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猕猴桃高密度SNP基因分型芯片研发成功

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首款茶树高密度SNP芯片开发成功

利用茶树高密度SNP芯片发掘茶树重要功能基因。中国农科院供图近日,中国农业科学院茶叶研究所茶树遗传育种团队基于“龙井43”基因组参考序列和茶树重测序数据,开发出一款200K茶树SNP芯片。相关研究成果在《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journal)上发表。该芯片是首款

PYRO测序用于SNP基因分型原理

其实是一种段片段焦磷酸测序技术,在测序引物的引导下,完成段片段(含snp)的测序,从而实现基因分型。缺点:不能检测长片段,对于重复序列没有办法。原理简介1.测序引物与单链,PCR扩增的DNA模板相结合。然后将其与DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶和三磷酸腺苷双磷酸酶,以及底物APS和荧光素一起孵

SNP基因分型(SNP genotyping)的几个常用数据库

做SNP genotyping应该常看的几个database:1. NCBI dbSNP从这里出发可以连到下面几个网站。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=snp2. International HapMap ProjectThe Int

首款鲶鱼高密度SNP芯片的开发

  为了破译鲶鱼抗病性状的遗传机制,改善鲶鱼的养殖,美国奥本大学(Auburn University)的研究人员利用Affymetrix公司的Axiom基因分型技术,开发出第一款高密度的鲶鱼SNP芯片——Catfish 250K SNP array。这项研究成果于近日发表在《BMC Rese

基因芯片与SNP分析

基因芯片技术作为一种新兴的生物技术,近年来得到迅速发展,其应用具有巨大的潜力。单核苷酸多态性(SNP)作为新的遗传标记对基因定位及相关疾病研究的意义亦非常重大。本文主要介绍了DNA 芯片技术的原理和分类、单核苷酸多态性检测方法及DNA 芯片技术在单核苷酸多态性检测方面的应用。生物芯片技术是90

Affymetrix推出AxiommiRNA靶基因分型芯片

  2012年11月6日,来自加利福尼亚州圣克拉拉的消息――Affymetrix公司(纳斯达克代码:AFFX)推出了 Axiom® miRNA靶基因分型芯片,唯一一款可在全基因组范围评估microRNA(miRNA)靶基因位点的高密度基因分型工具。这些新的芯片将实现全面研究,以阐明miRNA调控

Affymetrix推出AxiomBiobank芯片,用于基因分型研究

  2012年11月1日,来自加利福尼亚州圣克拉拉的消息――Affymetrix公司(纳斯达克代码:AFFX)今日宣布推出 Axiom® Biobank 芯片,一种内容灵活且性价比很高的功能生物学方案,能够经济地对大样品集合进行基因分型,如生物样本库、基因组中心及核心实验室筛查的样品。   A

基因分型的新方法被研发

    廉价的基因分型方法对现代基因组学至关重要。在最新这篇论文中,研究人员报道了QUILT,它使用低覆盖率的全基因组序列数据执行二倍体基因型填充。QUILT采用吉布斯采样将读数划分为母本和父本集,并使用大型参考面板促进快速单倍体填充。  研究人员证明了这种划分在许多兆碱基上是准确的,能够实现接近理

SNP检测技术(测序、taqman探针和snp芯片)

snp现有检测技术有主要的3大类别1、测序 主要发现新的snp位点和比较集中的snp位点,如hla区域,但成本较高,工作量大,不适合大样本做疾病关联分析。 2、taqman探针 结果比较可靠,国外文章也大量应用,不过对于国内成本偏高,同类还有snpshot技术,abi和贝克曼

应用SNP芯片测基因组知起源地

  欧洲的历史上充满着战争、入侵和移民,这些因素似乎可以彻底地将不同人种混合在一起。然而,美国和荷兰科学家独立进行的两项最新研究表明,一个欧洲人的基因组信息足以表明他的地理起源,欧洲人的基因地图和地理地图间存在着一种映射关系。相关论文分别发表在《自然》和《当代生物学》杂志上。   领导其中一项