肝脏脂质动态变化信号转变为再生修复信号的“桥梁”因子
中国科学院上海营养与健康研究所丁秋蓉研究组在《自然-通讯》(Nature Communications)上,在线发表了题为Acute liver steatosis translationally controls the epigenetic regulator MIER1 to promote liver regeneration in a study with male mice的研究论文。该研究发现肝脏再生过程中肝实质细胞的MIER1表观因子响应脂质动态改变,从而调控肝实质细胞增殖再生的机制。 哺乳动物的健康肝脏组织在肝损伤后具有强大的再生能力。作为一种“新建再生”,在肝脏组织经历2/3肝切或者急性毒性损伤后,处于静息期的肝脏细胞(主要为肝实质细胞)会重新进入细胞周期进行增殖,生成新的肝脏细胞,在不到两周的时间内恢复全部的肝脏质量和功能。而肝脏再生能力在脂代谢紊乱的肝脏组织中显著减弱,如酒精或非酒精性脂肪肝、衰老肝......阅读全文
DNA损伤修复信号通路相关因子MRE11
该基因编码一种核蛋白,参与同源重组、端粒长度维持和dna双链断裂修复。蛋白质本身具有3'到5'的外切酶活性和内切酶活性。该蛋白与rad50同源物形成复合物;该复合物用于dna末端的非同源连接,并具有增加的单链dna内切酶和3'到5'的外切酶活性。与dna连接酶结合,这
DNA损伤修复信号通路相关因子PARP1
聚[ADP-核糖]聚合酶1(PARP-1)也称为NAD + ADP-核糖基转移酶1或聚[ADP-核糖]合酶1是人类中由PARP1基因编码的酶。 它是PARP家族的酶之一。 PARP1的工作原理: · 通过聚ADP-核糖基化修饰核蛋白。 · 与BRCA一起发挥作用于双链; PARP家庭的成员以单股行事
DNA损伤修复信号通路相关因子RB1
RB1基因编码的蛋白是细胞周期的负调控因子,是第一个发现的抑癌基因,因为该基因与视网膜母细胞瘤的发生相关,因此被命名为视网膜母细胞瘤基因(Retinoblastomal,RB1)。RB1具有维持染色质结构稳定的作用,处于去磷酸化形式的RB1可以与转录因子E2F1结合,作为细胞周期的负调控因子,阻止细
DNA损伤修复信号通路相关因子MSH6
这个基因编码一个DNA错配修复muts家族的成员。在大肠杆菌中,muts蛋白在修复前帮助识别不匹配的核苷酸。一个大约150个氨基酸的高度保守区,称为walker-a腺嘌呤核苷酸结合基序,存在于muts同系物中。编码蛋白与MSH2异二聚体形成一个失配识别复合物,作为双向分子开关发挥作用,当DNA失配被
DNA损伤修复信号通路相关因子ERCC1
该基因的产物在核苷酸切除修复途径中起作用,是修复紫外光诱导或顺铂等亲电化合物形成的DNA损伤所必需的。编码蛋白与xpf内切酶(也称为ercc4)形成异二聚体,异二聚内切酶催化DNA损伤切除过程中的5'切口。异二聚内切酶也参与重组DNA修复和链间交联修复。该基因突变导致脑-眼骨骼综合征,改变该
DNA损伤修复信号通路相关因子PMS2
该基因编码的蛋白质是失配修复系统的关键组成部分,其功能是纠正DNA复制和同源重组过程中可能发生的DNA失配、小插入和缺失。该蛋白与mutl同源1(mlh1)基因的基因产物形成异二聚体,形成mutlα异二聚体。mutlα异二聚体具有一种内核溶解活性,在mutsα和mutsβ异二聚体识别不匹配和插入/删
DNA损伤修复信号通路相关因子ERCC3
该基因编码一种atp依赖的dna螺旋酶,在核苷酸切除修复中发挥作用。编码蛋白是基础转录因子2(tfiih)的一个亚单位,因此也在ii类转录中起作用。该基因突变与着色性干皮病B、Cockayne综合征和毛发硫营养不良有关。选择性剪接导致多个转录变体。[由RefSeq提供,2014年12月]This g
DNA损伤修复信号通路相关因子ERCC2
核苷酸切除修复途径是修复DNA损伤的机制。该基因编码的蛋白参与转录偶联核苷酸切除修复,是基础转录因子btf2/tfiih复合物的一个不可分割的成员。该基因产物具有ATP依赖性DNA解旋酶活性,属于解旋酶的RAD3/XPD亚家族。这种基因的缺陷可导致三种不同的疾病,即癌症易发综合征着色性干皮病互补组D
DNA损伤修复信号通路相关因子NKX2
