科学家首次证实线粒体碱基编辑器的脱靶效应
脱靶检测技术工作流程。中国农科院供图 日前,中国农业科学院深圳农业基因组研究所左二伟团队与国内其他科研单位合作,首次证实线粒体碱基编辑器(DdCBE)会导致核基因组严重的脱靶效应,因而医学应用存在严重的安全风险。该研究对研发高效安全的线粒体碱基编辑器具有指导意义。相关研究成果在线发表在《细胞发现》(Cell Discovery)。 线粒体碱基编辑器是美国博德研究所2020年研发的一项基因编辑技术,它可直接针对双链线粒体DNA,将C·G碱基对编辑为T·A碱基对。与作用于单链DNA的胞嘧啶碱基编辑器(CBE)不同,线粒体碱基编辑器可以在双链DNA相应位点发生脱氨基作用,达到碱基编辑的目的。此前研究发现,胞嘧啶碱基编辑器会导致基因组范围内完全随机无法预测的脱靶效应,由此引起人们对线粒体碱基编辑器安全性的关注。 该研究利用脱靶检测技术G......阅读全文
科学家首次证实线粒体碱基编辑器的脱靶效应
脱靶检测技术工作流程。中国农科院供图 日前,中国农业科学院深圳农业基因组研究所左二伟团队与国内其他科研单位合作,首次证实线粒体碱基编辑器(DdCBE)会导致核基因组严重的脱靶效应,因而医学应用存在严重的安全风险。该研究对研发高效安全的线粒体碱基编辑器具有指导意义。相关研究成果在线发表在《
科学家首次证实线粒体碱基编辑器的脱靶效应
脱靶检测技术工作流程。中国农科院供图 日前,中国农业科学院深圳农业基因组研究所左二伟团队与国内其他科研单位合作,首次证实线粒体碱基编辑器(DdCBE)会导致核基因组严重的脱靶效应,因而医学应用存在严重的安全风险。该研究对研发高效安全的线粒体碱
世界首次证实单碱基基因编辑存在脱靶效应
基因编辑技术越来越火,然而针对基因编辑工具最大的风险——脱靶效应,一直以来缺乏良好的检测工具。记者从中科院神经科学研究所获悉,其团队与多家机构合作完成的研究,建立了一种在精度、广度和准确性上远超越之前的基因编辑脱靶检测技术,这一技术首次证实:近年来兴起的单碱基编辑技术有可能导致大量无法预测的脱靶
DNA碱基中产生靶向变化的碱基编辑器-诱导广泛的脱靶
在一项新的研究中,来自美国麻省总医院、哈佛医学院和哈佛大学陈曾熙公共卫生学院的研究人员报道近期开发的几种在单个DNA碱基中产生靶向变化的碱基编辑器能够在RNA中诱导广泛的脱靶效应。他们还描述了对碱基编辑器变体进行基因改造可显著降低RNA编辑的发生率,这同时也会增加在靶DNA编辑的精确度。相关研究
DNA碱基编辑器或能诱导大量脱靶RNA突变!
DNA碱基编辑方法能够直接在基因组DNA中进行点突变的校正,同时并不会产生任何双链的断裂(DSBs,double-strand breaks),但潜在的脱靶效应常常限制了这些方法的应用,腺相关病毒(AAV)是DNA编辑基因疗法中最常用的传递系统,由于这些病毒能够在体内持续维持基因表达的功能,因此
单碱基基因编辑研究进展速览
本文中,小编整理了近年来科学家们在单碱基基因编辑研究领域取得的新进展,分享给大家! 【1】Nat Commun:科学家首次在猪身上实现多位点单碱基编辑 doi:10.1038/s41467-019-10421-8 近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学课题组利用单碱基编辑器首次在猪
中国科学家实现线粒体致病突变体内原位纠正
华东师范大学教授李大力、刘明耀团队联合临港实验室青年研究员陈亮团队,开发出高性能线粒体腺嘌呤碱基编辑器(eTd-mtABEs),并利用eTd-mtABEs成功构建了感音神经性耳聋和Leigh综合症大鼠疾病模型。此外,团队使用重新改造的DdCBE变体,首次实现线粒体致病突变的体内原位纠正,成功逆转了l
遗传发育所-个体水平发现单碱基编辑系统存在脱靶效应
人类遗传疾病和农作物农艺性状很多情况下是由基因组中的单个或少数核苷酸的突变引起的。因此,基因组中关键核苷酸变异的鉴定与定向修正是人类遗传疾病治疗及动植物育种的重要方向。基因组编辑工具单碱基编辑器的开发,为定向编辑和修正基因组中的关键核苷酸变异提供了重要工具,展现了其在遗传疾病治疗与动植物新品种培
单碱基基因编辑系统,基因治疗又一利器
TaC9-ABE单碱基编辑技术原理。黄博纯 供图近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员赖良学与五邑大学副教授邹庆剑团队合作首次将腺苷脱氨酶与转录激活因子样效应子(TALE)融合,开发了一种不会产生Cas9依赖性脱靶的新型碱基编辑系统TaC9-ABE。相关研究3月24日在线发表于《细胞发现》(
基因编辑技术,最后一块拼图补齐
韩国基础科学研究所(IBS)基因组工程中心研究人员开发了一种新的基因编辑平台,称为类转录激活因子效应相关脱氨酶(TALED)。TALED是能够在线粒体中进行A到G碱基转换的碱基编辑器。这一发现是长达数十年治愈人类遗传疾病之旅的结晶,而TALED,也被认为是基因编辑技术中最后缺失的一块拼图。研究成果发
