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orf1ab基因为何成为新型冠状病毒核酸检测的靶序列

为什么当前nCov的核酸检测试剂盒以ORF1ab、S和N作为目标基因?为什么单用ORF1b做进化就能推测nCov来源于蝙蝠?为什么用如此短的时间就能比较分析那么多种coronaviruses基因组从而否定重组阴谋论?我睡前思考着这些问题,索性搜搜文献看。精神食粮让我意识到自己是个无知的人类。 我检索了有关nCov基因组可视化的文献,截取了Paraskevis等人文章的组装注释图[1](按道理讲我更希望贴我国科学家发表在nature上的,无奈尺寸和配色不适用于手机屏幕),如下: 所以看看吧,这么小的基因组,就这么几个主要的基因,你还想用哪个做qPCR?!哈哈哈,我真的是如此愚钝。 此外,如此小的基因组,加上病毒基因组属于单正义链RNA(所以也不会出现高等植物多倍体、杂合等问题),对下游计算分析的硬件要求及耗时也将相应降低,分析个重组不重组的当然会更快。 Zumla等人对冠状病毒的生活史做了比较全面的综述[2]。病毒......阅读全文

再解析:新冠病毒基因组组学特性分析与检测试剂性能...

再解析:新冠病毒基因组组学特性分析与检测试剂性能的关联性2019新型冠状病毒于2020年1月12日被世界卫生组织(WHO)命名为2019-nCoV。2020年3月13日,世卫组织将2019冠状病毒疫情从流行病升级为全球大流行病,疫情已在全球广泛传播。随着分子生物学技术的发展,分子诊断方法成为病原体检

新冠核酸检测检查哪些项目

  自2019 年 12 月以来,湖北省武汉市陆续发现新型冠状病毒(2019 novel coronavirus, 2019-nCoV)感染患者,且呈快速上升之势。自新型冠状病毒疫情爆发以来,近期湖北、武汉疫情从过去的爆发式增长已经走向趋缓,武汉防控工作取得阶段性成效。  而事实上,在2020年1月

新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸实验室检测要点

2020庚子之春,突如其来的新冠病毒疫情,又一次将PCR推在疫情防控的前沿,使核酸检测成为热搜。那么,什么是核酸检测?它在新冠肺炎的诊断中起什么作用?如何发挥作用?如何在检测中保护检测人员安全、避免交叉传染和二次污染?为了帮助更多人了解这个熟悉而陌生的名字,带着诸多问题,让我们从实验室角度走近201

单靶标or多靶标:新冠检测试剂该如何选择?

目前,国家药品监督管理局(NMPA)批准的新型冠状病毒检测试剂中,大部分采用的方法为实时荧光RT-PCR。它具有简便快速、特异性强、灵敏度高等特点。那么,其高灵敏度和高特异性的基础究竟是什么呢?让我们来一探究竟。01试剂的检测性能如何体现?检测性能评价中最主要的就是灵敏度与特异性。PCR扩增产物以指

新冠病毒各种检测方法优缺点对比

  检测原理:   所有生物除朊病毒外都含有核酸,核酸包括脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)。新型冠状病毒(2019-nCoV)属于Beta冠状病毒属(Betacoronavirus),该病毒是蛋白包裹的单链正链RNA病毒,寄生和感染高等动物(包括人)。病毒中特异性RNA序列是区分该病毒与

新冠病毒各类检测方法异同 (一)

新型冠状病毒的检测方法主要包含核酸检测、抗体检测、抗原检测几种方法。由于抗原检测检出率较低,目前新冠检测主要集中在抗体和核酸检测。核酸检测目前是新型冠状病毒检测的“金标准”,具有早期诊断、灵敏度和特异性高等特点;但抗体检测操作便捷、检测迅速,可作为核酸诊断的补充手段。1.1核酸检测检测原理:所有生物

数字PCR或为新冠疑似病人、无症状感染病人检测及确立...

数字PCR或为新冠疑似病人、无症状感染病人检测及确立出院标准提供新方法近日,南通市第三人民医院与苏州锐讯生物科技有限公司运用锐讯DropX数字PCR平台及试剂盒在大量样本中开展了新冠肺炎检测,数字PCR相较于荧光定量PCR体现出了显而易见的高灵敏度,有效避免了痕量病毒携带病例出院风险,并有望为无症状

中国计量院研制出新冠病毒核酸检测弱阳性标准物质

  日前,中国计量科学研究院前沿中心生命科学计量团队为应对核酸检测实验室日常质量控制对质控品的迫切需求,紧急研制了一批新型冠状病毒核酸检测弱阳性标准物质。NIM-RM5205NIM-RM5206新型冠状病毒核酸检测弱阳性标准物质  2020年12月28日,国务院应对新型冠状病毒感染肺炎疫情联防联控机

