Science新文章解析癌症表观遗传
目前大多数癌症治疗的效果并不理想。在力图根除肿瘤之时，肿瘤学家们往往借助于放疗或化疗，这使得在遏制癌性生长的同时也导致了健康组织受损。来自洛克菲勒大学C. David Allis实验室的一项新研究，或许可以使科学家们朝着高精确度靶向肿瘤的癌症治疗更近一步。他们的研究结果在线发表在3月28日的《科学》（Science）杂志上。 近期几个国际基因组测序联盟在一系列研究发现中证实，一种突变组蛋白与一种儿童罕见脑干肿瘤（DIPG）存在关联。总的说来，这些研究是科学家们第一次将一种组蛋白突变与一种疾病联系到一起，这引起了Allis染色质生物学和表观遗传学实验室研究助理Peter Lewis的兴趣。 突变发生在组蛋白H3尾部，一个“沉默”相关基因的关键位点，使得一个赖氨酸被甲硫氨酸特异置换。通常情况下，甲基转移酶将一个甲基化学基团添加到H3尾部第27位赖氨酸上时，会发生基因沉默。甲硫氨酸替换赖氨酸使得这种称作甲基化的高度特......阅读全文
大白菜突变体库数据库建立
大白菜属十字花科芸薹属，以结球叶片为食用器官，原产于中国，栽培历史悠久，是我国的重要蔬菜作物之一。大白菜全基因组测序和群体变异组解析已经完成，大量基因等待着农业科学家去诠释其功能。突变体是开展植物功能基因组学研究的重要材料，但小范围获得突变体进行单个基因研究已经不能满足科研和育种的需要。所以，在功能
乙肝筛查需重视HBsAg突变体检测
乙肝表面抗原（HBsAg）是临床上应用最多的HBV感染血清标志物，它是WHO公认的判断HBV感染的关键指标【1】。HBV复制周期快且聚合酶易错配，导致HBV复制过程中突变率非常高。在内源性（宿主免疫清除）和外源性（疫苗、HBIG和抗病毒治疗）选择压力下非常容易选择出新的逃逸突变株。HBsAg突变会造
理化所纳米材料的肿瘤生物学效应研究取得新进展
介孔二氧化硅纳米材料（MSN）可通过降低细胞内的活性氧（ROS）来促进黑色素瘤的生长 在国家科技部“863”项目、“973”项目和国家自然科学基金的大力支持下，中科院理化所纳米材料可控制备与应用研究组，继一月份在《生物材料》（Biomaterials）上发表关于纳米材料的生物学效应
西南大学崔红娟在肿瘤生物学研究领域取得重要进展
家蚕基因组生物学国家重点实验室干细胞与转化研究方向在西南大学崔红娟教授的带领下，以干细胞生物学为依托，近期在肿瘤生物学及其家蚕疾病模型研究等方面取得了一系列最新研究进展。 近日，团队最新研究成果发表在神经肿瘤学领域顶级期刊Neuro-Oncology (IF=7.79) (DOI： 10.10
DLC1－START－域与磷脂酰丝氨酸、PLCD1－和－Caveolin－1－相互作用－DLC1
DLC1是一种肿瘤抑制基因，在许多癌症类型中通过遗传和非遗传机制下调，其编码的蛋白RhoGAP和支架活性有助于其肿瘤抑制功能。DLC1 START（StAR 相关脂质转移；DLC1 START）域的作用，除了与 Caveolin 1 的结合外，还知之甚少。 在其他 START 域中，一个关键功能
DLC1－START－域与磷脂酰丝氨酸、PLCD1－和－Caveolin－1－相互作用－DLC1
DLC1是一种肿瘤抑制基因，在许多癌症类型中通过遗传和非遗传机制下调，其编码的蛋白RhoGAP和支架活性有助于其肿瘤抑制功能。DLC1 START（StAR 相关脂质转移；DLC1 START）域的作用，除了与 Caveolin 1 的结合外，还知之甚少。 在其他 START 域中，一个关键功能
病理学和肿瘤分子生物学家顾健人逝世
9月27日，澎湃新闻记者从上海交通大学医学院附属仁济医院获悉，中国共产党优秀党员，中国工程院院士，中国医学科学院首届学部委员，癌基因与相关基因国家重点实验室创始人，著名病理学和肿瘤分子生物学家，上海交通大学教授、博士研究生导师，上海交通大学医学院附属仁济医院上海市肿瘤研究所名誉所长顾健人同志，因病于
肿瘤免疫检查点抑制剂疗效预测的计算生物学问题
来自同济大学生命科学与技术学院的刘琦教授受邀发表了题为“Towards In Silico Prediction of the Immune-Checkpoint Blockade Response”的文章，系统探讨了肿瘤免疫检查点抑制剂疗效预测的相关计算生物学问题。 这篇综述介绍公布在Cel
