高通量测序技术研究进展介绍

第二代测序技术, 又称新一代测序技术, 是相应于以Sanger 测序法为代表的第一代测序技术而得名。第二代测序中3种主流测序技术分别为依次出现的 Roche/454 焦磷酸测序(2005 年)、Illumina/Solexa 聚合酶合成测序(2006 年)和 ABI/SOLiD 连接酶测序(2007 年)技术。与 Sanger测序相比, 3种新一代测序技术共有的突出特征是, 单次运行(run)产出序列数据量大, 故而又被通称为高通量测序技术。 研究人员以“高通量测序技术在动植物研究领域中的应用”为题,就高通量测序技术应用于动植物基因组学和功能基因组学研究进展进行了系统阐述,并对当前高通量测序技术的现状和热点及未来的发展趋势作了深入剖析和讨论。 这篇文章从多个方面入手,包括全基因组de novo测序、全基因组重测序、简化基因组测序、转录组测序、数字基因表达谱技术、小RNAs 测序、降解组测序和基于测序的......阅读全文

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

高通量测序的意义

  高通量测序技术的诞生可以说是基因组学研究领域一个具有里程碑意义的事件。该技术使得核酸测序的单碱基成本与第一代测序技术相比急剧下降, 以人类基因组测序为例, 上世纪末进行的人类基因组计划花费 30 亿美元解码了人类生命密码, 而第二代测序使得人类基因组测序已进入万(美)元基因组时代。如此低廉的单碱

高通量测序的步骤

当然,首先地提取出您想要测序的东西,比如RNA、DNA 。再就是建库-测序-分析。建库需要将序列片段化、加接头、PCR。不同的业务有细微的差别,比如RNA要先反转录成cDNA等等。然后就是上机测序了!最后就是数据分析了。数据分析分为流程分析(基本分析)和个性分析(根据老师课题分析)。这些以后呢,就是

转录组高通量测序

(第二代高通量测序技术-454)  转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titanium第二代

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

江西省疾控高通量测序技术获突破

  近日,省疾控中心疾检所首次在我省采用高通量测序技术直接从患儿标本中获得病毒全基因组序列,这也意味着我省在不明原因传染病暴发疫情的病原诊断和溯源方面取得重大突破,对于我省传染病防控工作具有重要意义。  据了解,今年5月初,我省宜春市某幼儿园出现以发热、咳嗽为主要症状,并继发肺部感染的聚集性疫情。经

高通量DNA自动测序仪技术指标

  高通量DNA自动测序仪是一种用于信息科学与系统科学领域的分析仪器,于2012年3月15日启用。  技术指标  1.双光速双侧激光和后置超薄CCD检测成像系统  2.内置一体化自动进样器及样品板储器。  3.内置样品板条形码自动识别。  4.100次(9600个样品)运行试剂一次性上机。  5.自

高通量测序的相关介绍

  高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。  名词解释  根据发展历史、影响力、测序原

高通量测序的实验过程

1.样本准备(sample fragmentation)2.文库构建(library preparation)3.测序反应(sequencing reaction)4.数据分析(data analysis)

高通量测序分的原理

对DNA分子进行序列测定。1.对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。2.根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以下几种:大规模平行签名测序(Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony S

简述高通量测序的意义

  高通量测序技术的诞生可以说是基因组学研究领域一个具有里程碑意义的事件。该技术使得核酸测序的单碱基成本与第一代测序技术相比急剧下降, 以人类基因组测序为例, 上世纪末进行的人类基因组计划花费 30 亿美元解码了人类生命密码, 而第二代测序使得人类基因组测序已进入万(美)元基因组时代。如此低廉的单碱

高通量测序的实验过程

1.样本准备(sample fragmentation)2.文库构建(library preparation)3.测序反应(sequencing reaction)4.数据分析(data analysis)

高通量测序发展史

人类基因组计划(human genome project, HGP)  在介绍高通量测序发展之前,需要先为大家介绍一个人类发展史上的一项重要创举——人类基因组计划(human genome project, HGP)。HGP的完成对测序技术的推动作用意义重大。  HGP是由美国科学家于1985年率先

国内首家高通量测序技术创新应用示范中心揭牌

  9月1日,解码(上海)生物医药科技有限公司(以下简称“解码DNA”)和深圳华大智造科技股份有限公司(以下简称“华大智造”)举行合作签约仪式,并正式为国内首家“高通量测序技术创新应用示范中心”揭牌。该中心将基于全球最高日通量的基因测序仪DNBSEQ-T7等国产化测序平台,面向长三角地区的高通量测序

高通量测序技术在无创产前检测中的应用

染色体非整倍体是胎儿出生缺陷最常见病因之一,其中以21-三体综合征、18-三体综合征最为常见,占所有足月妊娠的0.2%~0.3%。对先天性遗传病进行产前筛查和产前诊断是优生优育的重要保证。自1970年以来,针对上述胎儿染色体疾病的产前筛查和产前诊断已逐渐应用到临床上,并在降低出生缺陷方面得到了良好的

