基因组稳定性驱动的低氧适应研究中取得进展
近期,中国科学院昆明动物研究所研究员赵博团队等在Journal of Experimental & Clinical Cancer Research上发表了题为RETSAT associates with DDX39B to promote fork restarting and resistance to gemcitabine based chemotherapy in pancreatic ductal adenocarcinoma的研究论文,报道了RETSAT基因在基因组稳定性维持和低氧耐受中的功能和机制。 基因组稳定性的维持以氧作为必要条件,特别是在极端低氧(氧浓度低于1%)条件下,HIF信号通路显著下调DNA损伤反应(DNA Damage Response,DDR)核心组分的表达,引起DNA复制和修复效率降低,造成DNA损伤累积和基因组不稳定,细胞被动地进入凋亡或衰老。然而,一些特例值得关注。例如,高原......阅读全文
基因组稳定性驱动的低氧适应研究中取得进展
近期,中国科学院昆明动物研究所研究员赵博团队等在Journal of Experimental & Clinical Cancer Research上发表了题为RETSAT associates with DDX39B to promote fork restarting and resista
Cell:精子保持基因组稳定性的秘密
纽约大学Langone医学中心的研究人员近日在Cell上发表了一篇题为"Widespread Transcriptional Scanning in the Testis Modulates Gene Evolution Rates"的研究,揭示了广泛的转录扫描如何调控睾丸中的基因表达和进化。
Nature子刊:基因组测序揭示脑瘤驱动基因
通过大规模基因组测序,来自Dana-Farber癌症研究所和Broad研究所的科学家们揭示了两个DNA突变,其似乎驱动了15%的脑膜瘤。这一研究发现有可能促成针对这类肿瘤的第一个有效药物治疗。 脑膜瘤是一种形成于脑膜及脑膜间隙,生长缓慢的肿瘤,通常为良性。但当脑膜瘤长到极大时,可导致癫痫发
协同创新驱动农业基因组学发展
“作为生物技术领域最基础的学科,农业基因组学研究不仅需要国内外科学家同行的协同创新,更需要与生物技术产业发展需求无缝衔接,才能发挥出农业基因组学的最大潜能。基于这种认识,在国家农业科技创新联盟的框架下,建立农业基因组学的协同创新联盟就显得十分迫切。”中国农科院科技局局长梅旭荣表示。 7月24
植食性昆虫群落时空稳定性驱动因素被揭示
近日,中国科学院成都生物研究所副研究员王明强以BEF-China样地连续6年(2017–2022)观测的鳞翅目幼虫为研究对象,联合多位研究人员,揭示了中国亚热带森林植食性昆虫群落时空稳定性驱动因素,为揭示气候变化背景下森林昆虫群落波动及害虫暴发的生态机制提供了重要证据。相关成果发表在《生态学论丛
研究发现生长信号与基因组稳定性有关
中科院生化与细胞所研究员高大明团队在生长信号对基因组稳定性调控方面取得重要进展,相关研究成果近日在线发表于《自然—细胞生物学》。 生物个体基因组完整性的维持得益于细胞内完善的DNA修复机制。研究表明,机体营养过剩或者生长信号的过度活化与基因组不稳定性和肿瘤发生密切相关,但具体的分子机制一直不
揭示eccDNA新功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排
在刚刚过去不到一个月的时间,染色体外环状DNA(eccDNA)重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊,这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖,吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增,极大地促进肿瘤
北京基因组所等揭示OGlcNAc维持基因组稳定性的分子机制
DNA总是受到内源或外源环境中多种损伤因子的攻击,例如DNA复制错误、细胞代谢产物、电离辐射、紫外线照射和化疗试剂等,这些因素都会引起DNA损伤的产生。如果不能够及时有效修复DNA损伤,将导致基因组不稳定性,进而诱发多种人类疾病,如肿瘤、神经退行和出生缺陷。为维持基因组稳定性,生物体进化出一套保
如何使用-geNorm-软件评估多内参基因组合的稳定性?
使用 geNorm 软件评估多内参基因组合的稳定性,一般按照以下步骤进行:准备数据:首先,您需要从实验中获得多个内参基因在不同样本中的定量 PCR 数据,通常是以 Ct 值(循环阈值)的形式。数据输入:打开 geNorm 软件,将准备好的数据按照软件要求的格式输入。软件分析:软件会计算每个内参基因的
Nature-Genetics-揭示eccDNA功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排
在刚刚过去不到一个月的时间,染色体外环状DNA(eccDNA)重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊,这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖,吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增,极大地促进肿瘤
Nature-Genetics揭示eccDNA新功能—驱动神经母细胞瘤基因组重..