深切哀悼！肿瘤分子生物学专家顾健人院士病逝
肿瘤分子生物学专家、中国工程院院士、中国医学科学院首届学部委员、癌基因与相关基因国家重点实验室创始人、著名病理学和肿瘤分子生物学家顾健人于9月27日在上海病逝。 顾健人院士1932年1月13日出生于江苏省吴县一个医学世家。1954年毕业于国立上海医学院，同年入党。1985年创建“癌基因与相关基
昆明植物所在天然产物肿瘤免疫化学生物学研究获进展
自然杀伤（Natural killer，NK）细胞是监控肿瘤早期发生发展的重要免疫细胞类群，细胞表面的活化性受体NKG2D (Natural-killer Group 2 member D)与肿瘤细胞表面的NKG2D配体的相互作用在NK细胞实行肿瘤免疫监视的过程中发挥着重要的功能。NKG2D配体
科技部将通报《肿瘤生物学》撤稿事件调查结果
央视网消息：科技部将于14日下午举行《肿瘤生物学》集中撤稿事件调查处理新闻通气会，这是科技部针对施普林格出版集团对中国的107篇学术论文的撤稿事件的首次回应。(央视记者 李峥) 4月21日，世界学术出版巨头斯普林格出版社(Springer)发布一则撤稿声明。斯普林格宣布撤回旗下医疗期刊《肿瘤生
mRNA测序应用于玉米籽粒dek突变体研究
2017年1月1日遗传学期刊Genetics（影响因子4.6）在线发表了上海大学生命科学学院祁巍巍老师的有关玉米突变体基因克隆与功能分析新文章，题为：Mitochondrial function and maize kernel development requires Dek2, a pen
外切核酸酶－Ⅲ－消化产生多组嵌套缺失突变体
试剂、试剂盒 dNTP 溶液 乙醇 外切核酸酶Ⅲ缓冲液 核酸酶 S1 停止反应混合液 酚 氯仿 醋酸钠 外
外切核酸酶－Ⅲ－消化产生多组嵌套缺失突变体
逐步地从靶 DNA 的一端或另一端删除多个寡核苷酸的嵌套式缺失突变方法被用来确定功能性顺式调控元件的边界，早先曾作为指导 DNA 测序的模板。该方法依赖于核酸酶，这些核酸酶均以可预测的方式消化 DNA, 其中外切核酸酶 HI 是目前最好的。本实验来源于分子克隆实验指南（第三版）下册，作者：〔美〕J.
快速便宜的CRISPR/Cas9突变体筛选方法
新的基因组编辑工具——如ZFNs、TALENs以及最近的CRISPR/Cas9系统，已经大大提高了在不同动物模型中敲除基因的能力，包括斑马鱼。然而，对数量庞大的动物进行筛选，所需的时间和成本，仍然是一个瓶颈。 最近，意大利多恩动物研究所（Stazione zoologica Anton Doh
外切核酸酶－Ⅲ－消化产生多组嵌套缺失突变体
试剂、试剂盒 dNTP 溶液乙醇外切核酸酶Ⅲ缓冲液核酸酶 S1 停止反应混合液酚氯仿醋酸钠外切核酸酶ⅢKlenow 混合物连接混合物核酸酶 S1 反应混合物限制性内切酶凝胶靶 DNA仪器、耗材 微量离心管或带 U-型孔的微量滴定板水浴装置实验步骤 材料缓冲液和溶液贮存液，缓冲液和试剂的成分清参阅附录
mRNA测序应用于玉米籽粒dek突变体研究
2017年1月1日遗传学期刊Genetics（影响因子4.6）在线发表了上海大学生命科学学院祁巍巍老师的有关玉米突变体基因克隆与功能分析新文章，题为：Mitochondrial function and maize kernel development requires Dek2, a pent
遗传发育所脑肿瘤抑制因子调控突触发育研究获进展
神经突触是神经元与其靶细胞之间进行信息交流的特化结构。突触生长过程的精确调控对于神经环路的形成和可塑性至关重要，突触发育和功能的异常导致多种神经精神疾病包括智力低下、自闭症、精神分裂症和神经变性病等。因此，寻找和鉴定突触发育和功能调控基因一直是神经生物学家的重要研究内容之一。 果蝇脑肿瘤基
农林RNA测序助力玉米籽粒Dek10突变体研究
呼吸作用是线粒体最重要的代谢。其中，线粒体中5个和呼吸相关的复合物起到了重要影响。很多呼吸链相关蛋白都是由线粒体基因组编码的。这些RNA会受到细胞核内诸如pentatricopeptide repeat (PPR) 蛋白的转录后修饰。玉米defective kernel 10(dek10) 是一
英国发现新冠病毒突变体传播能力提高70％
