2021年度“中国生物信息学十大进展”公布
为推动我国生物信息学的学科发展和创新研究，充分展示和宣传我国生物信息学领域的重大研究成果，《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 简称GPB)组织评选了2018年度、2019年度和2020年度“中国生物信息学十大进展”。在此基础上，GPB近期组织2021年度评选活动，经过推荐、初选和复选程序，现公布2021年度“中国生物信息学十大进展”评选结果(排名不分先后，按题目首字母顺序排序)。 感谢所有专家秉持专业和公正的态度参与本年度十大进展的推荐和评选;祝贺所有入选工作的团队!同时祝愿大家在2022新的一年里健康平安、工作顺利，如虎添翼! 评审委员会 2022年2月18日 • 3D基因组研究发现人类大脑发育独特遗传元件和调控机制 人类大脑起源于漫长的生命进化过程。哪些遗传改变造就了人类大脑是国际科学界长期力图回答的前沿科学问题。......阅读全文
北京大学PLOS生物信息学新成果
近日，北京大学分子医学研究所李川昀课题组与何爱彬研究员合作，在国际著名遗传学杂志《PLOS Genetics》发表一项重要研究成果，题为“Emergence, Retention and Selection: A Trilogy of Origination for Functional De
德国生物信息学家发现新冠病毒新弱点
近日，德国的生物信息学家通过计算机模型识别出人体中一种对新冠病毒繁殖至关重要的酶，如果抑制这种酶，病毒就会停止繁殖而不影响宿主细胞。该研究有助于找到对抗新冠病毒感染的新方法。 除了疫苗，寻找有效的治疗新冠病毒感染的药物也是战胜疫情的重要手段之一。现在，来自德国感染研究中心和蒂宾根大学的德尔格
生物信息学应用：序列分析，电子克隆等初探
生物信息学可指利用信息技术管理和分析生物学数据。这就意味着生物信息学所涉及的范围相当广泛，从人工智能、机器人一直到基因组(genome)分析。就基因组分析这一角度来看，生物信息学主要是指核酸和蛋白质序列数据的计算机处理和分析。近年来，蛋白质结构数据的快速增长，使蛋白质三维结构的处理分析也归入到生物信
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临挑战 2003年4月人类基因组图谱基本绘制完成，但对基因的调节与功能问题仍未能解读。由于基因的功能主要是通过其编码的蛋白质来实现，蛋白质才是生命活动真正的执行者，所以越来越多的科学家致力于蛋白质的研究，试图找出人类疾病的致病机理，最终解决人类
安捷伦科技将生物信息学系统扩展为综合生物学套装
2010年 11 月 15 日，北京 — 安捷伦科技公司（纽约证交所：A）今日发布了，这是广泛使用的生物信息学软件的扩展版，能够对多种类型的生物学数据进行可视化和分析。目前 GeneSpring GX 11.5 是首款可同时对外显子芯片、蛋白组学和代谢组学实验进行解读的软件，该工具
生物信息学技术分离蛋白质组的介绍
生物信息学在生命科学研究中起着越来越重要的作用。利用生物信息学对蛋白质组的各种数据进行处理和分析，也是蛋白质组研究的重要内容。生物信息学是蛋白质组学研究中不可缺少的一部分。生物信息学的发展，已不仅是单纯的对基因组、蛋白质组数据的分析，而且可以对已知的或新的基因产物进行全面分析。在蛋白质组数据库中
生物信息学数据库和软件的搜索实验
实验方法原理熟练掌握上网搜索生物信息学数据库和软件的方法及技能。实验材料电脑实验步骤一、搜索生物信息学数据库或者软件数据库是生物信息学的主要内容，各种数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域。核酸序列数据库有GenBank， EMBL， DDB等，蛋白质序列数据库有SWISS-PROT， PIR，OWL，
不被熟知的血型系统
MNS血型系统 MNS是继ABO血型之后，第二个被发现的血型系统。ISBT命名为MNS，数字序列002，目前已经确认的抗原有46个。 （一）基因及生化特征 MNS基因位于4号染色体，是两个紧密连锁的基因，即GYPA基因和GYPB基因，编码GPA和GPB。GYPA基因有7个外显子，G
基因组蛋白质组与生物信息学报进入国际同学科领域Q1区