基因编辑技术,最后一块拼图补齐
韩国基础科学研究所(IBS)基因组工程中心研究人员开发了一种新的基因编辑平台,称为类转录激活因子效应相关脱氨酶(TALED)。TALED是能够在线粒体中进行A到G碱基转换的碱基编辑器。这一发现是长达数十年治愈人类遗传疾病之旅的结晶,而TALED,也被认为是基因编辑技术中最后缺失的一块拼图
证实CRISPR/Cpf1基因组编辑几乎没有脱靶效应
作为CRISPR基因组编辑的新工具,Cpf1因其不同于Cas9的性质而引起人们的广泛关注。它只需要单个RNA,即crRNA(CRISPR RNA),因而组装更加简单;它的交错切割模式可能促进利用所需的序列替换现有的DNA序列;它识别富含胸腺嘧啶的DNA序列,而且相对于Cas9识别的富含鸟嘌呤的序
杨辉组/高彩霞组发现单碱基编辑系统存在严重脱靶效应
2016年,David Liu团队在 Nature 期刊上首次报道了基于胞嘧啶脱氨酶APOBEC1(能催化C脱氨基变成U,而U在DNA复制过程中会被识别成T)和尿嘧啶糖基化酶抑制剂UGI(能防止尿嘧啶糖基化酶将U糖基化引起碱基切除修复)的单碱基编辑工具(BE3)首次实现可以在不引入DNA双链断裂
上海科技大学等团队构建新型高精准碱基编辑系统
上海科技大学生命科学与技术学院教授陈佳、免疫化学研究所教授杨贝,中科院上海营养与健康研究所研究员杨力与武汉大学医学研究院教授殷昊合作研究构建了一种高精准碱基编辑系统,并依据其特性命名为变形式碱基编辑系统(简称tBEs)。5月10日,该研究成果在线发表于《自然—细胞生物学》。 据悉,研究人员利
Nature子刊:毕昌昊/张学礼团队开发基于糖基化酶的新型碱基编辑器
中国科学院天津工业生物技术研究所毕昌昊团队和张学礼团队合作,在 Nature Biotechnology 期刊发表了题为:Glycosylase-based base editors for efficient T-to-G and C-to-G editing in mammalian cel
Cell重磅:新型基因编辑工具诞生,吹散最后一片乌云
近日,韩国大田的基础科学研究所( Institute for Basic Science,IBS)基因组工程中心的研究团队开发了一种可编程工具,并在Cell发表了“Targeted A-to-G base editing in human mitochondrial DNA with progr
新型腺嘌呤碱基编辑器可让细胞RNA编辑最小化
在一项新的研究中,来自美国布罗德研究所和哈佛大学的研究人员发现有证据表明使用碱基编辑器会导致细胞中出现意想不到的RNA编辑。相关研究结果发表在2019年5月8日的Science Advances期刊上,论文标题为“Analysis and minimization of cellular RNA
本周Science期刊发布-检测CRISPR脱靶效应新方法DISCOVERSeq
本周又有一期新的Science期刊(2019年4月19日)发布,它有哪些精彩研究呢?让小编一一道来。图片来自Science期刊。 1.Science:开发出一种检测CRISPR脱靶效应的新方法---DISCOVER-Seq doi:10.1126/science.aav9023; doi:1
科学家提出基因编辑领域发展新方向
4月18日,中国科学院上海营养与健康研究所研究员杨力与上海科技大学生命技术学院教授陈佳、上海科技大学免疫化学研究所副研究员杨贝,应邀在国际学术期刊《自然-生物技术》(Nat Biotechnol)上发表题为To BE or not to BE, that is the question 的新闻与
Nature子刊|碱基编辑器新拓展
作为Cas9核酸酶的进化祖先,IscB蛋白作为紧凑RNA引导的DNA内切酶和缺口酶,使其成为碱基编辑的强有力候选者。然而,目标范围狭窄限制了IscB系统的应用;因此,有必要找到更多识别不同靶邻基序(TAMs)的IscB。2024年8月15日,辉大基因张海南、李彤、复旦大学黄锦海、中科院脑科学与智能技
设计基因编辑工具的AI大模型问世
记者27日从中国农业科学院获悉,该院农业基因组研究所农业基因编辑技术研发与应用创新团队构建了全球规模最大的实验验证数据集,并基于此开发出人工智能(AI)大模型AlphaCD。该模型不仅能高效预测超过2万余种胞嘧啶脱氨酶的酶活特征,还能设计出新型高性能碱基编辑工具。相关成果日前发表于国际期刊《细胞
多样化C-to-T植物碱基编辑器被开发
近日,电子科技大学张勇教授、马里兰大学YiPing Qi博士、扬州大学张韬教授课题组合作于《Plant Biotechnology Journal》发表了题名《Improved plant cytosine base editors with high editing activity, pur
基因编辑大牛Nature子刊发文:CRISPR单碱基编辑准确!
