RNA酶保护实验(RNaseProtectionAssay,RPA)简介

简介:RNA酶保护试验(RNase Protection Assay,RPA)是通过液相杂交的方式,用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。1. 原理:双链RNA(杂交的)能够抵抗RNA酶的降解。2. 应用:检测RNA表达3. 与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优点:(1) 检测灵敏度比Northern杂交高。由于Northern杂交步骤中转膜和洗膜都将造成样品和探针的损失,使灵敏度下降,而RPA将所有杂交体系进行电泳,故损失小,提高了灵敏度。(2)由于PCR扩增过程中效率不均一和反应“平台”问题,基于PCR产物量进行分析所得数据的可靠性将下降,而RPA没有扩增过程,因此,分析的数据真实性较高。(3)由于与反义RNA探针杂交的样品RNA仅为该RNA分子的部分片段,因此,部分降解的RNA样品仍可进行分析。(4)步骤较少,耗时短。与Northern杂交相比,省去了转膜和洗膜的过程。(5)RNA-R......阅读全文

RPA(重组酶聚合酶扩增)技术原理及RPA与LAMP对比

英国TwistDx公司(前身为ASM科技有限公司)成立于1999年,基于英国剑桥Babraham研究院建立的生物技术公司。该公司通过突破等温DNA扩增,开发的重组酶聚合酶扩增ZL技术(RPA),被誉为DNA诊断领域的革命性创新。(http://www.twistdx.co.uk)          

核酸酶保护分析的方法特点和应用

中文名称核酸酶保护分析英文名称nuclease protection assay定  义当核酸(DNA、RNA)中某段序列能与其他核酸(DNA、RNA)形成互补结合或与某种蛋白特异结合后,核酸酶(如S1核酸酶)就只能降解反应系统中未结合的核酸,留下被结合的核酸段落可以定性或定量检测出来的方法。此法可

核酸酶保护实验

实验材料核酸酶试剂、试剂盒ATPCTPGTPMUTPEDTANaCl甲酰胺Tris-HClRNase ARNase T1RNasinDTTUTPT7RNA聚合酶DNaseⅠ饱和酚氯仿酵母tRNANaAc无水乙醇SDS蛋白酶K异丙醇丙烯酰胺亚甲双丙烯酰胺TBE尿素过硫酸胺TEMED仪器、耗材低温离心机

核酸酶保护实验

实验材料 核酸酶试剂、试剂盒 ATPCTPGTPMUTPEDTANaCl甲酰胺Tris-HClRNase ARNase T1RNasinDTTUTPT7RNA聚合酶DNaseⅠ饱和酚氯仿酵母tRNANaAc无水乙醇SDS蛋白酶K异丙醇丙烯酰胺亚甲双丙烯酰胺TBE尿素过硫酸胺TEMED仪器、耗材 低温

核酸酶保护实验

            实验材料 核酸酶 试剂、试剂盒 ATP CTP GTP MUTP

关于RNA酶保护试验的个人体会

RNA酶保护试验实际上是很早就出现的技术。在1982年出版的第一版圣经(分子克隆)还没有提到。在1989年出版的第二版中已经出现:7.71 Mapping of RNA with Ribonuclease and Radiolabeled RNA(可参见中译本P383-387)。在2001年出版的第

DMS保护分析的方法用途

中文名称DMS保护分析英文名称dimethyl sulfate protection assay;DMS protection assay定  义与DNA酶足迹法类似的技术,但不用DNA酶来分解未被蛋白质结合保护的DNA部分,而是用硫酸二甲酯(DMS)来使未受保护的DNA甲基化,DNA可以在甲基化位

荧光素酶检测(Luciferase-assay)

Introduction Luciferase can be used as a reporter gene to measure the activity of promoters, and/or the transfection efficiency. Aims You will be prov

核酸检测的一场革命,可替代PCR的犀利技术

  自PCR技术诞生以来已经有三十年了。从经典PCR、实时定量PCR再到现在的数字PCR,这一技术在不断蜕变却从未淡出我们的视野。  英国TwistDx Inc公司开发的重组酶聚合酶扩增(Recombinase Polymerase Amplification,RPA),被称为是可以替代PCR的核酸

