研究可视化观察增强子和启动子的动态运动控制基因活性
尽管密集地排列在细胞核中，但储存我们遗传信息的染色体总是处于运动状态。这使得染色体的特定区域能够被接触到，从而激活一些基因。在一项新的研究中，来自奥地利科技学院、美国普林斯顿大学和法国巴斯德研究所的研究人员可视化观察这一动态过程，并对DNA的物理特性提出了新的见解。相关研究结果发表在2023年6月30日的Science期刊上，论文标题为“Stochastic motion and transcriptional dynamics of pairs of distal DNA loci on a compacted chromosome”。 进行前沿科学研究需要跳出思维定式，将不同的科学学科结合起来。有时这甚至意味着在正确的时间出现在正确的地点。对于奥地利科技学院博士后研究员David Brückner来说，当他参加普林斯顿大学Thomas Gregor教授的校内讲座时，上述所有事情都发生了。 在这一讲座的启发下，Brüc......阅读全文
启动子分类介绍
①组成型启动子(constitutive promoter)是指在该类启动子控制下，结构基因的表达大体恒定在一定水平上，在不同组织、部位表达水平没有明显差异。使用最广泛的组成型启动子是花椰菜花叶病毒(CaMV)35S 启动子、来自根癌农杆菌Ti 质粒T-DNA 区域的胭脂碱合成酶基因nos 启动子，
爆炸性新闻：垃圾DNA的神秘力量
置身于浩瀚基因组海洋中的遗传控件们需要在恰当的时机被激活，才能玩转复杂的人类生理特征发育。 位于基因前端的启动子序列必须精准地与增强子集团配对。为了成功接轨，遥远的启动子是如何靠近增强子的呢？如果双方配合的时机不对或不同步就容易造成白血病和淋巴瘤等疾病。导致疾病的关键又是什么呢？ 加州大学圣
eRNA与Super－Enhancer－RNA在转录调控中扮演的角色
增强子是真核生物中关键的顺式作用基因调控元件，能有效地促进基因表达。它们可以通过作为转录因子和辅助因子的结合平台来维持转录的精确控制。超级增强子是由一簇典型增强子串联组成的具有更强转录调控能力的顺式元件。而全基因组分析发现增强子和超级增强子可以普遍进行转录，产生eRNA和SE-lncRNA。它们都具
庄小威院士：新成像方法测量染色质的表观遗传修饰
空间组学方法的最新发展使得单细胞转录组分析和三维基因组组织具有较高的空间分辨率。空间分辨单细胞表观基因组学方法将扩展空间组学工具的知识库，加速对细胞和组织功能的空间调节的理解。 2022年10月21日，哈佛大学庄小威团队在Cell 在线发表题为“Spatially resolved epige
分子遗传学词汇增强子
中文名称：增强子外文名称：enhancer定义：增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域，与蛋白质结合之后，基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上游，也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因，这是因为染色质的缠绕结构，使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。
真核生物基因表达的dna水平调控包括什么方式
1、转录起始水平。这一环节是调控的最主要环节，由对基因转录活性的调控来完成，包括基因的空间结构、折叠状态、DNA上的调控序列、与调控因子的相互作用等。a.活化染色质：在真核生物体内，RNApol与启动子的结合受染色质结构的限制，需通过染色质重塑来活化转录。常态下，组蛋白可使DNA链形成核小体结构而抑
Nature子刊：用CRISPR操控表观基因组
杜克大学的研究人员开发出了一种新方法，可以精确地控制基因开启及激活的时间。借助这一新技术研究人员可通过化学操控包装DNA的蛋白，来开启特异的基因启动子和增强子——控制基因活性的基因组片段。 研究人员说，拥有操控表观基因组的能力将有助于他们探究特殊启动子和增强子在细胞命运或遗传病风险中所起的作用
拟南芥超级增强子鉴定与功能验证研究获进展
近日，东北地理所农田有害生物控制学科组孟凡立研究员团队与美国密歇根州立大学（Michigan State University）Jiming Jiang团队和英国约翰英纳斯中心（John Innes Centre）Anne Osbourn团队合作，在国际权威SCI期刊PROCEEDINGS OF
简述顺式作用元件结构增强子的作用原理
增强子的作用原理：一种观点认为，增强子为转录因子提供进入启动子区的位点。另一种认为，增强子能改变染色质的构象。因为增强子区域容易发生从B—DNA到Z—DNA的构象变化。
Nat－Genet：新方法揭示基因“增强子”的工作机理
来自日本理化研究所（RIKEN）综合医学科学中心和肿瘤分子研究所(IFOM)的研究人员与京都大学、卡罗林斯卡研究所和DNAFORM的合作者一起开发出了一种被称为NET-CAGE的新技术，揭示了基因组中被称为增强子的非编码基因的结构，增强子可以激活特定基因的功能。基因组的这些部分曾经被认为是不重要
启动子—基因表达的发动机
众所周知，一段基因从转录开始，最终形成蛋白质执行功能，离不开一个高效、匹配的启动子。启动子的一般结构包括核心启动子元件和上游调控元件。核心启动子元件又包括转录起始点和TATA框，主要作为RNA聚合酶结合并起始转录的位点，上游调控元件能够通过与对应的反式作用因子相结合改变转录的效率，如图1。
启动子阻抑的定义
中文名称启动子阻抑英文名称promoter suppression定 义由于转录抑制因子的作用或甲基化修饰等使启动子活性减弱或丧失。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
翻滚启动子的定义
中文名称翻滚启动子英文名称flip-flop promoter定 义可颠倒的启动子。最早见于沙门氏菌的两种鞭毛蛋白基因的交替表达。这些基因都受一个可以颠倒的DNA片段控制,在一个顺式作用因子的调节下,这个片段从不同的方向驱动不同基因的表达,后来发现奇异变形杆菌的氯霉素抗性基因和珠蛋白基因等基因的表
