大连化物所等发展出利用原位化学交联解码细胞中蛋白质动态结构的策略
近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员赵群、张丽华等,与中国科学院精密测量科学技术创新研究院副研究员龚洲合作,提出了利用原位化学交联-质谱技术(in vivo XL-MS),解码细胞中蛋白质动态结构的策略。该策略将AlphaFold2的结构作为先验信息,结合in vivo XL-MS数据与多种结构计算方法评估结构与交联信息的匹配度,重构了细胞内多种蛋白质,尤其是多结构域蛋白质和固有无序蛋白质(intrinsically disordered protein,IDP)的原位动态结构。为剖析蛋白质在细胞微环境中发挥功能的分子机制提供技术支撑。 活细胞内蛋白质的原位动态结构对于揭示其生物学功能至关重要。随着深度学习算法助力蛋白质结构预测的发展迭代,AlphaFold2实现了对蛋白质结构的全面预测,而该方法对柔性区域的结构预测仍面临挑战。近年来,in vivoXL-MS以高通量、高灵敏、......阅读全文
高内涵——基于FRET分析活细胞中的ERK信号转导
Extracellular signal-regulated kinase(ERK)是胚胎发生,细胞分化,细胞增殖和细胞死亡调控的关键组成部分。ERK途径起源于质膜中的活化受体,并通过Ras/Raf/MEK至ERK(图1)。 图1. Ras/Raf/MEK/ERK信号级联将信号从细胞表面受体如EGF
新方法可解析活细胞中药物作用早期分子事件
近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员叶明亮团队开发了一种名为“溶剂诱导细胞部分固定法”(SICFA)的蛋白质组学新方法。该方法可在活细胞中原位、高通量地识别药物结合靶点及其下游早期效应蛋白,并揭示药物作用在细胞内的动态调节顺序。其核心优势在于无需裂解细胞,在保持细胞结构完整性的条件下实现对药物早
我所提出基于交联剂载体靶向递送的活细胞内线粒体蛋白质原位构象和相互作用解析新技术
原文地址:http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202307/t20230714_6810001.html 近日,我所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组(1810组)杨开广研究员和张丽华研究员在基于交联剂载体靶向递送的活细胞内线粒体蛋白质原位构象和相互作用解析方
细胞膜蛋白质提取方法蛋白质沉淀法
1.热变性及酸碱变性沉淀法 用于选择性的除去某些不耐热及在一定PH值下易变性的杂蛋白。 2.有机溶剂沉淀法 多用于生物小分子、多糖及核酸产品的分离纯化,有时也用于蛋白质沉淀。3.等电点沉淀法 用于氨基酸、蛋白质及其它两性物质的沉淀。但此法单独应用较少,多与其它方法结合使用。4.非离子多聚体沉淀法
补体的灭活
使血液制品,特别是血清中的补体失去活性,不灭活补体的血液制品具有溶血作用,通过56度30分钟灭活后,补体失去活性,对细胞就没有破坏作用了。
病毒灭活系统
病毒灭活系统是一种用于预防医学与公共卫生学领域的分析仪器,于2014年12月4日启用。 技术指标 1、系统规格尺寸需满足(WXHXD)600X875X400mm; 2、系统灭活病毒基于254nm UV-C短波长照射; 3、系统紫外灯管可以连续稳定运行1000小时; 4、系统所产生的照射
血清灭活问题
1、问:加到培养基中的血清必须灭活吗? 答:不是必须的,看做什么实验了,我在使用Gibco南美血清10270106的时候,都不灭活。 2、问:Gibco胎牛血清新西兰(Gibco新西兰血清10091148)灭活是56℃ 30分钟吗? 答:如果用于培养大多数的肿瘤细胞,血清一般是不需要灭活的,例如经常
真核细胞蛋白质合成的相关介绍
真核细胞蛋白质合成的起始真核细胞蛋白质合成起始复合物的形成中需要更多的起始因子参与,因此起始过程也更复杂。 ⑴需要特异的起始tRNA即,-tRNAfmet,并且不需要N端甲酰化。已发现的真核起始因子有近10种(eukaryote Initiation factor,eIF) ⑵起始复合物形成
蛋白质生成卡顿引发细胞老化
德国莱布尼茨老龄研究所团队在一种名为鳉鱼的淡水鱼大脑中发现,随着年龄增长,细胞内合成蛋白质的“工厂”——核糖体,在制造某一类关键蛋白质时出现卡顿,从而引发一连串恶性循环,导致细胞功能不断衰退。这或许是一种潜在的细胞衰老“总开关”机制及多种细胞老化现象的根源。相关论文发表于新一期《科学》杂志。合成蛋白
蛋白质工程拓展免疫细胞语言
根据世界卫生组织统计,每年约600万人死于败血症,这些数字令人担忧。这种俗称“血液中毒”的疾病通常始于无害的感染。 一旦触发免疫系统过度反应,自身组织就会受到攻击和损伤。过度反应最终会导致危及生命的防御系统全面崩溃。仅在德国,死于败血症的人数就超过了艾滋病、结肠癌和乳腺癌的总和! 世界各地的
动物细胞蛋白质的提取方法
1、将高压的 PBS洗涤细胞瓶两次,弃PBS,倒置纸巾上吸干。2、加入2 ml裂解液10×permeabilization buffer 2 ml。3、放入冰箱里裂解,平放,拧紧盖子,置摇床半小时,200 转/min。4、收集裂解液至 1.5 ml EP管,分两管,12000 rpm,4 ℃离心,5
全新合成蛋白质只对癌细胞下手
对于癌细胞的特异性鉴定和消融,是医学研究中长期存在的问题,直至目前也尚未完全被解决。癌细胞为什么如此难以被攻克?原因可以归结于它们不受控制的增殖和存活能力。目前,用于癌症治疗的靶向药物能够及时抑制癌细胞信号传导,但这些药物也会受到毒副作用的限制,可能对癌症患者造成多重伤害。Michael Z.
