我科学家开发出高密度液相生物芯片

近日,中国农业科学院作物科学研究所作物分子育种技术和应用创新团队与相关企业组成联合研究小组,开发出可以取代固相芯片的高密度靶向测序-液相芯片技术体系。相关研究成果发表在《分子育种(Molecular Breeding)》等期刊上。 生物芯片作为制约生物育种的关键技术,从源头上决定了种业科技水平和国家粮食安全。长期以来,我国依赖跨国公司进行高密度固相芯片的设计、制作和检测,导致与芯片有关的分子育种成本高昂、种业发展受到极大限制。因此亟待发展能够替代固相生物芯片、更加简单高效的分子检测方法和技术。 该联合研究小组首先从玉米基因组中挑选多态性高、缺失率低、分布均匀的20K SNP标记,结合靶向测序基因型检测技术,对标记探针进行液相捕获,完成了一系列液相芯片标记的开发。随后,经过技术优化和改进,实现单个位点扩增多个SNP(mSNP),并使液相芯片的检测效率增加到40K mSNP、260K SNP、912K 单倍型,通过控制测序深......阅读全文

液相芯片介绍

1、液相芯片的概念液相芯片,又称悬浮阵列、流式荧光技术,是基于美国Luminex 公司研制的多功能流式点阵仪 (Luminex 100TM)开发的多功能生物芯片平台,通常用于免疫分析、核酸研究、酶学分析、受体和配体识别分析等研究。也是是目前唯一得到权威机构和医学界共同认可用于临床诊断的生物芯片平

全球首台液相定点基因测序仪问世

  如今,肿瘤靶向治疗和个体化用药正在医学界推广,要开展这类“基因治疗”,对人体的基因测序必不可少。记者昨天获悉,全球首台液相定点基因测序仪在张江高科技园区问世,这种仪器在癌细胞比例低于20%的样品中,能检测出基因变异,而目前医院使用的基因测序技术,都要求癌细胞数不得低于40%。生物芯片上

靶向深度测序和单细胞基因测序的区别

1、目标序列靶向测序是一种对感兴趣的基因组区域进行富集测序的研究策略。目标区域测序的主要优势在于可针对特定区域进行测序,有效降低了测序成本,提高了测序深度,能够更为经济有效地研究特定区域的遗传变异。2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序

靶向深度测序和单细胞基因测序的区别

1、目标序列靶向测序是一种对感兴趣的基因组区域进行富集测序的研究策略。目标区域测序的主要优势在于可针对特定区域进行测序,有效降低了测序成本,提高了测序深度,能够更为经济有效地研究特定区域的遗传变异。2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序

基因芯片的测序原理

基因芯片的测序原理是杂交测序方法,即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法,在一块基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG,与基因芯片上对应位置的核酸探针产生互补匹配时,通过确定荧光强度最强的探针位置,获得一组序列完全互补的探针序

基因芯片的测序原理

基因芯片的测序原理是杂交测序方法,即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法,在一块基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG,与基因芯片上对应位置的核酸探针产生互补匹配时,通过确定荧光强度最强的探针位置,获得一组序列完全互补的探针序

生物芯片用于基因测序

基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列,这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列,准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异,

基因芯片的测序原理是杂交测序方法

 基因芯片的测序原理是杂交测序方法        随着人类基因组(测序)计划( Human genome project )的逐步实施以及分子生物学相关学科的迅猛发展,越来越多的动植物、微生物基因组序列得以测定,基因序列数据正在以前所未有的速度迅速增长。然而 , 怎样去研究如此众多基因在生命过程中所

生物芯片技术用于基因测序

基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列,这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列,准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异,

生物芯片技术用于基因测序

基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列,这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列,准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异,

基因测序为何代替不了基因芯片以及PCR?