该基因编码一种最初被鉴定为甲状腺特异性转录因子的蛋白质。编码的蛋白质与甲状腺球蛋白启动子结合,调节甲状腺特异基因的表达,但也被证明调节与形态发生有关的基因的表达。该基因的突变和缺失与良性遗传性舞蹈病、舞蹈病、先天性甲状腺功能减退和新生儿呼吸窘迫有关,并可能与甲状腺癌有关。已发现该基因编码不同亚型的多
DNA损伤修复信号通路相关因子CDKN2A
CDKN2A基因通过可变剪切可产生不同的转录本,至少编码3个不同的蛋白,其中的两个蛋白分别为p16(INK4)与p14(ARF),p16为细胞周期蛋白依赖的激酶抑制剂,p14可与MDM2结合防止p53被泛素化降解,这两种蛋白通过共同调节CDK4和p53,从而控制细胞从G1期转到S期,基因突变或缺失与
DNA损伤修复信号通路相关因子SMARCA4
该基因编码的蛋白是Swi/SNF蛋白家族的一员,与果蝇的布拉马蛋白相似。这个家族的成员有螺旋酶和ATP酶活性,被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分,这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。此外,该蛋白能结合BRCA1
DNA损伤修复信号通路相关因子TSC2
这个基因的突变导致结节性硬化症。其基因产物被认为是一种肿瘤抑制因子,能够刺激特定的GTP酶。这种蛋白在细胞溶质复合体中与哈马汀结合,可能作为哈马汀的伴侣。选择性剪接导致编码不同亚型的多个转录变体。Mutations in this gene lead to tuberous sclerosis co
DNA损伤修复信号通路相关因子RAD50
该基因编码的蛋白质与酿酒酵母RAD50非常相似,后者是一种参与DNA双链断裂修复的蛋白质。这种蛋白与MRE11和NBS1形成复合物。这种蛋白复合物与DNA结合,并表现出DNA末端非同源连接所需的许多酶活性。这种蛋白与它的伙伴合作,对DNA双链断裂修复、细胞周期检查点激活、端粒维持和减数分裂重组很重要
DNA损伤修复信号通路相关因子ERCC4
该基因编码的蛋白质与ERCC1形成复合物,参与核苷酸切除修复过程中的5'切口。该复合物是一种与EME1相互作用的结构特异性DNA修复内切酶。该基因缺陷是着色性干皮病互补组F(xp-f)或着色性干皮病VI(xp6)的原因。[由Refseq提供,2009年3月]The protein encod
DNA损伤修复信号通路相关因子HOXB13
该基因编码属于同源盒基因家族的转录因子。该家族的基因在脊椎动物中高度保守,对脊椎动物胚胎发育至关重要。该基因与胎儿皮肤发育和皮肤再生有关。在小鼠体内,一个类似的基因在胚胎的主轴上表现出时间和空间的共线性,但没有在第二轴上表达,这表明了在沿着主轴的身体模式中的功能。这个基因和其他hoxb基因在染色体1
DNA损伤修复信号通路相关因子CHEK2
在对DNA损伤和复制阻滞作出反应时,通过控制关键的细胞周期调节器,细胞周期进程停止。该基因编码的蛋白质是一种细胞周期检查点调节因子和假定的肿瘤抑制因子。它包含一个叉头相关蛋白相互作用域,在对DNA损伤作出反应时对激活至关重要,并在对复制阻滞和DNA损伤作出反应时迅速磷酸化。当被激活时,编码蛋白被认为
DNA损伤修复信号通路相关因子RAD51
这个基因编码的蛋白质是rad51蛋白家族的一员。rad51家族成员与细菌reca和酿酒酵母rad51高度相似,参与dna的同源重组和修复。该蛋白能与ssdna结合蛋白rpa和rad52相互作用,在dna的同源配对和链转移中发挥重要作用。这种蛋白质也被发现与brca1和brca2相互作用,这可能对细胞
DNA损伤修复信号通路相关因子EZH2
EZH2基因编码的是一种组蛋白赖氨酸N-甲基转移酶,参与DNA甲基化从而抑制其他基因转录,EZH2也可甲基化组蛋白H3第27位赖氨酸。EZH2的甲基化活性促进异染色质的形成从而使基因沉默,是PRC2复合物的组分之一。EZH2的突变或者过表达与多种类型癌症相关,如乳腺癌、前列腺癌、黑色素瘤和膀胱癌等。
DNA损伤修复信号通路相关因子RANBP2
ran是ras超家族的一种小的gtp结合蛋白,与核膜相关,被认为通过与其他蛋白的相互作用来控制多种细胞功能。这个基因编码一个非常大的ran结合蛋白,免疫定位到核孔复合体。该蛋白是一个巨大的支架和嵌合体亲环素相关的核孔蛋白参与了ran-gtpase循环。编码蛋白直接与E2酶UBC9相互作用,并强烈促进