1. 神经母细胞瘤eccDNA整体统计研究人员联合eccDNA-seq和RNA-seq(云序生物提供此服务)技术,与开创性的生物信息学算法相结合,首次在神经母细胞瘤(一种主要发生在儿童的致命肿瘤)中进行详细的环状DNA序列分析。本研究中分析了93名儿童的神经母细胞瘤组织样本,结果显示,每个组织样本平
大模型驱动的基因组环形可视化生成研究获进展
近日,中国科学院计算机网络信息中心科研团队研发出大模型驱动的基因组环形可视化智能生成框架AuraGenome。AuraGenome突破“人工-脚本-静态”传统范式,开创“自然语言-智能体-交互”新模式,能够将基因组数据快速转化为高质量、可交互的可视化结果,并支持全流程的可追溯与复用。在急性髓系白血病
研究发现调控基因组稳定性的新的细胞质因子
中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员王涛团队在国家自然科学基金区域创新发展联合基金的资助下,研究发现了参与脱氧核糖核酸损伤修复及维持基因组稳定性的一个新的定位在细胞质中的因子YIPF2。相关成果近日发表于《细胞与生物科学》(Cell & Bioscience)。YIPF2通过调控HR修复与脱氧核
研究发现调控基因组稳定性的新的细胞质因子
中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员王涛团队在国家自然科学基金区域创新发展联合基金的资助下,研究发现了参与脱氧核糖核酸损伤修复及维持基因组稳定性的一个新的定位在细胞质中的因子YIPF2。相关成果近日发表于《细胞与生物科学》(Cell & Bioscience)。YIPF2通过调控HR修复与脱氧核
有哪些其他软件可以评估多内参基因组合的稳定性?
以下是一些可以评估多内参基因组合稳定性的其他软件:NormFinder:能够同时考虑组内和组间变异,评估单个内参基因和多个内参基因组合的稳定性。BestKeeper:通过分析基因的标准差、变异系数和相关系数等参数来评估内参基因的稳定性。RefFinder:综合了上述几种软件(如 geNorm、Nor
华南植物园揭示锥属物种基因组变异的驱动机制
遗传变异的形成与维持机制是进化生物学研究的重要议题。已有研究表明,不同物种间的基因组变异模式存在一定的相似性,并受到多种进化力量的影响。然而,关于不同进化机制对相似基因组变异景观形成的贡献以及不同机制间复杂的互作模式尚不清楚。此外,已有研究多是基于近期快速辐射产生的物种或者少量分化时间较长的物种对,
科学家揭示人类基因组古病毒复活驱动衰老
病毒与人类之间的协同进化关系源远流长,二者之间的交锋从未随时间停止过。在这场旷日持久的战争中,一方面,病毒使人类饱受疾病困扰,甚至死亡,并在此过程中对人类基因组不断地利用与改造;另一方面,人类的免疫系统会积极对抗病毒的入侵,使得整合到人类基因组中的病毒序列逐渐被宿主细胞的遗传调控系统接管,协同进
研究团队在干细胞基因组稳定性调控机制研究中取得进展
干细胞是机体发育和组织稳态维持的基础,基因组稳定是干细胞干性维持和再生医学应用的前提。研究干细胞如何维持基因组稳定,有助于推动干细胞的安全应用和理解相关发育疾病的致病机理。中国科学院昆明动物研究所研究员郑萍团队长期关注干细胞维持基因组稳定性的独特机制。前期工作中,该研究团队鉴定胚胎干细胞基因组稳
哺乳动物调控DNA复制起始以维持基因组稳定性的机理
DNA是主要的遗传物质,也是中心法则的源头。DNA代谢包括DNA复制、转录及DNA修复等。其中,DNA复制保证了遗传信息精确完整地传递,而转录则是细胞身份维持和功能调控的关键。DNA复制发生在整个染色质上,而转录则只发生在染色质上的转录区。如果这两个关键的细胞过程碰撞,犹如独木桥上狮虎相遇,会发
“基因组学+脑科学”双轮驱动,红杉中国医疗加速器启用
11月17日,“红杉中国智能医疗加速器”在上海张江正式宣布启用。上海市人民政府副秘书长陈鸣波、浦东新区区长杭迎伟、上海市经济和信息化委员会副主任张英、上海推进科技创新中心建设办公室专职副主任侯劲、上海市浦东新区副区长吴强、红杉中国创始及执行合伙人沈南鹏以及来自科研、产业、医疗机构的多位专家共同见证了