Chemotaxis-Assay趋化性实验

Springer Lab,The CBR Institute for Biomedical Research, Inc. Department of Pathology Harvard Medical Schoolhttp://cbr.med.harvard.edu/investigators/sp

twistDx-的重组酶聚合酶扩增(RPA)技术原理

twistDx 的重组酶聚合酶扩增(RPA)将彻底改变在资源有限的现场环境中扩增和检测核酸的能力。RPA 技术原理RPA 体系的重点是重组酶,这些酶与寡核苷酸引物形成复合体,并使引物与双链 DNA 中的同源序列配对。单链 DNA 结合(SSB)蛋白与被取代的 DNA 链结合,并使形成的 D 环保

韩春雨沉默6年突破PCR平台系统,它具备这些独特性能

  Argonaute 蛋白的特点是高效的指导 DNA/RNA 定向结合目标核酸。  2022年2月22日,河北科技大学韩春雨团队在预印版bioRxiv 在线发表未经同行评审的题为“Introducing an argonaute-facilitated PCR platform”的研究论文,该研究

RNase-inhibitors-and-RNases

Question  1.What are the differences among RNase H, RNase A, RNase B and RNase C?2.In your cDNA kits, RNase H is added in the second strand reaction t

用RNase-Ⅲ-消化长片断双链RNA制备siRNA的方法特点

其他制备siRNA的方法的缺陷是需要设计和检验多个siRNA序列以便找到一个有效的siRNA。而用这种方法——制备一份混合有各种siRNAs “混合鸡尾酒” 就可以避免这个缺陷。选择通常是200—1000碱基的靶mRNA模版,用体外转录的方法制备长片断双链dsRNA ,然后用RNase Ⅲ (or

用RNase-Ⅲ-消化长片断双链RNA制备siRNA的技术特点

其他制备siRNA的方法的缺陷是需要设计和检验多个siRNA序列以便找到一个有效的siRNA。而用这种方法——制备一份混合有各种siRNAs “混合鸡尾酒” 就可以避免这个缺陷。选择通常是200—1000碱基的靶mRNA模版,用体外转录的方法制备长片断双链dsRNA ,然后用RNase Ⅲ (or

关于RNA聚合酶的参与过程简介

  该酶需要四种核糖核苷酸三磷酸(NTP:ATP、GTP、CTP、UTP)作为RNA聚合酶的底物,DNA为模板,二价金属离子Mg2+、Mn2+是该酶的必需辅因子。其催化的反应表示为:(NMP)n+NTP→(NMP)n+1+PPi。RNA链的合成方向也是5’→3',第一个核苷酸带有3个磷酸基。

沉淀-σ32-和-RNA-聚合酶实验

试剂、试剂盒 聚乙烯亚胺 仪器、耗材 SDS-PAGE 电泳装置聚丙烯酰胺小胶 实验步骤 材料与设备 SDS-PAGE 电泳装置 聚丙烯酰胺小胶(10%) 试剂 聚乙烯亚胺(PEI)(6% 储液,pH7.9) (配方,见“试剂的配制”,pp.184~18

沉淀-σ32-和-RNA-聚合酶实验

试剂、试剂盒 聚乙烯亚胺仪器、耗材 SDS-PAGE 电泳装置聚丙烯酰胺小胶实验步骤 材料与设备SDS-PAGE 电泳装置聚丙烯酰胺小胶(10%)试剂聚乙烯亚胺(PEI)(6% 储液,pH7.9)(配方,见“试剂的配制”,pp.184~189)操作程序1)0.2%DOC 上清 (见 p.153)

沉淀-σ32-和-RNA-聚合酶实验

            试剂、试剂盒 聚乙烯亚胺 仪器、耗材 SDS-PAGE 电泳装置 聚丙烯酰胺小胶

RPA技术原理与RPA产品形态简述

  回顾2019年,RPA机器人流程自动化行业迎来了一个快速发展的机遇。RPA创业者得到了国内投资人的认可,一些RPA公司也接连拿到千万美金级别的融资,这在当下遇冷的资本市场环境下显得格外耀眼。  眼下,RPA已在金融、财会、电信、能源、制造、物流等行业领域生根发芽。当下的RPA技术可以替代各行业企

