Nature子刊:新技术开辟表观遗传研究新领域

来自犹他大学Huntsman癌症研究所(HCI)的研究人员,开发了一种强有力的新技术,可在人类RNA中鉴别出一组称作RNA胞嘧啶甲基转移酶(RMTs)的酶的靶标。他们将这一技术应用于一种与人类精神发育迟滞和癌症相关的特异RMT——NSUN2上,发现并确认了大量从前未知的RMT靶标,从而表明了这一技术的效力。相关研究结果在线发表在4月21日的《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。 研究的共同作者、Huntsman癌症研究所基础科学高级主管Bradley R. Cairns 说:“虽然人们知道RMTs已有多年,然而实际上对于人体中的大多数这些酶仍是一无所知。这项新技术现在使得我们能够非常快速地鉴别每种人类RMT的直接靶RNAs,我们对于正在开展中的工作感到非常的兴奋。” 在活细胞中,RNA充当了一个重要的媒介物传递来自DNA的遗传信息。DNA转录生成RNA,随后RNA被用于编码生......阅读全文

什么是胞嘧啶?

胞嘧啶,学名为4-氨基-2-羰基嘧啶,是一种有机物,分子式为C4H5N3O。是核酸(DNA和RNA)中的主要碱基组成成分之一。胞嘧啶可由二巯基脲嘧啶、浓氨水和氯乙酸为原料合成制得。用作药物中间体。

DNA-甲基化测序常用方法

随着高通量测序技术(NGS)技术的发展,使我们能够从全基因组水平来分析 5’甲基胞嘧啶及组蛋白修饰等事件,由此能够发现很多传统的基因组学研究所不能发现的东西,这就是所谓的“DNA 甲基化测序”!DNA 甲基化测序方法按原理可以分成三大类: 1、重亚硫酸盐测序; 2、基于限制性内切酶的测序; 3、靶向

关于基因表观修饰的方式—甲基化检测的程序介绍

  1.甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)  用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能

关于甲基化检测的检测程序介绍

  1.甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)  用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能

胞嘧啶的性状描述

白色或类白色结晶性或粉末;溶于水,溶于酸和碱,微溶于乙醇,不溶于有机溶剂。

胞嘧啶的基本用途

胞嘧啶核苷、胞嘧啶核苷酸均可作为升高白细胞的药物。 胞嘧啶是精细化工、农药和医药的重要中间体,特别在医药领域,主要用于合成抗艾滋病药物及抗乙肝药物拉米夫定,抗癌药物吉西他宾、依诺他宾以及5-氟胞嘧啶等,应用非常广泛。

胞嘧啶的物理参数

熔点: 210.0~220.0℃比旋度:+31~+35°干燥失重:≤0.5%炽灼残渣:≤0.1%重金属:≤10ppm含量(UV):98.0~101.5%纯度(HPLC):≥99.0%

胞嘧啶的基本用途

胞嘧啶核苷、胞嘧啶核苷酸均可作为升高白细胞的药物。 胞嘧啶是精细化工、农药和医药的重要中间体,特别在医药领域,主要用于合成抗艾滋病药物及抗乙肝药物拉米夫定,抗癌药物吉西他宾、依诺他宾以及5-氟胞嘧啶等,应用非常广泛。

胞嘧啶的用途说明

药品合成原料和生化试剂。用于CTP、CDP-胆碱、2′、3′-二去氧胞苷、阿糖胞苷等的制备。

胞嘧啶的物理特性

熔点:>300℃(lit.)性状:白色或类白色结晶性粉末100℃失水,300℃时成棕色,320~325℃分解。1g产品能溶于130ml水,微溶于乙醇,不溶于乙醚。pH2时,最大吸收波长276nm,摩尔吸光系数10000,最小吸收波长238nm,吸光度比值A250/A260=0.48、A280/A26

胞嘧啶的基本用途

胞嘧啶核苷、胞嘧啶核苷酸均可作为升高白细胞的药物。 胞嘧啶是精细化工、农药和医药的重要中间体,特别在医药领域,主要用于合成抗艾滋病药物及抗乙肝药物拉米夫定,抗癌药物吉西他宾、依诺他宾以及5-氟胞嘧啶等,应用非常广泛。

DNA甲基化的概念和方式

DNA甲基化(methylation)是真核细胞正常而普遍的修饰方式,也是哺乳动物基因表达调控的主要表观遗传学形式。DNA甲基化后核苷酸顺序及其组成虽未发生改变,但基因表达受影响。尽管甲基化修饰有多种方式,被修饰位点的碱基可以是腺嘌呤的N-6位、胞嘧啶的N-4位、鸟嘌呤的N-7位和胞嘧啶的C-5位,

甲基化的检测方法

(1) 甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到

甲基化检测方法介绍

(1) 甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到

生化与细胞所DNA去甲基化机制研究有新发现

  高等生物的基因组DNA中除含有腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)四种常见的碱基形式外,还含有胞嘧啶的修饰形式:5-甲基胞嘧啶(5mC),被称为第5种碱基。而且它可以进一步被氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5hmC),也被称为第6碱基。这些修饰形式在表观调控中都具有重要的作用,但它们