微流控芯片驱动磁驱动泵
采用磁激发的泵(magnetic-actuated pump) 即磁驱动泵(magnetically-driven pump ,MDP) 也是一种重要的微流体驱动控制技术—磁流控技术。磁流控技术与光驱动泵一样,一般需要在被驱动流体中添加亲磁性纳米粒子介质,实现对流体的有效控制。磁流体驱动泵的优缺点优
因美纳推出5碱基解决方案以驱动多组学发现,开启基因组与表观基因组的同步洞察
• 在美国人类遗传学会(ASHG)年会上,因美纳5碱基解决方案的早期试用客户——伦敦健康科学中心研究所将展示该技术在加速罕见病病例解析方面的强大潜力。 • 因美纳专有的5碱基化学技术与全新DRAGEN算法助力双组学分析,为科研人员带来驱动精准医疗突破的全新工具。 美国加利福尼亚州圣迭戈—
遗传发育所在细胞凋亡及基因组稳定性研究中取得新进展
基因组稳定性对于真核生物的正常生长发育以及增殖是必不可少的前提条件。然而,在生存过程中,生物体基因组由于经常受到一些内在和外在因素的影响,造成各种形式的DNA损伤。为了保持基因组的稳定性,真核生物中已经形成了一种在进化上高度保守的机制,来修复应对各种DNA损伤。当DNA损伤严重到无法正确修复时,
有哪些方法可以评估多内参基因组合的稳定性和适用性?
以下是一些评估多内参基因组合稳定性和适用性的方法:利用统计学软件: 如 geNorm、NormFinder 等软件,这些软件不仅可以评估单个内参基因的稳定性,还可以分析多个内参基因组合的稳定性。它们通过计算相关指标来确定最优的内参基因组合。比较不同组合在不同样本中的变异系数(CV):计算多个内参基因
OGlcNAc糖基化修饰维持基因组稳定性的分子机制揭示
DNA总是受到内源或外源环境中多种损伤因子的攻击。O-GlcNAc糖基化修饰调控Polη与复制叉解离的分子机制示意图 DNA总是受到内源或外源环境中多种损伤因子的攻击,例如DNA复制错误、细胞代谢产物、电离辐射、紫外线照射和化疗试剂等,这些因素都会引起DNA损伤的产生。如果不能够及时有效修复D
动态稳定性和暂态稳定性区别
1.电力系统稳定性 电力系统稳定性可分为静态稳定、暂态稳定和动态稳定。 (1)电力系统静态稳定是指电力系统受到小干扰后,不发生非周期性的失步,自动恢复到起始运行状态的能力。 (2)电力系统暂态稳定指的是电力系统受到大干扰后,各发电机保持同步运行并过渡到新的或恢得到原来稳定运行状态的能力,通常指第一或
《分子细胞生物学报》出版“基因组不稳定性与癌症”专刊
《分子细胞生物学报》(JMCB)刚出版的2011年第一期,是由本刊副主编之一,美国新泽西癌症研究所沈智渊教授所组织的综述专刊,主题是“基因组不稳定性与癌症”。由于基因组不稳定性和癌症之间存在着复杂的关系,因此本专刊涵盖了DNA复制、DNA损伤反应和修复几个方面,并列举了它们在
KHDC3L维持早期胚胎基因组稳定性的功能和突变致病机制
10月14日,PLOS Biology 以KHDC3L mutation causes recurrent pregnancy loss by inducing genomic instability of human early embryonic cells 为题,在线发表了中国科学院昆明动
同济大学Cell-Rep:一种因子能提高iPS细胞基因组稳定性
来自同济大学生命科学与技术学院的研究人员利用年轻和年老组小鼠的皮肤细胞诱导成iPS细胞系,发现年老组iPS细胞的基因组稳定性下降,NHEJ修复能力下降,但HR修复能力不变。研究表明对于提高年老组iPS细胞基因组稳定性,重编程起始时联合运用OSKM和Sirt6将是一个有效可行的方法。这一研究将为利
我国学者在造血干祖细胞基因组稳定性的机制研究方面取得进展
图 胚胎肝细胞通过分泌Fetuin-A蛋白维持造血干祖细胞基因组的稳定性 在国家自然科学基金项目(批准号:81920108005、U23A20417、81730007、31872842、91442106)等资助下,上海交通大学医学院洪登礼教授研究团队,在揭示胚胎发育组织维持干细胞基因组稳定性及其疾