人们在英国伦敦圣潘克拉斯火车站等待登上开往法国巴黎的最后一班火车。图片来源：STEFAN ROUSSEAU 一种变异的新冠病毒不仅为英国即将到来的圣诞节蒙上阴影，还将伦敦、英格兰东南部和东部部分地区的新冠疫情防控级别从第三级提升至新增加的第四级。 12月8日，在英国冠状病毒疫情传播例行会议上
自然要览：与自闭症有关的钠通道突变体
基因SCN1A （编码一个由电压门控的钠通道）的“单倍不足”引起Dravet’s综合征，这是一种儿童癫痫症，有时还会有自闭症的一些特征。这项研究发现，有“Scn1a单倍不足”的小鼠也会表现出与自闭症有关的行为，其中包括多动性和社交功能障碍。这些小鼠的GABAergic神经传输降低，通过用“氯硝西泮”
农林RNA测序助力玉米籽粒Dek10突变体研究
呼吸作用是线粒体最重要的代谢。其中，线粒体中5个和呼吸相关的复合物起到了重要影响。很多呼吸链相关蛋白都是由线粒体基因组编码的。这些RNA会受到细胞核内诸如pentatricopeptide repeat (PPR) 蛋白的转录后修饰。玉米defective kernel 10(dek10)
农林RNA测序助力玉米籽粒Dek10突变体研究
呼吸作用是线粒体最重要的代谢。其中，线粒体中5个和呼吸相关的复合物起到了重要影响。很多呼吸链相关蛋白都是由线粒体基因组编码的。这些RNA会受到细胞核内诸如pentatricopeptide repeat (PPR) 蛋白的转录后修饰。玉米defective kernel 10(dek10) 是一
拟南芥sos突变体在盐胁迫下的离子流模式
SOS信号转导途径在植物离子平衡和耐盐中非常重要。SOS模型认为高Na+引起了胞内自由Ca2+的升高，激活了Ca2+结合蛋白编码的SOS3的表达，影响到下游的反应。SOS3激活了相连的SOS2（丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶），SOS2/SOS3复合体调节盐忍耐因子编码的SOS1（质膜Na+/H+反向转运体
mRNA测序应用于玉米籽粒dek突变体研究（一）
2017年1月1日遗传学期刊Genetics（影响因子4.6）在线发表了上海大学生命科学学院祁巍巍老师的有关玉米突变体基因克隆与功能分析新文章，题为：Mitochondrial function and maize kernel development requires Dek2, a pe
mRNA测序应用于玉米籽粒dek突变体研究（二）
dek2是一个保守的线粒体定位蛋白PPR蛋白在植物中广泛存在。研究人员为了确认dek2的进化地位，构建了dek2全长蛋白序列的进化树。结果表明，dek2同源基因广泛存在于被子植物中，而在玉米中没有同源基因（图4）。对dek2的共聚焦显微镜亚细胞定位研究发现，dek2与线粒体marker存在共定位，即
酵母的转化及突变体的透射电镜观察
实验概要本实验制备了酵母感受态细胞，转化细胞在以葡萄糖为碳源的SD培养基中诱导后，对突变体进行了透射电镜观察。主要试剂SD培养基配方:12 g/L NaOH；20 g/L琥珀酸(Succinnic acid )；事先将这两种药品溶解，再加下述药品；1.7 g/L，无硫酸铵的酵母氮源(Yeast Ni
精氨酸甲基化调控细胞凋亡研究
遗传与发育生物学研究所杨崇林实验室以秀丽线虫为模式，探索蛋白质精氨酸甲基化这一重要的蛋白质翻译后修饰方式在调控DNA损伤诱导的细胞凋亡方面的作用机制。 通过研究发现哺乳动物II型蛋白质精氨酸甲基转移酶PRMT5在线虫中的同源物，即线虫的PRMT-5，参与调控DNA损伤引起的细胞凋亡。在prmt-5基
Science揭示癌症表观遗传新机制
在细胞核中，染色体DNA与称作为组蛋白的结构蛋白紧密结合，生物学家们把这种DNA—蛋白质混合物叫做染色质。直到大约20年前，组蛋白都被视作是核“伙伴”，是DNA链环绕的包装物质。而近年来，生物学家们大大增进了对DNA/组蛋白互作支配基因表达机制的理解。 2012年，来自多个研究机构的研究人员
水生所等创制出无肌间刺银鲫突变体
无肌间刺鱼突变体种质的创制是近年来鱼类遗传育种学研究的热点。异育银鲫以其肉质细嫩鲜美深受消费者青睐，但其体内具有的80多根细小的肌间刺给食用者带来了不少麻烦。近两年来，中国科学院院士、中科院水生生物研究所研究员桂建芳团队经全基因组解析揭示银鲫为双三倍体，即包含有两套三倍体基因组，由此开拓完善了在