新型冠状病毒荧光PCR引物探针设计之我见(三)

 4、二聚体设计时通常将二聚体(自身二聚体或配对二聚体)控制在dG>-5.0kc/m, 最好dG>-3.6 kc/m。从图8显示的三套引物探针的自身二聚体可见,第二套的探针具有一个非常稳定的自身二聚体(dG=-13.1kc/m),第二套的上游引物N2F有一个稳定的自身二

以码抗病:计算机也能辅助抗病毒药物研发

  我原以为,这依然会是一个寻常的寒假。  直到疫情的形势愈发严峻。  对病毒各类蛋白的调研任务分配到远在五湖四海的每个实验室成员头上。没有瓶瓶罐罐,没有五花八门的试剂,没有昂贵精致的仪器。一台能远程连上服务器的电脑,这便是我所拥有的全部。图1。 药物研发有时只需要一台能连上服务器的笔记本(图片来源

新增2种,核酸检测弱阳性标准物质

  NIM-RM5205,NIM-RM5206新型冠状病毒核酸检测弱阳性标准物质  日前,中国计量科学研究院前沿中心生命科学计量团队为应对核酸检测实验室日常质量控制对质控品的迫切需求,紧急研制了一批新型冠状病毒核酸检测弱阳性标准物质。  2020年12月28日,国务院应对新型冠状病毒感染肺炎疫情联防

一文读懂新型冠状病毒的核酸检测

2019年12月以来,武汉市部分医疗机构陆续出现不明原因肺炎病例。国家药品监督管理局随即启动《医疗器械应急审批程序》。目前,已批准7家企业的新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒上市。为进一步合理使用上述产品,有效满足疫情防控需求,现将使用情况做如下说明:1、新型冠状病毒的核酸检测原理所有生物

美拉沙星:一个可以高效抑制读码框移位的小分子化合物

  新冠肺炎(coronavirus disease 2019, COVID-19)自2019年底爆发以来肆虐全球,严重威胁着人们的生命健康和日常生活,也给许多国家的经济带来沉重打击。同时,全球科学家的目光也空前聚焦于新冠病毒(SARS-CoV-2)与新冠肺炎的研究,以期通过科学的力量帮助人类战胜这

新型冠状病毒肺炎病毒核酸检测专家共识

今日,国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV)宣布,新型冠状病毒(2019-nCoV)的正式分类名为严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coro

orf1ab阳性什么意思

您好,orf1ab阳性其实就是单阳性反应。但是一般新冠患者是双阳性反应,除了orf1ab是阳性以外,还需要N基因同时阳性。所以如果检测出来orf1ab是阳性,还需要继续进行荧光rtm-pcr方法来进一步确认。

警惕,新冠核酸检测失败可能是这个原因

 案例发生比较典型,为了避免发生类似的问题,梳理原因分析过程并整理实验验证资料,与大家进行分享。 案例经过与原因分析 9月21日下午16:00接班时,值班老师称当日新冠核酸RT-PCR扩增失败致使检验报告全部未发,正在准备对标本重新复查。实验室使用的新型冠状病毒(201

新型冠状病毒肺炎病例标本采集与实验室检测技术指南

为指导各级疾控部门和其他相关机构开展新型冠状病毒肺炎病例标本采集与实验室检测工作,特制定本技术指南。 一、标本采集(一)采集对象。新型冠状病毒肺炎疑似病例和聚集性病例,需要进行新型冠状病毒感染诊断或鉴别诊断者,或其他需要进一步筛查检测的环境或生物材料。(二)标本采集要求。1.从事新型冠状病

湖北新冠病毒检测试剂可先用后申报 这81家企业已可提供

  新型冠状病毒疫情日益严峻,武汉地区医护人员口罩、防护服、检测试剂等物资稀缺的新闻牵动每个国人的心。由于试剂缺乏,很多患者不能被第一时间确诊和收治,导致很多后续治疗工作推进缓慢。  1月25日下午,湖北召开新型肺炎疫情防控工作发布会。湖北省医保局副局长刘松林介绍,新型冠状病毒感染导致的肺炎,早诊断

orf1ab阳性什么意思

orf1ab阳性其实就是单阳性反应。但是一般新冠患者是双阳性反应,除了orf1ab是阳性以外,还需要N基因同时阳性。所以如果检测出来orf1ab是阳性,还需要继续进行荧光rtm-pcr方法来进一步确认。

