拟南芥超级增强子鉴定与功能验证研究获进展
近日，东北地理所农田有害生物控制学科组孟凡立研究员团队与美国密歇根州立大学（Michigan State University）Jiming Jiang团队和英国约翰英纳斯中心（John Innes Centre）Anne Osbourn团队合作，在国际权威SCI期刊PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA[l1] （PNAS）（IF：12.779）上在线发表了题为“Identification and functional validation of super-enhancers in Arabidopsis thaliana”的研究论文，该研究在植物中首次定位和鉴定植物超级增强子，将超级增强子概念引入植物研究领域。 增强子是长度约200 bp非编码DNA序列，通过结合转录因子（Transcriptio......阅读全文
拟南芥超级增强子鉴定与功能验证研究获进展
近日，东北地理所农田有害生物控制学科组孟凡立研究员团队与美国密歇根州立大学（Michigan State University）Jiming Jiang团队和英国约翰英纳斯中心（John Innes Centre）Anne Osbourn团队合作，在国际权威SCI期刊PROCEEDINGS OF
Cell：两项研究聚焦“超级增强子”
近日，麻省理工白头研究所和哈佛丹娜法伯癌症研究所以及冷泉港实验室这三家知名的研究机构的科学家惊讶地发现，一组称作“超级增强子”( super-enhancer)的强有力基因调控子，它们控制了细胞的状态和特性。相关两个研究论文刊登在了近期出版的《细胞》(Cell)杂志上。 研究发现，健康
拟南芥种子休眠机制研究获进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498538.shtm 种子休眠是指完整有活力的种子在适宜环境条件下仍不能萌发的生物学特性，受环境和遗传因素影响，是典型的多基因调控的复杂数量性状。目前已发现的种子休眠调控因子的作用机制中，基因转录调控
拟南芥转基因植株的鉴定
实验概要本实验介绍了拟南芥转基因植株的初步鉴定方法，包括：阳性苗的筛选，GUS基因表达分析，组织PCR和RT-PCR分析。主要试剂0.2%的Triton X-100，10%的次氯酸钠，含20 mg/L Hygromycin的MS培养基，X-Gluc，75%乙醇，0.25 N NaOH，0.25
拟南芥种子休眠机制最新研究进展
近日，中科院植物研究所研究员刘永秀团队发现拟南芥转录后调控的重要分子机器pre-mRNA 3'末端加工复合体参与种子休眠调控。相关研究成果发表于《植物杂志》。种子休眠是指完整有活力的种子在适宜环境条件下仍不能萌发的生物学特性，受环境和遗传因素影响，是典型的多基因调控的复杂数量性状。目前已发现
增强子鉴定新技术研发成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/515099.shtm
eRNA与Super－Enhancer－RNA在转录调控中扮演的角色
增强子是真核生物中关键的顺式作用基因调控元件，能有效地促进基因表达。它们可以通过作为转录因子和辅助因子的结合平台来维持转录的精确控制。超级增强子是由一簇典型增强子串联组成的具有更强转录调控能力的顺式元件。而全基因组分析发现增强子和超级增强子可以普遍进行转录，产生eRNA和SE-lncRNA。它们都具
武汉大学发现一个新的结直肠癌的致癌转录因子
结直肠癌是世界上发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一。近日，武汉大学生命科学学院的一项最新研究成果，揭示了一个新的结直肠癌的致癌转录因子，为结直肠癌的研究提供了重要的表观基因组数据和新的关键调控因子，相关论文近日在线发表于《自然—通讯》。 据介绍，目前关于结直肠癌的多组学研究广泛集中在基因组学和转
PLoS－Genet：何新建等模式植物拟南芥研究获进展
2014年1月22日，北京生命科学研究所何新建实验室在《PLOS Genetics》杂志在线发表题为“The SET domain proteins SUVH2 and SUVH9 are required for Pol V occupancy at RNA-directed DNA me
拟南芥RNA核糖甲基化修饰研究方面获进展
3月30日，中国科学院生物物理研究所研究员叶克穷课题组、北京大学现代农学院博士王玉秋和中科院遗传与发育研究所研究员李家洋课题组合作在Nucleic Acids Research上发表了题为Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis tha