关于基因组高通量测序的技术发展介绍

  高通量测序平台(high-throughput_genome_sequence_database)  自从2005年454 Life Sciences公司(2007年该公司被Roche正式收购)推出了454 FLX焦磷酸测序平台(454 FLX pyrosequencing platform)以

第三代高通量测序技术简介——纳米孔

    第一代Sanger法为DNA测序打开了大门,但它高昂的费用限制了在大规模测序工程上的使用。当今发展迅猛的第二代高通量测序设备,包括Illumina的Solexa、Roche 454系列以及ABI的SOLiD系统等,使测序费用大幅降低到60-1美元/megabase。 它们共同的缺点是

Roche-454(GS-FLX-Titanium-System)超高通量测序技术原理

Roche 454(GS FLX Titanium System)超高通量测序技术原理2005年底,454公司推出了革命性的基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Sequencer 20 System,被《Nature》杂志以里程碑事件报道,开创了边合成边测序的先河。2007

高通量测序数据分析

  1. 是不是一定要用大型计算机?  除了序列拼接组装以外,其它分析不是一定要大型计算机,在普通的PC上也可以进行一些处理,当然,买一台或几台高性能的工作站电脑,能显著加快数据处理的速度。  2. 是不是一定要用Linux系统?  也不一定非用Linux不可,在Window下可以完成部分数据处理。

高通量测序的应用及前景

一、高通量测序的应用 高通量测序可以帮助研究者跨过文库构建这一实验步骤,避免了亚克隆过程中引入的偏差。 依靠后期强大的生物信息学分析能力,对照一个参比基因组(reference genome)高通量测序技术可以非常轻松完成基因组重测序(re-sequence),2007年van Orsouw

llumina高通量测序平台的应用

  Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收

高通量测序(NGS)的原理简介

高通量测序(High-Throughput Sequencing)又名下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS),是相对于传统的桑格测序(Sanger Sequencing)而言的。目前高通量测序的主要平台代表有罗氏公司(Roche)的454测序仪(Roch

关于高通量测序的基本介绍

  高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology),或大规模平行测序(Massively parallel sequencing,MPS)。区别于传统Sanger(双脱氧法)测

llumina高通量测序平台的应用

  Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收

第二代高通量测序仪基因检测技术介绍

基因检测不像衣食住行,在人们的潜意识中归属于非生活必需品,因此国内大众消费群体对基因检测的认知程度很长一段时间处于低级水平。但随着测序技术的飞速发展,基因检测也逐渐被国人所知;人们意识到基因检测可以做到疾病病因与预防,并且随着科技发展人们即将迎来精准医疗大时代。基因组革命从1869年米歇尔发现核素开

创新ctDNA高通量测序技术让临床不再“盲人摸象”

  安可济(AccuraGen)公司联合创始人兼科研总监赵奇志(Grace Zhao)博士  在3月6日-11日举行的旧金山分子医学三方会议(The Molecular Medicine Tri-Conference)上,安可济(AccuraGen)公司的联合创始人兼科研总监赵奇志(Grace Zh

技术赋能基因测序新趋势,华大智造DNBSEQG400高通量测序仪

  华大智造,这个在基因测序领域一直以创新引领潮流的企业,近日再次证明了其在该领域的领先地位,发布了其最新产品——DNBSEQ-G400高通量测序仪。这款创新型基因测序设备以其卓越的性能和突破性的技术,为基因测序领域带来了新的发展趋势。  DNBSEQ-G400高通量测序仪的突出亮点在于其无与伦比的

高通量测序-锁定病原体“命门”

  病原体能使人类群体性致病甚至致死,为追本溯源,找到变异基因作为有效靶点,科学家们在迎战埃博拉病毒的过程中取得突破。  《科学》杂志的历史上,刊载过一篇沉重的学术文章。2014年一篇关于通过基因组学手段监测埃博拉病毒的起源和传播的论文,在刊登时已有6名研究人员因感染埃博拉而死亡。  “对埃博拉病毒

关于高通量测序的内容简介

  高通量测序已经成为一种常规的实验技术,不过最近新一代测序技术的显著优势,比如大规模平行信号(MPSS, Brenner et al.2000)和焦磷酸测序法(也称454测序; Margulies et al.2005, Langaee and ronaghi2005)已经使测序技术发生了彻底的变

基因组高通量测序的原理

测序方案建立在双脱氧测序法(Sanger等,1977)的基础上。为了从每一克隆插入片段两端成对地进行测序,每一个质粒模板DNA板应配备两个384孔循环测序反应板。测序反应采用Big Dye Terminator chemistry version 3.1(AppliedBiosystems)和标准M