细胞膜蛋白质提取方法
NRC Institute for Biological SciencesTriton X-114 extraction protocol (Hydrophobic protein preparation)Ressuspend cells in Solution A (dil 1/8) and ad
单细胞蛋白质的微生物
生产单细胞蛋白质的微生物种类很多,有酵母菌、细菌、霉菌和担子菌等。 糖质原料:酵母属和假丝酵母属为主要生产菌。 正烷烃:假丝酵母为最主要利用菌。 甲烷:能利用甲烷作为唯一碳源的微生物,主要是细菌,如甲烷假单胞菌等。 甲醇:主要以细菌为主,放线菌、酵母菌和霉菌次之。甲烷利用菌也为甲醇利用菌
蛋白质帮助细胞生存还是死亡?
在一项研究中,科学家展示了细胞应激是怎样阻止和促进细胞自杀的,这两种作用是均衡对抗的。 7月3日发表在Science杂志上的一篇文章报道:未折叠蛋白反应(UPR)细胞应激通路不仅能激活死亡受体5蛋白(DR5)促进细胞自杀,也能通过降解DR5来抑制细胞自杀。该理论认为初始应激会阻碍细胞自杀或凋亡,给予
单细胞蛋白质的概念及优点
概念 用单细胞微生物发酵生产的蛋 白质称为单细胞蛋白质。 优点 ①单细胞蛋白质可以不受气候等外界条件的影响,能够工业化进行生产。 ②微生物的生长速率远较动、植物快,并且能在发酵罐中进行,因而可以在短时间内,在有限的体积内生产出大量的菌体,如500kg的牛每24h只能合成0.5kg蛋白质,
细胞外液中蛋白质浓度最低
四个当中细胞内液蛋白质浓度最高,这个不需多说了吧,毕竟蛋白质是在细胞内产生的,只有一小部分被分泌出去。第二应该是血浆,血浆中蛋白质含量大概是7%~9%,在其中也同样需要进行各种生物反应,含有各种酶。再者就是组织液和淋巴了,组织液主要是其中间桥梁的作用,帮助细胞运输营养物质,并接受细胞产生的代谢废物,
单细胞蛋白质定量技术解析干细胞异质性
干细胞是具有自我更新和多向分化潜能的未分化细胞。体内或体外研究表明, 干细胞具有表型及功能的异质性, 这一特性也决定了其不同的分化和再生能力。越来越多的证据表明, 干细胞自我更新及分化的分子机制以及与干细胞功能失调的相关疾病的产生都是在单细胞水平发生的, 基于异质性的干细胞群体的研究结果
如何提取细胞膜(动物细胞)上的蛋白质
一,蛋白质(包括酶)的提取大部分蛋白质都可溶于水、稀盐、稀酸或碱溶液,少数与脂类结合的蛋白质则溶于乙醇、丙酮、丁醇等有机溶剂中,因些,可采用不同溶剂提取分离和纯化蛋白质及酶。(一)水溶液提取法稀盐和缓冲系统的水溶液对蛋白质稳定性好、溶解度大、是提取蛋白质最常用的溶剂,通常用量是原材料体积的1-5倍,
细胞膜蛋白质提取方法——蛋白质沉淀法(二)
第二节 有机溶剂沉淀法有机溶剂的沉淀机理是降低水的介电常数,导致具有表面水层的生物大分子脱水,相互聚集,最后析出。该法优点在于:1)分辨能力比盐析法高,即蛋白质或其它溶剂只在一个比较窄的有机溶剂浓度下沉淀;2)沉淀不用脱盐,过滤较为容易;3)在生化制备中应用比盐析法广泛。其缺点是对具有生物活性的大分
细胞膜蛋白质提取方法——蛋白质沉淀法(一)
1.热变性及酸碱变性沉淀法 用于选择性的除去某些不耐热及在一定PH值下易变性的杂蛋白。 2.有机溶剂沉淀法 多用于生物小分子、多糖及核酸产品的分离纯化,有时也用于蛋白质沉淀。3.等电点沉淀法 用于氨基酸、蛋白质及其它两性物质的沉淀。但此法单独应用较少,多与其它方法结合使用。4.非离子多聚体沉淀法
一个蛋白质引发的惨案-|-蛋白质促进癌细胞转移
