聚合酶35外切酶活性──校对作用的介绍
这种酶活性的主要功能是从3'→5'方向识别和切除不配对的DNA生长链末端的核苷酸。当反应体系中没有反应底物dNTP时,由于没有聚合作用而出现暂时的游离现象,从而被3'→5'外切酶活性所降解。如果提高反应体系的温度可以促进这种作用,这表明温度升高使DNA生长链3'末端与模板发生分离的机会更多,因而降解作用加强。当向反应体系加入dNTP,而且只加放与模板互补的上述核苷酸才会使这种外切酶活性受到抑制,并继续进行DNA的合成。由此推论,3'→5'外切酶活性的主要功能是校对作用,当加入的核苷酸与模板不互补而游离时则被3'→5'外切酶切除,以便重新在这个位置上聚合对应的核苷酸。在某些T4噬菌体突变株中DNA复制的真实性降低,而易发生突变,从此突变株分离得到的聚合酶的3'→5'外切酶活性很低。相反,另外一些具有抗突变能力的T4突变株中的聚合酶的3......阅读全文
DNA聚合酶及其应用
(一)大肠杆菌DNA聚合酶I是Kornberg A. 1956年首先从大肠杆菌E。Coli 细胞中分离出来的。它是一种多功能性的酶,包括 3种不同的酶活力:5′→ 3′聚合酶活性(模板, 带3′-OH游离基团的引物、4dNTPs、 Mg2+ )。双链特异性的5'→3'核酸外切酶活性。
PCR技术(三):Taq-DNA聚合酶
Taq DNA聚合酶是从一种水生栖热菌(Thermusaquaticus)yT1株分离提取的.yT是 一种嗜热真菌,能在70~75℃生长.该菌是1969年从美国黄石国家森林公园火山温泉 中分离的.(一)酶活性与热稳定性 该酶基因全长2496个碱基,编码832个氨基酸,酶蛋白分子为 94KDa.其比
DNA聚合酶的定义
真核细胞有5种DNA聚合酶,分别为DNA聚合酶α(定位于胞核,参与复制引发,不具有5'-3'外切酶活性及3'-5'外切酶活性,有5'-3'聚合酶活性),β(定位于核内,参与高保真度复制,不具有5'-3'外切酶活性,其中疑似存在5
大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ-Klenow片段实验——修复突出的3’或5‘末端
Klenow酶是大肠杆菌八聚合酶I的羧基端片段,它具有DNA聚合酶和3’到5’方向的外切酶活性,不含5’到3”方向的外切酶活性。实验材料DNA试剂、试剂盒限制性内切酶EDTA仪器、耗材水浴锅实验步骤1. 在20 μl 反应体积中,用限制性内切酶消化0.1~4 μg DNA。2. 加入1 μl 0
DNA聚合酶有什么作用
DNA聚合酶(DNA polymerase)是细胞复制DNA的重要作用酶。DNA聚合酶 , 以DNA为复制模板,从将DNA由5'端点开始复制到3'端的酶。DNA聚合酶的主要活性是催化DNA的合成(在具备模板、引物、dNTP等的情况下)及其相辅的活性。DNA聚合酶的共同特点是:⑴需要提
DNA聚合酶有什么作用
DNA作为遗传物质的基本特点就是能够准确地进行自我复制。在合成DNA时,决定其结构特异性的遗传信息来自其本身,必须由原来存在的DNA分子为模板来合成新的DNA分子。这种以自身DNA为模板,以脱氧核苷酸为底物催化合成新的DNA的酶称为DNA聚合酶。在微生物、植物和动物中都发现有这种酶,而且原核细胞和真
关于T4DNA聚合酶的简介
最近年来在枯草杆菌,鼠伤寒沙门氏杆菌等细胞及噬菌体T4、T5、T7中分离到DNA聚合酶,这里只介绍T4DNA聚合酶。T4DNA聚合酶与大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ相似,也是一条多肽链,分子量亦相近,但 氨基酸组成不同,它至少含有15个半胱氨酸残基。但是,它在作用上与大肠杆菌DNApol不同;[1]它无
聚合酶的分类介绍
可分为以下几个类群:(1)依赖DNA的DNA聚合酶;(2)依赖RNA的DNA聚合酶;(3)依赖DNA的RNA聚合酶;(4)依赖RNA的RNA聚合酶。前两者是DNA聚合酶,它使DNA复制链按模板顺序延长。如在原核生物中仅就大肠杆菌中已被发现的就有三种(分别简称为PolⅠ,PolⅡ和PolⅢ等);D
