打破“数据孤岛”,推动组学资源管理自立自强

今年1月,依托中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)(以下简称基因组所)的国家基因组科学数据中心(NGDC)有10篇论文集中亮相国际生物数据库期刊《核酸研究》。对于这样一本顶级期刊来说,这种情况并不多见。一个刚6岁的数据中心何以取得这样的成绩?近日,《中国科学报》走进基因组所了解NGDC成长背后的秘密。面向国家需要,追赶国际步伐NGDC可追溯至2016年2月基因组所成立的生命与健康大数据中心。它的成立既是对接国家需求,也是研究所自身发展的需要。长期以来,全世界科学家产生的组学数据都要提交给三大数据库——美国国立生物技术信息中心(NCBI)、欧洲生物信息学研究所(EBI)、日本核酸数据库(DDBJ)。这三家于上世纪八九十年代成立的机构在2005年建立了国际核酸序列共享联盟(INSDC),形成领域内数据存储和共享使用的标准。这使得我国科学家发表论文时需要通过互联网将数据提交到这些数据库,而做科研时需要使用的数据又要从这些数据......阅读全文

2025蛋白质组学大会之基于蛋白质组学的精准检验医学

2025年10月14日上午10点10分在广州白云国际会议中心国际会堂珠水厅,第12届 AOHUPO 大会暨第8届AOAPO大会暨π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“Proteomics-Driven Precision Laboratory Medicine”分论坛顺利

基因组学做不了的事-蛋白质组学更精准打击癌症

近日,国际人类蛋白质组组织公布了2020年度权威奖励获奖名单,中国科学院院士、军事科学院军事医学研究院研究员贺福初荣获蛋白质组学杰出成就奖。 贺福初院士率先提出人类蛋白质组计划的科学目标与技术路线,倡导并领衔了人类第一个关于组织、器官的蛋白质组计划,揭示了人体首个器官(肝脏)蛋白质组。2014年

蛋白质组与蛋白质组学简介1

一、蛋白质组概念:一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表

蛋白质组与蛋白质组学简介2

3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合,然后将DNA从被修饰的碱基处切割,电泳分离,结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰,不能切断,可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白

中国人类遗传资源管理办公室开展人类遗传资源管理调研

   为加强现阶段人类遗传资源管理工作,进一步完善《人类遗传资源管理条例(送审稿)》(以下简称《条例》),中国人类遗传资源管理办公室于2014年7月8-9日在上海进行了人类遗传资源管理工作专题调研。调研小组由科技部社发司、生物中心,教育部科技司,海关总署监管司相关工作人员及有关专家组成。   调研小

“遗传学+连接组学”,推动精神疾病客观诊疗

近日,北京邮电大学人工智能学院与荷兰阿姆斯特丹自由大学、德国明斯特大学研究者合作,基于多组学医学大数据,揭示了脑连接组和精神分裂症及双相情感障碍拥有的共同的遗传因素,发现两种疾病的遗传因素对宏观脑连接组的构成起着重要作用。 这是对精神疾病病理机制研究的又一重要发现,有望推动精神疾病迈向基于多组学

综述:基于质谱技术的糖蛋白质组学与糖组学研究进展

   糖是组成生命体的四大类重要分子之一,糖蛋白质是由糖链与肽链中的特定氨基酸残基以糖苷键共价连接而成的蛋白质。糖蛋白质普遍存在于生物体内,在很多生命过程中起着重要作用,如蛋白质的折叠、细胞之间的相互识别、炎症反应等。同时,糖基化修饰在疾病中,特别是肿瘤的发生、发展和转移过程中也起到重要作用,许多疾

美印药物基因组学与癌症基因组学检测商业化

美国Companiondx实验室拟与健康信息技术服务商Enable Healthcare合作,向医生推广药物基因组学检测;印度癌症医学公司HCG宣布建立一个新的肿瘤基因中心,旨在下代测序技术能够帮助定位肿瘤,从而提高化疗和放疗的效率和响应率  美国药物基因组学检测商业化  Companiondx实验

整合基因组和组织学信息-基因组学公司联手开拓新前沿

  10x Genomics公司宣布收购位于瑞典斯德哥尔摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空间基因组学(spatial genomics)领域的领先公司。空间基因组学是一个新兴领域,它不但让研究人员可以获得单细胞内的基因组数据

安捷伦举办芯片液相色谱及蛋白质组学/代谢组学用户交流会

  疾病蛋白质组学重庆市市级重点实验室第二届学术委员会研讨会   暨安捷伦第一届芯片液相色谱及蛋白质组学/代谢组学用户交流会成功举办   2007年秋,为了开发建立一套全新理念的,与临床研究紧密联结的整体化蛋白质组学研究平台,以实现科研及早期临床诊断、新药开发及个体化医疗的需求,安捷伦科技和西南

2025蛋白质组学大会之聚焦计算与人工智能蛋白质组学

  2025年10月14日上午,计算与人工智能蛋白质组学(Computational and AI Proteomics)专题分论坛顺利召开。本场会议由本领域学者谢鹭教授、温翰教授、迟浩教授、曾文锋教授、Yasset Perez-Riverol教授共同召集和组织。来自海内外的多位知名学者围绕该领域的

“空间定位组学”和“4D组学”建起科学研究与疾病治疗的桥梁

  分析测试百科网讯 布鲁克一直以MALDI技术闻名全球,并已在成像领域占据领导地位;自去年推出timsTOF Pro创新组学系统后,在深度覆盖和高通量蛋白质组学分析中取得了突破性的进展,并且迅速和国内院校和企业开展了一系列深度的合作。比如timsTOF系列,已和北京大学、清华大学、复旦大学、厦门大