中科院32种SCI收录期刊进入国际同学科排名Q1区——《基因组蛋白质组与生物信息学报》等今年获得首个影响因子即进入国际同学科领域Q1区。 近日，科睿唯安2017年SCI期刊引证报告（Journal Citation Reports，JCR）正式公布。中国科学院SCI收录期刊增加至81种，占全国
临床精准医疗必须重视的新兴科学：临床生物信息学
由世界最大出版社“施普林格-自然”2016年出版的“临床生物信息学的应用”在短短几个月被下载近万次，引起国际同行的广泛重视和密切关注。该书融临床信息学、医学信息学、遗传信息学、生物信息学和系统生物学为一体，详细和系统地阐述了基因组学、蛋白组学、基因测序、基因表观学、代谢组学、计算机数学、大数据
生物信息学mapping率高或低代表什么意思
生物信息学高度依赖于网络。实际上，你需要的几乎所有资源，都可以从网上下到。你需要关注你研究领域所需要的那些，而不是全部的资源。我原来常用的：NCBI：持有INSDC的节点。网站上有核酸、蛋白、基因名、基因组名等等的搜索工具，以及BLAST序列比对搜索工具，PUBMED文献数据库，Taxonomy数据
《GPB》2013推出iPSC专刊周琪邓宏魁等发文
2013年第5期Genomics, Proteomics & Bioinformatics(GPB)出版了Induced Pluripotent Stem Cells(iPSCs，诱导性多功能干细胞)专刊，由中国科学院动物研究所周琪博士担任Guest editor。2006年，Yam
2021年度“中国生物信息学十大进展”公布
为推动我国生物信息学的学科发展和创新研究，充分展示和宣传我国生物信息学领域的重大研究成果，《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 简称GPB)组织评选了2018年度、2019年度和2020年度“中国生物信息学十大进展
新的生物信息学工具，可以分析CRISPR合并的筛选数据
由贝勒医学院的研究人员领导的团队开发了一种新的生物信息学工具，可以分析CRISPR合并的筛选数据，并以比其他现有方法更高的灵敏度和准确度确定潜在相关基因的候选基因。新的基于网络的分析工具也更快，更友好，因为它不需要生物信息学培训来使用它。该研究发表在《Genome Research》杂志上。
《Nature－Biotechnology》：新型生物信息学工具使转录组形象化
目前，日本RIKEN生命科学技术中心开发出一种免费可用的新型生物信息工具——ZENBU，可让研究人员快速轻松地对大规模下一代测序实验中产生的大量基因组信息，进行整合、形象化和比较分析。 下一代测序(Next-generation sequencing)技术已经彻底改变了功能基因组学，例
采用生物信息学和实验方法联合分析转录组信息
The wealth of transcript information that has been made publicly available in recent years requires the development of high-throughput functional geno
Nature－Genetics：细胞重编程迎来革命性生物信息学工具
Duke-NUS医学院、Bristol大学、Monash大学和RIKEN的研究团队开发了一个革命性的计算工具，能够准确预测将一种人类细胞转变为另一种类型所需的细胞因子。这项研究发表在一月十八日Nature Genetics杂志上，对细胞重编程和再生医学的进一步发展有重要意义。 我们知道，特定的
陈润生院士等获颁中国生物信息学终身成就奖
9月27日，第九届全国生物信息学与系统生物学学术大会在上海开幕。在为期2天半的会议期间，来自全国各地的700余名专家学者代表，将围绕“新冠病毒研究与转化医学信息学”“单细胞组学分析方法与应用”“人工智能与生物信息学”和“脑科学与生物信息学”等生物信息学诸多传统与新兴领域进行研讨与交流。 中国科
通过整合生物信息学与实验分析解析子宫内膜异位症关键基因及免疫细胞浸润特征
子宫内膜异位症（Endometriosis，EM）是育龄女性中常见的妇科疾病，如同 “隐藏在身体里的神秘幽灵”，困扰着众多女性。它以子宫内膜组织出现在子宫腔外，尤其是盆腔器官为特征，发病率约为 10%-15%。患有 EM 的女性，常遭受痛经、盆腔疼痛、月经紊乱、不孕甚至性交困难等痛苦，同时卵巢肿瘤风
