遗传发育所参与的番茄基因组成果2012年最受关注
由“番茄基因组研究国际协作组”(中科院遗传与发育生物学研究所研究员李传友、薛勇彪、程祝宽、左建儒、凌宏清组成的团队负责第3号染色体测序工作)完成的番茄基因组研究成果被美国《科学家》杂志评为2012年最受科学家关注的基因组。 《科学家》杂志对该成果评述如下:“经过14个国家的科学家们9年的不懈努力,全世界第一套番茄基因组序列(栽培品种Heinz)于今年5月正式公布。对于番茄的近缘物种(如马铃薯,茄子,烟草和辣椒)来说,这套番茄基因组序列究竟能给研究者们带来什么样的信息是人们期待已久的。例如,同样是近期正式公布的马铃薯全基因组序列与番茄全基因组序列有着92%的相似性。现在科学家们就可以开始研究这8%的基因组序列差异是如何使得番茄能够在地上部分结出美味的果实,而马铃薯却在地下部分产生块茎。此外,科学家们通过系统地分析番茄的基因组序列,发现番茄基因组曾经历过两次三倍化的复制过程,一次发生在大约一亿三千万年前,另一次则发生在六千......阅读全文
马铃薯基因组序列框架图全球发布
中国科学家的创新性思路助推测序工作提前完成 9月23日,由14国科学家组成的“国际马铃薯基因组测序协作组”分别在北京、阿姆斯特丹、伦敦、纽约、利马等地同时宣布了马铃薯基因组序列框架图的完成。此次公布的马铃薯基因“蓝图”绘制工作的中国参与单位主要来自中国农业科学院蔬菜花卉所和深圳华大基因研究院。
我科学家主导完成马铃薯基因组测序
7月15日,中国农业科学院公布,经过6年努力,由14个国家97名研究人员组成的“马铃薯基因组测序国际协作组”日前完成了马铃薯基因组测序。由中方团队主导的这项研究,奠定了中国在这一研究领域的领先地位。 7月14日,国际权威学术期刊《自然》以封面文章的形式发表了马铃薯全基因组序列
马铃薯单倍型DM基因组全序列完成图组装成功
中国农业科学院蔬菜花卉研究所马铃薯遗传育种与栽培创新团队和蔬菜分子设计育种创新团队,对马铃薯单倍型DM的基因组进行了全序列组装,获得了包含24个端粒和12个着丝粒完整序列的马铃薯单倍型DM的端粒到端粒(T2T)的基因组完成图(DM8.1),并在之前马铃薯基因组未能完整组装的高度重复序列区域中,发现了
科学家破译“纯种马”基因组序列
马有90多种遗传疾病与人类的遗传疾病相似 一个国际科研小组11月5日报告说,他们破译了“纯种马”的基因组序列。这项研究成果将刊登在6日出版的新一期《科学》杂志上。 报告中所指的“纯种马”最早是300多年前英国培育的一种名贵赛马品种,后被一些欧美和亚洲国家引进,主要用于赛马和马
科学家完成辣椒全基因组序列测定
由我国科技人员主导完成的“栽培种和野生种辣椒的全基因组测序揭示辣椒属的驯化与特异性”研究论文,今年3月在国际著名期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)刊发。该论文的正式发表,标志着辣椒基因组序列成功解码,我国辣椒基础性研究取得重大进展,进入分子育种阶段。 美国农艺学会主席、新墨西哥州立大学
我国科学家开发高效基因组序列分析工具
人类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异,往往由DNA序列变化造成,这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是通过比对大量人群的遗传信息,利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学
我国科学家开发高效基因组序列分析工具
类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异,往往由DNA序列变化造成,这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是通过比对大量人群的遗传信息,利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学的
我国科学家绘制出毛白杨基因组序列框架图
