糖基化酶碱基编辑器的机器学习研究中获进展
碱基编辑技术可实现精确的碱基转换，当前，有三类碱基编辑器被广泛应用，包括胞嘧啶碱基编辑器（cytosine base editor，CBE）、腺嘌呤碱基编辑器（adenine base editor，ABE）、糖基化酶碱基编辑器（glycosylase base editor，GBE）。 2020年，中国科学院天津工业生物技术研究所研究员毕昌昊带领的合成生物技术研究团队与研究员张学礼带领的微生物代谢工程团队开发出GBE，可实现胞嘧啶到鸟嘌呤的碱基颠换，具有纠正3000多个已知致病单核苷酸变异（single nucleotide polymorphism，SNP）的潜力，这或为主要的遗传疾病如abca4相关性视网膜疾病和X-linked视网膜色素变性等提供治疗方案。 为评估GBE在多个位点的编辑情况，提高其应用潜力，研究人员运用高通量细胞建模技术，在哺乳动物细胞中进行6400多个基因组靶点的GBE编辑，建立了人工智能AI机......阅读全文
机器学习也许能“算命”
12月19日，《自然-计算科学》发表的一项研究描述了一种机器学习方法，能够从不同方面准确预测人类生活，包括早死可能性和个性的细微差异。该模型或许能提供对人类行为的量化认知。 社会科学家对人类生活是否能被预测的问题看法不一。虽然我们对在人类生活中起到重要作用的社会人口学因素已有充分了解，但一直无
科学家提出基因编辑领域发展新方向
4月18日，中国科学院上海营养与健康研究所研究员杨力与上海科技大学生命技术学院教授陈佳、上海科技大学免疫化学研究所副研究员杨贝，应邀在国际学术期刊《自然-生物技术》（Nat Biotechnol）上发表题为To BE or not to BE, that is the question 的新闻与
我国科研人员开发新型普适高效的碱基编辑器
在国家自然科学基金项目（项目编号：31730111、91540115、31600654 、31600619、31471241）等资助下，中国科学院上海生命科学研究院杨力研究组与上海科技大学生命学院陈佳研究组和黄行许研究组合作，成功开发出可高效介导甲基化胞嘧啶mC到胸腺嘧啶T的编辑碱基编
新型双碱基编辑器助力基因饱和突变文库构建
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员赖良学课题组在新型碱基编辑器开发方面取得重要进展，获得了可同时兼具当前多种单碱基编辑器及CRISPR/Cas9基因编辑功能的多功能碱基编辑器，可广泛地诱导产生多种模式的突变，对于饱和突变文库构建、基因突变功能研究等方面具有重要促进作用。相关研究在线发表于
广州生物院开发出新型双碱基编辑器
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学课题组在新型碱基编辑器开发方面取得重要进展，获得了可同时兼具当前多种单碱基编辑器及CRISPR/Cas9基因编辑功能的多功能碱基编辑器，可广泛地诱导产生多种模式的突变，对于饱和突变文库构建、基因突变功能研究等方面具有促进作用。相关研究成果以AGBE: a
多样化C－to－T植物碱基编辑器被开发
近日，电子科技大学张勇教授、马里兰大学YiPing Qi博士、扬州大学张韬教授课题组合作于《Plant Biotechnology Journal》发表了题名《Improved plant cytosine base editors with high editing activity, pur
全新「碱基编辑器」：不用「切割」也能精准编辑基因
原标题:不用「切割」也能精准编辑基因了，华人学者开发全新「碱基编辑器」摘要：CRISPR 基因编辑技术之外的新工具。基因编辑技术有了重大进展。Broad 研究所的华人学者 David Liu 教授的团队开发出了一种「碱基编辑器」，可以让细胞内 DNA 的一种碱基通过简单的化学反应，变成另一种
软件所在因果图表示学习方面获进展
近日，中国科学院软件研究所天基综合信息系统重点实验室研究团队撰写的题为Rethinking Causal Relationships Learning in Graph Neural Networks的研究成果，被人工智能领域顶级学术会议Association for the Advanceme
多糖裂解酶高温适应性研究获进展