新一代基因测序技术在最近五年飞速发展,这吸引了不少人的目光,做为精准医疗的基础,之前市场上的报告都集中关注于基因测序。于是原本红火的基因芯片技术沉寂了不少。早些 年,有人甚至预言,芯片技术面临消亡。诚然,在某些方面,新一代测序让芯片失色,但就 很多应用而言,芯片仍然是不可取代的。 芯片和高通

我科学家开发出高密度液相生物芯片

  近日,中国农业科学院作物科学研究所作物分子育种技术和应用创新团队与相关企业组成联合研究小组,开发出可以取代固相芯片的高密度靶向测序-液相芯片技术体系。相关研究成果发表在《分子育种(Molecular Breeding)》等期刊上。  生物芯片作为制约生物育种的关键技术,从源头上决定了种业科技水平

生物芯片技术应用与基因测序

基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列,这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列,准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异,

突破耐药基因组测序缺陷-靶向测序对抗耐药菌新契机

  自以抗生素为代表的抗菌剂问世以来,细菌对人类健康的危害得到了极大的控制。然而进入21世纪后,情况好似走入了另一个极端——由于抗生素滥用所致的耐药菌的出现以及广泛传播。这是由于在药物的选择压力下,敏感菌株被抑制或杀灭,天然耐药或获得性耐药菌株则继续生存、繁殖和克隆传播,导致细菌的耐药性增高。  细

液相芯片技术的技术现状

流式荧光平台一经推出,便在医学诊断与基础研究的各个领域得到了迅速推广,截止2014年底,已有20000台以上流式荧光平台在全球各大权威实验室、临床诊断科、主要的诊断试剂和生物技术公司、制药企业中投入使用。应用领域涉及HLA配型、自身免疫病检测、过敏原检测、基因突变检测、肿瘤标志物检测、HPV分型等众

液相芯片技术的技术应用

白血病是严重威胁人类健康的恶性疾病,既往的细胞形态学分型诊断符合率及正确率受检测者主观成分影响较大,近两年白血病分子特征的研究取得了明显进展,尤其是对染色体易位形成的融合基因,有一些已作为诊断不同类型白血病的分子生物学特异性标志和确定诊断的唯一依据。基于此,在流式荧光技术基础上推出的白血病融合基因检

液相芯片技术的技术原理

将荧光标记后的单细胞(或颗粒)悬液进入吸样管,进而随鞘液进入流动室。进入流动室之前的管道变细,迫使鞘液从四周、样本在中心进入流动室,在外加压力的作用下由下向上(或由上向下)直线流动。鞘液充满流动室将样品裹挟,当二者通过流动室喷嘴流出时,压力迫使鞘液包裹的液滴包含单一细胞或颗粒垂直通过检测区。在检测区

液相芯片技术的技术特点

1、高通量:将许多种不同荧光编码的微球放在同一反应体系内,一次可同时检测2-500种生理病理指标,这与传统方法的逐个检测相比是质的飞跃。2、高敏感性:流式荧光技术最高的检测下限可达0.01 pg/ml,常规的酶联免疫吸附试验(ELISA)仅为μg级,比后者检测的灵敏度提高10—100倍。3、线性范围

液相芯片技术的检测意义

1.融合基因检测对白血病诊断的意义评价白血病的急性程度、克隆特性及分型,使白血病的诊断分型更加科学化和规范化;可检出1×106个有核细胞中的一个白血病细胞,在白血病的早期诊断方面有着其它方法无可比拟的特异性和敏感性。2.融合基因检测对白血病治疗和预后判断的意义细胞遗传学分型与疾病的预后关系密切,对于

什么是数码液相芯片技术

Applied BioCode首创的数码液相芯片(Digital Liquid Chip)核心技术,是基于数码粒子 (Barcoded Magnetic Beads,BMB)的高通量检测技术平台,数码粒子是将顺磁性材料掺入具有生物兼容性的高分子聚合物内,通过光刻法将12位二进制的数字条码刻到