我国林木基因组学研究取得突破。北京林业大学的科学家们选用百年古树作为测序的样本,利用最新的全基因组鸟枪法测序和拼接策略,绘制完成了毛白杨的基因组序列图谱,标志着毛白杨分子育种进入基因组时代。 在“985”平台建设资金支持下,北林大林木育种国家工程实验室的专家们用短短的6个月完成了这一
我国科学家完成鲤鱼全基因组序列图谱绘制
近日,由中国水产科学研究院首席科学家孙效文牵头,中国水产科学研究院联合黑龙江水产研究所、中科院基因组研究所、哈佛大学、奥本大学等单位组建的国际合作研究团队,完成了鲤鱼全基因组序列图谱绘制,在国际上首个完成全面解析的异源四倍体硬骨鱼类基因组图谱。该研究成果于9月21日在国际生物学权威期刊《自然—
我国科学家绘制完成鲤鱼全基因组序列图谱
鲤科鱼类是我国最重要的水产养殖种类,年产量占我国淡水养殖总产量的70%以上,其中鲤鱼不仅是我国也是世界性的重要养殖鱼类。5月6日,中国“鲤鱼基因组计划”学术报告会暨新闻发布会在京举行。由中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心、黑龙江水产研究所和中科院北京基因组研究所共同实施
基因组研究揭示欧洲马铃薯进化史
近日,来自德国、秘鲁、英国和西班牙的一个国际研究团队,对大量的马铃薯品种进行了测序,以了解更多关于现代欧洲马铃薯的历史。在他们6月24日发表在Nature Ecology and Evolution上的论文中,该团队描述了他们对马铃薯历史的研究以及新发现。 过去的研究表明,马铃薯是在17世纪被
解析现代月季基因组序列
科学家研究现代月季基因。图片来源:monticelloshop.org 近日,法国农业科学研究院、里昂大学、法国国家科学研究中心的研究人员解密了现代月季的基因组序列。现代月季拥有独特的颜色与香味,广受称赞,这项研究帮助人们从分子角度了解这背后的基因和代谢流程。4月30日,相关论文在线刊登于《自然
基因组序列草图的概念
中文名称基因组序列草图英文名称draft genome sequence定 义已测定序列占到90%以上、测序精度在1%的基因组序列图。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
科学家公布恶性疟原虫大批量基因组序列
近期《自然—遗传学》公布了大量采集的恶性疟原虫的基因测序结果。疟原虫是导致疟疾产生的病因所在,这项研究结果有助我们更好地了解疟原虫为对青篙素这种近期在东南亚流行的抗疟疾首选药物产生抗药性而发生的进化过程。 Dominic Kwiatkowski等人从西非和东南亚的10个地区的825个近
遗传发育所参与的番茄基因组成果2012年最受关注
由“番茄基因组研究国际协作组”(中科院遗传与发育生物学研究所研究员李传友、薛勇彪、程祝宽、左建儒、凌宏清组成的团队负责第3号染色体测序工作)完成的番茄基因组研究成果被美国《科学家》杂志评为2012年最受科学家关注的基因组。 《科学家》杂志对该成果评述如下:“经过14个国家的科学家们9年的不
科学家利用基因组序列设计新药--精确性瞄准致癌RNA
报道,来自美国弗罗里达大学斯克里普斯研究所(TSRI)的科学家称,他们开发出一种很有潜力的通用方法,可通过基因组序列来设计新药,并利用这种方法识别出一种高效化合物,其能让癌细胞攻击自身并最终死亡。相关论文在线发表于2月9日的《自然·化学生物学》。 “这还是第一次只凭借一个RNA序列,就理性
概述酿酒酵母的基因组序列
1996年6月,在国际互联网的公共数据库中公布了酿酒酵母的完整基因组顺序,它被称为遗传学上的里程碑。因为首先,这是人们第一次获得真核生物基因组的完整核苷酸序列;其次,这是人们第一次获得一种易于操作的实验生物系统的完整基因组。 [10] 在酿酒酵母测序计划开始之前,人们通过传统的遗传学方法已确定
首次测定玉米蛇基因组序列
在现有的5000种哺乳动物中,有超过100种已经进行了基因组测序,但是,只有9种爬行动物(在10000个物种当中)的基因组对科学界来说是可用的。最近,瑞士日内瓦大学(UNIGE)的一个研究小组,构建了一个大的数据库,其中就包括一种爬行动物——玉米蛇的新基因组测序,这种蛇越来越多地被用来了解爬行动
科学家绘制完成世界首张大熊猫基因组序列图谱