温度是进化的重要驱动力之一。随着温度的升高，酶的催化活性会相应地提高，但酶与底物之间的亲和力会下降。 金属离子能够增强金属酶的活性、稳定性和底物亲和力，但是金属离子螯合氨基酸在高温适应性过程的作用尚不明确。近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所微生物资源团队针对多糖裂解酶高温适应性的相关研究
复杂体系酶促动力学研究获进展
近日，中国科学院大连化学物理研究所生物分离分析新材料与新技术研究组(1809组)研究员叶明亮、邹汉法等人在复杂体系酶与底物相互作用的酶促动力学研究中取得进展。相关研究成果以Correspondence的形式发表在最新一期的Nature Methods上(Nature Methods, 201
武汉大学新型聚酮合酶研究获进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/3/474885.shtm C-C键形成是有机分子的构成基础，也是化学及其他相关领域的核心科学问题，新型聚酮合酶的发现可以为未来开发C-C合成工具提供全新的思路。近日，中国科学院院士、武汉大学药学院教授邓子
纳米酶催化肿瘤光声成像研究获进展
12月12日，Nano Letters 杂志在线发表了类外泌体纳米酶小体催化肿瘤光声成像的最新研究成果。研究人员首次利用纳米酶的酶学催化特性，实现了鼻咽癌移植瘤的光声成像。 光声成像结合了纯光学成像的高对比度和纯超声成像的高穿透深度优点，能够提供高对比度和高分辨率的组织成像，是目前非常有应用前
单碱基基因编辑研究进展速览
本文中，小编整理了近年来科学家们在单碱基基因编辑研究领域取得的新进展，分享给大家！ 【1】Nat Commun：科学家首次在猪身上实现多位点单碱基编辑 doi：10.1038/s41467-019-10421-8 近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学课题组利用单碱基编辑器首次在猪
力学所在薄膜的界面剥离研究中获进展
柔性薄膜作为性能优异的基底材料，被广泛应用于纳微系统、柔性电子、软体机器人和生物医学设备等新兴应用领域。随着薄膜厚度趋于微/纳米尺度，实现薄膜简单、无损的界面剥离已成为实际应用中的最大挑战之一。近日，中国科学院力学研究所非线性力学国家重点实验室赵亚溥研究团队在薄膜的界面剥离研究中取得重要进展，提
森林群落中物种稀有性机制研究中获进展
局域群落中的大部分物种都是只有较少个体的稀有种，理解局域群落中物种稀有性的机制是群落生态学的挑战之一。生态位分割假说（Niche partitioning hypothesis）认为，稀有种利用空间上有限且局域稀有的资源。 为了更好地理解不同多度树种如何在群落里中实现共存，中国科学院西双版纳热
古脊椎所在侏罗纪蜥蜴研究中获进展
鳞龙形类的系统发育学研究显示侏罗纪是有鳞类演化的一个重要时期。在这一时期，有鳞类迅速地演化出它的几个主要的分支类群。但侏罗纪的有鳞类化石记录却十分有限，只在北美和欧亚大陆的少数几个化石点，如美国的Morrison组、德国的Solnhofen灰岩、哈萨克的Karatau组中有记录。 在中国，白垩
研究团队在太阳能燃料研究中获进展
近年来，聚光太阳能利用逐渐成为能源领域中的国际前沿热点，太阳能热化学循环制取太阳能燃料被认为是具有发展前景的聚光太阳能热利用方式之一。聚光太阳能可实现不同聚光比条件下驱动碳氢燃料参与的化学反应和太阳能互补系统的燃料转化。太阳能燃料制备的主要问题在于热化学循环反应温度高、辐射热损失大、不可逆损失严
研究团队在肿瘤声动力治疗研究中获进展
作为一种新兴的非侵入性肿瘤治疗手段，声动力治疗（SDT）技术发展迅速。较之于现有的光动力治疗技术，SDT技术具有更好的组织穿透能力，因此其在肿瘤治疗领域具有优势。超声作用下的声热、声空化和声化学过程是SDT过程对肿瘤细胞杀灭的主要机制。其中，声敏剂参与下的声化学过程在SDT过程中起重要作用。因此
上海药物所肝素合成过程中关键酶结构的解析研究获进展
硫酸乙酰肝素是在细胞表面和细胞质基质中广泛存在的一种多糖，它能与一系列的生长因子、趋化因子和白介素等功能性蛋白质相互作用，进而在胚胎发育、细胞生长、炎症反应、凝血、肿瘤转移和病毒侵染等生理过程中发挥作用。葡萄糖醛酸C5异构酶则是硫酸乙酰肝素和肝素合成中的一个关键酶，它能将糖链中的葡萄糖醛酸异构为