关于聚合酶的介绍
1957年,美国科学家阿瑟·科恩伯格(Arthur Kornberg)首次在大肠杆菌中发现DNA聚合酶,这种酶被称为DNA聚合酶I(DNA polymerase I,简称:Pol I)。1970年,德国科学家罗尔夫·克尼佩尔斯(Rolf Knippers)发现DNA聚合酶II(Pol II)。随
关于DNA聚合酶的聚合作用的介绍
在引物RNA'-OH末端,以dNTP为底物,按模板DNA上的指令由DNApolⅠ逐个将核苷酸加上去,就是DNApolⅠ的聚合作用。 酶的专一性主要表现为新进入的脱氧核苷酸必须与模板DNA配对时才有 催化作用。dNTP进入结合位点后,可能使酶的 构象发生变化,促进3'-OH与5
可以DNA结合的酶聚合酶
聚合酶:聚合酶是从核苷三磷酸合成多核苷酸链的酶。它们通过向链上存在的先前核苷酸的3'-OH添加核苷酸起作用。因此,所有聚合酶都以5' - 3'方向起作用。DNA复制需要DNA依赖的DNA聚合酶,实现DNA序列的完美拷贝。有些DNA聚合酶具有校对功能,能够检测含氮碱基之间的错配
关于核酸外切酶的简介
有些核酸酶能从DNA或RNA链的一端逐个水解下单核苷酸,所以称为核酸外切酶。只作用于DNA的核酸外切酶称为脱氧核糖核酸外切酶,只作用于RNA的核酸外切酶称为核糖核酸外切酶;也有一些核酸外切酶可以作用于DNA或RNA。核酸外切酶从3′端开始逐个水解核苷酸,称为3′→5′外切酶,例如,蛇毒磷酸二酯酶
结合脱氧核糖核酸DNA的酶的介绍
核酸酶和连接酶:核酸酶是能够切割DNA链的酶,因为它们催化磷酸二酯键的水解。从位于DNA链末端的核苷酸开始水解DNA的核酸酶称为核酸外切酶。另一方面,直接切入DNA链的那些是内切核酸酶。分子生物学中使用最广泛的核酸酶,称为限制性内切酶,以切割特定序列的DNA。在自然界中,这种酶通过在进入细菌细胞
结合DNA的酶
核酸酶和连接酶:核酸酶是能够切割DNA链的酶,因为它们催化磷酸二酯键的水解。从位于DNA链末端的核苷酸开始水解DNA的核酸酶称为核酸外切酶。另一方面,直接切入DNA链的那些是内切核酸酶。分子生物学中使用最广泛的核酸酶,称为限制性内切酶,以切割特定序列的DNA。在自然界中,这种酶通过在进入细菌细胞时消
可以与DNA结合的酶有哪些?
核酸酶和连接酶:核酸酶是能够切割DNA链的酶,因为它们催化磷酸二酯键的水解。从位于DNA链末端的核苷酸开始水解DNA的核酸酶称为核酸外切酶。另一方面,直接切入DNA链的那些是内切核酸酶。分子生物学中使用最广泛的核酸酶,称为限制性内切酶,以切割特定序列的DNA。在自然界中,这种酶通过在进入细菌细胞时消
基因工程的载体和工具酶5
(二)Klenow片段酶Klenow片段是大肠杆菌聚合酶 I 全酶经枯草杆菌蛋白酶处理后产生的大片段酶分子,分子量为76KD 。酶催活性:⑴5’ →3’ 的聚合酶活性 ⑵3’→5’ 的核酸外切酶活性Klenow片段的主要用途(利用5’ →3’ 的聚合酶活性):⑴修补限制性酶消化DNA形成的3
关于工具酶的连接酶的介绍
它是一种封闭DNA链上缺口酶,借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA链的5'-PO4与另一DNA链的3'-OH生成磷酸二酯键。但这两条链必须是与同一条互补链配对结合的(T4DNA连接酶除外),而且必须是两条紧邻DNA链才能被DNA连接酶催化成磷酸二酯键。 连接酶有T4噬菌体
基因操作的工具酶2
(三) DNA连接酶的反应条件影响连接效率的因素有:1. 温度(通常在4-15℃ )2. ATP的浓度(10μM/L - 1mM/L )3. 连接酶浓度(一般平末端大约需1~2U,黏性末端仅需0.1U)4. 反应时间(通常连接过夜)5. 插入片段和载体片段的摩尔比( 1∶1~5∶1)(四)T4 DN
简述聚合酶的聚合作用
在引物RNA'-OH末端,以dNTP为底物,按模板DNA上的指令由DNApolⅠ逐个将核苷酸加上去,就是DNApolⅠ的聚合作用。酶的专一性主要表现为新进入的脱氧核苷酸必须与模板DNA配对时才有催化作用。dNTP进入结合位点后,可能使酶的构象发生变化,促进3'-OH与5'