一文汇总新型冠状病毒肺炎病毒核酸检测专家共识

  突发新型冠状病毒(2019 novel coronavirus,2019-nCoV)肺炎疫情以来,感染病例快速上升。随着疫情的发展和防控力度加大,全国各地乃至境外均有病例报道[1,2,3,4],及时对急重症及疑似患者进行诊断需要快速有效的方法,病毒核酸检测可为诊断提供直接证据[5,6]。核酸检测

中国计量院首发新冠病毒核酸标准物质 免费支持一线

  日前,中国计量科学研究院前沿中心生命科学计量团队成功研发了高低两种浓度水平的新型冠状病毒核酸标准物质,并通过专家鉴定。  两种标准物质均为体外转录RNA,目标基因范围涵盖已公布的新冠病毒3个主要基因:核壳蛋白N基因全长、包膜蛋白E基因全长、开放阅读框1ab (ORF1ab)基因片段(基因组坐标:

微滴芯片数字PCR技术在检测新冠病毒的应用

国家卫健委发布了《新型冠状病毒肺炎防控方案(第五版)》,其中在实验室检测技术指南中明确提出,核酸检测结果阴性不能排除新型冠状病毒感染。3月4日,国家卫健委发布的《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第七版)》 中提到了以下两点:对疑似病例要尽可能采取包括快速抗原检测和多重PCR核酸检测等方法对呼吸道病

新型冠状病毒感染的常规检测方法是它

  根据新型冠状病毒感染的肺炎实验室检测技术指南(第二版),新型冠状病毒感染的肺炎实验室检测主要是实时荧光RT-PCR方法。  新型冠状病毒核酸测定(实时荧光RT-PCR方法)  1.推荐选用针对新型冠状病毒的ORF1ab、N基因区域的引物和探针。  靶标一(ORF1ab):  正向引物(F):CC

第四版新型冠肺炎防控方案公布,实验室检测指南出炉

  2020-02-09作者:浏览次数:181   第四版新型冠状病毒肺炎防控方案重点从检测标本采集和实时荧光RT-PCR检测方法等维度对新冠病毒检测工作作出要求,访指南方未能成熟、易于实施。   为做好全国新型冠状病毒肺炎防控工作,加强新型冠状病毒肺炎疫情防控相关机构的组织协调,完善疫情信息

实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸作业指导书

实时荧光 RT-PCR 方法检测新型冠状病毒核酸   (一)目的。 规范实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸的工作程序,保证实验结果的正确可靠。 (二)范围。 copyright sysqy.com 适用于实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸。 (

多国团队警告:新冠和MERS可能在人体内重组为嵌合病毒

  2012年4月,以沙特阿拉伯为中心的中东地区首次爆发了中东呼吸综合征冠状病毒(MERS -CoV),该病毒感染后致死率高达37%。2015年,MERS在韩国爆发,致死率高达20%,实际上,MERS至今仍在沙特并未消失,2019年12月至2020年3月,沙特至少出现了34名MERS确诊病例,至少1

以丙肝病毒血清样本为例介绍如何提高RNA病毒核酸检测...

以丙肝病毒血清样本为例介绍如何提高RNA病毒核酸检测灵敏度这段时间普通民众都是谈新冠病毒色变,无非印证了一句话「人们对不了解的事物才会感到恐惧」。为了减少我们的恐惧感,让我们来深入了解新闻发布会上不断提及的「新冠病毒核酸检测」吧。首先分享中国疾控中心发布的检测新冠病毒的引物、探针序列:推荐选用针对新

新型冠状病毒核酸和抗体检测临床应用专家共识

当前,复工复产逐步推进、疫情境外输入压力不断增大,以及无症状感染者存在一定传播风险等情况,对新型冠状病毒检测工作提出了新的要求。上海市卫生健康委员会贯彻《关于进一步做好疫情期间新冠病毒检测有关工作的通知》联防联控机制综发〔2020〕152号精神,发布加强本市医疗机构新型冠状病毒检测工作的通知,强调结

新冠、流感联合检测“二合一”试剂盒获批上市

  一次检测,即可获知是否感染新冠、流感两种病毒。在上海市科委支持下,上海思路迪生物医学科技有限公司研发生产的“新型冠状病毒2019-nCoV和甲型乙型流感病毒核酸联合检测试剂盒(荧光PCR法)”,日前通过国家药品监督管理局审核,获批上市。这是国内首个基于荧光定量PCR平台的新冠联合甲乙流病毒核酸检

为什么检测2019nCov用ORF1ab基因?

  为什么当前nCov的核酸检测试剂盒以ORF1ab、S和N作为目标基因?为什么单用ORF1b做进化就能推测nCov来源于蝙蝠?为什么用如此短的时间就能比较分析那么多种coronaviruses基因组从而否定重组阴谋论?我睡前思考着这些问题,索性搜搜文献看。精神食粮让我意识到自己是个无知的人类。