BioTNT-mRNA-引物筛选,引物定制或specific-primers的使用说明1

BioTNT mRNA 引物筛选,引物定制或specific primers的使用说明版本号:20100001BioTNT qPCR Primer Assay for specific mRNA genes目录号:SER-PCR –编号(500T);说明书 Part A 一、产品简介:本试剂盒是基于

荧光素酶实验(luciferase-assay)通常变化多少倍才算明显

Dual-Luciferase®Reporter Assay System E1910Dual-Luciferase® Reporter (DLR™) Assay System (Dual-Luciferase® 双萤光素酶报告基因检测系统) 为双报告基因检测提供有效的手段。 在DLR™ 检测中,萤

古老的RNase-III抗病毒防御系统有望引发RNA治疗变革

  尽管人类主要依赖更加复杂的更加强大的抗病毒防御系统,但是早期的生命形式在十亿年前形成的让它们自己抵抗病毒感染的原始防御系统仍然能够在人细胞中发现到。如果科学家们能够设计出有益的病毒,让这些病毒利用这种古老的系统直接运送药物到患病组织中,那么这种系统尽管比较简单,但可能成为下一个精准医疗时代的基础

在抽提RNA时,有色素污染,怎样去除色

用Trizol法沉淀RNA容易有一些杂质的。部分色素是会和RNA一起沉下来。这种情况可以用75%冷的乙醇多洗几遍。对后续qRT-PCR多数情况下没什么影响。另外可以用硅胶柱法纯化RNA,色素残留会少一些。RNase 污染的10大来源1:手指头 – 手指头是外源酶的第一来源,所以必需戴手套并且频繁更换

RNase-and-DEPC-Treatment:-Fact-or-Laboratory-Myth

Researchers are usually trained in RNA isolation and analysis methods by one another or by technical manuals. Experimental procedures are often not qu

DNA酶保护分析的方法用途

中文名称DNA酶保护分析英文名称DNase protection assay定  义主要用来检测染色质结构与功能状态的方法。当染色质结构致密,DNA被组蛋白压缩很紧时,基因是不表达的,同时也对DNA酶不敏感。反之,结构蓬松、活跃进行基因表达的染色质,则易遭DNA酶的降解。应用学科生物化学与分子生物学

RNAse-A-Treatment-of-Mouse-Cells

IntroductionRNAse A treatment of permeabilized cells followed by immunostaining is a method which allows to show if the localization of a protein into

核糖核酸酶T1的基本信息介绍

  核糖核酸酶T1(RNase T1)来源于米曲霉(Aspergillus orjzae),它特异地作用于鸟嘌呤3’端磷酸,切割位点在鸟嘌呤的3’磷酸和相邻核苷酸的5‘羟基之问的磷酸二酯键,反应终产物为3’鸟苷酸和末端带3’鸟苷酸的寡核苷酸片段。RNaseTl的反应条件极广,且极难失活,其催化活性类

肿瘤细胞侵袭实验(Tumour-Invasion-Assay)

实验方法原理 Matrigel 是从小鼠EHS肉瘤中提取的基质成分,含有LN、IV型胶原、接触蛋白和肝素硫酸多糖,铺在无聚乙烯吡硌烷酮的聚碳酸酯滤膜上,能在DMEM培养基中重建形成膜结构,这种膜结构与天然基质膜结构极为相似。 滤膜孔径一般为8um,而且膜孔都被Matrigel覆盖,细胞不能自由穿过,

Realtime-PCR实验注意事项(防RNA酶污染和常用RNA酶抑制...2

[注意] 1、整个操作要带口罩及一次性手套,并尽可能在低温下操作。另外,提取上清这步一定要小心,靠近沉淀的部分一定要舍得不要,要不然会有蛋白质污染,影响比值2、加氯仿前的匀浆液可在-70℃保存一个月以上,RNA沉淀在70%乙醇中可在4℃保存一周,-20℃保存一年。总mRNA的提取(自己的经验)一、关