T4-DNA聚合酶实验
T4 DNA 聚合酶具依赖人为模板的聚合酶活性,同时具有对单链、双链DNA的3’到5’端的外切酶活性,缺少5’到3’端的外切酶活性。实验材料DNA试剂、试剂盒Trish·CldNTPMgCl2BSADTT仪器、耗材水浴锅实验步骤一、50 μl 反应体积:(1)50 mmol/l Tris·Cl,p
DNA聚合酶的相关介绍
可分为以下几个类群: (1)依赖DNA的DNA聚合酶; (2)依赖RNA的DNA聚合酶; (3)依赖DNA的RNA聚合酶; (4)依赖RNA的RNA聚合酶。 前两者是DNA聚合酶,它使DNA复制链按模板顺序延长。如在原核生物中仅就大肠杆菌中已被发现的就有三种(分别简称为P01Ⅰ,P01
RNA聚合酶的基本介绍
RNA聚合酶(RNA polymerase):以一条DNA链或RNA为模板催化由核苷-5′-三磷酸合成RNA的酶。 催化转录的RNA聚合酶是一种由多个蛋白亚基组成的复合酶。如大肠杆菌的 RNA聚合酶有五个亚基组成,其分子量为480000,含有α,β,β’,σ,ω等5种不同的多肽,其中α为两个分
RNA聚合酶的特点介绍
RNA聚合酶催化RNA的合成,其与DNA聚合酶有许多相同的催化特点: ①以DNA为模板; ②催化核苷酸通过聚合反应合成核酸; ③聚合反应是核苷酸形成3’,5’一磷酸二酯键的反应; ④以3’→5’方向阅读模板,5’→3’方向合成核酸; ⑤按照碱基配对原则忠实转录模板序列。
关于聚合酶的分类介绍
可分为以下几个类群: (1)依赖DNA的DNA聚合酶; (2)依赖RNA的DNA聚合酶; (3)依赖DNA的RNA聚合酶; (4)依赖RNA的RNA聚合酶。 前两者是DNA聚合酶,它使DNA复制链按模板顺序延长。如在原核生物中仅就大肠杆菌中已被发现的就有三种(分别简称为PolⅠ,Pol
基因操作的工具酶3
(三)T4 DNA聚合酶 T4DNA聚合酶是从T4噬菌体感染了的大肠杆菌中分离出来的, 1.酶催活性: ⑴5′→3′的聚合酶活性 ⑵3 ′→ 5 ′的核酸外切酶活性。其外切酶活性要比大肠杆菌聚合酶 I 的活性高200倍。比Klenow 片段酶强100~1,00
真核生物的DNA聚合酶的简介
真核生物的DNA聚合酶:真核生物中也具有几种DNA聚合酶,但这些聚合酶都没有3'→5'或5'→3'外切酶活性。其聚合反应机制与原核生物的聚合一样。DNA聚合酶α主要负责合成引物,既能合成前导链的又能合成后随链的,它与引发酶(primase)形成复合体,因其有引发、
实时定量PCR技术综述(原理、荧光标记、TaqMan-Probes和...1
一.实时定量PCR基本原理1.PCR反应动力学右图为PCR反应曲线(横坐标为循环数,纵坐标表征产物量),不同的曲线代表初始模板量不同的 PCR反应。PCR反应的动力学公式为:Cn=C0(1+E)n其中C0和Cn分别为初始模板和n循环的拷贝数,n为循环数,E为扩增效率(0≤E≤1),理想状态下(即每个
酶的活性位点的作用
酶的活性位点通常是蛋白质表面一个能够让底物结合和嵌入的凹陷或裂隙,底物通常通过不同的相互反应结合位点上与现存的氨基酸结合,如:氢键、离子键、范德华力相互作用或偶极-偶极相互作用。例如,底物可能通过氢键结合在丝氨酸残基上,也可通过离子键结合在天冬氨酸残基上,或通过范德华力结合在苯丙氨酸残基上。这些结合
耐热DNA聚合酶的应用介绍
DNA序列测定中应用的耐热DNA聚合酶 1.Promega公司测序级TaqDNA聚合酶 是在TaqDNA聚合酶的基础上对它进行修饰,去除5'-3'外切酶活性,保证测序记过的高度准确性,可产生强度均一的测序条带,背景清晰。 2.Bca Best DNA 聚合酶 从Bacil
DNA重组(DNA-recombination)技术:工具酶
一、限制性内切酶限制性内切酶(restriction endonucleases,RE)是其中最重要的工具酶之一。它是一类核酸水解酶,能识别和切割双链DNA分子中的特定核苷酸序列。(一)命名原则限制性内切酶大多从细菌中发现,根据来源进行命名,限制酶的第一个字母(大写,斜体)为宿主菌的属名,第二、第三