在拟南芥生殖细胞DNA复制研究中取得进展
被子植物雄配子发生过程中，单倍体小孢子经历一次不对称有丝分裂（PMI）产生营养细胞和生殖细胞，之后生殖细胞再进行一次对称的有丝分裂（PMII）形成两个精细胞。拟南芥花粉常被看作一个理想的发育生物学模型，这个简单的系统不仅经历了细胞的分裂、分化、细胞命运的决定等重要生物学过程，还涉及大量花粉特异基
拟南芥精氨酸甲基转移酶AtPRMT5功能研究获新进展
蛋白质是生物体结构与功能的基本单位，是所有生命活动的物质基础和生理功能的重要执行者。蛋白质翻译后修饰是调节蛋白质生物学功能的关键步骤之一。作为基因产物，几乎所有的蛋白质都要经过翻译后的剪切修饰才能成为成熟蛋白质。目前已发现的蛋白质翻译后修饰形式已经多达100种以上，其中蛋白质精氨酸
研究人员揭示超级增强子动态甲基化调控转录异质性
CpG DNA甲基化早在70年代就被提出是一种用来控制基因表达的DNA化学修饰，而我们对DNA甲基化在基因组不同区域的具体功能，在疾病、发育过程中所扮演的具体角色，以及控制基因表达的详细机理，直到今天并没有全面详细的认知。 2019年8月15日，美国Whitehead研究所Rudolf Jae
盖塔病毒鉴定研究取得进展
近日，广东省农业科学院动物卫生研究所猪病研究室研究员翟少伦团队与复旦大学研究员张荣团队合作，在国家自然科学基金等项目的资助下，在猪盖塔病毒鉴定研究方面取得新进展。相关成果发表于《微生物学谱》（Microbiology Spectrum）。盖塔病毒隶属于披膜病毒科甲病毒属，是一种由蚊虫传播的虫媒病毒，
Nature子刊：鉴定增强子全新方法
增强子是能够加强特定基因表达的DNA序列。日期，劳伦斯伯克利国家实验室(Berkeley Lab)的研究团队，开发了一个能在人类和其他哺乳动物基因组中鉴定基因增强子的新技术。文章于三月二十三日发表在Nature Methods杂志的网站上。 这一技术被称为SIF-seq(site-sp
从全才到专家，Cell子刊揭示启动干细胞分化的蛋白团队
生物通报道：当植物将根扎进土壤的时候，根尖形成的新细胞就要担负不同的责任，比如输送水和营养物质或者感知重力。 Duke大学的研究人员在拟南芥根部鉴定了一组DNA结合蛋白。他们在Developmental Cell杂志上发表文章指出，这些蛋白共同作用帮助前体细胞选择性读取基因组的不同部分，从而走
拟南芥PRL1基因调控根尖分生区活力研究获进展
根尖分生区的微环境（stem cell niche）对维持根尖干细胞的活力，保证根系正常持续生长起着重要作用。目前已经报道了一些在根尖干细胞维持方面的研究，但根尖干细胞命运决定以及微环境的活力维持还没有完全阐述清楚。 中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心李霞课题组通过正向遗传学的方
何新建等拟南芥叶酸多聚谷氨酰基化研究获进展
2013年7月23日，北京生命科学研究所何新建实验室在《The Plant Cell》杂志在线发表题为“Folate polyglutamylation is involved in chromatin silencing by maintaining global DNA methyl
遗传发育所拟南芥根木质部发育机制研究获进展
真核生物转录起始因子eIF5A是一类在真核生物中高度保守的基因家族，调控真核生物生长发育的多个生物学过程。 中科院遗传与发育生物研究所左建儒研究组最近的研究发现，拟南芥eIF5A-2/FBR12通过细胞分裂素信号通路调控拟南芥根木质部的发育。 eIF5A-2/FBR1通过与细胞分裂素受
研究揭示－“超级细菌”抑制机制新进展
近日，中国科学技术大学教授陈宇星、周丛照和孙林峰课题组合作阐明了应用抑制剂Targocil抑制超级细菌的机理。该研究成果在线发表于《微生物学》。 由于近年来抗生素滥用，出现了一类对所有的β-内酰胺类药物（包括临床最常用的青霉素与头孢菌素）都具有耐药性的“超级细菌”——耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（
新研究揭示猪肌纤维类型分化及转化机制
7月1日，华南农业大学教授吴珍芳团队首次揭示了不同代谢类型猪骨骼肌的染色质空间构象及其介导的调控差异，通过整合表观基因组学与三维基因组学分析并结合分子实验，阐明了超级增强子调控肌纤维类型分化与转化的分子机制。相关成果发表于《自然-通讯》（Nature Communications）。研究对象及高通量
PlantScreen表型助力转录组水平amiRNA筛选鉴定拟南芥激素...