能准确挖掘地方猪重要基因的育种液相芯片诞生

  种业振兴,良种先行。优良的猪种是现代化高效养猪的前提和核心。  《中国科学报》记者4月16日从中国科学院亚热带农业生态研究所获悉,中国工程院院士、亚热带生态所研究员印遇龙科研团队牵头,联合湖南农业大学与华智生物技术有限公司科研团队,利用cGPS靶向测序技术合作开发了首款适用于湘猪等地方猪的64K

液相芯片技术的原理与应用

液相芯片,也称为微球体悬浮芯片(suspension array,liquid chip),是基于xMAP(flexible MultiAnalyte Profiling)技术的新型生物芯片技术平台,它是在不同荧光编码的微球上进行抗原抗体、酶底物、配体受体的结合反应及核酸杂交反应,通过红、绿

芯片与测序(二)

  另外,欲寻找疾病诊断标记物的小伙伴可要记住了,无论是mRNA或者lncRNA,HTA平台有更多的基因可作为biomarker。  可变剪切分析是识别基因不同转录本特异性表达的有效手段。其中,RNA-seq可鉴定到23,934个差异exons,HTA鉴定到26,999个差异exons(3698个共

芯片与测序(一)

在高通量检测这个领域里,基因芯片和二代测序这对相爱相杀的cp,原本均是了解基因组结构和功能的绝佳高手,如今为了一争高下,又是闹的不开交。这不,基因芯片仗着自己老大哥的身份,手持一个二维的DNA探针阵列所形成的三维地图,以数以万计的探针做方向标,能按图索骥的找到基因组的特定位置,且结合完整成熟的指控分

液相芯片技术的原理与应用进展

   液相芯片,也称为微球体悬浮芯片(suspension array,liquid chip),是基于xMAP(flexible Multi Analyte Profiling)技术的新型生物芯片技术平台,它是在不同荧光编码的微球上进行抗原 抗体、酶 底物、配体 受体的结合反应及核酸杂交反应,

数码液相芯片技术的原理和应用

液相芯片概念液相芯片,也称为微球体悬浮芯片(suspension array,liquid chip),是基于微球编码技术的新型生物芯片技术平台,它是在不同编码的微球上进行抗原抗体、酶底物、配体受体的结合反应及核酸杂交反应,通过两束不同的激光分别检测微球编码和报告荧光来达到定性和定量的目的,一个

Applied-Biocode及数码液相芯片技术简介

Applied BioCode,Inc.是一家专注于数码液相芯片技术研发及应用的高科技公司,总部位于美国加州洛杉矶。 数码液相芯片Applied BioCode® 首创的数码液相芯片(Digital Liquid Chip)核心技术,是基于数码磁珠(Barcoded Magnetic Beads,B

液相序列捕获系统与高通量测序

Nature Biotechnology 2009年2月封面文章:基于安捷伦寡核苷酸序列合成技术的液相序列捕获系统 – 高通量平行靶向测序的最佳解决方案来自美国麻省理工学院和哈佛大学Broad研究院的研究人员,利用安捷伦(Agilent Technologies)卓越的寡核苷酸序列合成技术,合成

国人首创!新型高分辨率多聚SNP技术让分子检测不再昂贵

  以DNA变异为基础的分子检测技术被广泛应用于生物分子学、基因组学、遗传学和育种等领域。在动植物遗传育种方面,DNA变异被开发为SSR和SNP等不同类型的分子标记,用于遗传图谱构建、多样性分析、标记-性状关联、图位克隆、分子育种、指纹鉴定等方面。各种高通量检测技术设备和高密度DNA芯片的开发,极大

基因靶向的基因敲除

实验步骤构建重组基因载体绝大多数的基因敲除策略都是基于同源重组的机制,其基因载体包括载体骨架、靶基因同源序列和突变序列及选择性标记基因等非同源序列,其中同源序列是影响同源重组效率的关键因素。用电穿孔显微注射方法把重组DNA转入受体细胞(一般是胚胎干细胞)核内。同源重组基因重组时以载体的同源序列取代染