北京基因组所生命组学数据资源建设获进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为The BIG Data Center: from deposition to integration to translation 的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。该研究成

蛋白质组学之逆袭,深度注释基因组

  申请课题缺创新点?撰写论文没思路?急着毕业时间紧?别怕,对于吉凯,一切都是套路!更有甚者,对于宇宙终极难题:“屌丝如何逆袭白富美?”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。   从前,在生物学研究领域,有一个白富美叫基因组学(Genomics),她有一项强大的技能:DNA测序,凭借这项技能,她完

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

2025蛋白质组学大会之蛋白质组动态

  2025年10月14日14点在广州白云国际会议中心国际会堂珠水厅,第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会暨π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“Proteome Dynamics”分论坛顺利拉开帷幕。本论坛由中国科学院大连化学物理研究所张丽华研究员、南京大学刘

2025蛋白质组学大会之体液蛋白质组

  2025年10月14日,由AOHUPO, AOAPO, π-HuB和CNHUPO四会联办的体液蛋白质组分论坛在广州成功举办。来自北京师范大学、复旦大学、南方医科大学中国医学科学院基础医学研究所、深圳湾实验室、首都医科大学附属北京地坛医院、北京青莲百奥生物科技有限公司、香港科技大学、Nationa

2025蛋白质组学大会之农业蛋白质组

  2025年10月14日10:10-12:10,由AOHUPO, AOAPO, π-HuB和CNHUPO四会联办的农业蛋白质组分论坛在广州成功举办。论坛由CNHUPO植物蛋白质组工作组和中国遗传学会农业蛋白质组分会负责召集。来自日本福井工业大学、美国密西西比大学、奥地利维也纳大学、武汉大学、中国科

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

蛋白质组学质谱分析

Proteomics Primer1. Proteomics2. 2-D PAGE3. Immobilised pH gradients (IPGs)4. Mass spectrometry5. Principles of mass spectrometry6. Matrix assisted la

实质等同性(转录组学)实验

实验材料小麦试剂、试剂盒β-巯基乙醇氯仿异戊醇SSTE 缓冲液仪器、耗材SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤3.1 芯片背景我们使用了 19846 个点,包含 9246 个 Unigene 序列的小麦 cDNA 芯片(http://www . cerealsdb. uk. net/index. htm

定量蛋白质组学的诞生

  在现代研究技术,如荧光显微镜,流式细胞仪和蛋白质芯片技术中,抗体仍然扮演着非常重要的角色。但依赖于抗体的蛋白质检测存在一些缺点,其中最大的限制就是,抗体的可用性和质量差别很大。一些大规模项目,比如人类蛋白质图谱(Human Protein Atlas),Antibodypedia,以及美国NIH

Nature技术:解决组学研究大问题

  METLIN是由美国Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak开发出的新型数据库,将能用于解决代谢组学等领域研究中关于数据处理这个大问题。   在过去十年间,代谢组学 metabolomics 已成为最新“-omic(组学)”(继基因组学和蛋白质组

Science专题:癌症基因组学

  在2001年完成人类基因组测序后,许多的研究人员立即将目光放到了利用这些信息来更好地了解遗传学上。最近,越来越多的研究确定了表观遗传学在癌症的发生、形成及发展过程中起效应。从鉴别与遗传性癌症相关的单基因变异的前基因组时代转向,测序技术的进步使得研究人员能够利用全基因组方法来检测基因组间的差异,以

蛋白质组学的研究内容

主要有两方面,一是结构蛋白质组学,二是功能蛋白质组学。其研究前沿大致分为三个方面:  ①针对有关基因组或转录组数据库的生物体或组织细胞,建立其蛋白质组或亚蛋白质组及其蛋白质组连锁群,即组成性蛋白质组学。  ②以重要生命过程或人类重大疾病为对象,进行重要生理病理体系或过程的局部蛋白质组或比较蛋白质组学

蛋白质组学入门问题集锦

  1 . HPLC 灵敏度不够的主要原因及解决办法   样品量不足:解决办法为增加样品量   样品未从柱子中流出:可根据样品的化学性质改变流动相或柱子   样品与检测器不匹配:根据样品化学性质调整波长或改换检测器   检测器衰减太多:调整衰减即可。   检测器时间常数太大:解决

实质等同性(代谢组学)实验

实验材料SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒[ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤本章描述的方法最适合于分析小麦精白面,但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织,如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前,如其他任何田间试验或温室

实质等同性(转录组学)实验

实验材料:小麦  试剂、试剂盒:β-巯基乙醇                                                                  氯仿                                                            

代谢组学全流程解决方案

赛默飞基于其超高分辨的静电场轨道阱(Orbitrap)质谱平台结合其功能强大的软件平台,提供代谢组学全流程解决方案。该方案不仅覆盖从极性代谢物到非极性代谢物的全面检测、峰提取与定量、统计学分析与可视化作图、代谢产物的全面鉴定、代谢通路分析等全流程的要求,而且还整合了从非靶标生物标记物发现到靶标生物标

空间转录组学研究案例简析

01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1]影响因子:11.878发表时间:2018.06发表期刊:Nat Commun肿瘤内异质性是当今癌症治疗中最大的挑战之一。在这里,研究人员使用空间转录组学(ST)技术研究整个多灶性前列腺癌的全组织基因表达异质性。利用一种新的去卷积方法,分析12个区域的近6