关于甲基化的类型的介绍

  甲基化包括DNA甲基化或蛋白质甲基化  (1)DNA甲基化。脊椎动物的DNA甲基化一般发生在CpG位点(胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤位点,即DNA序列中胞嘧啶后紧连鸟嘌呤的位点)。经DNA甲基转移酶催化胞嘧啶转化为5-甲基胞嘧啶。人类基因中约80%-90%的CpG位点已被甲基化,但是在某些特定区域,如富

关于甲基化的类型介绍

  甲基化包括DNA甲基化和蛋白质甲基化。  (1)DNA甲基化:脊椎动物的DNA甲基化一般发生在CpG位点(胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤位点,即DNA序列中胞嘧啶后紧连鸟嘌呤的位点)。经DNA甲基转移酶催化胞嘧啶转化为5-甲基胞嘧啶。人类基因中约80%-90%的CpG位点已被甲基化,但是在某些特定区域,如

甲基化的类型介绍

甲基化包括DNA甲基化和蛋白质甲基化。(1)DNA甲基化:脊椎动物的DNA甲基化一般发生在CpG位点(胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤位点,即DNA序列中胞嘧啶后紧连鸟嘌呤的位点)。经DNA甲基转移酶催化胞嘧啶转化为5-甲基胞嘧啶。人类基因中约80%-90%的CpG位点已被甲基化,但是在某些特定区域,如富含胞嘧

甲基化的主要类型

(1)DNA甲基化:脊椎动物的DNA甲基化一般发生在CpG位点(胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤位点,即DNA序列中胞嘧啶后紧连鸟嘌呤的位点)。经DNA甲基转移酶催化胞嘧啶转化为5-甲基胞嘧啶。人类基因中约80%-90%的CpG位点已被甲基化,但是在某些特定区域,如富含胞嘧啶和鸟嘌呤的CpG岛则未被甲基化。这与

关于甲基化检测的基本信息介绍

  甲基化检测:DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,真核生物中的甲基化仅发生于胞嘧啶,即在DNA甲基化转移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5’-端的胞嘧啶转变为5’-甲基胞嘧啶。DNA甲基化通常抑制基因表达,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。这种DNA修饰方式在不改变基因序列前

关于基因表观修饰的方式—甲基化检测的介绍

  DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,真核生物中的甲基化仅发生于胞嘧啶,即在DNA甲基化转移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5’-端的胞嘧啶转变为5’-甲基胞嘧啶。DNA甲基化通常抑制基因表达,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。这种DNA修饰方式在不改变基因序列前提下实现对基

关于甲基化检测的内容介绍

  DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,真核生物中的甲基化仅发生于胞嘧啶,即在DNA甲基化转移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5’-端的胞嘧啶转变为5’-甲基胞嘧啶。DNA甲基化通常抑制基因表达,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。这种DNA修饰方式在不改变基因序列前提下实现对基

两篇PNAS:蛋白纳米孔检测DNA甲基化

  两个独立的研究团队利用通道蛋白实现纳米孔测序,成功鉴别了5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。这两篇文章发表在同一期的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。   基因组所蕴含的编码信息,包括DNA序列和核苷酸修饰两个部分。其中,动态的DNA甲基化模式,是基因表达的重要调控者,与细胞分化、胚胎发育和癌症

美国哈佛大学医学院张毅教授到生物物理所交流

    张毅教授作报告  11月14日,应生物大分子国家重点实验室许瑞明研究员的邀请,哈佛大学医学院的张毅教授在生物物理所图书馆报告厅作了一场题为Mechanism and function of Tet-mediated 5-methylcytosine Oxidation的报告。

研究揭示植物中DNA半甲基化稳态维持的机制

DNA甲基化是一种常见的表观遗传修饰,其在基因表达调控中起着重要作用。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在“胞嘧啶-鸟嘌呤”(CG)位点的胞嘧啶上。CG双链上两个胞嘧啶的甲基化状态通常一致,完全甲基化或非甲基化。这种对称的甲基化状态会在DNA复制过程中转化为不对称的“半甲基化”状态,再由DNA甲基转

甲基化特异性的PCR

  用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到扩增片段,则说明该位点存在甲基化;反之,说明被检测的位点不存在甲基化。

关于甲基化特异性的PCR介绍

  用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到扩增片段,则说明该位点存在甲基化;反之,说明被检测的位点不存在甲基化。

甲基化特异性的PCR检测

用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到扩增片段,则说明该位点存在甲基化;反之,说明被检测的位点不存在甲基化。

胞嘧啶的功能用途

胞嘧啶核苷、胞嘧啶核苷酸均可作为升高白细胞的药物。 胞嘧啶是精细化工、农药和医药的重要中间体,特别在医药领域,主要用于合成抗艾滋病药物及抗乙肝药物拉米夫定,抗癌药物吉西他宾、依诺他宾以及5-氟胞嘧啶等,应用非常广泛。

胞嘧啶的基本信息

简写为C。核酸中嘧啶型碱基之一。存在于DNA和RNA中。在植物DNA中,除胞嘧啶外,还有少量的5-甲基胞嘧啶。在DNA的双股螺旋中,一股链上的胞嘧啶与另一股链上的鸟嘌呤配对,分子间形成三个氢键。这种碱基互补对之间的氢键是DNA双螺旋结构稳定性的重要作用力之一。胞嘧啶核苷、胞嘧啶核苷酸均可作为升高白细