新华网深圳10月11日电 题:科学家绘制完成世界首张大熊猫基因组序列图谱 新华社记者 彭勇 中国科学家11日在深圳宣布:世界首张大熊猫基因组序列图谱绘制完成。科学家们说,它将为保护和人工繁育这个被称为“中国国宝”的濒危物种提供新的途径,以及推进针对大熊猫的其他科学研究。
科学家构建出目前最高质量的植物基因组参考序列
随着PacBio单分子实时(SMRT)测序技术的发展,利用它已能够独立完成高质量基因组草图的组装。然而,这些草图序列中仍然存在多种错误,比如序列中会包含有很多嵌合体(即不同位置的序列连接到了一起)或是组装质量比较差的区域等,特别是重复序列区域有的没有组装出来,有的组装出来多个序列,而且这些错误通
我国科学家完成大黄鱼全基因组序列图谱绘制
浙江省科技厅、上海市科委30日在浙江省舟山市共同宣布,来自浙江海洋学院、复旦大学、上海交通大学等院所的科学家已绘制完成大黄鱼的全基因组测序、组装和序列图谱。 据介绍,这是我国科学家完成的第二个鱼类基因组序列图谱,也是世界上首个石首鱼科鱼类基因组序列图谱。 大黄鱼属硬骨鱼
中外科学家首次成功测序马铃薯
马铃薯是世界上最重要的非谷物粮食作物,如今科学家终于开始对它们有了更多的了解。 中国科学家与来自美国、英国等国家的研究人员在7月10日的《自然》杂志网络版上报告说,他们已经完成了第一个高品质的马铃薯基因组测序工作,揭示了能够帮助种植者培育出具有更佳抵御疾病与虫害能力的品种的关
胡萝卜基因组序列草图成功绘出
来自美国的一个研究小组称,他们完成了对30余种胡萝卜样品的测序,绘制出了胡萝卜基因组序列草图。这很可能是迄今最完整的蔬菜基因组序列草图。研究人员称,这一研究阐明了胡萝卜的起源和演化过程,对改善胡萝卜和其他农作物的营养价值提供了可能。相关论文在线发表在《自然·遗传学》杂志网站上。 胡萝卜和生菜
新软件按需组装无缝基因组序列
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日报北京2月16日电 (记者张梦然)美国国立卫生研究院研究人员发布了一种创新的软件工具,用于组装来自各种物种的真正完整(即无缝)的基因组序列。这种名为Verkko的软件在芬兰
白菜甘蓝油菜全基因组序列测定
由中国科学家领衔的白菜、甘蓝和油菜全基因组测序项目取得阶段性重大成果,获得了白菜全基因组的精细图,甘蓝和油菜全基因组的框架图。 研究表明,白菜、甘蓝和油菜的基因组大小分别约为5亿、6.5亿和11亿个碱基对,白菜和甘蓝含有的基因总数目分别约4.2万和4.5万个,油菜基因覆盖度85%以上。该
-震惊!Genbank参考基因组序列多处错误!
震惊!Genbank参考基因组序列多处错误! 随着基因组测序技术的飞速发展以及测序成本的快速降低,全基因组数据也在急速增加。尽管参考基因组数据是非常有价值的资源,但是由于测序过程中的外源污染或者研究者对数据组装方法的误用,使得基因组数据面临很多问题。 近日,约翰霍
马铃薯琼脂
成分 马铃薯(去皮切块) 200g 琼脂 20g 蒸馏水 1000mL制法 同马铃薯葡萄糖琼脂。 用途 鉴定霉菌用。
《Genome-Research》:根据基因组序列预测MRSA毒性
微生物毒力一直是一个复杂的多因素表型,与病原体的进化轨迹有着复杂的关联。毒性,破坏宿主细胞膜和粘附的能力,粘附到人体组织的能力,是许多细菌病原体的主要毒力因子,包括金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。 金黄色葡萄球菌是临床上常见的毒性较强的细菌,自从上世纪40
草鱼全基因组序列图谱绘制完成
近日,记者从中国科学院水生生物研究所获悉,该所鱼类功能基因组学学科组负责的草鱼全基因组序列图谱绘制完成。该成果由水生生物研究所、中国科学院国家基因研究中心和中山大学等机构合作完成,相关研究成果于5月4日在线发表于《自然—遗传学》杂志。 据该所研究员汪亚平介绍,该研究采用鸟枪法测序策略,分别对一
史上最全小麦基因组序列图集问世
据最新一期《自然》杂志报道,加拿大萨斯喀彻温大学领导的国际团队在一项对全球小麦生产具有里程碑意义的研究——10+基因组计划中,对代表全球育种计划的15个小麦品种的基因组进行了测序。这将使科学家和育种人员能够更快地识别出具有影响力的基因,从而提高小麦产量、害虫抗性和其他重要的农作物性状。 小麦