启动子阻抑的定义
中文名称启动子阻抑英文名称promoter suppression定 义由于转录抑制因子的作用或甲基化修饰等使启动子活性减弱或丧失。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
启动子封堵的定义
中文名称启动子封堵英文名称promoter occlusion定 义上游启动子对下游启动子的阻碍作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
启动子解脱的定义
中文名称启动子解脱英文名称promoter escape定 义发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象,即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离,此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录,但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二
启动子封堵的概念
中文名称启动子封堵英文名称promoter occlusion定 义上游启动子对下游启动子的阻碍作用。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
启动子解脱的定义
中文名称启动子解脱英文名称promoter escape定 义发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象，即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离，此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录，但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二
杂合启动子的定义
中文名称杂合启动子英文名称hybrid promoter定 义由两种或两种以上不同启动子元件融合构成的一个新的启动子。如tac启动子就是将色氨酸启动子Ptrp-35区域与突变的乳糖启动子PlacUV5的-10区域融合构成的杂合启动子，兼具Ptac强启动能力和乳糖启动子可操控特性(受lacI产物的阻
启动子清除的概念
聚合酶转录时，首先结合到启动子上，找到特异结合位点，激活后起始转录。 特异性结合的聚合酶－启动子复合物连接紧密，如果转录要延长需要聚合酶的前进，只有脱离结合的启动子才可以。聚合酶离开结合的启动子以延伸转录产物的过程就叫启动子清除。
克隆启动子的方法
随着基因工程的发展，常常需要构建一种能高水平表达异源蛋白质的表达载体。启动子对外源基因的表达水平影响很大，是基因工程表达载体的重要元件。因此研究启动子的克隆方法，对研究基因表达调控和构建表达载体至关重要。迄今为止，国外尚未见到有关启动子克隆方法的综述性报道，国内仅孙晓红等曾就启动子的结构、分类、克隆
启动子元件的功能
中文名称启动子元件英文名称promoter element定 义启动子中的一些顺式作用序列,可以位于启动子的任何方向和任何位置(上游或下游)。可以被一些转录因子所识别,从而调节启动子的活性。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
启动子清除的定义
聚合酶转录时,首先结合到启动子上,找到特异结合位点,激活后起始转录。 特异性结合的聚合酶-启动子复合物连接紧密,如果转录要延长需要聚合酶的前进,只有脱离结合的启动子才可以。聚合酶离开结合的启动子以延伸转录产物的过程就叫启动子清除。
双向启动子的定义
双向启动子( bidirectional promoter)位于两个相邻且转录方向相反的基因之间 的一段DNA序列。
克隆启动子的方法
随着基因工程的发展，常常需要构建一种能高水平表达异源蛋白质的表达载体。启动子对外源基因的表达水平影响很大，是基因工程表达载体的重要元件。因此研究启动子的克隆方法，对研究基因表达调控和构建表达载体至关重要。迄今为止，国外尚未见到有关启动子克隆方法的综述性报道，国内仅孙晓红等曾就启动子的结构、分类、克隆
启动子的功能介绍
一个启动子是一组DNA序列能使一个基因进行转录。启动子是由RNA聚合酶所确认，并且引发转录。在RNA的合成中，启动子是一种方法区分哪一个基因用作制造mRNA，及进而控制细胞制造哪一种蛋白质。
启动子的基本结构
启动子是一段位于结构基因5'端上游区的DNA序列，能活化RNA聚合酶，使之与模板DNA准确地相结合并具有转录起始的特异性。因为基因的特异性转录取决于酶与启动子能否有效地形成二元复合物，故RNA聚合酶如何有效地找到启动子并与之相结合是转录起始过程中首先要解决的问题。有实验表明，对许多启动子来说
揭秘胚胎发育奥秘！为何发育中胚胎细胞彼此并不相同？
近日，一项刊登在国际杂志Molecular Cell上的研究报告中，来自纽约大学的科学家们通过研究阐明了在胚胎发育（embryogenesis）过程中细胞变得彼此不同的分子机制，相关研究结果或能帮助阐明胚胎发育的遗传规律，同时也能帮助理解疾病发生和出生缺陷的原因。图片来源：commons.wik
NAR：科学家阐明基因调节过程中的关键表观遗传开关机制
2016年10月16日 讯 /生物谷BIOON/ --日前，来自普渡大学的研究人员通过研究阐明了一种关键的表观遗传学机制，其或许是一种关键因子来揭示基因如何被开启和关闭，相关研究刊登于国际杂志Nucleic Acids Research上。遗传学和表观遗传机制都能够调节人类机体基因的表达，外部环
－Nature：人成纤维细胞中的染色质相互作用
Hi-C是基于“染色体构形捕捉”(称之为3C，因为三个单词的首字母都是C)的一项基因组技术，能以没有偏颇的方式在整个基因组中识别长距离成环相互作用。 Bing Ren及同事为Hi-C数据集建立了一个新颖的分析流程，其分辨率大大提高，使得顺式调控元素如增强子和启动子之间的相互作用可以被确定。