PlantScreen表型助力转录组水平amiRNA筛选鉴定拟南芥激素运输功能基因研究信号分子的运输在调节植物生长、发育和环境应答方面起到非常重要的作用。最显著的例子就是植物激素的空间分布控制植物发育模式。以色列特拉维夫大学Eilon Shani研究团队使用amiRNA进行转录组多目标正向遗传筛
高性能路由验证和路由查找研究获进展
路由验证和路由查找是实现安全路由和高效转发的关键技术。随着网络规模和网络流量的持续增长以及大范围路由异常事件频发，路由查找和路由验证面临严峻的性能挑战。中国科学院计算机网络信息中心前瞻实验室团队围绕上述挑战开展研究，提出一系列创新算法与机制，部分算法已在实际系统部署应用。针对BGP路由验证的性能挑战
南京土壤所在铵影响拟南芥主根向地性研究中获进展
根系构型对于植物适应不同水分养分及土壤物理结构的生长环境至关重要。根长，侧根数量与根的向地性是决定植物根系空间构型的主要因素。铵作为主要的土壤环境因子之一，对植物根系伸长与侧根形成的调控机制已有广泛研究，但其对根系向地性的影响却少有报道。 中国科学院南京土壤研究所施卫明课题组研究发现铵离子
拟南芥形成侧生分生组织的细胞谱系研究中获进展
植物分枝是决定植物株型和作物产量的重要因素。叶片基部叶腋处能够形成侧生分生组织，并产生侧芽。侧芽可以进而发育成为侧枝。 中国科学院遗传与发育生物学研究所焦雨铃研究组的前期研究揭示了侧生分生组织形成的激素调控（Wang et al., 2014； Han et al., 2014），并初步解析了
遗传发育所在拟南芥独脚金内酯信号研究中取得新进展
独脚金内酯（Strigolactones, SLs）是一类新的植物激素，调控侧芽伸长、株高、叶片形状、衰老、种子萌发、侧根生长等发育过程，在单子叶植物和双子叶植物中具有功能保守性。在水稻独脚金内酯信号途径中F-box蛋白DWARF3 (D3)与独脚金内酯的受体DWARF4 (D14)形成SCF复
“超级增强子”调控关键基因－科学家为其编目录
据物理学家组织网10月10日报道，最近，美国怀特黑德生物医学研究所科学家发现了一套称为“超级增强子”的基因调控器，能控制、影响人类和小鼠的大量细胞型。研究人员指出，超级增强子富集在基因组的变异区，而这些变异区与多种疾病谱系密切相关，所以它们最终可能在疾病诊断与治疗方面发挥重要作用。相关论文在线发
大连化物所微型超级电容器研究获进展
近日，中国科学院大连化学物理研究所二维材料与能源器件研究组研究员吴忠帅团队采用自下而上热解法制备出连续、均匀、超薄的硫掺杂石墨烯薄膜，并将其应用于高比容量微型超级电容器，相关研究成果发表在《美国化学会志》（J. Am. Chem. Soc.，DOI:10.1021/jacs.7b00805）上。
西北农林科大等破译维持干细胞“多能性”的核心
哺乳动物多能性相关超级增强子的进化模型。论文作者供图 西北农林科技大学动物医学院华进联教授团队等成功破译维持干细胞“多能性”的核心，鉴定出三个在胎盘哺乳动物中高度保守的超级增强子（SE-SOX2、SE-PIM1、SE-FGFR1）。其相关成果《胎盘动物超级增强子维持干细胞多能性》9月26日
酰基载体蛋白的基本表达
随着分子生物学和基因组学研究的不断深入,有关植物不同 ACP 功能分析的研究取得了一定进展。拟南芥 ACP1 是种子中优先表达的 ACP 基因。Branen 等人构建了 35S 启动子驱动的带有 ACP1 和其上游 400bp 序列的植物表达载体,转基因的拟南芥植株在叶组织中该基因的表达增加了