类基因组计划”后又一宏伟壮举。该项目预计耗资10亿美元

C.elegans基因文库的分类和选择

自 1995 年成立以来,Dharmacon 在生物信息学,RNA 生物学和合成化学方面的专长 , 使我们能够开发出一整套研究基因功能的产品。作为 RNA 定制合成的领导者,Dharmacon 公司是 RNA 干扰新发现领域的早期参与者,并且在若干重要的科学发现中,以及确保沉默效率的 siRNA

C.elegans基因文库的分类和选择

自 1995 年成立以来,Dharmacon 在生物信息学,RNA 生物学和合成化学方面的专长 , 使我们能够开发出一整套研究基因功能的产品。作为 RNA 定制合成的领导者,Dharmacon 公司是 RNA 干扰新发现领域的早期参与者,并且在若干重要的科学发现中,以及确保沉默效率的 siRNA

基因分离克隆的方法

1 基因芯片技术分离目的基因生物芯片是高密度固定在固相支持介质上的生物信息分子的微列阵。列阵中每个分子的序列及位置都是已知的,并按预先设定好的顺序点阵。基因芯片是生物芯片的一种,其上固定的是核算类物质,主要用于DNA、RNA分析。分为DNA芯片和微点阵两种。分离目的基因是是指从基因组中发现或找出某个

蛋白质组技术(Proteomic Techniques)

一、研究材料1995年,Wasinger等在第一篇蛋白质组研究文章中研究的对象为目前已知最小但能自主复制的原核微生物——支原体Mycoplasma genitalium。1996年,研究对象即扩展到单细胞真核生物——酵母以及人体正常组织及病理标本[28],进而突破了早期人们普遍认为的“蛋白质组研

基因芯片技术知识概要

生物科学正迅速地演变为一门信息科学。最明显的一个例子就是目前正在进行的HGP(human genome project),最终要搞清人类全部基因组的30亿左右碱基对的序列。除了人的遗传信息以外,还有其它生物尤其是模式生物(model organism)已经或正在被大规模测序,如大肠杆菌、啤酒酵母、秀

基因编辑进展梳理 Part II 基于CRISPR-Cas9的技术应用篇(下)

  上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。   一、大规模基因功能的筛选   尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基因型-表型关系仍

基因编辑进展梳理 Part II 基于CRISPR-Cas9的技术应用篇(下)

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老年性痴呆的动物模型及评价

  第一节 老年痴呆的定义   阿尔茨海默氏病(Alzheimer’s disease,AD),又称老年性痴呆,是一种与衰老相关,以认知功能下降为特征的渐进性脑退行性疾病或综合症。病人整个大脑弥散性萎缩并出现明显的病 理组织学改变——老年斑(senile plaque, SP)(或神经炎性斑,ne

老年性痴呆的动物模型及评价

  第一节 老年痴呆的定义   阿尔茨海默氏病(Alzheimer’s disease,AD),又称老年性痴呆,是一种与衰老相关,以认知功能下降为特征的渐进性脑退行性疾病或综合症。病人整个大脑弥散性萎缩并出现明显的病 理组织学改变——老年斑(senile plaque, SP)(或神经炎性斑,ne

《环球科学》2011年十大科学新闻评选

  “十大科学新闻”评选是《环球科学》(《科学美国人》杂志中文版)每年一度的重头戏,也是本年度全球各大科学领域的重大事件进行的一次全面盘点。经过专业编辑和专家团队的商讨,《环球科学》初步挑选出了30条候选新闻,接受网友的点评和投票。  1、超光速粒子挑战爱因斯坦相对论  9月23日,欧洲核子研究中心