DNA损伤修复信号通路相关因子NPM1
NPM1是一种广泛在核仁表达的蛋白,它可以在细胞核和细胞质之间穿梭,参与核糖体蛋白的组装和运输,调控中心体的复制以及调控肿瘤抑制因子ARF的表达。NPM1的突变会导致该蛋白从细胞核转移到细胞质,引起急性髓细胞白血病。
DNA损伤修复信号通路相关因子BRCA2
BRCA1和BRCA2基因的遗传突变会增加患乳腺癌或卵巢癌的终生风险。BRCA1和BRCA2都参与了基因组稳定性的维持,特别是双链DNA修复的同源重组途径。BRCA2蛋白含有一个70 a a基序的几个拷贝,称为BRC基序,这些基序介导了与在DNA修复中起作用的RAD51重组酶的结合。BRCA2被认为
DNA损伤修复信号通路相关因子MSH3
该基因编码的蛋白质与msh2形成异二聚体,形成mutsβ,是复制后dna错配修复系统的一部分。mutsβ通过与失配结合并与mutlα杂二聚体形成复合物来启动失配修复。该基因在第一个外显子中含有一个多态的9bp串联重复序列。在参考基因组序列中,重复出现6次,已有3-7次报道。这个基因的缺陷是子宫内膜癌
DNA损伤修复信号通路相关因子CCND1
该基因编码的蛋白质属于高度保守的细胞周期蛋白家族,其成员在整个细胞周期内具有显著的蛋白质丰度周期性。细胞周期蛋白起着调节CDK激酶的作用。不同的细胞周期蛋白表现出不同的表达和降解模式,这有助于每个有丝分裂事件的时间协调。该细胞周期蛋白与CDK4或CDK6形成复合物并作为其调节亚单位发挥作用,其活性是
DNA损伤修复信号通路相关因子BCL6
该基因编码的蛋白是锌指转录因子,含有一个n端poz结构域。该蛋白作为一种序列特异性的转录抑制因子,已被证明调节b细胞stat依赖性il-4应答的转录。这种蛋白质可以与多种poz蛋白相互作用,poz蛋白具有转录辅压作用。该基因在弥漫性大细胞淋巴瘤(dlcl)中常发生易位和过度突变,可能参与dlcl的发
DNA损伤修复信号通路相关因子TB53
TP53基因编码的是分子量约为53kDa的蛋白,P35根据其分子量大小命名的,首次是在1979年发现致瘤病毒SV40可以与该蛋白形成复合物,并且将克隆得到p53转入到细胞可引起细胞癌变,所以最初的10年普遍认为p53是抑癌基因。后来发现之前肿瘤细胞来源的p53基因突变体能够促使细胞发生转化,而野生型
DNA损伤修复信号通路相关因子STAG2
该基因编码的蛋白质是黏着素复合物的一个亚单位,在细胞分裂过程中调节姐妹染色单体的分离。该基因的靶向失活导致染色单体粘聚缺陷和非整倍体,这表明粘聚素的遗传破坏是人类癌症非整倍体的原因之一。另外,还发现了编码不同亚型的剪接转录变体。The protein encoded by this gene is
DNA损伤修复信号通路相关因子CDk4
细胞周期蛋白依赖性激酶4也称为细胞分裂蛋白激酶4,是人类中由CDK4基因编码的酶。 CDK4是细胞周期蛋白依赖性激酶家族的成员。 该基因编码的蛋白质是Ser / Thr蛋白激酶家族的成员。该蛋白质与酿酒酵母cdc28和粟酒裂殖酵母cdc2的基因产物高度相似。它是蛋白激酶复合物的催化亚基,对细胞周期G
DNA损伤修复信号通路相关因子CCND3
该基因编码的蛋白质属于高度保守的细胞周期蛋白家族,其成员在细胞周期内具有显著的蛋白质丰度周期性。细胞周期蛋白起着调节CDK激酶的作用。不同的细胞周期蛋白表现出不同的表达和降解模式,这有助于每个有丝分裂事件的时间协调。该细胞周期蛋白与CDK4或CDK6形成复合物并作为其调节亚单位发挥作用,其活性是细胞
DNA损伤修复信号通路相关因子BRCA1
该基因编码一种在维持基因组稳定性中起作用的核磷蛋白,并作为肿瘤抑制因子发挥作用。编码蛋白与其他肿瘤抑制因子、DNA损伤传感器和信号转导子结合形成一个大的多亚单位蛋白复合物,称为BRCA1相关基因组监测复合物(BASC)。该基因产物与RNA聚合酶Ⅱ结合,并通过C端域与组蛋白脱乙酰基酶复合物相互作用。因
DNA损伤修复信号通路相关因子MDm2
这个基因编码一个核定位的E3泛素连接酶。编码蛋白可通过靶向肿瘤抑制蛋白(如p53)促进蛋白酶体降解形成肿瘤。这个基因本身是由p53转录调节的。这种基因座的过度表达或扩增可在多种不同的癌症中检测到。在2号染色体上有一个这个基因的假基因。选择性剪接导致大量转录变异,其中许多可能只在肿瘤细胞中表达。Thi