院士专家共议：生物信息学的下一个十年
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503634.shtm“十年来，数学、计算机与生命科学交叉领域发生了显著的变化，如今伴随着大模型、人工智能等给我们提出了巨大挑战，也到了学科必须‘交叉’的时候，这无论对现代科学的发展，还是服务国家战略需求，
“生物信息学基础信息整编”项目实施方案论证会在沪举行
“生物信息学基础信息整编”项目实施方案论证暨启动会在沪举行 6月2日，国家科技基础性工作专项重点项目“生物信息学基础信息整编”项目实施方案论证暨启动会在上海生科院举行。科技部基础研究司司长张先恩、综合与基础性工作处处长沈建磊，上海市科委施强华副巡视员，中科院计划财务局副局长
基因组所等RNA甲基化表观转录组学研究获进展
2014年1月，中国科学院北京基因组研究所基因组变异与精准生物医学实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组，与中国科学院动物研究所“百人计划”研究员刘峰研究组合作开展的“m6A甲基转移酶复合物鉴定”研究，发现了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
医学信息学学科势必大有作为
近日，由中国医学科学院北京协和医学院主办、中国医学科学院医学信息研究所承办的第二届中国医学信息学学科发展大会在京召开。此次会议以“数字化转型与融合发展”为主题，与会专家从不同角度围绕行业数字化转型展开了精彩纷呈的分享交流，引领了学科创新发展，回应了行业同仁关切，引起了热烈的反响。 面临良好的发
蛋白质组结果一般需要做哪些方面的生物信息学分析？
目前一般文献中的分析主要为维恩图分析、热图分析、火山图分析、层次聚类分析、蛋白质功能分析（GO分类为主）、蛋白质所属代谢通路富集分析（基于KEGG的pathway）、差异蛋白互作网络构建、转录因子预测等方面。其它一些比较特异的高级分析包括多组数据关联分析、多pathway延伸分析、磷酸蛋白激酶预测分
智能医学时代，医学信息学科如何发展？
“生物技术（BT）与信息技术（IT）作为21世纪的两大热门技术领域，融合发展相互促进，已成为新一轮产业变革的重要驱动力。医学信息学作为‘医学-卫生-健康’的赋能之术，在‘促、防、诊、控、治、康’六个方面和‘语、药、械、食、居、环’六种方法中发挥着重要作用。”近日，在第四届中国医学信息学学科发展大会上
转基因生物的概念
“转基因生物”一词的最初来源是英语“Transgenic Organisms”，因为在上世纪70年代，重组脱氧核糖核酸技术（rDNA）刚开始应用于动植物育种的时候，常规的做法是将外源目的基因转入生物体内，使其得到表达，因而在早期的英语文献中，这种移植了外源基因的生物被形象地称为“transgenic
转基因生物的发展
随着分子生物技术的不断发展，尤其是上世纪90年代末以来，科学家们能够在不导入外源基因的情况下，通过对生物体本身遗传物质的加工、敲除、屏蔽等方法也能改变生物体的遗传特性，获得人们希望得到的性状。 在此类情形下，没有转入外源基因，严格说就不能再称为转基因，称为“基因修饰”更加合适和全面，因此现在开
转基因生物的种类
应用转基因技术培育的转基因生物已多达上百种，它们中有的用于生产医药类的疫苗、生物制剂；有的用于生产食品工业中的纤维素酶、凝乳酶；有的用于消除环境污染；还有许多转基因生物在农业生产中发挥了重要作用。
《生物制药基因学》：吸烟可“开关”基因
刊登在最新一期《生物制药基因学》杂志上的一份研究报告显示，吸烟者身体健康会因吸烟受到“永久性损害”。路透社9月30日援引这份研究报告说，吸烟可“开启”一些有害基因或“关闭”一些有益基因，且戒烟后这些基因的不正常状态数年内不能得到修复。这解释了戒烟者肺癌发病率仍居高不下的原因。 加拿大不列颠哥伦比亚癌
首届中国医学信息学学科发展大会召开
全国医学信息学学科发展联盟成立揭牌仪式。（主办方供图） 11月27日~28日，由中国医学科学院北京协和医学院主办、中国医学科学院医学信息研究所承办的首届中国医学信息学学科发展大会在北京召开。大会以“深度交叉融合，信息赋能健康”为主题，紧扣健康中国、数字中国发展战略，聚焦医学信息学学科发展，