最近,挪威卑尔根大学(UiB)的研究人员分离出了一种蛋白质,可使癌细胞能够进行扩散。相关研究结果发表在4月14日的《Cancer Cell》。 在一个肿瘤内的细胞差异很大。尽管一些仍然是“好”细胞,不制造麻烦,但是其他一些细胞会变得具有侵袭性,并开始扩散到其他器官部位。我们很难预测哪些细胞会变
2025蛋白质组学大会之单细胞蛋白质组学研究
2025年10月13日上午10:10,第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会、π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“Single Cell Proteomics”分论坛在广州白云国际会议中心汕头厅(Shantou Hall)成功举行。 本场论坛由浙江大学方群
活细胞内的光催化生物相容反应研究获进展
实时调控细胞生命活动对研究细胞的生理功能具有重要价值。由于光优异的时空分辨率,生物相容的光引发化学工具可用于原位实时调控动态的生命过程。传统的光去笼方法通过直接光照射底物分子切断化学键从而释放生物活性分子,光去笼方法近年来的新发展希望实现如下重要新特质:一、通过廉价易得的可见光光源实现更好的生物
新型显微镜可“看到”活细胞内超微小结构
日本研究人员日前利用新开发的显微镜,首次在世界上观测到了活细胞内的线粒体等非常微小的器官。 日本原子能研究开发机构和奈良女子大学研究人员说,他们联合开发出的新型显微镜称为“激光等离子体软X线显微镜”,它利用了波长比紫外线短但是比X射线长的电磁波“软X线”,无需使用荧光物质,就能观测到
活细胞显微成像系统硬件触发方案的简要探讨五问汇总
一、显微镜各组件工作方式及为什么需要硬件触发?广州科适特科学仪器有限公司在为客户提供显微镜及配件和服务过程中,经常有客户问到为什么显微镜需要做硬件触发?为了帮助客户更好的理解显微镜,我们整理了此文简单探讨。活细胞成像实验现在需要比以往更高的速度和更多的数据处理量。本文以尼康显微镜为例简单介绍通过硬件
Nature-Methods:这个蛋白-能可视化活细胞发育周期的“盲区”
G1期(first gap):从有丝分裂到DNA复制前的一段时期,又称合成前期,此期主要合成RNA和核糖体。该期特点是物质代谢活跃,迅速合成RNA和蛋白质,细胞体积显著增大。这一期的主要意义在于为下阶段S期的DNA复制作好物质和能量的准备。 S期(synthesis):即DNA合成期,在此期,
Nikon-Ti2E全自动活细胞显微成像系统共享
仪器名称:Nikon Ti2-E全自动活细胞显微成像系统仪器编号:22009067产地:日本生产厂家:Nikon型号:Nikon Ti2-E出厂日期:购置日期:2022-06-09所属单位:医研院>生物医学测试中心>细胞生物学平台>细胞平台光镜机组放置地点:医学科学楼C119固定电话:固定手机:固定
不需活检就可观察活组织细胞,这个新仪器帮大忙
美国哥伦比亚大学工程团队开发了一种技术,可实现活体内的实时成像并取代传统的活检。在28日的《自然·生物医学工程》上发表的一篇论文中,研究人员描述了一种高速3D显微镜MediSCAPE,其能捕获组织结构的图像,以指导外科医生定位肿瘤及其边界,而无需活体取样分析病理结果。 哥伦比亚大学生物医学工程和
量子点标记技术实现分子马达在活细胞的示踪
基于量子点的单分子荧光示踪技术,对于体外研究分子马达在细胞骨架上的行走模式具有重要意义。目前对于细胞内分子马达运动特性的研究,是通过对内吞体、黑素体等细胞器的示踪而间接实现的。这些细胞器通过分子马达运输,因此,对细胞器的运动监测可间接分析分子马达的运动特性。巴黎第六大学Giovanni Capp