来自韩国基础科学研究所IBS的研究人员发表了题为“Genome-wide target specificities of CRISPR RNA-guided programmable deaminases”的文章,证实了最近研发的基因编辑方法的准确性。这一研究成果公布在4月10日的Nature
广州生物院开发出新型双碱基编辑器
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学课题组在新型碱基编辑器开发方面取得重要进展,获得了可同时兼具当前多种单碱基编辑器及CRISPR/Cas9基因编辑功能的多功能碱基编辑器,可广泛地诱导产生多种模式的突变,对于饱和突变文库构建、基因突变功能研究等方面具有促进作用。相关研究成果以AGBE: a
新型“碱基编辑器”有助治疗遗传疾病
一个美国团队25日在英国《自然》杂志发表报告说,它在基因编辑技术方面取得新进展,可通过一种新型“碱基编辑器”在基因中替换碱基,有助科学家增强对遗传疾病的理解和开发新疗法。 基因是脱氧核糖核酸(DNA)上的片段,而DNA双链螺旋结构由4种化学碱基组成,即腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和
新进展!构建新型双碱基编辑器
碱基编辑器是基于CRISPR/Cas9发展的新一代基因组编辑技术,可诱导单个碱基的突变,而鲜有关于特异性介导A-to-G和C-to-G双突变的碱基编辑工具的研究。此外,关于碱基编辑系统与染色质环境之间的联系也少见报道。 近日,中国科学院天津工业生物技术研究所研究员毕昌昊带领的合成生物学技术研究
遗传发育所利用环状RNA开发出基于Cas12a的引导编辑器
基于CRISPR-Cas9的引导编辑器(prime editors,PEs)可同时实现任意碱基类型的精准替换,以及小片段的精准插入、替换和删除。目前,几乎所有的引导编辑器均是依赖于Cas9蛋白开发而成,但Cas9蛋白存在尺寸较大、脱靶效应高和受限于G/C-rich区域编辑的缺点,限制了引导编辑器
恢复动物部分视力——病毒运送传递先导编辑器
先导编辑是一种通用的基因编辑形式,可纠正大多数已知的致病基因突变。美国麻省理工学院与哈佛大学布罗德研究所的科学家设计了类似病毒的颗粒,以足够高的效率将先导编辑器传递给小鼠细胞,以治疗遗传疾病。该研究成果8日发表在《自然·生物技术》杂志上。团队采用了他们之前设计的工程病毒样颗粒(eVLP),以携带碱基
基因测序技术升级检测CRISPR脱靶效应
政府主导致效率低 2014年末,习近平总书记前往镇江视察时发表过如下言论:“一些大医院始终处于‘战时状态’的状况需要改观。”新医改启动至今已是第七年,但因患者在大医院高度拥堵造成的看病难、看病贵却丝毫不见缓解,反而有所加剧,习总书记所指出的,正是这一轮医疗卫生体制改革最亟需解决的问题。 相关
科学家首次证实人类大脑存在“内置GPS”
用于确定人类定位细胞的虚拟现实导航游戏的屏幕截图。 在20世纪70年代末,科学家们发现,当老鼠处于一个特定的场所时,它海马中的神经细胞就会激活。这些细胞被称作位置细胞,而且不久之后人类也被发现拥有这种细胞。2005 年科学家们在老鼠体内发现了定位细胞,后来在蝙蝠和猴子体内也发现了定位细胞,