磷脂合成过程中重要膜内酶Cds的结构与功能研究获进展
6月27日，Nature communications 期刊在线发表了中国科学院生物物理研究所柳振峰研究组报道的嗜热古菌Thermotogamaritima来源的胞苷二磷酸-二脂酰基甘油（CDP-DAG）合成酶（TmCdsA）的研究成果，题为Structure and mechanism of
上海应物所在单分子酶促反应分子马达研究中获进展
近日，中国科学院上海应用物理研究所研究人员实现了对界面酶分子的单分子实时荧光成像。上海应物所在单分子酶促反应分子马达研究中获进展 通过对运动轨迹的分析发现酶分子的趋向运动(Chemotaxis)是平动与转动的竞争平衡结果，相关工作发表在Journal of the American Chemi
天津工生所等在水凝胶固定化酶研究中获进展
生物催化因绿色、温和、高选择性等特点，逐渐成为传统精细化学品制造的替代方法。而生物催化剂——酶，通常存在活性差、不稳定和难以回收利用等缺点。将酶固定化后能够提高酶的催化活性和稳定性，且可重复使用，这使得酶固定化成为有效的策略，对生物催化剂的工业化应用具有助推作用。近日，中国科学院天津工业生物技术研究
天津工生所在酶立体偏好性改造及其应用研究中获进展
手性γ-氨基丁酸类化合物是合成一些药物的关键结构单元。腈水解酶催化3-取代戊二腈去对称化水解，是合成这类化合物的有效方法。目前，已测试的腈水解酶对3-烷基或3-芳基戊二腈通常生成（S）-构型产物，而（R）-构型产物的对映体过量值较低。定向进化是实现酶立体偏好性翻转的有效手段，但在不损失酶活的基础
上海应物所在单分子酶促反应分子马达研究中获进展
近日，中国科学院上海应用物理研究所研究人员实现了对界面酶分子的单分子实时荧光成像，通过对运动轨迹的分析发现酶分子的趋向运动(Chemotaxis)是平动与转动的竞争平衡结果，相关工作发表在Journal of the American Chemical Society上。 液体中的分子通常
科学家首次证实线粒体碱基编辑器的脱靶效应
脱靶检测技术工作流程。中国农科院供图 日前，中国农业科学院深圳农业基因组研究所左二伟团队与国内其他科研单位合作，首次证实线粒体碱基编辑器（DdCBE）会导致核基因组严重的脱靶效应，因而医学应用存在严重的安全风险。该研究对研发高效安全的线粒体碱基编辑器具有指导意义。相关研究成果在线发表在《
科学家首次证实线粒体碱基编辑器的脱靶效应
脱靶检测技术工作流程。中国农科院供图 日前，中国农业科学院深圳农业基因组研究所左二伟团队与国内其他科研单位合作，首次证实线粒体碱基编辑器（DdCBE）会导致核基因组严重的脱靶效应，因而医学应用存在严重的安全风险。该研究对研发高效安全的线粒体碱
遗传发育所在作物基因组单碱基编辑方法研究中取得进展
单核苷酸点突变是作物许多重要农艺性状发生变异的遗传基础。单碱基的变异会导致氨基酸替换或蛋白质翻译终止，使基因功能发生改变，从而有可能产生优良的等位基因与优异性状。传统诱变及单碱基突变筛选技术（如TILLING）需要进行基因组规模的筛选，耗时、耗力且鉴定到的点突变数目和种类有限。基因组编辑技术，特
机器学习加速探索材料的开发
设计空间几何增长是材料设计中的一大挑战。机器学习（ML）加速探索材料设计已经开始在的这一挑战中发挥作用，并显著提高了发现材料的效率。然而，这个流程暗含了密度泛函理论（DFT）产生的训练集的统计上的偏见。并且，在使用高通量计算产生训练集的时候，大量的计算会失败。这种情况对于一些有趣的，例如含有自由
从同源重组到碱基编辑器－看基因编辑72变
基因编辑尤其是“基因魔剪”CRISPR的新闻报道几乎每天都能见到。仅在3月份，就有两篇引起广泛关注的重磅成果，其一，曾与张峰合作开创“基因魔剪”CRISPR的科技大牛刘如谦（David Liu），利用基因编辑技术研发出给细胞活动拍照的“细胞记录仪”（CAMERA）。正如黑匣子能记录事故发生时的
机器学习能够有效筛选“苦味”
苦味往往在食物味道中并不受欢迎，而引起这种苦味的重要因素之一是一种生物分子—苦味肽。苦味肽是能够与细胞膜上的苦味受体结合进而引发苦味感知的一类小分子肽，通常在食品加工、储存或消化过程中生成。近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员靳艳团队与大连工业大学、内蒙古伊利实业集团有限公司合作，发展了一种